More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_1535 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_1535  guanylate kinase  100 
 
 		 220 aa  452  1.0000000000000001e-126  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0748909  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1205  guanylate kinase  83.18 
 
 		 220 aa  380  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.197853  hitchhiker  0.00108752 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1062  guanylate kinase  83.18 
 
 		 220 aa  381  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0143004 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0759  guanylate kinase  76.61 
 
 		 219 aa  350  7e-96  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.784504  normal  0.122144 
 
 
-
 
NC_004310  BR0464  guanylate kinase  66.06 
 
 		 220 aa  314  7e-85  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.328382  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0469  guanylate kinase  66.06 
 
 		 220 aa  314  7e-85  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.149667  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0576  guanylate kinase  66.67 
 
 		 220 aa  313  1.9999999999999998e-84  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.400734  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1763  guanylate kinase  67.13 
 
 		 218 aa  303  1.0000000000000001e-81  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.201865  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1953  guanylate kinase  58.41 
 
 		 223 aa  265  2.9999999999999995e-70  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.217119  normal  0.0786696 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2277  guanylate kinase  57.94 
 
 		 223 aa  261  6.999999999999999e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.140709  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2000  guanylate kinase  57.94 
 
 		 223 aa  261  6.999999999999999e-69  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0607745  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0502  guanylate kinase  58.02 
 
 		 221 aa  257  8e-68  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3720  guanylate kinase  61.11 
 
 		 220 aa  257  9e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0647286  normal  0.109171 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2348  guanylate kinase  57.64 
 
 		 219 aa  247  1e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0429  guanylate kinase  55.87 
 
 		 218 aa  244  4.9999999999999997e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0988  guanylate kinase  55.56 
 
 		 234 aa  243  9.999999999999999e-64  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0107524 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3823  guanylate kinase  56.65 
 
 		 219 aa  243  1.9999999999999999e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.162212 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3155  guanylate kinase  54.37 
 
 		 220 aa  243  1.9999999999999999e-63  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1683  guanylate kinase  55.67 
 
 		 219 aa  241  6e-63  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3193  guanylate kinase  57.67 
 
 		 219 aa  241  6e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0391032 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2781  guanylate kinase  56.22 
 
 		 219 aa  239  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1290  guanylate kinase  58.91 
 
 		 205 aa  238  4e-62  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.609971  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2305  guanylate kinase  54.9 
 
 		 219 aa  237  9e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00214709  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3936  guanylate kinase  54.37 
 
 		 212 aa  234  6e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2974  guanylate kinase  52.22 
 
 		 219 aa  234  8e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.291122 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2714  guanylate kinase  51.46 
 
 		 213 aa  233  2.0000000000000002e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1563  guanylate kinase  55.07 
 
 		 211 aa  230  1e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.106259  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3479  guanylate kinase  50.95 
 
 		 220 aa  230  1e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2472  guanylate kinase  50.95 
 
 		 220 aa  230  1e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2919  guanylate kinase  55.07 
 
 		 211 aa  229  3e-59  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3136  guanylate kinase  53.69 
 
 		 231 aa  224  6e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.328978 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3354  guanylate kinase  54.41 
 
 		 212 aa  221  4.9999999999999996e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1845  guanylate kinase  50 
 
 		 230 aa  221  9e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2440  guanylate kinase  51.71 
 
 		 218 aa  216  2e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000682251 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1104  guanylate kinase  51.69 
 
 		 211 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.631702  normal  0.011032 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1220  guanylate kinase  50 
 
 		 218 aa  213  2.9999999999999995e-54  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.289802 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1003  guanylate kinase  53.96 
 
 		 221 aa  207  1e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1266  guanylate kinase  47.32 
 
 		 217 aa  207  1e-52  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.979121  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2523  guanylate kinase  44.81 
 
 		 214 aa  204  7e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1529  guanylate kinase  47.8 
 
 		 217 aa  203  1e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.2579 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00630  guanylate kinase  46.94 
 
 		 207 aa  197  7e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5842  guanylate kinase  50.28 
 
 		 259 aa  197  1.0000000000000001e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.509377 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001862  guanylate kinase  46.94 
 
 		 207 aa  196  3e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3894  guanylate kinase  46.94 
 
 		 200 aa  196  3e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000112061  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0048  guanylate kinase  46.84 
 
 		 202 aa  194  1e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0251  guanylate kinase  50 
 
 		 207 aa  192  2e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000337673  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3810  guanylate kinase  48.13 
 
 		 207 aa  193  2e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.18291  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03505  guanylate kinase  48.45 
 
 		 207 aa  192  3e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0057  Guanylate kinase  48.45 
 
 		 207 aa  192  3e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0063  guanylate kinase  48.45 
 
 		 207 aa  192  3e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000240109 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4151  guanylate kinase  48.45 
 
 		 207 aa  192  3e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3859  guanylate kinase  48.45 
 
 		 207 aa  192  3e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3983  guanylate kinase  48.45 
 
 		 207 aa  192  3e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4099  guanylate kinase  48.45 
 
 		 207 aa  192  3e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4581  guanylate kinase  47.34 
 
 		 207 aa  192  3e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.877029  unclonable  0.0000000250462 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0363  guanylate kinase  47.85 
 
 		 210 aa  192  3e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000053777 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03457  hypothetical protein  48.45 
 
 		 207 aa  192  3e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0266  guanylate kinase  50.53 
 
 		 207 aa  192  4e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0360  guanylate kinase  47.85 
 
 		 210 aa  191  6e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0355  guanylate kinase  47.85 
 
 		 210 aa  191  6e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.398163  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3877  guanylate kinase  50.54 
 
 		 210 aa  191  6e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0353  guanylate kinase  47.85 
 
 		 210 aa  191  6e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0361  guanylate kinase  48.39 
 
 		 207 aa  191  7e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5020  guanylate kinase  48.45 
 
 		 207 aa  191  8e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0336  guanylate kinase  47.87 
 
 		 207 aa  191  8e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.57704 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3630  guanylate kinase  47.31 
 
 		 224 aa  191  8e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.09026  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1406  Guanylate kinase  49.5 
 
 		 202 aa  190  1e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.77411  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3623  guanylate kinase  47.03 
 
 		 207 aa  189  2e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3613  guanylate kinase  47.85 
 
 		 207 aa  190  2e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0330  guanylate kinase  47.85 
 
 		 224 aa  190  2e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0351596  normal  0.331396 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4020  guanylate kinase  47.94 
 
 		 207 aa  189  2.9999999999999997e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4127  guanylate kinase  47.94 
 
 		 207 aa  189  2.9999999999999997e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.514606  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4066  guanylate kinase  47.94 
 
 		 207 aa  189  2.9999999999999997e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3948  guanylate kinase  47.94 
 
 		 207 aa  189  2.9999999999999997e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00531185 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3957  guanylate kinase  47.94 
 
 		 207 aa  189  2.9999999999999997e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3260  guanylate kinase  43.38 
 
 		 221 aa  188  4e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3497  guanylate kinase  46.34 
 
 		 207 aa  189  4e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0091  guanylate kinase  47.42 
 
 		 207 aa  187  1e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1761  guanylate kinase  42.56 
 
 		 207 aa  187  1e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0365  guanylate kinase  46.28 
 
 		 207 aa  187  1e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2280  guanylate kinase  44.39 
 
 		 229 aa  186  2e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3433  guanylate kinase  48.39 
 
 		 207 aa  186  3e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.21703  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0210  guanylate kinase  46.35 
 
 		 207 aa  185  4e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0322  guanylate kinase  45.67 
 
 		 209 aa  185  4e-46  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.254004  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0681  guanylate kinase  46.15 
 
 		 209 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0045  guanylate kinase  47.42 
 
 		 207 aa  183  1.0000000000000001e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00153  guanylate kinase  45.79 
 
 		 213 aa  183  2.0000000000000003e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0558456  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1700  guanylate kinase  44.16 
 
 		 200 aa  183  2.0000000000000003e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4019  guanylate kinase  45.5 
 
 		 204 aa  183  2.0000000000000003e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.565127  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3948  guanylate kinase  47.42 
 
 		 207 aa  182  3e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.498976  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2318  guanylate kinase  45 
 
 		 198 aa  182  3e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000195285  hitchhiker  0.00462206 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4176  guanylate kinase  46.91 
 
 		 207 aa  182  3e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0297777  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0041  guanylate kinase  46.91 
 
 		 207 aa  182  3e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1457  guanylate kinase  46.63 
 
 		 212 aa  182  3e-45  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2001  guanylate kinase  44.44 
 
 		 216 aa  182  4.0000000000000006e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1719  guanylate kinase  44.44 
 
 		 216 aa  182  4.0000000000000006e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0717  guanylate kinase  47.31 
 
 		 212 aa  181  5.0000000000000004e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000116826 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0962  guanylate kinase  43 
 
 		 202 aa  182  5.0000000000000004e-45  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0132271  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0563  guanylate kinase  47.31 
 
 		 212 aa  181  5.0000000000000004e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3845  guanylate kinase  44.95 
 
 		 202 aa  181  7e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>