More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_2781 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_2781  guanylate kinase  100 
 
 		 219 aa  437  9.999999999999999e-123  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3193  guanylate kinase  93.61 
 
 		 219 aa  382  1e-105  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0391032 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1953  guanylate kinase  77.73 
 
 		 223 aa  338  4e-92  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.217119  normal  0.0786696 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2277  guanylate kinase  77.4 
 
 		 223 aa  337  9e-92  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.140709  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2000  guanylate kinase  77.4 
 
 		 223 aa  337  9e-92  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0607745  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3720  guanylate kinase  77.51 
 
 		 220 aa  324  7e-88  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0647286  normal  0.109171 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1763  guanylate kinase  63.16 
 
 		 218 aa  272  2.0000000000000002e-72  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.201865  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0464  guanylate kinase  60.27 
 
 		 220 aa  270  2e-71  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.328382  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0469  guanylate kinase  60.27 
 
 		 220 aa  270  2e-71  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.149667  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0759  guanylate kinase  60.83 
 
 		 219 aa  266  2e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.784504  normal  0.122144 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0576  guanylate kinase  58.9 
 
 		 220 aa  262  3e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.400734  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0988  guanylate kinase  63.11 
 
 		 234 aa  259  2e-68  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0107524 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1535  guanylate kinase  56.22 
 
 		 220 aa  258  6e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0748909  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1062  guanylate kinase  55.76 
 
 		 220 aa  252  4.0000000000000004e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0143004 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1205  guanylate kinase  55.3 
 
 		 220 aa  248  4e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.197853  hitchhiker  0.00108752 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1290  guanylate kinase  65.84 
 
 		 205 aa  246  2e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.609971  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1683  guanylate kinase  57.71 
 
 		 219 aa  241  9e-63  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0502  guanylate kinase  53.99 
 
 		 221 aa  235  4e-61  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2974  guanylate kinase  53.88 
 
 		 219 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.291122 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2348  guanylate kinase  56.72 
 
 		 219 aa  233  1.0000000000000001e-60  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3479  guanylate kinase  53.55 
 
 		 220 aa  232  3e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2472  guanylate kinase  52.4 
 
 		 220 aa  231  4.0000000000000004e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3823  guanylate kinase  54.37 
 
 		 219 aa  229  2e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.162212 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1845  guanylate kinase  56.52 
 
 		 230 aa  229  2e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0429  guanylate kinase  58.21 
 
 		 218 aa  228  4e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2305  guanylate kinase  53.92 
 
 		 219 aa  226  2e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00214709  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3936  guanylate kinase  55.87 
 
 		 212 aa  226  2e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1563  guanylate kinase  56.46 
 
 		 211 aa  214  7e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.106259  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2919  guanylate kinase  55.98 
 
 		 211 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3354  guanylate kinase  55.02 
 
 		 212 aa  213  1.9999999999999998e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2440  guanylate kinase  53.88 
 
 		 218 aa  213  2.9999999999999995e-54  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000682251 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3155  guanylate kinase  48.84 
 
 		 220 aa  210  1e-53  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1529  guanylate kinase  51.92 
 
 		 217 aa  209  3e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.2579 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3136  guanylate kinase  51.47 
 
 		 231 aa  208  4e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.328978 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2714  guanylate kinase  48.82 
 
 		 213 aa  204  8e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1104  guanylate kinase  52.36 
 
 		 211 aa  202  5e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.631702  normal  0.011032 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1266  guanylate kinase  50.49 
 
 		 217 aa  201  5e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.979121  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2523  guanylate kinase  47.55 
 
 		 214 aa  198  5e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1220  guanylate kinase  50.97 
 
 		 218 aa  197  7.999999999999999e-50  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.289802 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00630  guanylate kinase  46.12 
 
 		 207 aa  191  1e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2280  guanylate kinase  45.54 
 
 		 229 aa  190  1e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001862  guanylate kinase  46.12 
 
 		 207 aa  189  2.9999999999999997e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4145  guanylate kinase  46.6 
 
 		 207 aa  189  2.9999999999999997e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0353  guanylate kinase  44.08 
 
 		 210 aa  188  4e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0355  guanylate kinase  44.08 
 
 		 210 aa  188  4e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.398163  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0360  guanylate kinase  44.08 
 
 		 210 aa  188  4e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0363  guanylate kinase  43.6 
 
 		 210 aa  187  1e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000053777 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3623  guanylate kinase  46.67 
 
 		 207 aa  186  2e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0347  guanylate kinase  45.69 
 
 		 215 aa  186  2e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3630  guanylate kinase  45.64 
 
 		 224 aa  185  4e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.09026  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3948  guanylate kinase  46.6 
 
 		 207 aa  185  4e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.498976  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0211  guanylate kinase  48.22 
 
 		 214 aa  184  6e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0330  guanylate kinase  44.62 
 
 		 224 aa  184  8e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0351596  normal  0.331396 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2444  guanylate kinase  50.53 
 
 		 203 aa  184  8e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.337517 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03505  guanylate kinase  45.63 
 
 		 207 aa  184  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0057  Guanylate kinase  45.63 
 
 		 207 aa  184  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4151  guanylate kinase  45.63 
 
 		 207 aa  184  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0336  guanylate kinase  45.19 
 
 		 207 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.57704 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03457  hypothetical protein  45.63 
 
 		 207 aa  184  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4099  guanylate kinase  45.63 
 
 		 207 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4066  guanylate kinase  45.63 
 
 		 207 aa  183  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4127  guanylate kinase  45.63 
 
 		 207 aa  183  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.514606  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0063  guanylate kinase  45.63 
 
 		 207 aa  184  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000240109 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3957  guanylate kinase  45.63 
 
 		 207 aa  183  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3859  guanylate kinase  45.63 
 
 		 207 aa  184  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3433  guanylate kinase  45.36 
 
 		 207 aa  183  1.0000000000000001e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.21703  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0210  guanylate kinase  44.66 
 
 		 207 aa  184  1.0000000000000001e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3613  guanylate kinase  44.1 
 
 		 207 aa  183  1.0000000000000001e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3948  guanylate kinase  45.63 
 
 		 207 aa  183  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00531185 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3983  guanylate kinase  45.63 
 
 		 207 aa  184  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4020  guanylate kinase  45.63 
 
 		 207 aa  183  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5020  guanylate kinase  45.63 
 
 		 207 aa  183  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1003  guanylate kinase  51.71 
 
 		 221 aa  183  2.0000000000000003e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0048  guanylate kinase  50 
 
 		 202 aa  182  3e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0361  guanylate kinase  44.1 
 
 		 207 aa  182  4.0000000000000006e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0365  guanylate kinase  43.27 
 
 		 207 aa  182  4.0000000000000006e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3810  guanylate kinase  44.1 
 
 		 207 aa  182  4.0000000000000006e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.18291  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3894  guanylate kinase  47.15 
 
 		 200 aa  181  6e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000112061  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5842  guanylate kinase  45.75 
 
 		 259 aa  181  6e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.509377 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4581  guanylate kinase  44.23 
 
 		 207 aa  181  7e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.877029  unclonable  0.0000000250462 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0251  guanylate kinase  50 
 
 		 207 aa  181  8.000000000000001e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000337673  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00153  guanylate kinase  47.21 
 
 		 213 aa  181  9.000000000000001e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0558456  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3497  guanylate kinase  43.59 
 
 		 207 aa  180  1e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4019  guanylate kinase  50.53 
 
 		 204 aa  180  2e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.565127  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4388  guanylate kinase  50 
 
 		 205 aa  180  2e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.11044 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0091  guanylate kinase  44.66 
 
 		 207 aa  179  2.9999999999999997e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1457  guanylate kinase  48.19 
 
 		 212 aa  178  4.999999999999999e-44  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0052  guanylate kinase  47.12 
 
 		 210 aa  178  5.999999999999999e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00408303  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70440  guanylate kinase  50.26 
 
 		 203 aa  178  5.999999999999999e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0075  guanylate kinase  46.7 
 
 		 214 aa  177  8e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3877  guanylate kinase  43.59 
 
 		 210 aa  177  8e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0545  guanylate kinase  46.32 
 
 		 203 aa  176  2e-43  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.071067  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0045  guanylate kinase  44.44 
 
 		 207 aa  175  4e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1311  guanylate kinase  44.5 
 
 		 205 aa  175  5e-43  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1192  guanylate kinase  44.5 
 
 		 207 aa  175  5e-43  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6112  guanylate kinase  49.74 
 
 		 203 aa  174  6e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.509466  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0041  guanylate kinase  44.44 
 
 		 207 aa  174  7e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4176  guanylate kinase  44.44 
 
 		 207 aa  174  7e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0297777  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0100  guanylate kinase  42.33 
 
 		 202 aa  174  9e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0912271  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3845  guanylate kinase  48.65 
 
 		 202 aa  174  9.999999999999999e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>