More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_5842 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_5842  guanylate kinase  100 
 
 
259 aa  523  1e-147  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.509377 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2472  guanylate kinase  51.53 
 
 
220 aa  208  8e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2974  guanylate kinase  52.04 
 
 
219 aa  207  1e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.291122 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0294  guanylate kinase  55.1 
 
 
212 aa  203  3e-51  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3479  guanylate kinase  51.02 
 
 
220 aa  202  4e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1763  guanylate kinase  49.74 
 
 
218 aa  201  8e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.201865  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3823  guanylate kinase  50.78 
 
 
219 aa  199  5e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.162212 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0469  guanylate kinase  52.75 
 
 
220 aa  197  1.0000000000000001e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.149667  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0464  guanylate kinase  52.75 
 
 
220 aa  197  1.0000000000000001e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.328382  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1535  guanylate kinase  50.28 
 
 
220 aa  197  1.0000000000000001e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0748909  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2444  guanylate kinase  53.97 
 
 
203 aa  197  1.0000000000000001e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.337517 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1062  guanylate kinase  48.77 
 
 
220 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0143004 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0759  guanylate kinase  52.91 
 
 
219 aa  196  3e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.784504  normal  0.122144 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1205  guanylate kinase  49.75 
 
 
220 aa  196  4.0000000000000005e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.197853  hitchhiker  0.00108752 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3354  guanylate kinase  51.11 
 
 
212 aa  195  6e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1104  guanylate kinase  50.83 
 
 
211 aa  193  2e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.631702  normal  0.011032 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3155  guanylate kinase  52.22 
 
 
220 aa  193  3e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2305  guanylate kinase  49 
 
 
219 aa  192  4e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00214709  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3630  guanylate kinase  50 
 
 
224 aa  190  2e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.09026  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1285  guanylate kinase  52.2 
 
 
210 aa  190  2e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000194386  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0576  guanylate kinase  49.72 
 
 
220 aa  189  2.9999999999999997e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.400734  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2348  guanylate kinase  49.49 
 
 
219 aa  189  2.9999999999999997e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2714  guanylate kinase  51.67 
 
 
213 aa  189  5e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3136  guanylate kinase  51.11 
 
 
231 aa  188  5.999999999999999e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.328978 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0502  guanylate kinase  46.41 
 
 
221 aa  188  8e-47  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0976  guanylate kinase  52.11 
 
 
211 aa  187  1e-46  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.194665  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3894  guanylate kinase  48.15 
 
 
200 aa  186  2e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000112061  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3613  guanylate kinase  51.67 
 
 
207 aa  187  2e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0330  guanylate kinase  52.22 
 
 
224 aa  187  2e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0351596  normal  0.331396 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0355  guanylate kinase  48.53 
 
 
210 aa  186  3e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.398163  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0363  guanylate kinase  48.53 
 
 
210 aa  186  3e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000053777 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3877  guanylate kinase  48.53 
 
 
210 aa  186  3e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2277  guanylate kinase  48.72 
 
 
223 aa  186  3e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.140709  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0353  guanylate kinase  48.53 
 
 
210 aa  186  3e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2000  guanylate kinase  48.72 
 
 
223 aa  186  3e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0607745  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0360  guanylate kinase  48.53 
 
 
210 aa  186  3e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2573  guanylate kinase  55.1 
 
 
223 aa  186  4e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0392077 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3810  guanylate kinase  52.22 
 
 
207 aa  185  5e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.18291  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0361  guanylate kinase  51.67 
 
 
207 aa  185  6e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0429  guanylate kinase  47.34 
 
 
218 aa  184  8e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2692  guanylate kinase  52.94 
 
 
225 aa  184  1.0000000000000001e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2606  guanylate kinase  53.03 
 
 
226 aa  184  1.0000000000000001e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.100354  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2787  guanylate kinase  52.94 
 
 
225 aa  184  1.0000000000000001e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1220  guanylate kinase  51.03 
 
 
218 aa  184  1.0000000000000001e-45  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.289802 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3497  guanylate kinase  47.06 
 
 
207 aa  183  2.0000000000000003e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3720  guanylate kinase  51.1 
 
 
220 aa  183  3e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0647286  normal  0.109171 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1683  guanylate kinase  47.96 
 
 
219 aa  182  4.0000000000000006e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1529  guanylate kinase  50.28 
 
 
217 aa  182  4.0000000000000006e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.2579 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3845  guanylate kinase  50 
 
 
202 aa  181  9.000000000000001e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2084  guanylate kinase  54.44 
 
 
207 aa  181  1e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.338387  decreased coverage  0.00871463 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00153  guanylate kinase  49.18 
 
 
213 aa  181  1e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0558456  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2919  guanylate kinase  51.93 
 
 
211 aa  180  2e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0988  guanylate kinase  44.62 
 
 
234 aa  180  2e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0107524 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5204  guanylate kinase  49.72 
 
 
206 aa  180  2e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.952406  normal  0.288026 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2286  guanylate kinase  49.22 
 
 
202 aa  180  2e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.30068  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1563  guanylate kinase  51.93 
 
 
211 aa  180  2e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.106259  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1953  guanylate kinase  47.42 
 
 
223 aa  179  4e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.217119  normal  0.0786696 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1406  Guanylate kinase  51.37 
 
 
202 aa  179  4e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.77411  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3623  guanylate kinase  47.87 
 
 
207 aa  178  7e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1845  guanylate kinase  46.43 
 
 
230 aa  178  8e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1266  guanylate kinase  48.91 
 
 
217 aa  177  1e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.979121  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0336  guanylate kinase  49.44 
 
 
207 aa  177  1e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.57704 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0717  guanylate kinase  49.44 
 
 
212 aa  177  2e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000116826 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1003  guanylate kinase  49.74 
 
 
221 aa  177  2e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0563  guanylate kinase  49.44 
 
 
212 aa  177  2e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0251  guanylate kinase  46.49 
 
 
207 aa  177  2e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000337673  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1138  Guanylate kinase  51.11 
 
 
209 aa  176  3e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2902  guanylate kinase  51.37 
 
 
215 aa  176  3e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5296  guanylate kinase  48.04 
 
 
206 aa  176  4e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0446222  normal  0.471806 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0726  guanylate kinase  44.79 
 
 
206 aa  176  4e-43  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2401  guanylate kinase  45.55 
 
 
202 aa  176  4e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0298091  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3433  guanylate kinase  47.57 
 
 
207 aa  176  5e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.21703  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3936  guanylate kinase  47.92 
 
 
212 aa  176  5e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0347  guanylate kinase  46.12 
 
 
215 aa  175  7e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5344  guanylate kinase  47.49 
 
 
206 aa  175  8e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0394211 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2719  guanylate kinase  51.91 
 
 
206 aa  175  8e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00356396  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4019  guanylate kinase  46.84 
 
 
204 aa  174  9.999999999999999e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.565127  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0177  guanylate kinase  44.62 
 
 
206 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000695034 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3193  guanylate kinase  47.47 
 
 
219 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0391032 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4581  guanylate kinase  48.89 
 
 
207 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.877029  unclonable  0.0000000250462 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70440  guanylate kinase  48.63 
 
 
203 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0266  guanylate kinase  50 
 
 
207 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2781  guanylate kinase  45.75 
 
 
219 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0091  guanylate kinase  48.07 
 
 
207 aa  172  3.9999999999999995e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4388  guanylate kinase  45.25 
 
 
205 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.11044 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6112  guanylate kinase  48.63 
 
 
203 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.509466  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2138  guanylate kinase  43.68 
 
 
205 aa  172  5.999999999999999e-42  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.585915  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0365  guanylate kinase  47.78 
 
 
207 aa  172  5.999999999999999e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3957  guanylate kinase  48.07 
 
 
207 aa  171  7.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4066  guanylate kinase  48.07 
 
 
207 aa  171  7.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4020  guanylate kinase  48.07 
 
 
207 aa  171  7.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4127  guanylate kinase  48.07 
 
 
207 aa  171  7.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.514606  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3948  guanylate kinase  48.07 
 
 
207 aa  171  7.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00531185 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03505  guanylate kinase  48.07 
 
 
207 aa  170  2e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0057  Guanylate kinase  48.07 
 
 
207 aa  170  2e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0063  guanylate kinase  48.07 
 
 
207 aa  170  2e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000240109 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4151  guanylate kinase  48.07 
 
 
207 aa  170  2e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3859  guanylate kinase  48.07 
 
 
207 aa  170  2e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03457  hypothetical protein  48.07 
 
 
207 aa  170  2e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3983  guanylate kinase  48.07 
 
 
207 aa  170  2e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>