More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_1205 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_1205  guanylate kinase  100 
 
 
220 aa  449  1e-125  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.197853  hitchhiker  0.00108752 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1062  guanylate kinase  96.82 
 
 
220 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0143004 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1535  guanylate kinase  83.18 
 
 
220 aa  380  1e-105  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0748909  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0759  guanylate kinase  77.06 
 
 
219 aa  355  1.9999999999999998e-97  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.784504  normal  0.122144 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0576  guanylate kinase  70 
 
 
220 aa  312  1.9999999999999998e-84  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.400734  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0464  guanylate kinase  69.19 
 
 
220 aa  308  4e-83  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.328382  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0469  guanylate kinase  69.19 
 
 
220 aa  308  4e-83  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.149667  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1763  guanylate kinase  65.58 
 
 
218 aa  291  6e-78  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.201865  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1953  guanylate kinase  57.97 
 
 
223 aa  251  7e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.217119  normal  0.0786696 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0502  guanylate kinase  57.21 
 
 
221 aa  249  3e-65  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3720  guanylate kinase  61.24 
 
 
220 aa  248  4e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0647286  normal  0.109171 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2000  guanylate kinase  57.49 
 
 
223 aa  248  7e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0607745  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2277  guanylate kinase  57.49 
 
 
223 aa  248  7e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.140709  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0988  guanylate kinase  57.28 
 
 
234 aa  241  7.999999999999999e-63  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0107524 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1290  guanylate kinase  60.4 
 
 
205 aa  238  5e-62  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.609971  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2348  guanylate kinase  56.65 
 
 
219 aa  238  5e-62  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3155  guanylate kinase  52.38 
 
 
220 aa  238  5.999999999999999e-62  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3936  guanylate kinase  53.59 
 
 
212 aa  233  1.0000000000000001e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1683  guanylate kinase  54.68 
 
 
219 aa  233  2.0000000000000002e-60  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3823  guanylate kinase  54.68 
 
 
219 aa  232  3e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.162212 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0429  guanylate kinase  53.05 
 
 
218 aa  232  3e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2781  guanylate kinase  55.3 
 
 
219 aa  230  1e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3193  guanylate kinase  57.08 
 
 
219 aa  230  1e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0391032 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1563  guanylate kinase  55.88 
 
 
211 aa  227  1e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.106259  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2919  guanylate kinase  55.88 
 
 
211 aa  226  2e-58  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2305  guanylate kinase  52.71 
 
 
219 aa  226  2e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00214709  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2714  guanylate kinase  49.29 
 
 
213 aa  225  4e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2974  guanylate kinase  48.83 
 
 
219 aa  225  4e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.291122 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1845  guanylate kinase  52.68 
 
 
230 aa  224  9e-58  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3136  guanylate kinase  54.19 
 
 
231 aa  224  1e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.328978 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2472  guanylate kinase  48.83 
 
 
220 aa  221  7e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3479  guanylate kinase  48.36 
 
 
220 aa  217  8.999999999999998e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3354  guanylate kinase  51.69 
 
 
212 aa  216  2e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1104  guanylate kinase  51.21 
 
 
211 aa  209  2e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.631702  normal  0.011032 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1220  guanylate kinase  49.51 
 
 
218 aa  208  5e-53  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.289802 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2440  guanylate kinase  50.24 
 
 
218 aa  207  1e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000682251 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1003  guanylate kinase  53.47 
 
 
221 aa  204  9e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1266  guanylate kinase  47.37 
 
 
217 aa  201  8e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.979121  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1529  guanylate kinase  46.89 
 
 
217 aa  200  1.9999999999999998e-50  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.2579 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0336  guanylate kinase  45.89 
 
 
207 aa  198  6e-50  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.57704 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5842  guanylate kinase  49.75 
 
 
259 aa  196  3e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.509377 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00630  guanylate kinase  47.26 
 
 
207 aa  195  5.000000000000001e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3894  guanylate kinase  47.96 
 
 
200 aa  195  5.000000000000001e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000112061  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03505  guanylate kinase  51.03 
 
 
207 aa  194  8.000000000000001e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0057  Guanylate kinase  51.03 
 
 
207 aa  194  8.000000000000001e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3859  guanylate kinase  51.03 
 
 
207 aa  194  8.000000000000001e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03457  hypothetical protein  51.03 
 
 
207 aa  194  8.000000000000001e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3983  guanylate kinase  51.03 
 
 
207 aa  194  8.000000000000001e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4151  guanylate kinase  51.03 
 
 
207 aa  194  8.000000000000001e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0063  guanylate kinase  51.03 
 
 
207 aa  194  8.000000000000001e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000240109 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4099  guanylate kinase  51.03 
 
 
207 aa  194  8.000000000000001e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4581  guanylate kinase  46.86 
 
 
207 aa  194  9e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.877029  unclonable  0.0000000250462 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2523  guanylate kinase  44.83 
 
 
214 aa  194  1e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5020  guanylate kinase  51.03 
 
 
207 aa  193  2e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3948  guanylate kinase  51.03 
 
 
207 aa  193  2e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.498976  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001862  guanylate kinase  46.77 
 
 
207 aa  192  4e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4127  guanylate kinase  50.52 
 
 
207 aa  191  6e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.514606  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4020  guanylate kinase  50.52 
 
 
207 aa  191  6e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3957  guanylate kinase  50.52 
 
 
207 aa  191  6e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3948  guanylate kinase  50.52 
 
 
207 aa  191  6e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00531185 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4066  guanylate kinase  50.52 
 
 
207 aa  191  6e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4019  guanylate kinase  48.95 
 
 
204 aa  191  8e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.565127  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0266  guanylate kinase  47.17 
 
 
207 aa  191  8e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0251  guanylate kinase  50.53 
 
 
207 aa  191  8e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000337673  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4176  guanylate kinase  50 
 
 
207 aa  190  1e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0297777  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0041  guanylate kinase  50 
 
 
207 aa  190  1e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0365  guanylate kinase  42.38 
 
 
207 aa  190  1e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0048  guanylate kinase  46.53 
 
 
202 aa  190  2e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3613  guanylate kinase  44.88 
 
 
207 aa  189  2e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0330  guanylate kinase  44.88 
 
 
224 aa  190  2e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0351596  normal  0.331396 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1761  guanylate kinase  41.09 
 
 
207 aa  189  2.9999999999999997e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0045  guanylate kinase  49.48 
 
 
207 aa  189  2.9999999999999997e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0091  guanylate kinase  50 
 
 
207 aa  189  2.9999999999999997e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3810  guanylate kinase  44.61 
 
 
207 aa  189  2.9999999999999997e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.18291  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0363  guanylate kinase  44.39 
 
 
210 aa  189  4e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000053777 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0360  guanylate kinase  44.39 
 
 
210 aa  188  5.999999999999999e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0355  guanylate kinase  44.39 
 
 
210 aa  188  5.999999999999999e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.398163  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3623  guanylate kinase  46.03 
 
 
207 aa  188  5.999999999999999e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0353  guanylate kinase  44.39 
 
 
210 aa  188  5.999999999999999e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4145  guanylate kinase  48.45 
 
 
207 aa  188  5.999999999999999e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3630  guanylate kinase  43.9 
 
 
224 aa  187  1e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.09026  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0361  guanylate kinase  43.9 
 
 
207 aa  186  2e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3497  guanylate kinase  44.88 
 
 
207 aa  186  2e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00153  guanylate kinase  47.92 
 
 
213 aa  185  6e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0558456  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3877  guanylate kinase  45.1 
 
 
210 aa  184  7e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0110  guanylate kinase  45.83 
 
 
204 aa  184  9e-46  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.361568  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2280  guanylate kinase  45.31 
 
 
229 aa  184  1.0000000000000001e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0210  guanylate kinase  44.79 
 
 
207 aa  184  1.0000000000000001e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3260  guanylate kinase  42.47 
 
 
221 aa  182  3e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3433  guanylate kinase  43.75 
 
 
207 aa  182  4.0000000000000006e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.21703  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0856  guanylate kinase  45.73 
 
 
216 aa  182  5.0000000000000004e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0756  guanylate kinase  45.99 
 
 
204 aa  181  6e-45  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0347  guanylate kinase  43.37 
 
 
215 aa  181  7e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4867  guanylate kinase  49.73 
 
 
207 aa  181  7e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.807857  hitchhiker  0.00555507 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0563  guanylate kinase  45.59 
 
 
212 aa  181  8.000000000000001e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0717  guanylate kinase  45.59 
 
 
212 aa  181  8.000000000000001e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000116826 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0843  guanylate kinase  45.45 
 
 
204 aa  180  1e-44  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0177  guanylate kinase  43.3 
 
 
206 aa  180  1e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000695034 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1956  guanylate kinase  45.37 
 
 
221 aa  180  2e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.414906 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2276  guanylate kinase  44.88 
 
 
221 aa  179  2.9999999999999997e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0318334  normal  0.859222 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>