More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_1447 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_1447  guanylate kinase  100 
 
 
193 aa  386  1e-106  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.373553  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1845  guanylate kinase  57.29 
 
 
230 aa  219  1.9999999999999999e-56  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3936  guanylate kinase  52.85 
 
 
212 aa  199  1.9999999999999998e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3354  guanylate kinase  54.95 
 
 
212 aa  194  8.000000000000001e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3155  guanylate kinase  52.08 
 
 
220 aa  192  2e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1104  guanylate kinase  50.26 
 
 
211 aa  185  3e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.631702  normal  0.011032 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1563  guanylate kinase  50.26 
 
 
211 aa  185  3e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.106259  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2919  guanylate kinase  50.26 
 
 
211 aa  184  6e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0355  guanylate kinase  50 
 
 
210 aa  182  3e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.398163  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0360  guanylate kinase  50 
 
 
210 aa  182  3e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0353  guanylate kinase  50 
 
 
210 aa  182  3e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2280  guanylate kinase  48.7 
 
 
229 aa  182  4.0000000000000006e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3136  guanylate kinase  48.97 
 
 
231 aa  181  6e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.328978 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0634  guanylate kinase  50.81 
 
 
210 aa  181  6e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0363  guanylate kinase  49.48 
 
 
210 aa  181  6e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000053777 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0429  guanylate kinase  49.48 
 
 
218 aa  179  2.9999999999999997e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3630  guanylate kinase  50.26 
 
 
224 aa  178  4e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.09026  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3810  guanylate kinase  49.21 
 
 
207 aa  178  4e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.18291  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001862  guanylate kinase  47.67 
 
 
207 aa  178  4.999999999999999e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2444  guanylate kinase  50.27 
 
 
203 aa  177  5.999999999999999e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.337517 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1457  guanylate kinase  49.74 
 
 
212 aa  177  1e-43  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0361  guanylate kinase  48.68 
 
 
207 aa  176  2e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3877  guanylate kinase  47.4 
 
 
210 aa  176  2e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2348  guanylate kinase  51.04 
 
 
219 aa  176  2e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3613  guanylate kinase  48.15 
 
 
207 aa  176  2e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0330  guanylate kinase  48.68 
 
 
224 aa  176  2e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0351596  normal  0.331396 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5296  guanylate kinase  47.34 
 
 
206 aa  176  3e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0446222  normal  0.471806 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3845  guanylate kinase  51.09 
 
 
202 aa  175  3e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00630  guanylate kinase  47.15 
 
 
207 aa  175  4e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2472  guanylate kinase  48.96 
 
 
220 aa  174  5e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0210  guanylate kinase  47.64 
 
 
207 aa  174  6e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2974  guanylate kinase  49.48 
 
 
219 aa  174  7e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.291122 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1763  guanylate kinase  45.83 
 
 
218 aa  174  8e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.201865  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2305  guanylate kinase  47.92 
 
 
219 aa  172  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00214709  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4581  guanylate kinase  47.62 
 
 
207 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.877029  unclonable  0.0000000250462 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5204  guanylate kinase  46.81 
 
 
206 aa  172  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.952406  normal  0.288026 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1003  guanylate kinase  50 
 
 
221 aa  172  2.9999999999999996e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3479  guanylate kinase  49.48 
 
 
220 aa  172  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0091  guanylate kinase  47.64 
 
 
207 aa  172  2.9999999999999996e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4145  guanylate kinase  48.69 
 
 
207 aa  171  3.9999999999999995e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1683  guanylate kinase  49.48 
 
 
219 aa  171  5.999999999999999e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3623  guanylate kinase  46.43 
 
 
207 aa  171  5.999999999999999e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0759  guanylate kinase  46.32 
 
 
219 aa  171  6.999999999999999e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.784504  normal  0.122144 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4127  guanylate kinase  47.64 
 
 
207 aa  170  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.514606  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4066  guanylate kinase  47.64 
 
 
207 aa  170  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4020  guanylate kinase  47.64 
 
 
207 aa  170  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3957  guanylate kinase  47.64 
 
 
207 aa  170  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0266  guanylate kinase  45.64 
 
 
207 aa  170  1e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00153  guanylate kinase  48.68 
 
 
213 aa  170  1e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0558456  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3433  guanylate kinase  45.83 
 
 
207 aa  170  1e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.21703  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3948  guanylate kinase  47.64 
 
 
207 aa  170  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00531185 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5344  guanylate kinase  45.74 
 
 
206 aa  170  1e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0394211 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0336  guanylate kinase  48.15 
 
 
207 aa  169  2e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.57704 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0407  guanylate kinase  47.34 
 
 
206 aa  169  2e-41  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.360667  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2003  guanylate kinase  48.11 
 
 
216 aa  169  2e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1780  guanylate kinase  47.34 
 
 
206 aa  169  2e-41  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0438453  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0976  guanylate kinase  49.47 
 
 
211 aa  169  3e-41  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.194665  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0177  guanylate kinase  45.21 
 
 
206 aa  169  3e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000695034 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3497  guanylate kinase  46.56 
 
 
207 aa  169  3e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1529  guanylate kinase  45.99 
 
 
217 aa  169  3e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.2579 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1266  guanylate kinase  45.74 
 
 
217 aa  169  3e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.979121  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3948  guanylate kinase  48.17 
 
 
207 aa  168  4e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.498976  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03505  guanylate kinase  47.12 
 
 
207 aa  168  5e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0057  Guanylate kinase  47.12 
 
 
207 aa  168  5e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3983  guanylate kinase  47.12 
 
 
207 aa  168  5e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4099  guanylate kinase  47.12 
 
 
207 aa  168  5e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2138  guanylate kinase  46.99 
 
 
205 aa  168  5e-41  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.585915  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0063  guanylate kinase  47.12 
 
 
207 aa  168  5e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000240109 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3859  guanylate kinase  47.12 
 
 
207 aa  168  5e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0347  guanylate kinase  45.55 
 
 
215 aa  168  5e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4151  guanylate kinase  47.12 
 
 
207 aa  168  5e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0365  guanylate kinase  46.35 
 
 
207 aa  168  5e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03457  hypothetical protein  47.12 
 
 
207 aa  168  5e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3823  guanylate kinase  47.92 
 
 
219 aa  167  6e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.162212 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02367  guanylate kinase  48.63 
 
 
203 aa  167  6e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0717  guanylate kinase  48.65 
 
 
212 aa  166  2e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000116826 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0563  guanylate kinase  48.65 
 
 
212 aa  166  2e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0988  guanylate kinase  46.07 
 
 
234 aa  166  2e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0107524 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5020  guanylate kinase  46.6 
 
 
207 aa  165  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0045  guanylate kinase  47.12 
 
 
207 aa  165  2.9999999999999998e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2440  guanylate kinase  43.92 
 
 
218 aa  165  2.9999999999999998e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000682251 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2975  guanylate kinase  48.17 
 
 
204 aa  165  4e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0048  guanylate kinase  47.03 
 
 
202 aa  165  4e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0251  guanylate kinase  44.85 
 
 
207 aa  165  4e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000337673  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0041  guanylate kinase  47.12 
 
 
207 aa  164  5e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4867  guanylate kinase  47.28 
 
 
207 aa  165  5e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.807857  hitchhiker  0.00555507 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4176  guanylate kinase  47.12 
 
 
207 aa  164  5e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0297777  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1062  guanylate kinase  43.16 
 
 
220 aa  164  5.9999999999999996e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0143004 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3260  guanylate kinase  49.19 
 
 
221 aa  164  6.9999999999999995e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3695  guanylate kinase  47.87 
 
 
225 aa  164  6.9999999999999995e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.241605 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1220  guanylate kinase  50 
 
 
218 aa  164  6.9999999999999995e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.289802 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4019  guanylate kinase  47.62 
 
 
204 aa  164  8e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.565127  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4384  guanylate kinase  44.09 
 
 
207 aa  164  1.0000000000000001e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1987  guanylate kinase  45.6 
 
 
209 aa  163  1.0000000000000001e-39  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1535  guanylate kinase  43.16 
 
 
220 aa  163  1.0000000000000001e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0748909  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2714  guanylate kinase  45.31 
 
 
213 aa  163  1.0000000000000001e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3233  guanylate kinase  46.32 
 
 
215 aa  164  1.0000000000000001e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2401  guanylate kinase  47.12 
 
 
227 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0871  guanylate kinase  47.12 
 
 
227 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0859  guanylate kinase  47.12 
 
 
227 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.675802  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>