More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_0717 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011761  AFE_0563  guanylate kinase  100 
 
 		 212 aa  434  1e-121  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0717  guanylate kinase  100 
 
 		 212 aa  434  1e-121  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000116826 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02830  guanylate kinase  58.91 
 
 		 205 aa  227  1e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70440  guanylate kinase  58.42 
 
 		 203 aa  226  2e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6112  guanylate kinase  57.43 
 
 		 203 aa  222  3e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.509466  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1780  guanylate kinase  56.5 
 
 		 206 aa  221  4e-57  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0438453  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0407  guanylate kinase  56.5 
 
 		 206 aa  221  4e-57  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.360667  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0856  guanylate kinase  54.41 
 
 		 216 aa  221  8e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5296  guanylate kinase  53.96 
 
 		 206 aa  219  3e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0446222  normal  0.471806 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5344  guanylate kinase  53.47 
 
 		 206 aa  218  5e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0394211 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0976  guanylate kinase  56.59 
 
 		 211 aa  217  8.999999999999998e-56  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.194665  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4388  guanylate kinase  59.12 
 
 		 205 aa  216  2e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.11044 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3695  guanylate kinase  54.46 
 
 		 225 aa  216  2e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.241605 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2444  guanylate kinase  55.45 
 
 		 203 aa  216  2e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.337517 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5204  guanylate kinase  52.97 
 
 		 206 aa  214  5e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.952406  normal  0.288026 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2276  guanylate kinase  54.41 
 
 		 221 aa  214  5e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0318334  normal  0.859222 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4145  guanylate kinase  54.15 
 
 		 207 aa  214  8e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3845  guanylate kinase  55.33 
 
 		 202 aa  213  9.999999999999999e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001862  guanylate kinase  50.98 
 
 		 207 aa  214  9.999999999999999e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4019  guanylate kinase  54.64 
 
 		 204 aa  214  9.999999999999999e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.565127  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3433  guanylate kinase  51.47 
 
 		 207 aa  213  9.999999999999999e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.21703  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4066  guanylate kinase  53.17 
 
 		 207 aa  213  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4127  guanylate kinase  53.17 
 
 		 207 aa  213  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.514606  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3948  guanylate kinase  53.17 
 
 		 207 aa  213  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00531185 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1956  guanylate kinase  53.92 
 
 		 221 aa  213  1.9999999999999998e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.414906 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02367  guanylate kinase  56.59 
 
 		 203 aa  213  1.9999999999999998e-54  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0048  guanylate kinase  57.53 
 
 		 202 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0177  guanylate kinase  52.48 
 
 		 206 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000695034 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4020  guanylate kinase  53.17 
 
 		 207 aa  213  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3957  guanylate kinase  53.17 
 
 		 207 aa  213  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00630  guanylate kinase  51.47 
 
 		 207 aa  212  2.9999999999999995e-54  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2155  guanylate kinase  53.43 
 
 		 221 aa  212  3.9999999999999995e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000431933  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0634  guanylate kinase  53.14 
 
 		 210 aa  211  3.9999999999999995e-54  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3187  Guanylate kinase  55.17 
 
 		 210 aa  211  7e-54  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0843  guanylate kinase  52.48 
 
 		 204 aa  211  9e-54  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5549  guanylate kinase  53.47 
 
 		 206 aa  211  9e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.405224 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3948  guanylate kinase  53.66 
 
 		 207 aa  211  9e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.498976  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03505  guanylate kinase  52.2 
 
 		 207 aa  210  1e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0057  Guanylate kinase  52.2 
 
 		 207 aa  210  1e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3859  guanylate kinase  52.2 
 
 		 207 aa  210  1e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2473  guanylate kinase  51.47 
 
 		 216 aa  210  1e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.276793  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03457  hypothetical protein  52.2 
 
 		 207 aa  210  1e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0355  guanylate kinase  51.96 
 
 		 210 aa  210  1e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.398163  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0360  guanylate kinase  51.96 
 
 		 210 aa  210  1e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3983  guanylate kinase  52.2 
 
 		 207 aa  210  1e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0353  guanylate kinase  51.96 
 
 		 210 aa  210  1e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4099  guanylate kinase  52.2 
 
 		 207 aa  210  1e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0063  guanylate kinase  52.2 
 
 		 207 aa  210  1e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000240109 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4151  guanylate kinase  52.2 
 
 		 207 aa  210  1e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0756  guanylate kinase  52.97 
 
 		 204 aa  209  2e-53  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2280  guanylate kinase  53.19 
 
 		 229 aa  209  2e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3260  guanylate kinase  55.38 
 
 		 221 aa  209  3e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2096  guanylate kinase  52.13 
 
 		 227 aa  209  3e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2949  guanylate kinase  52.13 
 
 		 227 aa  209  3e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.391895  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2648  guanylate kinase  52.13 
 
 		 227 aa  209  3e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3049  guanylate kinase  52.13 
 
 		 227 aa  209  3e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.520623  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0815  guanylate kinase  52.13 
 
 		 227 aa  209  3e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.605718  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1964  guanylate kinase  52.13 
 
 		 227 aa  209  3e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.736317  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2003  guanylate kinase  53.85 
 
 		 216 aa  209  3e-53  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0330  guanylate kinase  51.72 
 
 		 224 aa  209  3e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0351596  normal  0.331396 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3015  guanylate kinase  52.13 
 
 		 227 aa  209  3e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0363  guanylate kinase  51.47 
 
 		 210 aa  209  4e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000053777 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0210  guanylate kinase  50 
 
 		 207 aa  208  4e-53  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3613  guanylate kinase  51.23 
 
 		 207 aa  209  4e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2975  guanylate kinase  54.68 
 
 		 204 aa  208  5e-53  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1212  guanylate kinase  55.17 
 
 		 203 aa  208  5e-53  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0091  guanylate kinase  52.2 
 
 		 207 aa  208  5e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1457  guanylate kinase  53.61 
 
 		 212 aa  208  5e-53  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5020  guanylate kinase  51.71 
 
 		 207 aa  208  6e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1078  guanylate kinase  54.79 
 
 		 212 aa  207  7e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2401  guanylate kinase  51.66 
 
 		 227 aa  207  9e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3085  guanylate kinase  51.67 
 
 		 226 aa  207  1e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.831514  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3810  guanylate kinase  51.23 
 
 		 207 aa  207  1e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.18291  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3630  guanylate kinase  51.23 
 
 		 224 aa  206  2e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.09026  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2138  guanylate kinase  51.24 
 
 		 205 aa  206  2e-52  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.585915  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00153  guanylate kinase  52.17 
 
 		 213 aa  206  2e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0558456  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0905  guanylate kinase  51.2 
 
 		 225 aa  206  2e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.247766  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3497  guanylate kinase  50.25 
 
 		 207 aa  206  2e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0336  guanylate kinase  50.74 
 
 		 207 aa  205  3e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.57704 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4971  guanylate kinase  51.44 
 
 		 218 aa  205  4e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1987  guanylate kinase  50 
 
 		 209 aa  205  4e-52  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0365  guanylate kinase  48.54 
 
 		 207 aa  205  5e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0052  guanylate kinase  52.5 
 
 		 210 aa  204  6e-52  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00408303  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0871  guanylate kinase  51.18 
 
 		 227 aa  204  6e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0859  guanylate kinase  51.18 
 
 		 227 aa  204  6e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.675802  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0361  guanylate kinase  50.74 
 
 		 207 aa  204  7e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1723  guanylate kinase  50.5 
 
 		 208 aa  204  7e-52  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.671499 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1992  guanylate kinase  49.5 
 
 		 209 aa  204  8e-52  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1586  guanylate kinase  51.18 
 
 		 227 aa  204  8e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0562043  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3877  guanylate kinase  49.75 
 
 		 210 aa  203  1e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0473  guanylate kinase  54.55 
 
 		 209 aa  204  1e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0793  guanylate kinase  53.68 
 
 		 212 aa  203  1e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.637166 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0045  guanylate kinase  51.22 
 
 		 207 aa  203  1e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0041  guanylate kinase  51.22 
 
 		 207 aa  203  2e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4176  guanylate kinase  51.22 
 
 		 207 aa  203  2e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0297777  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2003  guanylate kinase  50.5 
 
 		 208 aa  203  2e-51  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.170887 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0959  guanylate kinase  50.71 
 
 		 227 aa  202  4e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.465114  normal  0.426596 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0520  guanylate kinase  50.71 
 
 		 227 aa  202  4e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0999  guanylate kinase  50.71 
 
 		 227 aa  202  4e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0075  guanylate kinase  54.68 
 
 		 214 aa  201  5e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>