More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_2974 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007958  RPD_2974  guanylate kinase  100 
 
 
219 aa  450  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.291122 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2472  guanylate kinase  93.64 
 
 
220 aa  424  1e-118  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3479  guanylate kinase  87.67 
 
 
220 aa  392  1e-108  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3823  guanylate kinase  72.48 
 
 
219 aa  329  2e-89  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.162212 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2305  guanylate kinase  73.24 
 
 
219 aa  328  3e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00214709  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2348  guanylate kinase  73.24 
 
 
219 aa  326  1.0000000000000001e-88  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1683  guanylate kinase  72.64 
 
 
219 aa  322  3e-87  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3155  guanylate kinase  60.39 
 
 
220 aa  264  8.999999999999999e-70  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3136  guanylate kinase  60.19 
 
 
231 aa  255  3e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.328978 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0429  guanylate kinase  62.25 
 
 
218 aa  254  7e-67  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2714  guanylate kinase  59.11 
 
 
213 aa  250  1e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3936  guanylate kinase  57.84 
 
 
212 aa  240  1e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3354  guanylate kinase  60.1 
 
 
212 aa  240  1e-62  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1104  guanylate kinase  56.52 
 
 
211 aa  239  2e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.631702  normal  0.011032 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1535  guanylate kinase  52.22 
 
 
220 aa  234  8e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0748909  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0759  guanylate kinase  52.58 
 
 
219 aa  233  1.0000000000000001e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.784504  normal  0.122144 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2919  guanylate kinase  57.49 
 
 
211 aa  233  1.0000000000000001e-60  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1563  guanylate kinase  57.49 
 
 
211 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.106259  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1003  guanylate kinase  58.94 
 
 
221 aa  230  1e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1953  guanylate kinase  52.86 
 
 
223 aa  228  4e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.217119  normal  0.0786696 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1062  guanylate kinase  50.74 
 
 
220 aa  228  7e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0143004 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2277  guanylate kinase  51.43 
 
 
223 aa  227  1e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.140709  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2000  guanylate kinase  51.43 
 
 
223 aa  227  1e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0607745  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1529  guanylate kinase  52.88 
 
 
217 aa  225  3e-58  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.2579 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1205  guanylate kinase  48.83 
 
 
220 aa  225  4e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.197853  hitchhiker  0.00108752 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2440  guanylate kinase  51.89 
 
 
218 aa  224  9e-58  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000682251 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1763  guanylate kinase  52.5 
 
 
218 aa  224  1e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.201865  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3193  guanylate kinase  54.37 
 
 
219 aa  220  9.999999999999999e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0391032 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2781  guanylate kinase  53.88 
 
 
219 aa  219  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1220  guanylate kinase  55.56 
 
 
218 aa  218  7.999999999999999e-56  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.289802 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0988  guanylate kinase  50.95 
 
 
234 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0107524 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2975  guanylate kinase  53.68 
 
 
204 aa  212  3.9999999999999995e-54  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0464  guanylate kinase  49.26 
 
 
220 aa  209  2e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.328382  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02830  guanylate kinase  53.97 
 
 
205 aa  209  2e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0469  guanylate kinase  49.26 
 
 
220 aa  209  2e-53  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.149667  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0502  guanylate kinase  49.26 
 
 
221 aa  209  3e-53  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3720  guanylate kinase  50.94 
 
 
220 aa  207  8e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0647286  normal  0.109171 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5842  guanylate kinase  52.04 
 
 
259 aa  207  9e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.509377 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0576  guanylate kinase  48.77 
 
 
220 aa  207  9e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.400734  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1845  guanylate kinase  49.28 
 
 
230 aa  207  9e-53  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0976  guanylate kinase  52.31 
 
 
211 aa  204  7e-52  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.194665  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1266  guanylate kinase  46.63 
 
 
217 aa  199  1.9999999999999998e-50  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.979121  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70440  guanylate kinase  52.38 
 
 
203 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2523  guanylate kinase  46.8 
 
 
214 aa  199  3e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6112  guanylate kinase  51.85 
 
 
203 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.509466  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5549  guanylate kinase  48.68 
 
 
206 aa  195  5.000000000000001e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.405224 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00630  guanylate kinase  49.48 
 
 
207 aa  194  6e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2280  guanylate kinase  49.48 
 
 
229 aa  194  7e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4145  guanylate kinase  50 
 
 
207 aa  194  1e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4388  guanylate kinase  50.83 
 
 
205 aa  194  1e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.11044 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001862  guanylate kinase  49.48 
 
 
207 aa  193  2e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1237  guanylate kinase  48.15 
 
 
195 aa  192  2e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.74814  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0251  guanylate kinase  49.22 
 
 
207 aa  192  3e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000337673  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0563  guanylate kinase  49.48 
 
 
212 aa  191  5e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0717  guanylate kinase  49.48 
 
 
212 aa  191  5e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000116826 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1290  guanylate kinase  49.75 
 
 
205 aa  191  9e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.609971  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3613  guanylate kinase  48.96 
 
 
207 aa  190  2e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0330  guanylate kinase  48.96 
 
 
224 aa  189  2e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0351596  normal  0.331396 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0363  guanylate kinase  48.96 
 
 
210 aa  189  2.9999999999999997e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000053777 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0353  guanylate kinase  48.96 
 
 
210 aa  189  2.9999999999999997e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0355  guanylate kinase  48.96 
 
 
210 aa  189  2.9999999999999997e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.398163  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0360  guanylate kinase  48.96 
 
 
210 aa  189  2.9999999999999997e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3497  guanylate kinase  49.48 
 
 
207 aa  187  8e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0075  guanylate kinase  47.21 
 
 
214 aa  187  9e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2238  guanylate kinase  48.96 
 
 
203 aa  187  1e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0211  guanylate kinase  47.21 
 
 
214 aa  187  1e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0045  guanylate kinase  47.4 
 
 
207 aa  187  1e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3810  guanylate kinase  48.44 
 
 
207 aa  187  1e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.18291  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03505  guanylate kinase  48.96 
 
 
207 aa  186  2e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0057  Guanylate kinase  48.96 
 
 
207 aa  186  2e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3948  guanylate kinase  48.96 
 
 
207 aa  186  2e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.498976  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4176  guanylate kinase  47.4 
 
 
207 aa  186  2e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0297777  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03457  hypothetical protein  48.96 
 
 
207 aa  186  2e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3630  guanylate kinase  47.92 
 
 
224 aa  186  2e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.09026  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0048  guanylate kinase  47.12 
 
 
202 aa  186  2e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4151  guanylate kinase  48.96 
 
 
207 aa  186  2e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3983  guanylate kinase  48.96 
 
 
207 aa  186  2e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0041  guanylate kinase  47.4 
 
 
207 aa  186  2e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4099  guanylate kinase  48.96 
 
 
207 aa  186  2e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0063  guanylate kinase  48.96 
 
 
207 aa  186  2e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000240109 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3859  guanylate kinase  48.96 
 
 
207 aa  186  2e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4581  guanylate kinase  47.92 
 
 
207 aa  186  3e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.877029  unclonable  0.0000000250462 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5020  guanylate kinase  48.96 
 
 
207 aa  186  3e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3845  guanylate kinase  48.11 
 
 
202 aa  186  3e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0210  guanylate kinase  47.4 
 
 
207 aa  186  3e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3894  guanylate kinase  46.35 
 
 
200 aa  186  3e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000112061  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0361  guanylate kinase  47.4 
 
 
207 aa  185  4e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0336  guanylate kinase  47.92 
 
 
207 aa  185  4e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.57704 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2444  guanylate kinase  50.26 
 
 
203 aa  185  4e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.337517 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0322  guanylate kinase  43.27 
 
 
209 aa  185  5e-46  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.254004  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00153  guanylate kinase  46.91 
 
 
213 aa  184  6e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0558456  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0091  guanylate kinase  48.44 
 
 
207 aa  185  6e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3877  guanylate kinase  45.54 
 
 
210 aa  184  6e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1457  guanylate kinase  48.19 
 
 
212 aa  184  7e-46  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3957  guanylate kinase  48.44 
 
 
207 aa  184  8e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4066  guanylate kinase  48.44 
 
 
207 aa  184  8e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5344  guanylate kinase  46.56 
 
 
206 aa  184  8e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0394211 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3948  guanylate kinase  48.44 
 
 
207 aa  184  8e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00531185 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4127  guanylate kinase  48.44 
 
 
207 aa  184  8e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.514606  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4020  guanylate kinase  48.44 
 
 
207 aa  184  8e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>