More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_0988 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_0988  guanylate kinase  100 
 
 		 234 aa  476  1e-133  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0107524 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1290  guanylate kinase  75.25 
 
 		 205 aa  295  5e-79  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.609971  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1953  guanylate kinase  63.59 
 
 		 223 aa  265  5e-70  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.217119  normal  0.0786696 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2277  guanylate kinase  62.62 
 
 		 223 aa  261  6.999999999999999e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.140709  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2000  guanylate kinase  62.62 
 
 		 223 aa  261  6.999999999999999e-69  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0607745  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3720  guanylate kinase  62.79 
 
 		 220 aa  258  7e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0647286  normal  0.109171 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1763  guanylate kinase  58.94 
 
 		 218 aa  254  5e-67  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.201865  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1062  guanylate kinase  58.74 
 
 		 220 aa  248  6e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0143004 
 
 
-
 
NC_004310  BR0464  guanylate kinase  54.21 
 
 		 220 aa  247  9e-65  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.328382  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0469  guanylate kinase  54.21 
 
 		 220 aa  247  9e-65  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.149667  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0576  guanylate kinase  54.21 
 
 		 220 aa  247  1e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.400734  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1535  guanylate kinase  55.56 
 
 		 220 aa  243  1.9999999999999999e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0748909  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1205  guanylate kinase  57.28 
 
 		 220 aa  241  9e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.197853  hitchhiker  0.00108752 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3193  guanylate kinase  64.08 
 
 		 219 aa  241  1e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0391032 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0759  guanylate kinase  57 
 
 		 219 aa  238  5.999999999999999e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.784504  normal  0.122144 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2781  guanylate kinase  63.11 
 
 		 219 aa  237  1e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0502  guanylate kinase  53.08 
 
 		 221 aa  231  9e-60  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1683  guanylate kinase  52.38 
 
 		 219 aa  219  3.9999999999999997e-56  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2974  guanylate kinase  50.95 
 
 		 219 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.291122 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2348  guanylate kinase  51.43 
 
 		 219 aa  212  2.9999999999999995e-54  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3155  guanylate kinase  50.73 
 
 		 220 aa  213  2.9999999999999995e-54  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2305  guanylate kinase  50.49 
 
 		 219 aa  211  1e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00214709  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2472  guanylate kinase  49.76 
 
 		 220 aa  208  6e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3479  guanylate kinase  49.76 
 
 		 220 aa  205  4e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3823  guanylate kinase  49.52 
 
 		 219 aa  205  6e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.162212 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2714  guanylate kinase  49.51 
 
 		 213 aa  204  1e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2440  guanylate kinase  53.16 
 
 		 218 aa  201  9.999999999999999e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000682251 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3354  guanylate kinase  51.47 
 
 		 212 aa  200  9.999999999999999e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3936  guanylate kinase  49.04 
 
 		 212 aa  201  9.999999999999999e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1104  guanylate kinase  53.85 
 
 		 211 aa  199  3.9999999999999996e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.631702  normal  0.011032 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1845  guanylate kinase  47.29 
 
 		 230 aa  196  4.0000000000000005e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2523  guanylate kinase  46.41 
 
 		 214 aa  195  4.0000000000000005e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1563  guanylate kinase  52.38 
 
 		 211 aa  191  6e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.106259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3136  guanylate kinase  48.77 
 
 		 231 aa  191  7e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.328978 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2919  guanylate kinase  52.38 
 
 		 211 aa  191  1e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1529  guanylate kinase  50.26 
 
 		 217 aa  189  2e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.2579 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0429  guanylate kinase  52.36 
 
 		 218 aa  189  2.9999999999999997e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1266  guanylate kinase  46.73 
 
 		 217 aa  185  5e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.979121  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1003  guanylate kinase  50.45 
 
 		 221 aa  185  7e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0726  guanylate kinase  46.12 
 
 		 206 aa  181  6e-45  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5842  guanylate kinase  44.62 
 
 		 259 aa  180  1e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.509377 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1220  guanylate kinase  46.15 
 
 		 218 aa  181  1e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.289802 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4019  guanylate kinase  47.8 
 
 		 204 aa  179  2.9999999999999997e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.565127  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03505  guanylate kinase  46.57 
 
 		 207 aa  175  5e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0057  Guanylate kinase  46.57 
 
 		 207 aa  175  5e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3983  guanylate kinase  46.57 
 
 		 207 aa  175  5e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3859  guanylate kinase  46.57 
 
 		 207 aa  175  5e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0063  guanylate kinase  46.57 
 
 		 207 aa  175  5e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000240109 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4151  guanylate kinase  46.57 
 
 		 207 aa  175  5e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0048  guanylate kinase  47.06 
 
 		 202 aa  175  5e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4099  guanylate kinase  46.57 
 
 		 207 aa  175  5e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03457  hypothetical protein  46.57 
 
 		 207 aa  175  5e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0347  guanylate kinase  41.71 
 
 		 215 aa  175  6e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0251  guanylate kinase  46.31 
 
 		 207 aa  175  6e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000337673  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1285  guanylate kinase  44.23 
 
 		 210 aa  175  7e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000194386  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5020  guanylate kinase  46.57 
 
 		 207 aa  174  9e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0363  guanylate kinase  42.36 
 
 		 210 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000053777 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0355  guanylate kinase  42.36 
 
 		 210 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.398163  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0353  guanylate kinase  42.36 
 
 		 210 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0360  guanylate kinase  42.36 
 
 		 210 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3957  guanylate kinase  46.08 
 
 		 207 aa  173  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4127  guanylate kinase  46.08 
 
 		 207 aa  173  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.514606  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4066  guanylate kinase  46.08 
 
 		 207 aa  173  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3623  guanylate kinase  46.15 
 
 		 207 aa  173  1.9999999999999998e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3948  guanylate kinase  46.08 
 
 		 207 aa  173  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00531185 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4020  guanylate kinase  46.08 
 
 		 207 aa  173  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00630  guanylate kinase  41.75 
 
 		 207 aa  172  5e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2444  guanylate kinase  44.06 
 
 		 203 aa  172  5e-42  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.337517 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1597  guanylate kinase  47.09 
 
 		 197 aa  171  5.999999999999999e-42  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00198885  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1457  guanylate kinase  45.37 
 
 		 212 aa  171  7.999999999999999e-42  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0045  guanylate kinase  46.57 
 
 		 207 aa  171  9e-42  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1761  guanylate kinase  43.01 
 
 		 207 aa  170  1e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0336  guanylate kinase  41.38 
 
 		 207 aa  171  1e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.57704 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0091  guanylate kinase  45.59 
 
 		 207 aa  170  1e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3497  guanylate kinase  44.32 
 
 		 207 aa  171  1e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001862  guanylate kinase  41.26 
 
 		 207 aa  171  1e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0041  guanylate kinase  46.57 
 
 		 207 aa  170  2e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4176  guanylate kinase  46.57 
 
 		 207 aa  170  2e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0297777  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00153  guanylate kinase  44.56 
 
 		 213 aa  170  2e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0558456  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3948  guanylate kinase  45.1 
 
 		 207 aa  169  3e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.498976  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4581  guanylate kinase  44.32 
 
 		 207 aa  169  3e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.877029  unclonable  0.0000000250462 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3877  guanylate kinase  40.39 
 
 		 210 aa  169  3e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3845  guanylate kinase  49.45 
 
 		 202 aa  169  3e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2327  guanylate kinase  45.18 
 
 		 203 aa  169  3e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000761567  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3613  guanylate kinase  40.39 
 
 		 207 aa  169  3e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0330  guanylate kinase  40.89 
 
 		 224 aa  169  3e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0351596  normal  0.331396 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3810  guanylate kinase  40.89 
 
 		 207 aa  169  3e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.18291  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0099  guanylate kinase  42.63 
 
 		 204 aa  169  4e-41  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.261524  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3433  guanylate kinase  44.32 
 
 		 207 aa  169  5e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.21703  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3260  guanylate kinase  44.23 
 
 		 221 aa  168  6e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0361  guanylate kinase  40.39 
 
 		 207 aa  167  9e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2280  guanylate kinase  41.75 
 
 		 229 aa  168  9e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3630  guanylate kinase  40.39 
 
 		 224 aa  167  1e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.09026  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1406  Guanylate kinase  50.54 
 
 		 202 aa  167  1e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.77411  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0322  guanylate kinase  41.23 
 
 		 209 aa  166  2e-40  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.254004  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2001  guanylate kinase  41.88 
 
 		 216 aa  167  2e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1719  guanylate kinase  41.67 
 
 		 216 aa  167  2e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1237  guanylate kinase  47.09 
 
 		 195 aa  166  2e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.74814  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2715  guanylate kinase  46.23 
 
 		 206 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.446098  normal  0.772738 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1447  guanylate kinase  46.07 
 
 		 193 aa  166  2.9999999999999998e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.373553  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>