More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_3630 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_3630  guanylate kinase  100 
 
 		 209 aa  433  1e-121  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.601224  normal  0.100424 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3845  guanylate kinase  52.75 
 
 		 202 aa  199  3e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0048  guanylate kinase  49.22 
 
 		 202 aa  198  3.9999999999999996e-50  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0856  guanylate kinase  47.5 
 
 		 216 aa  192  3e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0052  guanylate kinase  48.91 
 
 		 210 aa  191  5e-48  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00408303  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70440  guanylate kinase  51.04 
 
 		 203 aa  191  5e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6112  guanylate kinase  51.04 
 
 		 203 aa  191  5e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.509466  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1078  guanylate kinase  46.6 
 
 		 212 aa  191  9e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0793  guanylate kinase  46.57 
 
 		 212 aa  191  9e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.637166 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09810  Guanylate kinase  47.03 
 
 		 194 aa  189  2e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5549  guanylate kinase  47.96 
 
 		 206 aa  188  4e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.405224 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2473  guanylate kinase  47.24 
 
 		 216 aa  187  9e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.276793  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001862  guanylate kinase  49.23 
 
 		 207 aa  186  2e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2238  guanylate kinase  51.63 
 
 		 203 aa  186  3e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2280  guanylate kinase  46.04 
 
 		 229 aa  185  5e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2327  guanylate kinase  50.54 
 
 		 203 aa  184  6e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000761567  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2155  guanylate kinase  46.73 
 
 		 221 aa  184  7e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000431933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1677  guanylate kinase  47.28 
 
 		 217 aa  184  8e-46  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2276  guanylate kinase  46.23 
 
 		 221 aa  182  2.0000000000000003e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0318334  normal  0.859222 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0976  guanylate kinase  51.34 
 
 		 211 aa  183  2.0000000000000003e-45  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.194665  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00630  guanylate kinase  48.72 
 
 		 207 aa  182  3e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0210  guanylate kinase  45.54 
 
 		 207 aa  182  4.0000000000000006e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0669  guanylate kinase  46.23 
 
 		 228 aa  181  5.0000000000000004e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.877591  normal  0.744923 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1910  guanylate kinase  49.45 
 
 		 210 aa  181  5.0000000000000004e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000116154  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1956  guanylate kinase  46.23 
 
 		 221 aa  181  7e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.414906 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0473  guanylate kinase  46.8 
 
 		 209 aa  181  8.000000000000001e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0363  guanylate kinase  50 
 
 		 210 aa  181  9.000000000000001e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000053777 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3810  guanylate kinase  50 
 
 		 207 aa  181  9.000000000000001e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.18291  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2648  guanylate kinase  45.23 
 
 		 227 aa  180  1e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2096  guanylate kinase  45.23 
 
 		 227 aa  180  1e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1964  guanylate kinase  45.23 
 
 		 227 aa  180  1e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.736317  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3049  guanylate kinase  45.23 
 
 		 227 aa  180  1e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.520623  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2949  guanylate kinase  45.23 
 
 		 227 aa  180  1e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.391895  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0360  guanylate kinase  50 
 
 		 210 aa  180  1e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0815  guanylate kinase  45.23 
 
 		 227 aa  180  1e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.605718  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0353  guanylate kinase  50 
 
 		 210 aa  180  1e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0355  guanylate kinase  50 
 
 		 210 aa  180  1e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.398163  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1050  guanylate kinase  47.83 
 
 		 202 aa  181  1e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000462152 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3015  guanylate kinase  45.23 
 
 		 227 aa  180  1e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0361  guanylate kinase  50 
 
 		 207 aa  180  2e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0785  guanylate kinase  49.19 
 
 		 201 aa  179  2e-44  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000101008  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3613  guanylate kinase  49.46 
 
 		 207 aa  180  2e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0330  guanylate kinase  50 
 
 		 224 aa  180  2e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0351596  normal  0.331396 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3213  guanylate kinase  47.83 
 
 		 202 aa  179  2e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000935163  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3877  guanylate kinase  50.54 
 
 		 210 aa  179  2e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3630  guanylate kinase  49.46 
 
 		 224 aa  180  2e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.09026  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2401  guanylate kinase  45.23 
 
 		 227 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2902  guanylate kinase  48.91 
 
 		 215 aa  179  2.9999999999999997e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4019  guanylate kinase  48.65 
 
 		 204 aa  179  2.9999999999999997e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.565127  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1719  guanylate kinase  45.7 
 
 		 216 aa  178  4e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0717  guanylate kinase  50.52 
 
 		 212 aa  178  4.999999999999999e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000116826 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0563  guanylate kinase  50.52 
 
 		 212 aa  178  4.999999999999999e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0100  guanylate kinase  44.22 
 
 		 202 aa  178  4.999999999999999e-44  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0912271  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0347  guanylate kinase  42.72 
 
 		 215 aa  178  4.999999999999999e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2001  guanylate kinase  45.7 
 
 		 216 aa  178  4.999999999999999e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0985  guanylate kinase  44.22 
 
 		 207 aa  177  1e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00175631  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4107  guanylate kinase  44.72 
 
 		 227 aa  177  1e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0130992  normal  0.288359 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4124  Guanylate kinase  48.31 
 
 		 233 aa  177  1e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3260  guanylate kinase  47.12 
 
 		 221 aa  176  2e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1700  guanylate kinase  45.11 
 
 		 200 aa  176  2e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02830  guanylate kinase  45.83 
 
 		 205 aa  176  2e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5296  guanylate kinase  47.83 
 
 		 206 aa  175  3e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0446222  normal  0.471806 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3085  guanylate kinase  44.5 
 
 		 226 aa  176  3e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.831514  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0808  guanylate kinase  49.72 
 
 		 192 aa  176  3e-43  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.116088  normal  0.89906 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00153  guanylate kinase  48.15 
 
 		 213 aa  175  3e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0558456  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1586  guanylate kinase  44.22 
 
 		 227 aa  175  4e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0562043  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0905  guanylate kinase  44.5 
 
 		 225 aa  175  4e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.247766  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07800  guanylate kinase  48.17 
 
 		 189 aa  175  4e-43  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.364153  normal  0.897368 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0266  guanylate kinase  51.63 
 
 		 207 aa  175  4e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1145  guanylate kinase  43.72 
 
 		 207 aa  175  5e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.49439  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0365  guanylate kinase  48.91 
 
 		 207 aa  175  5e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5204  guanylate kinase  47.83 
 
 		 206 aa  174  6e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.952406  normal  0.288026 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0871  guanylate kinase  44.72 
 
 		 227 aa  174  7e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0859  guanylate kinase  44.72 
 
 		 227 aa  174  7e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.675802  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3426  Guanylate kinase  48.07 
 
 		 194 aa  174  8e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2084  guanylate kinase  51.41 
 
 		 207 aa  174  8e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.338387  decreased coverage  0.00871463 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5344  guanylate kinase  47.83 
 
 		 206 aa  174  9e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0394211 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2003  guanylate kinase  48.66 
 
 		 216 aa  174  9e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03505  guanylate kinase  50 
 
 		 207 aa  174  9.999999999999999e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0057  Guanylate kinase  50 
 
 		 207 aa  174  9.999999999999999e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0063  guanylate kinase  50 
 
 		 207 aa  174  9.999999999999999e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000240109 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0075  guanylate kinase  43.06 
 
 		 214 aa  173  9.999999999999999e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0211  guanylate kinase  43.06 
 
 		 214 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3859  guanylate kinase  50 
 
 		 207 aa  174  9.999999999999999e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1406  Guanylate kinase  48.39 
 
 		 202 aa  174  9.999999999999999e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.77411  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03457  hypothetical protein  50 
 
 		 207 aa  174  9.999999999999999e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4151  guanylate kinase  50 
 
 		 207 aa  174  9.999999999999999e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4099  guanylate kinase  50 
 
 		 207 aa  174  9.999999999999999e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0099  guanylate kinase  47.22 
 
 		 204 aa  174  9.999999999999999e-43  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.261524  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3983  guanylate kinase  50 
 
 		 207 aa  174  9.999999999999999e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3894  guanylate kinase  46.74 
 
 		 200 aa  174  9.999999999999999e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000112061  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2401  guanylate kinase  46.19 
 
 		 202 aa  173  9.999999999999999e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0298091  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0091  guanylate kinase  49.46 
 
 		 207 aa  172  1.9999999999999998e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1285  guanylate kinase  49.19 
 
 		 210 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000194386  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4388  guanylate kinase  46.99 
 
 		 205 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.11044 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2715  guanylate kinase  45.65 
 
 		 206 aa  172  1.9999999999999998e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.446098  normal  0.772738 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0634  guanylate kinase  48.02 
 
 		 210 aa  173  1.9999999999999998e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0520  guanylate kinase  44.22 
 
 		 227 aa  171  5e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0999  guanylate kinase  44.22 
 
 		 227 aa  171  5e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3936  guanylate kinase  47.47 
 
 		 212 aa  171  5e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>