More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_3497 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009092  Shew_3497  guanylate kinase  100 
 
 
207 aa  427  1e-119  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0360  guanylate kinase  82.04 
 
 
210 aa  358  2e-98  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0355  guanylate kinase  82.04 
 
 
210 aa  358  2e-98  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.398163  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0330  guanylate kinase  83.01 
 
 
224 aa  359  2e-98  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0351596  normal  0.331396 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0353  guanylate kinase  82.04 
 
 
210 aa  358  2e-98  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3613  guanylate kinase  82.52 
 
 
207 aa  358  3e-98  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0363  guanylate kinase  82.04 
 
 
210 aa  358  4e-98  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000053777 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3810  guanylate kinase  82.52 
 
 
207 aa  356  9.999999999999999e-98  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.18291  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3630  guanylate kinase  81.55 
 
 
224 aa  355  1.9999999999999998e-97  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.09026  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4581  guanylate kinase  81.64 
 
 
207 aa  355  2.9999999999999997e-97  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.877029  unclonable  0.0000000250462 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0336  guanylate kinase  80.19 
 
 
207 aa  353  8.999999999999999e-97  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.57704 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0361  guanylate kinase  81.55 
 
 
207 aa  353  1e-96  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3877  guanylate kinase  80.1 
 
 
210 aa  351  5e-96  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3433  guanylate kinase  78.26 
 
 
207 aa  342  2e-93  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.21703  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0365  guanylate kinase  75.85 
 
 
207 aa  335  3.9999999999999995e-91  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0266  guanylate kinase  71.98 
 
 
207 aa  321  4e-87  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03505  guanylate kinase  65.05 
 
 
207 aa  281  5.000000000000001e-75  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0057  Guanylate kinase  65.05 
 
 
207 aa  281  5.000000000000001e-75  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4151  guanylate kinase  65.05 
 
 
207 aa  281  5.000000000000001e-75  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03457  hypothetical protein  65.05 
 
 
207 aa  281  5.000000000000001e-75  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4099  guanylate kinase  65.05 
 
 
207 aa  281  5.000000000000001e-75  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0063  guanylate kinase  65.05 
 
 
207 aa  281  5.000000000000001e-75  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000240109 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3983  guanylate kinase  65.05 
 
 
207 aa  281  5.000000000000001e-75  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3859  guanylate kinase  65.05 
 
 
207 aa  281  5.000000000000001e-75  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4066  guanylate kinase  64.56 
 
 
207 aa  280  1e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3948  guanylate kinase  64.56 
 
 
207 aa  280  1e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00531185 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4127  guanylate kinase  64.56 
 
 
207 aa  280  1e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.514606  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3957  guanylate kinase  64.56 
 
 
207 aa  280  1e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4020  guanylate kinase  64.56 
 
 
207 aa  280  1e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5020  guanylate kinase  64.56 
 
 
207 aa  278  4e-74  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0091  guanylate kinase  63.59 
 
 
207 aa  276  1e-73  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001862  guanylate kinase  65.05 
 
 
207 aa  272  2.0000000000000002e-72  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4145  guanylate kinase  62.62 
 
 
207 aa  270  1e-71  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3948  guanylate kinase  63.59 
 
 
207 aa  268  4e-71  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.498976  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3623  guanylate kinase  60.39 
 
 
207 aa  266  2e-70  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00630  guanylate kinase  63.59 
 
 
207 aa  265  2.9999999999999995e-70  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0210  guanylate kinase  62.14 
 
 
207 aa  265  4e-70  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00153  guanylate kinase  61.17 
 
 
213 aa  263  8.999999999999999e-70  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0558456  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4971  guanylate kinase  62.68 
 
 
218 aa  263  1e-69  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2280  guanylate kinase  62.62 
 
 
229 aa  262  3e-69  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0347  guanylate kinase  59.62 
 
 
215 aa  258  5.0000000000000005e-68  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4867  guanylate kinase  62.14 
 
 
207 aa  256  1e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.807857  hitchhiker  0.00555507 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0045  guanylate kinase  60.49 
 
 
207 aa  254  6e-67  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4176  guanylate kinase  60 
 
 
207 aa  253  1.0000000000000001e-66  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0297777  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0041  guanylate kinase  60 
 
 
207 aa  253  1.0000000000000001e-66  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4209  guanylate kinase  61.65 
 
 
207 aa  247  7e-65  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1457  guanylate kinase  58.45 
 
 
212 aa  247  9e-65  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4492  guanylate kinase  61.65 
 
 
207 aa  246  2e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5296  guanylate kinase  55.45 
 
 
206 aa  235  4e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0446222  normal  0.471806 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5204  guanylate kinase  55.45 
 
 
206 aa  234  7e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.952406  normal  0.288026 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5344  guanylate kinase  55.45 
 
 
206 aa  234  7e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0394211 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3187  Guanylate kinase  54.9 
 
 
210 aa  234  1.0000000000000001e-60  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2444  guanylate kinase  54.95 
 
 
203 aa  232  3e-60  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.337517 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2003  guanylate kinase  53.69 
 
 
216 aa  231  5e-60  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0177  guanylate kinase  54.46 
 
 
206 aa  230  1e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000695034 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70440  guanylate kinase  55.45 
 
 
203 aa  230  1e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6112  guanylate kinase  54.95 
 
 
203 aa  228  5e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.509466  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4388  guanylate kinase  53.88 
 
 
205 aa  226  3e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.11044 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0976  guanylate kinase  53.69 
 
 
211 aa  223  1e-57  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.194665  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02830  guanylate kinase  52.43 
 
 
205 aa  223  2e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5549  guanylate kinase  54.46 
 
 
206 aa  223  2e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.405224 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3695  guanylate kinase  52.43 
 
 
225 aa  223  2e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.241605 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2975  guanylate kinase  54.46 
 
 
204 aa  222  3e-57  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3845  guanylate kinase  54.5 
 
 
202 aa  222  3e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4384  guanylate kinase  52.94 
 
 
207 aa  222  4e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0048  guanylate kinase  54.46 
 
 
202 aa  221  4e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0075  guanylate kinase  52.63 
 
 
214 aa  221  6e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0211  guanylate kinase  52.15 
 
 
214 aa  220  9.999999999999999e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0035  guanylate kinase  52.22 
 
 
209 aa  216  1e-55  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1723  guanylate kinase  51.72 
 
 
208 aa  216  2e-55  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.671499 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2003  guanylate kinase  51.23 
 
 
208 aa  215  2.9999999999999998e-55  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.170887 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0634  guanylate kinase  51.96 
 
 
210 aa  215  4e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0429  guanylate kinase  53.12 
 
 
218 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1212  guanylate kinase  50.75 
 
 
203 aa  212  1.9999999999999998e-54  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3155  guanylate kinase  51.28 
 
 
220 aa  210  1e-53  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0110  guanylate kinase  50.53 
 
 
204 aa  209  2e-53  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.361568  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4019  guanylate kinase  52.38 
 
 
204 aa  208  6e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.565127  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1586  guanylate kinase  49.5 
 
 
227 aa  207  1e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0562043  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3233  guanylate kinase  51.26 
 
 
215 aa  207  1e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0563  guanylate kinase  50.25 
 
 
212 aa  206  2e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0717  guanylate kinase  50.25 
 
 
212 aa  206  2e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000116826 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0959  guanylate kinase  50 
 
 
227 aa  206  3e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.465114  normal  0.426596 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0815  guanylate kinase  49 
 
 
227 aa  205  3e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.605718  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1964  guanylate kinase  49 
 
 
227 aa  205  3e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.736317  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2096  guanylate kinase  49 
 
 
227 aa  205  3e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2401  guanylate kinase  49 
 
 
227 aa  206  3e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2949  guanylate kinase  49 
 
 
227 aa  205  3e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.391895  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3049  guanylate kinase  49 
 
 
227 aa  205  3e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.520623  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2648  guanylate kinase  49 
 
 
227 aa  205  3e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0520  guanylate kinase  50 
 
 
227 aa  206  3e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3015  guanylate kinase  49 
 
 
227 aa  205  3e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0577  guanylate kinase  48.53 
 
 
204 aa  205  3e-52  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.213259  normal  0.177715 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0999  guanylate kinase  50 
 
 
227 aa  206  3e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2138  guanylate kinase  49.5 
 
 
205 aa  204  7e-52  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.585915  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2473  guanylate kinase  50.25 
 
 
216 aa  204  1e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.276793  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0871  guanylate kinase  49 
 
 
227 aa  203  1e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0856  guanylate kinase  52.11 
 
 
216 aa  204  1e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0859  guanylate kinase  49 
 
 
227 aa  203  1e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.675802  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4107  guanylate kinase  49 
 
 
227 aa  203  2e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0130992  normal  0.288359 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3936  guanylate kinase  48.47 
 
 
212 aa  202  4e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>