More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_2401 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_2401  guanylate kinase  100 
 
 
202 aa  411  1e-114  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0298091  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2286  guanylate kinase  64.85 
 
 
202 aa  283  1.0000000000000001e-75  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.30068  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2327  guanylate kinase  61.88 
 
 
203 aa  261  6e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000761567  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2238  guanylate kinase  60.4 
 
 
203 aa  259  2e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3213  guanylate kinase  59.41 
 
 
202 aa  258  5.0000000000000005e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000935163  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1050  guanylate kinase  58.91 
 
 
202 aa  256  2e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000462152 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3162  guanylate kinase  59.9 
 
 
202 aa  243  1.9999999999999999e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0281521  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1285  guanylate kinase  57.43 
 
 
210 aa  242  3e-63  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000194386  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1406  Guanylate kinase  53.23 
 
 
202 aa  204  1e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.77411  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3894  guanylate kinase  46.2 
 
 
200 aa  192  2e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000112061  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3845  guanylate kinase  47.21 
 
 
202 aa  192  3e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4019  guanylate kinase  53.33 
 
 
204 aa  188  4e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.565127  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2028  guanylate kinase  46.77 
 
 
220 aa  188  5e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.413126  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0473  guanylate kinase  47.45 
 
 
209 aa  184  8e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2084  guanylate kinase  48.91 
 
 
207 aa  183  1.0000000000000001e-45  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.338387  decreased coverage  0.00871463 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2719  guanylate kinase  47.28 
 
 
206 aa  182  3e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00356396  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1910  guanylate kinase  49.44 
 
 
210 aa  182  4.0000000000000006e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000116154  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1761  guanylate kinase  43.32 
 
 
207 aa  182  4.0000000000000006e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2902  guanylate kinase  48.92 
 
 
215 aa  181  7e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3877  guanylate kinase  46.32 
 
 
210 aa  181  8.000000000000001e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3497  guanylate kinase  49.74 
 
 
207 aa  181  9.000000000000001e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4581  guanylate kinase  47.62 
 
 
207 aa  180  1e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.877029  unclonable  0.0000000250462 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0785  guanylate kinase  46.32 
 
 
201 aa  180  1e-44  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000101008  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0266  guanylate kinase  46.77 
 
 
207 aa  180  1e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09810  Guanylate kinase  42.62 
 
 
194 aa  179  2.9999999999999997e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0361  guanylate kinase  46.56 
 
 
207 aa  178  4e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0330  guanylate kinase  47.09 
 
 
224 aa  178  5.999999999999999e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0351596  normal  0.331396 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3613  guanylate kinase  46.56 
 
 
207 aa  177  8e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3810  guanylate kinase  46.56 
 
 
207 aa  177  8e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.18291  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0336  guanylate kinase  47.09 
 
 
207 aa  177  1e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.57704 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2523  guanylate kinase  46.19 
 
 
214 aa  177  1e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1138  Guanylate kinase  44.39 
 
 
209 aa  177  1e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5842  guanylate kinase  45.55 
 
 
259 aa  176  2e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.509377 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3778  guanylate kinase  50.54 
 
 
233 aa  175  3e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.208797 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0365  guanylate kinase  44.44 
 
 
207 aa  175  3e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0353  guanylate kinase  46.03 
 
 
210 aa  175  4e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0360  guanylate kinase  46.03 
 
 
210 aa  175  4e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0355  guanylate kinase  46.03 
 
 
210 aa  175  4e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.398163  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1700  guanylate kinase  41.08 
 
 
200 aa  174  6e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4218  guanylate kinase  46.49 
 
 
214 aa  174  6e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0363  guanylate kinase  46.03 
 
 
210 aa  174  7e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000053777 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0294  guanylate kinase  48.9 
 
 
212 aa  174  7e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1329  guanylate kinase  39.39 
 
 
204 aa  174  8e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000708025  normal  0.428768 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0862  guanylate kinase  45.41 
 
 
206 aa  174  8e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.693982  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0947  guanylate kinase  45.41 
 
 
206 aa  174  8e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.0000973722  hitchhiker  0.000000351977 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3630  guanylate kinase  46.56 
 
 
224 aa  174  8e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.09026  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2715  guanylate kinase  44 
 
 
206 aa  174  9e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.446098  normal  0.772738 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1335  guanylate kinase  44.86 
 
 
206 aa  174  9e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3433  guanylate kinase  45.5 
 
 
207 aa  173  9.999999999999999e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.21703  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2158  guanylate kinase  40.8 
 
 
205 aa  174  9.999999999999999e-43  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3630  guanylate kinase  46.19 
 
 
209 aa  173  9.999999999999999e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.601224  normal  0.100424 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0100  guanylate kinase  42.86 
 
 
202 aa  173  1.9999999999999998e-42  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0912271  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0856  guanylate kinase  45.92 
 
 
216 aa  173  1.9999999999999998e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0347  guanylate kinase  43.63 
 
 
215 aa  172  1.9999999999999998e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0729  guanylate kinase  45.41 
 
 
209 aa  172  2.9999999999999996e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.148488 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2444  guanylate kinase  46.96 
 
 
203 aa  172  2.9999999999999996e-42  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.337517 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2472  guanylate kinase  46.15 
 
 
220 aa  172  3.9999999999999995e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0099  guanylate kinase  42.11 
 
 
204 aa  172  3.9999999999999995e-42  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.261524  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3936  guanylate kinase  44.9 
 
 
212 aa  172  3.9999999999999995e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3147  guanylate kinase  44.86 
 
 
206 aa  171  5.999999999999999e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4329  guanylate kinase  44.86 
 
 
206 aa  171  7.999999999999999e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.970942  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3354  guanylate kinase  47.25 
 
 
212 aa  170  1e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1791  guanylate kinase  38.5 
 
 
201 aa  170  1e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.395222  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1677  guanylate kinase  41.79 
 
 
217 aa  170  1e-41  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03505  guanylate kinase  43.35 
 
 
207 aa  169  2e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0057  Guanylate kinase  43.35 
 
 
207 aa  169  2e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03457  hypothetical protein  43.35 
 
 
207 aa  169  2e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4151  guanylate kinase  43.35 
 
 
207 aa  169  2e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07800  guanylate kinase  46.15 
 
 
189 aa  169  2e-41  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.364153  normal  0.897368 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4099  guanylate kinase  43.35 
 
 
207 aa  169  2e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0063  guanylate kinase  43.35 
 
 
207 aa  169  2e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000240109 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3983  guanylate kinase  43.35 
 
 
207 aa  169  2e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1719  guanylate kinase  39.79 
 
 
216 aa  169  2e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3859  guanylate kinase  43.35 
 
 
207 aa  169  2e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5020  guanylate kinase  43.35 
 
 
207 aa  170  2e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00153  guanylate kinase  43.56 
 
 
213 aa  169  3e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0558456  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0811  guanylate kinase  43.78 
 
 
206 aa  169  3e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.990051 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5344  guanylate kinase  46.7 
 
 
206 aa  169  3e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0394211 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2318  guanylate kinase  42.7 
 
 
198 aa  169  3e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000195285  hitchhiker  0.00462206 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3155  guanylate kinase  43.94 
 
 
220 aa  169  3e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2155  guanylate kinase  45.41 
 
 
221 aa  168  4e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000431933  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0313  guanylate kinase  41.38 
 
 
209 aa  168  4e-41  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0875391  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3583  guanylate kinase  44.32 
 
 
206 aa  168  4e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00415905  normal  0.118983 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5296  guanylate kinase  46.15 
 
 
206 aa  168  5e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0446222  normal  0.471806 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0634  guanylate kinase  46.15 
 
 
210 aa  168  5e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2000  guanylate kinase  45.88 
 
 
223 aa  168  6e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0607745  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1237  guanylate kinase  41.62 
 
 
195 aa  168  6e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.74814  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70440  guanylate kinase  44.72 
 
 
203 aa  168  6e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2277  guanylate kinase  45.88 
 
 
223 aa  168  6e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.140709  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001862  guanylate kinase  41.5 
 
 
207 aa  167  7e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1192  guanylate kinase  41.18 
 
 
207 aa  167  7e-41  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2001  guanylate kinase  39.89 
 
 
216 aa  167  7e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0091  guanylate kinase  43.35 
 
 
207 aa  167  7e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0563  guanylate kinase  46.15 
 
 
212 aa  167  8e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0717  guanylate kinase  46.15 
 
 
212 aa  167  8e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000116826 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3957  guanylate kinase  43.35 
 
 
207 aa  167  9e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4127  guanylate kinase  43.35 
 
 
207 aa  167  9e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.514606  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4020  guanylate kinase  43.35 
 
 
207 aa  167  9e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4066  guanylate kinase  43.35 
 
 
207 aa  167  9e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3948  guanylate kinase  43.35 
 
 
207 aa  167  9e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00531185 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>