More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_1266 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_1266  guanylate kinase  100 
 
 		 217 aa  446  1.0000000000000001e-124  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.979121  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1529  guanylate kinase  76.33 
 
 		 217 aa  331  6e-90  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.2579 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2440  guanylate kinase  71.76 
 
 		 218 aa  315  4e-85  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000682251 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1104  guanylate kinase  68.6 
 
 		 211 aa  298  4e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.631702  normal  0.011032 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1563  guanylate kinase  66.18 
 
 		 211 aa  285  2.9999999999999996e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.106259  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2919  guanylate kinase  66.18 
 
 		 211 aa  284  5.999999999999999e-76  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3936  guanylate kinase  62.62 
 
 		 212 aa  275  5e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2714  guanylate kinase  52.63 
 
 		 213 aa  224  1e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1220  guanylate kinase  50.96 
 
 		 218 aa  220  1.9999999999999999e-56  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.289802 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3155  guanylate kinase  50.72 
 
 		 220 aa  219  3e-56  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1683  guanylate kinase  49.04 
 
 		 219 aa  209  2e-53  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1845  guanylate kinase  51.28 
 
 		 230 aa  209  2e-53  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3354  guanylate kinase  52.66 
 
 		 212 aa  208  5e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0759  guanylate kinase  47.64 
 
 		 219 aa  207  7e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.784504  normal  0.122144 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3479  guanylate kinase  46.95 
 
 		 220 aa  207  9e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2348  guanylate kinase  48.8 
 
 		 219 aa  207  9e-53  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1535  guanylate kinase  47.32 
 
 		 220 aa  207  1e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0748909  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3136  guanylate kinase  48.77 
 
 		 231 aa  206  2e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.328978 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0429  guanylate kinase  48 
 
 		 218 aa  206  3e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1205  guanylate kinase  47.37 
 
 		 220 aa  201  8e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.197853  hitchhiker  0.00108752 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2472  guanylate kinase  46.63 
 
 		 220 aa  200  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2444  guanylate kinase  50.75 
 
 		 203 aa  200  9.999999999999999e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.337517 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2974  guanylate kinase  46.63 
 
 		 219 aa  199  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.291122 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3823  guanylate kinase  46.41 
 
 		 219 aa  199  3e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.162212 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1062  guanylate kinase  46.83 
 
 		 220 aa  199  3.9999999999999996e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0143004 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2305  guanylate kinase  45.67 
 
 		 219 aa  195  4.0000000000000005e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00214709  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0469  guanylate kinase  46.12 
 
 		 220 aa  194  8.000000000000001e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.149667  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0464  guanylate kinase  46.12 
 
 		 220 aa  194  8.000000000000001e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.328382  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2000  guanylate kinase  47.47 
 
 		 223 aa  193  2e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0607745  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2277  guanylate kinase  47.47 
 
 		 223 aa  193  2e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.140709  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1763  guanylate kinase  46.6 
 
 		 218 aa  192  3e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.201865  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1953  guanylate kinase  45.71 
 
 		 223 aa  190  1e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.217119  normal  0.0786696 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0576  guanylate kinase  45.15 
 
 		 220 aa  189  2e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.400734  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2523  guanylate kinase  44.79 
 
 		 214 aa  187  8e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3497  guanylate kinase  47.92 
 
 		 207 aa  187  9e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1003  guanylate kinase  50 
 
 		 221 aa  187  1e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3433  guanylate kinase  48.44 
 
 		 207 aa  187  1e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.21703  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5344  guanylate kinase  46.45 
 
 		 206 aa  186  3e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0394211 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5296  guanylate kinase  46.45 
 
 		 206 aa  185  4e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0446222  normal  0.471806 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0988  guanylate kinase  46.73 
 
 		 234 aa  185  4e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0107524 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0365  guanylate kinase  49.2 
 
 		 207 aa  185  5e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5204  guanylate kinase  46.45 
 
 		 206 aa  185  6e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.952406  normal  0.288026 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0336  guanylate kinase  50.27 
 
 		 207 aa  184  7e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.57704 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03505  guanylate kinase  48.7 
 
 		 207 aa  183  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0057  Guanylate kinase  48.7 
 
 		 207 aa  183  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3859  guanylate kinase  48.7 
 
 		 207 aa  183  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3877  guanylate kinase  48.44 
 
 		 210 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0063  guanylate kinase  48.7 
 
 		 207 aa  183  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000240109 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03457  hypothetical protein  48.7 
 
 		 207 aa  183  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3983  guanylate kinase  48.7 
 
 		 207 aa  183  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4099  guanylate kinase  48.7 
 
 		 207 aa  183  1.0000000000000001e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4151  guanylate kinase  48.7 
 
 		 207 aa  183  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5549  guanylate kinase  47.24 
 
 		 206 aa  181  7e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.405224 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2286  guanylate kinase  49.2 
 
 		 202 aa  181  9.000000000000001e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.30068  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2781  guanylate kinase  50.49 
 
 		 219 aa  180  1e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3630  guanylate kinase  48.13 
 
 		 224 aa  180  1e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.09026  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5020  guanylate kinase  48.19 
 
 		 207 aa  181  1e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3233  guanylate kinase  44.6 
 
 		 215 aa  180  1e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4581  guanylate kinase  49.2 
 
 		 207 aa  180  1e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.877029  unclonable  0.0000000250462 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3193  guanylate kinase  49.5 
 
 		 219 aa  181  1e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0391032 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3720  guanylate kinase  48.37 
 
 		 220 aa  180  1e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0647286  normal  0.109171 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0859  guanylate kinase  47.37 
 
 		 227 aa  181  1e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.675802  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0871  guanylate kinase  47.37 
 
 		 227 aa  181  1e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0439  guanylate kinase  46.96 
 
 		 205 aa  180  2e-44  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.483895  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0360  guanylate kinase  46.35 
 
 		 210 aa  179  2e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2138  guanylate kinase  46.2 
 
 		 205 aa  179  2e-44  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.585915  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0355  guanylate kinase  46.35 
 
 		 210 aa  179  2e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.398163  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0353  guanylate kinase  46.35 
 
 		 210 aa  179  2e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2001  guanylate kinase  42.78 
 
 		 216 aa  180  2e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1719  guanylate kinase  42.78 
 
 		 216 aa  180  2e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2401  guanylate kinase  46.84 
 
 		 227 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0726  guanylate kinase  45.69 
 
 		 206 aa  179  4e-44  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4127  guanylate kinase  48.19 
 
 		 207 aa  178  4.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.514606  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0266  guanylate kinase  49.73 
 
 		 207 aa  178  4.999999999999999e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4066  guanylate kinase  48.19 
 
 		 207 aa  178  4.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3810  guanylate kinase  47.59 
 
 		 207 aa  178  4.999999999999999e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.18291  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3948  guanylate kinase  48.19 
 
 		 207 aa  178  4.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00531185 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3957  guanylate kinase  48.19 
 
 		 207 aa  178  4.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4020  guanylate kinase  48.19 
 
 		 207 aa  178  4.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0363  guanylate kinase  45.83 
 
 		 210 aa  178  4.999999999999999e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000053777 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2003  guanylate kinase  45.03 
 
 		 216 aa  178  5.999999999999999e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4145  guanylate kinase  47.62 
 
 		 207 aa  178  5.999999999999999e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5842  guanylate kinase  48.91 
 
 		 259 aa  177  8e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.509377 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0035  guanylate kinase  45.03 
 
 		 209 aa  177  9e-44  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0473  guanylate kinase  44.12 
 
 		 209 aa  177  1e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0052  guanylate kinase  44.55 
 
 		 210 aa  177  1e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00408303  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0330  guanylate kinase  47.06 
 
 		 224 aa  177  1e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0351596  normal  0.331396 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00630  guanylate kinase  46.67 
 
 		 207 aa  177  1e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3948  guanylate kinase  47.52 
 
 		 207 aa  177  2e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.498976  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0959  guanylate kinase  46.32 
 
 		 227 aa  176  2e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.465114  normal  0.426596 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0976  guanylate kinase  44.06 
 
 		 211 aa  176  2e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.194665  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0361  guanylate kinase  46.52 
 
 		 207 aa  176  2e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0177  guanylate kinase  45.88 
 
 		 206 aa  176  2e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000695034 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4107  guanylate kinase  46.32 
 
 		 227 aa  176  2e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0130992  normal  0.288359 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0520  guanylate kinase  46.32 
 
 		 227 aa  176  2e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3613  guanylate kinase  46.52 
 
 		 207 aa  176  2e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0999  guanylate kinase  46.32 
 
 		 227 aa  176  2e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001862  guanylate kinase  46.15 
 
 		 207 aa  176  3e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0048  guanylate kinase  44.83 
 
 		 202 aa  176  3e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1723  guanylate kinase  43.75 
 
 		 208 aa  175  4e-43  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.671499 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>