More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_3136 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_3136  guanylate kinase  100 
 
 
231 aa  469  1.0000000000000001e-131  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.328978 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3823  guanylate kinase  64.73 
 
 
219 aa  271  5.000000000000001e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.162212 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3354  guanylate kinase  70.53 
 
 
212 aa  271  7e-72  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2305  guanylate kinase  61.68 
 
 
219 aa  270  1e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00214709  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1683  guanylate kinase  61.84 
 
 
219 aa  265  5e-70  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0429  guanylate kinase  61.54 
 
 
218 aa  263  2e-69  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2348  guanylate kinase  62.93 
 
 
219 aa  263  2e-69  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2472  guanylate kinase  60.87 
 
 
220 aa  257  1e-67  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2974  guanylate kinase  60.19 
 
 
219 aa  256  2e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.291122 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3479  guanylate kinase  60.87 
 
 
220 aa  254  9e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3155  guanylate kinase  58.13 
 
 
220 aa  241  7.999999999999999e-63  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2714  guanylate kinase  56.65 
 
 
213 aa  237  1e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1563  guanylate kinase  56.86 
 
 
211 aa  235  4e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.106259  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2919  guanylate kinase  56.37 
 
 
211 aa  233  1.0000000000000001e-60  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0759  guanylate kinase  53.69 
 
 
219 aa  226  2e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.784504  normal  0.122144 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1535  guanylate kinase  53.69 
 
 
220 aa  225  5.0000000000000005e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0748909  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1205  guanylate kinase  54.19 
 
 
220 aa  224  6e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.197853  hitchhiker  0.00108752 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1104  guanylate kinase  52.94 
 
 
211 aa  223  1e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.631702  normal  0.011032 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3936  guanylate kinase  53.92 
 
 
212 aa  223  2e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1062  guanylate kinase  53.2 
 
 
220 aa  223  2e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0143004 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1003  guanylate kinase  57.64 
 
 
221 aa  219  3e-56  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2277  guanylate kinase  51.96 
 
 
223 aa  214  5.9999999999999996e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.140709  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2000  guanylate kinase  51.96 
 
 
223 aa  214  5.9999999999999996e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0607745  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1763  guanylate kinase  51.46 
 
 
218 aa  214  7e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.201865  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1529  guanylate kinase  48.31 
 
 
217 aa  214  9e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.2579 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1220  guanylate kinase  54.23 
 
 
218 aa  213  1.9999999999999998e-54  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.289802 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1845  guanylate kinase  47.27 
 
 
230 aa  212  4.9999999999999996e-54  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1953  guanylate kinase  52.2 
 
 
223 aa  211  7.999999999999999e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.217119  normal  0.0786696 
 
 
-
 
NC_004310  BR0464  guanylate kinase  49.51 
 
 
220 aa  207  1e-52  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.328382  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1266  guanylate kinase  48.77 
 
 
217 aa  207  1e-52  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.979121  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0469  guanylate kinase  49.51 
 
 
220 aa  207  1e-52  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.149667  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0576  guanylate kinase  49.51 
 
 
220 aa  207  2e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.400734  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0502  guanylate kinase  50.25 
 
 
221 aa  203  2e-51  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2440  guanylate kinase  46.83 
 
 
218 aa  196  2.0000000000000003e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000682251 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3193  guanylate kinase  50.98 
 
 
219 aa  196  3e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0391032 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3720  guanylate kinase  51.71 
 
 
220 aa  195  5.000000000000001e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0647286  normal  0.109171 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0717  guanylate kinase  48.94 
 
 
212 aa  194  8.000000000000001e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000116826 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0563  guanylate kinase  48.94 
 
 
212 aa  194  8.000000000000001e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2781  guanylate kinase  51.47 
 
 
219 aa  193  2e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0988  guanylate kinase  48.77 
 
 
234 aa  191  6e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0107524 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2523  guanylate kinase  45.5 
 
 
214 aa  191  1e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5842  guanylate kinase  51.11 
 
 
259 aa  189  2.9999999999999997e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.509377 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4019  guanylate kinase  50.27 
 
 
204 aa  189  4e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.565127  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2975  guanylate kinase  50.26 
 
 
204 aa  188  7e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0322  guanylate kinase  43.28 
 
 
209 aa  186  2e-46  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.254004  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0251  guanylate kinase  47.69 
 
 
207 aa  186  2e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000337673  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0976  guanylate kinase  48.22 
 
 
211 aa  186  2e-46  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.194665  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1457  guanylate kinase  49.22 
 
 
212 aa  186  3e-46  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0439  guanylate kinase  48.33 
 
 
205 aa  184  8e-46  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.483895  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2138  guanylate kinase  47.54 
 
 
205 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.585915  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4384  guanylate kinase  45.7 
 
 
207 aa  184  1.0000000000000001e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00630  guanylate kinase  46.12 
 
 
207 aa  183  2.0000000000000003e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2444  guanylate kinase  46.8 
 
 
203 aa  182  3e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.337517 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03505  guanylate kinase  48.17 
 
 
207 aa  182  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0057  Guanylate kinase  48.17 
 
 
207 aa  182  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4127  guanylate kinase  48.69 
 
 
207 aa  182  4.0000000000000006e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.514606  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2003  guanylate kinase  46.81 
 
 
216 aa  182  4.0000000000000006e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3948  guanylate kinase  48.69 
 
 
207 aa  182  4.0000000000000006e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00531185 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4020  guanylate kinase  48.69 
 
 
207 aa  182  4.0000000000000006e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4151  guanylate kinase  48.17 
 
 
207 aa  182  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4066  guanylate kinase  48.69 
 
 
207 aa  182  4.0000000000000006e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3859  guanylate kinase  48.17 
 
 
207 aa  182  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03457  hypothetical protein  48.17 
 
 
207 aa  182  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3983  guanylate kinase  48.17 
 
 
207 aa  182  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0063  guanylate kinase  48.17 
 
 
207 aa  182  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000240109 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3957  guanylate kinase  48.69 
 
 
207 aa  182  4.0000000000000006e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4099  guanylate kinase  48.17 
 
 
207 aa  182  4.0000000000000006e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1447  guanylate kinase  48.97 
 
 
193 aa  181  6e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.373553  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4388  guanylate kinase  47.57 
 
 
205 aa  181  7e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.11044 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4145  guanylate kinase  48.69 
 
 
207 aa  181  8.000000000000001e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5020  guanylate kinase  48.17 
 
 
207 aa  181  8.000000000000001e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0336  guanylate kinase  48.69 
 
 
207 aa  180  1e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.57704 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001862  guanylate kinase  45.63 
 
 
207 aa  181  1e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3630  guanylate kinase  48.69 
 
 
224 aa  180  1e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.09026  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0363  guanylate kinase  48.42 
 
 
210 aa  179  2.9999999999999997e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000053777 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0355  guanylate kinase  48.42 
 
 
210 aa  179  2.9999999999999997e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.398163  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0353  guanylate kinase  48.42 
 
 
210 aa  179  2.9999999999999997e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0360  guanylate kinase  48.42 
 
 
210 aa  179  2.9999999999999997e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3497  guanylate kinase  47.92 
 
 
207 aa  179  2.9999999999999997e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0577  guanylate kinase  45.11 
 
 
204 aa  179  4e-44  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.213259  normal  0.177715 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0756  guanylate kinase  44.15 
 
 
204 aa  178  7e-44  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0091  guanylate kinase  47.64 
 
 
207 aa  178  7e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0330  guanylate kinase  47.12 
 
 
224 aa  177  9e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0351596  normal  0.331396 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1723  guanylate kinase  45.79 
 
 
208 aa  177  1e-43  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.671499 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3948  guanylate kinase  48.44 
 
 
207 aa  177  1e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.498976  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3433  guanylate kinase  46.56 
 
 
207 aa  177  1e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.21703  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2003  guanylate kinase  45.79 
 
 
208 aa  177  1e-43  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.170887 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3810  guanylate kinase  47.37 
 
 
207 aa  177  1e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.18291  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4581  guanylate kinase  47.64 
 
 
207 aa  177  2e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.877029  unclonable  0.0000000250462 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3260  guanylate kinase  45.45 
 
 
221 aa  176  2e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3233  guanylate kinase  46.84 
 
 
215 aa  177  2e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3613  guanylate kinase  46.84 
 
 
207 aa  176  2e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0843  guanylate kinase  43.09 
 
 
204 aa  177  2e-43  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0365  guanylate kinase  45.88 
 
 
207 aa  176  3e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2280  guanylate kinase  46.07 
 
 
229 aa  176  4e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1700  guanylate kinase  42.33 
 
 
200 aa  175  5e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4492  guanylate kinase  47.92 
 
 
207 aa  175  5e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3187  Guanylate kinase  44.68 
 
 
210 aa  175  5e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02830  guanylate kinase  47.03 
 
 
205 aa  175  5e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0048  guanylate kinase  44.97 
 
 
202 aa  175  6e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>