More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_2348 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_2348  guanylate kinase  100 
 
 		 219 aa  446  1.0000000000000001e-124  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1683  guanylate kinase  89.95 
 
 		 219 aa  397  9.999999999999999e-111  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3823  guanylate kinase  86.76 
 
 		 219 aa  389  1e-107  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.162212 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2305  guanylate kinase  82.57 
 
 		 219 aa  365  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00214709  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2974  guanylate kinase  73.24 
 
 		 219 aa  326  1.0000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.291122 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3479  guanylate kinase  73.11 
 
 		 220 aa  321  6e-87  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2472  guanylate kinase  72.04 
 
 		 220 aa  318  3.9999999999999996e-86  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2714  guanylate kinase  63.05 
 
 		 213 aa  265  5e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3136  guanylate kinase  62.93 
 
 		 231 aa  262  3e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.328978 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0429  guanylate kinase  62.25 
 
 		 218 aa  261  4e-69  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3155  guanylate kinase  59.81 
 
 		 220 aa  261  4.999999999999999e-69  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1535  guanylate kinase  57.64 
 
 		 220 aa  247  1e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0748909  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2277  guanylate kinase  57.77 
 
 		 223 aa  244  6.999999999999999e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.140709  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2000  guanylate kinase  57.77 
 
 		 223 aa  244  6.999999999999999e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0607745  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3354  guanylate kinase  60.58 
 
 		 212 aa  243  1.9999999999999999e-63  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1062  guanylate kinase  56.65 
 
 		 220 aa  242  3e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0143004 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1003  guanylate kinase  61.84 
 
 		 221 aa  239  2.9999999999999997e-62  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1205  guanylate kinase  56.65 
 
 		 220 aa  238  5e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.197853  hitchhiker  0.00108752 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1104  guanylate kinase  56.04 
 
 		 211 aa  236  2e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.631702  normal  0.011032 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0759  guanylate kinase  57.14 
 
 		 219 aa  236  3e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.784504  normal  0.122144 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1953  guanylate kinase  55.83 
 
 		 223 aa  234  5.0000000000000005e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.217119  normal  0.0786696 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1563  guanylate kinase  56.25 
 
 		 211 aa  232  3e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.106259  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2919  guanylate kinase  56.25 
 
 		 211 aa  231  6e-60  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3936  guanylate kinase  54.11 
 
 		 212 aa  228  4e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1763  guanylate kinase  56 
 
 		 218 aa  228  5e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.201865  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1529  guanylate kinase  54.81 
 
 		 217 aa  225  5.0000000000000005e-58  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.2579 
 
 
-
 
NC_004310  BR0464  guanylate kinase  54.37 
 
 		 220 aa  223  2e-57  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.328382  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0469  guanylate kinase  54.37 
 
 		 220 aa  223  2e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.149667  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0576  guanylate kinase  54.19 
 
 		 220 aa  221  9.999999999999999e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.400734  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3193  guanylate kinase  57.21 
 
 		 219 aa  220  9.999999999999999e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0391032 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2781  guanylate kinase  56.72 
 
 		 219 aa  218  7e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2440  guanylate kinase  51.43 
 
 		 218 aa  214  8e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000682251 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1845  guanylate kinase  52.13 
 
 		 230 aa  214  9.999999999999999e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0502  guanylate kinase  50.99 
 
 		 221 aa  212  2.9999999999999995e-54  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0988  guanylate kinase  51.43 
 
 		 234 aa  212  2.9999999999999995e-54  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0107524 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1220  guanylate kinase  53.92 
 
 		 218 aa  210  1e-53  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.289802 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3720  guanylate kinase  54.25 
 
 		 220 aa  209  2e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0647286  normal  0.109171 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1266  guanylate kinase  48.8 
 
 		 217 aa  207  9e-53  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.979121  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2523  guanylate kinase  47.78 
 
 		 214 aa  205  4e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0976  guanylate kinase  51.5 
 
 		 211 aa  202  5e-51  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.194665  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2975  guanylate kinase  51.58 
 
 		 204 aa  199  3e-50  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001862  guanylate kinase  49.48 
 
 		 207 aa  198  6e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00630  guanylate kinase  48.96 
 
 		 207 aa  196  2.0000000000000003e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2280  guanylate kinase  47.55 
 
 		 229 aa  196  2.0000000000000003e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0322  guanylate kinase  45.19 
 
 		 209 aa  196  2.0000000000000003e-49  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.254004  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2444  guanylate kinase  51.03 
 
 		 203 aa  195  4.0000000000000005e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.337517 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1290  guanylate kinase  50.75 
 
 		 205 aa  191  6e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.609971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0336  guanylate kinase  50.54 
 
 		 207 aa  191  6e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.57704 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1457  guanylate kinase  47.06 
 
 		 212 aa  191  8e-48  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4145  guanylate kinase  48.96 
 
 		 207 aa  191  1e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0681  guanylate kinase  45.81 
 
 		 209 aa  190  1e-47  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5842  guanylate kinase  49.49 
 
 		 259 aa  189  2e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.509377 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0363  guanylate kinase  48.92 
 
 		 210 aa  189  2.9999999999999997e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000053777 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3630  guanylate kinase  49.46 
 
 		 224 aa  189  2.9999999999999997e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.09026  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0360  guanylate kinase  48.92 
 
 		 210 aa  189  4e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0353  guanylate kinase  48.92 
 
 		 210 aa  189  4e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0355  guanylate kinase  48.92 
 
 		 210 aa  189  4e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.398163  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0251  guanylate kinase  49.74 
 
 		 207 aa  189  4e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000337673  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3613  guanylate kinase  48.39 
 
 		 207 aa  187  7e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0330  guanylate kinase  48.39 
 
 		 224 aa  187  9e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0351596  normal  0.331396 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3957  guanylate kinase  47.92 
 
 		 207 aa  187  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4020  guanylate kinase  47.92 
 
 		 207 aa  187  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4127  guanylate kinase  47.92 
 
 		 207 aa  187  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.514606  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4581  guanylate kinase  49.46 
 
 		 207 aa  187  1e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.877029  unclonable  0.0000000250462 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4066  guanylate kinase  47.92 
 
 		 207 aa  187  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0210  guanylate kinase  48.19 
 
 		 207 aa  187  1e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3497  guanylate kinase  47.87 
 
 		 207 aa  187  1e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3948  guanylate kinase  47.92 
 
 		 207 aa  187  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00531185 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03505  guanylate kinase  47.92 
 
 		 207 aa  186  2e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0057  Guanylate kinase  47.92 
 
 		 207 aa  186  2e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3983  guanylate kinase  47.92 
 
 		 207 aa  186  2e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4099  guanylate kinase  47.92 
 
 		 207 aa  186  2e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0063  guanylate kinase  47.92 
 
 		 207 aa  186  2e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000240109 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03457  hypothetical protein  47.92 
 
 		 207 aa  186  2e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3810  guanylate kinase  48.39 
 
 		 207 aa  186  2e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.18291  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3877  guanylate kinase  48.39 
 
 		 210 aa  187  2e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4388  guanylate kinase  49.72 
 
 		 205 aa  186  2e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.11044 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4151  guanylate kinase  47.92 
 
 		 207 aa  186  2e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3859  guanylate kinase  47.92 
 
 		 207 aa  186  2e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0266  guanylate kinase  50 
 
 		 207 aa  185  4e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5020  guanylate kinase  47.92 
 
 		 207 aa  185  4e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2003  guanylate kinase  50.54 
 
 		 216 aa  185  5e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0361  guanylate kinase  47.31 
 
 		 207 aa  185  5e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1987  guanylate kinase  46.7 
 
 		 209 aa  184  7e-46  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1700  guanylate kinase  48.13 
 
 		 200 aa  184  8e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3948  guanylate kinase  48.72 
 
 		 207 aa  184  9e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.498976  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0045  guanylate kinase  46.35 
 
 		 207 aa  184  1.0000000000000001e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1992  guanylate kinase  46.19 
 
 		 209 aa  184  1.0000000000000001e-45  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3433  guanylate kinase  48.39 
 
 		 207 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.21703  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3233  guanylate kinase  48.15 
 
 		 215 aa  183  1.0000000000000001e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4176  guanylate kinase  46.35 
 
 		 207 aa  183  2.0000000000000003e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0297777  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0041  guanylate kinase  46.35 
 
 		 207 aa  183  2.0000000000000003e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02830  guanylate kinase  47.94 
 
 		 205 aa  182  3e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0365  guanylate kinase  46.77 
 
 		 207 aa  182  3e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1237  guanylate kinase  47.62 
 
 		 195 aa  182  4.0000000000000006e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.74814  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0091  guanylate kinase  46.88 
 
 		 207 aa  182  4.0000000000000006e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2138  guanylate kinase  48.63 
 
 		 205 aa  182  5.0000000000000004e-45  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.585915  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0100  guanylate kinase  43.35 
 
 		 202 aa  181  9.000000000000001e-45  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0912271  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00153  guanylate kinase  44.85 
 
 		 213 aa  181  9.000000000000001e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0558456  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4867  guanylate kinase  49.19 
 
 		 207 aa  180  1e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.807857  hitchhiker  0.00555507 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>