More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_1237 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008346  Swol_1237  guanylate kinase  100 
 
 
195 aa  404  1.0000000000000001e-112  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.74814  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1761  guanylate kinase  55.08 
 
 
207 aa  233  2.0000000000000002e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1700  guanylate kinase  54.36 
 
 
200 aa  221  6e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1329  guanylate kinase  50.77 
 
 
204 aa  215  2.9999999999999998e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000708025  normal  0.428768 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2318  guanylate kinase  53.19 
 
 
198 aa  210  1e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000195285  hitchhiker  0.00462206 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09810  Guanylate kinase  53.48 
 
 
194 aa  208  5e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1719  guanylate kinase  49.74 
 
 
216 aa  207  9e-53  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1597  guanylate kinase  51.35 
 
 
197 aa  206  2e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00198885  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2001  guanylate kinase  49.21 
 
 
216 aa  205  3e-52  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1058  guanylate kinase  49.75 
 
 
204 aa  204  9e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000145749  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3894  guanylate kinase  51.08 
 
 
200 aa  203  1e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000112061  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1713  guanylate kinase  51.81 
 
 
198 aa  203  1e-51  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.463283  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1791  guanylate kinase  46.81 
 
 
201 aa  197  1.0000000000000001e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.395222  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0962  guanylate kinase  48.13 
 
 
202 aa  195  3e-49  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0132271  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1948  guanylate kinase  47.96 
 
 
205 aa  195  4.0000000000000005e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3155  guanylate kinase  49.21 
 
 
220 aa  194  6e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2974  guanylate kinase  48.15 
 
 
219 aa  192  2e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.291122 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3613  guanylate kinase  49.47 
 
 
207 aa  192  3e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0330  guanylate kinase  49.73 
 
 
224 aa  191  5e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0351596  normal  0.331396 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07800  guanylate kinase  52.13 
 
 
189 aa  191  7e-48  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.364153  normal  0.897368 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2158  guanylate kinase  47.62 
 
 
205 aa  191  8e-48  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0361  guanylate kinase  48.4 
 
 
207 aa  190  1e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0840  guanylate kinase  49.46 
 
 
202 aa  189  2e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3213  guanylate kinase  45.83 
 
 
202 aa  189  2e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000935163  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3845  guanylate kinase  48.89 
 
 
202 aa  188  2.9999999999999997e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1035  guanylate kinase  47.67 
 
 
199 aa  189  2.9999999999999997e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1050  guanylate kinase  45.83 
 
 
202 aa  188  2.9999999999999997e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000462152 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3810  guanylate kinase  48.94 
 
 
207 aa  189  2.9999999999999997e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.18291  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1677  guanylate kinase  47.57 
 
 
217 aa  188  5e-47  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2472  guanylate kinase  47.09 
 
 
220 aa  187  5.999999999999999e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3479  guanylate kinase  47.62 
 
 
220 aa  187  9e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4145  guanylate kinase  48.97 
 
 
207 aa  187  9e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0360  guanylate kinase  49.2 
 
 
210 aa  187  1e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0355  guanylate kinase  49.2 
 
 
210 aa  187  1e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.398163  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0363  guanylate kinase  49.2 
 
 
210 aa  187  1e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000053777 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0353  guanylate kinase  49.2 
 
 
210 aa  187  1e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0577  guanylate kinase  50.52 
 
 
204 aa  186  1e-46  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.213259  normal  0.177715 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0976  guanylate kinase  50 
 
 
211 aa  186  2e-46  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.194665  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3630  guanylate kinase  48.66 
 
 
224 aa  186  2e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.09026  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4384  guanylate kinase  48.11 
 
 
207 aa  185  3e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3623  guanylate kinase  47.87 
 
 
207 aa  184  5e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3877  guanylate kinase  48.4 
 
 
210 aa  185  5e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1683  guanylate kinase  47.62 
 
 
219 aa  184  7e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3948  guanylate kinase  47.94 
 
 
207 aa  184  7e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.498976  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3694  guanylate kinase  48.94 
 
 
205 aa  184  8e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03505  guanylate kinase  48.45 
 
 
207 aa  183  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0057  Guanylate kinase  48.45 
 
 
207 aa  183  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3914  guanylate kinase  48.94 
 
 
214 aa  183  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3722  guanylate kinase  48.94 
 
 
205 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3612  guanylate kinase  48.94 
 
 
214 aa  183  1.0000000000000001e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3630  guanylate kinase  48.94 
 
 
214 aa  183  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3885  guanylate kinase  48.94 
 
 
205 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000575833 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3919  guanylate kinase  48.94 
 
 
205 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.364605  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4151  guanylate kinase  48.45 
 
 
207 aa  183  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3859  guanylate kinase  48.45 
 
 
207 aa  183  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2327  guanylate kinase  45.21 
 
 
203 aa  183  1.0000000000000001e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000761567  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4009  guanylate kinase  48.94 
 
 
205 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4099  guanylate kinase  48.45 
 
 
207 aa  183  1.0000000000000001e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03457  hypothetical protein  48.45 
 
 
207 aa  183  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1273  guanylate kinase  48.94 
 
 
205 aa  183  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.213463  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0063  guanylate kinase  48.45 
 
 
207 aa  183  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000240109 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3970  guanylate kinase  48.94 
 
 
205 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0125676  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4581  guanylate kinase  47.87 
 
 
207 aa  183  1.0000000000000001e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.877029  unclonable  0.0000000250462 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3983  guanylate kinase  48.45 
 
 
207 aa  183  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1176  guanylate kinase  46.43 
 
 
206 aa  182  2.0000000000000003e-45  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000749098  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0759  guanylate kinase  47.06 
 
 
219 aa  182  2.0000000000000003e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.784504  normal  0.122144 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2238  guanylate kinase  44.68 
 
 
203 aa  182  3e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1780  guanylate kinase  48.94 
 
 
206 aa  182  3e-45  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0438453  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0407  guanylate kinase  48.94 
 
 
206 aa  182  3e-45  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.360667  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1231  guanylate kinase  48.4 
 
 
198 aa  182  3e-45  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.726797  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3433  guanylate kinase  47.06 
 
 
207 aa  181  4.0000000000000006e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.21703  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2348  guanylate kinase  47.62 
 
 
219 aa  182  4.0000000000000006e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0266  guanylate kinase  49.73 
 
 
207 aa  181  4.0000000000000006e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0336  guanylate kinase  47.34 
 
 
207 aa  181  5.0000000000000004e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.57704 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3823  guanylate kinase  45.5 
 
 
219 aa  181  6e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.162212 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2523  guanylate kinase  47.87 
 
 
205 aa  181  6e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0052  guanylate kinase  49.46 
 
 
210 aa  181  6e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00408303  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3957  guanylate kinase  47.94 
 
 
207 aa  181  7e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4127  guanylate kinase  47.94 
 
 
207 aa  181  7e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.514606  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3948  guanylate kinase  47.94 
 
 
207 aa  181  7e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00531185 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4066  guanylate kinase  47.94 
 
 
207 aa  181  7e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4020  guanylate kinase  47.94 
 
 
207 aa  181  7e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5020  guanylate kinase  47.94 
 
 
207 aa  181  8.000000000000001e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0091  guanylate kinase  47.94 
 
 
207 aa  181  8.000000000000001e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2444  guanylate kinase  48.39 
 
 
203 aa  180  9.000000000000001e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.337517 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2975  guanylate kinase  48.13 
 
 
204 aa  179  2e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1535  guanylate kinase  44.39 
 
 
220 aa  179  2e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0748909  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1319  guanylate kinase  48.42 
 
 
224 aa  179  2e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.773987  normal  0.110661 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0099  guanylate kinase  42.33 
 
 
204 aa  179  2.9999999999999997e-44  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.261524  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2715  guanylate kinase  46.88 
 
 
206 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.446098  normal  0.772738 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1763  guanylate kinase  44.97 
 
 
218 aa  179  2.9999999999999997e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.201865  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3497  guanylate kinase  45.74 
 
 
207 aa  178  4e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2093  guanylate kinase  48.91 
 
 
223 aa  178  4.999999999999999e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.353708  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4867  guanylate kinase  50 
 
 
207 aa  177  5.999999999999999e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.807857  hitchhiker  0.00555507 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0365  guanylate kinase  45.99 
 
 
207 aa  177  7e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0776  guanylate kinase  45.16 
 
 
207 aa  176  1e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.753859  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0313  guanylate kinase  45.88 
 
 
209 aa  176  1e-43  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0875391  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2305  guanylate kinase  46.03 
 
 
219 aa  177  1e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00214709  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2834  guanylate kinase  47.78 
 
 
186 aa  176  2e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.522471  normal  0.276726 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0251  guanylate kinase  44.74 
 
 
207 aa  176  2e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000337673  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>