More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_5296 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_5296  guanylate kinase  100 
 
 		 206 aa  426  1e-118  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0446222  normal  0.471806 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5204  guanylate kinase  98.06 
 
 		 206 aa  418  1e-116  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.952406  normal  0.288026 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5344  guanylate kinase  97.57 
 
 		 206 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0394211 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0177  guanylate kinase  83.5 
 
 		 206 aa  360  1e-98  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000695034 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5549  guanylate kinase  71.84 
 
 		 206 aa  305  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.405224 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4388  guanylate kinase  71.92 
 
 		 205 aa  302  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.11044 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0075  guanylate kinase  65.42 
 
 		 214 aa  289  2e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02830  guanylate kinase  67.49 
 
 		 205 aa  289  2e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0211  guanylate kinase  64.95 
 
 		 214 aa  287  9e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70440  guanylate kinase  67.82 
 
 		 203 aa  285  4e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6112  guanylate kinase  67.33 
 
 		 203 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.509466  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2444  guanylate kinase  66.67 
 
 		 203 aa  282  3.0000000000000004e-75  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.337517 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3695  guanylate kinase  62.87 
 
 		 225 aa  273  1.0000000000000001e-72  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.241605 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4145  guanylate kinase  62.44 
 
 		 207 aa  272  3e-72  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00630  guanylate kinase  61.39 
 
 		 207 aa  270  9e-72  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4020  guanylate kinase  62.44 
 
 		 207 aa  269  2e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4066  guanylate kinase  62.44 
 
 		 207 aa  269  2e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3948  guanylate kinase  62.44 
 
 		 207 aa  269  2e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00531185 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4127  guanylate kinase  62.44 
 
 		 207 aa  269  2e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.514606  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0266  guanylate kinase  63.41 
 
 		 207 aa  269  2e-71  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3957  guanylate kinase  62.44 
 
 		 207 aa  269  2e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001862  guanylate kinase  60.59 
 
 		 207 aa  269  2.9999999999999997e-71  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0091  guanylate kinase  61.46 
 
 		 207 aa  266  1e-70  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03505  guanylate kinase  61.95 
 
 		 207 aa  266  2e-70  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0057  Guanylate kinase  61.95 
 
 		 207 aa  266  2e-70  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3859  guanylate kinase  61.95 
 
 		 207 aa  266  2e-70  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03457  hypothetical protein  61.95 
 
 		 207 aa  266  2e-70  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4151  guanylate kinase  61.95 
 
 		 207 aa  266  2e-70  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0063  guanylate kinase  61.95 
 
 		 207 aa  266  2e-70  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000240109 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3983  guanylate kinase  61.95 
 
 		 207 aa  266  2e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4099  guanylate kinase  61.95 
 
 		 207 aa  266  2e-70  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5020  guanylate kinase  61.46 
 
 		 207 aa  263  1e-69  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3810  guanylate kinase  62.38 
 
 		 207 aa  262  3e-69  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.18291  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3433  guanylate kinase  62.38 
 
 		 207 aa  261  4e-69  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.21703  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3877  guanylate kinase  61.19 
 
 		 210 aa  261  4e-69  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2280  guanylate kinase  60.59 
 
 		 229 aa  261  4.999999999999999e-69  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4581  guanylate kinase  62.07 
 
 		 207 aa  260  8.999999999999999e-69  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.877029  unclonable  0.0000000250462 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0330  guanylate kinase  61.88 
 
 		 224 aa  259  1e-68  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0351596  normal  0.331396 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3613  guanylate kinase  61.39 
 
 		 207 aa  259  2e-68  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0336  guanylate kinase  62.25 
 
 		 207 aa  258  5.0000000000000005e-68  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.57704 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0634  guanylate kinase  59.3 
 
 		 210 aa  258  5.0000000000000005e-68  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3948  guanylate kinase  60.49 
 
 		 207 aa  258  6e-68  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.498976  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0361  guanylate kinase  61.39 
 
 		 207 aa  257  7e-68  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0045  guanylate kinase  60.59 
 
 		 207 aa  256  2e-67  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0353  guanylate kinase  60.4 
 
 		 210 aa  255  3e-67  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0355  guanylate kinase  60.4 
 
 		 210 aa  255  3e-67  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.398163  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0360  guanylate kinase  60.4 
 
 		 210 aa  255  3e-67  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4176  guanylate kinase  60.1 
 
 		 207 aa  254  5e-67  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0297777  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0041  guanylate kinase  60.1 
 
 		 207 aa  254  5e-67  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00153  guanylate kinase  58.25 
 
 		 213 aa  254  6e-67  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0558456  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0210  guanylate kinase  59.51 
 
 		 207 aa  254  6e-67  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3630  guanylate kinase  65.76 
 
 		 224 aa  254  7e-67  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.09026  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0363  guanylate kinase  59.9 
 
 		 210 aa  254  9e-67  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000053777 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3233  guanylate kinase  61.39 
 
 		 215 aa  251  4.0000000000000004e-66  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2138  guanylate kinase  56.5 
 
 		 205 aa  251  5.000000000000001e-66  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.585915  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4867  guanylate kinase  61.46 
 
 		 207 aa  251  7e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.807857  hitchhiker  0.00555507 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0365  guanylate kinase  61.86 
 
 		 207 aa  250  1e-65  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0473  guanylate kinase  61.19 
 
 		 209 aa  248  5e-65  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2003  guanylate kinase  56.72 
 
 		 216 aa  246  1e-64  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3187  Guanylate kinase  56.65 
 
 		 210 aa  243  1.9999999999999999e-63  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4209  guanylate kinase  60.98 
 
 		 207 aa  241  3.9999999999999997e-63  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4492  guanylate kinase  60.98 
 
 		 207 aa  241  3.9999999999999997e-63  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3623  guanylate kinase  56.16 
 
 		 207 aa  238  5e-62  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2975  guanylate kinase  54.19 
 
 		 204 aa  235  3e-61  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1457  guanylate kinase  56.16 
 
 		 212 aa  235  3e-61  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3497  guanylate kinase  55.45 
 
 		 207 aa  235  4e-61  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3260  guanylate kinase  54.5 
 
 		 221 aa  234  6e-61  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0048  guanylate kinase  57 
 
 		 202 aa  234  8e-61  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0976  guanylate kinase  56.22 
 
 		 211 aa  233  2.0000000000000002e-60  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.194665  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1212  guanylate kinase  53.23 
 
 		 203 aa  232  3e-60  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0035  guanylate kinase  54.95 
 
 		 209 aa  231  8.000000000000001e-60  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3845  guanylate kinase  55.72 
 
 		 202 aa  229  2e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0347  guanylate kinase  50.7 
 
 		 215 aa  229  2e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4971  guanylate kinase  52.91 
 
 		 218 aa  229  3e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4384  guanylate kinase  50 
 
 		 207 aa  224  5.0000000000000005e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02367  guanylate kinase  54 
 
 		 203 aa  222  3e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4019  guanylate kinase  56.44 
 
 		 204 aa  222  4e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.565127  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1987  guanylate kinase  50.25 
 
 		 209 aa  219  1.9999999999999999e-56  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0843  guanylate kinase  51 
 
 		 204 aa  219  1.9999999999999999e-56  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0756  guanylate kinase  51.5 
 
 		 204 aa  219  1.9999999999999999e-56  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2276  guanylate kinase  53.2 
 
 		 221 aa  219  1.9999999999999999e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0318334  normal  0.859222 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0577  guanylate kinase  53 
 
 		 204 aa  219  1.9999999999999999e-56  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.213259  normal  0.177715 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0563  guanylate kinase  53.96 
 
 		 212 aa  219  3e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0717  guanylate kinase  53.96 
 
 		 212 aa  219  3e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000116826 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1723  guanylate kinase  51.98 
 
 		 208 aa  218  3.9999999999999997e-56  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.671499 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1956  guanylate kinase  53.2 
 
 		 221 aa  218  3.9999999999999997e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.414906 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2003  guanylate kinase  51.98 
 
 		 208 aa  218  5e-56  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.170887 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1992  guanylate kinase  49.75 
 
 		 209 aa  217  1e-55  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2155  guanylate kinase  52.22 
 
 		 221 aa  214  7e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000431933  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0856  guanylate kinase  52.76 
 
 		 216 aa  213  9.999999999999999e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2473  guanylate kinase  52.26 
 
 		 216 aa  211  4.9999999999999996e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.276793  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0110  guanylate kinase  49.01 
 
 		 204 aa  211  4.9999999999999996e-54  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.361568  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2401  guanylate kinase  50.75 
 
 		 227 aa  210  1e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0407  guanylate kinase  48.51 
 
 		 206 aa  209  2e-53  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.360667  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1780  guanylate kinase  48.51 
 
 		 206 aa  209  2e-53  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0438453  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0052  guanylate kinase  49.51 
 
 		 210 aa  206  1e-52  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00408303  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0859  guanylate kinase  50.25 
 
 		 227 aa  206  2e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.675802  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0871  guanylate kinase  50.25 
 
 		 227 aa  206  2e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1078  guanylate kinase  51.26 
 
 		 212 aa  206  2e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2096  guanylate kinase  49.75 
 
 		 227 aa  203  1e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>