More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_2902 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_2902  guanylate kinase  100 
 
 
215 aa  449  1e-125  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0294  guanylate kinase  61 
 
 
212 aa  256  1e-67  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2084  guanylate kinase  59.8 
 
 
207 aa  250  1e-65  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.338387  decreased coverage  0.00871463 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1138  Guanylate kinase  56.78 
 
 
209 aa  244  6.999999999999999e-64  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2719  guanylate kinase  58.29 
 
 
206 aa  240  1e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00356396  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1406  Guanylate kinase  56.22 
 
 
202 aa  225  5.0000000000000005e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.77411  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2238  guanylate kinase  47.31 
 
 
203 aa  190  1e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0099  guanylate kinase  42.71 
 
 
204 aa  189  2e-47  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.261524  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2401  guanylate kinase  48.92 
 
 
202 aa  186  2e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0298091  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3630  guanylate kinase  48.91 
 
 
209 aa  185  4e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.601224  normal  0.100424 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09810  Guanylate kinase  45.11 
 
 
194 aa  182  2.0000000000000003e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5842  guanylate kinase  51.37 
 
 
259 aa  183  2.0000000000000003e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.509377 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2523  guanylate kinase  45.36 
 
 
214 aa  182  2.0000000000000003e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2327  guanylate kinase  46.2 
 
 
203 aa  182  3e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000761567  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0793  guanylate kinase  44.39 
 
 
212 aa  182  4.0000000000000006e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.637166 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3845  guanylate kinase  50 
 
 
202 aa  181  6e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3894  guanylate kinase  46.28 
 
 
200 aa  180  1e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000112061  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0330  guanylate kinase  48.19 
 
 
224 aa  180  1e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0351596  normal  0.331396 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3613  guanylate kinase  47.67 
 
 
207 aa  179  2e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1078  guanylate kinase  44.28 
 
 
212 aa  177  1e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1050  guanylate kinase  47.28 
 
 
202 aa  177  1e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000462152 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1700  guanylate kinase  44.97 
 
 
200 aa  177  1e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3213  guanylate kinase  47.28 
 
 
202 aa  177  1e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000935163  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1719  guanylate kinase  43.32 
 
 
216 aa  176  2e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3810  guanylate kinase  47.15 
 
 
207 aa  176  2e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.18291  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2001  guanylate kinase  43.55 
 
 
216 aa  176  3e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3630  guanylate kinase  47.67 
 
 
224 aa  176  3e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.09026  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0361  guanylate kinase  46.63 
 
 
207 aa  175  5e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1285  guanylate kinase  46.74 
 
 
210 aa  172  1.9999999999999998e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000194386  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2286  guanylate kinase  47.8 
 
 
202 aa  173  1.9999999999999998e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.30068  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1237  guanylate kinase  42.93 
 
 
195 aa  172  1.9999999999999998e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.74814  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0355  guanylate kinase  46.63 
 
 
210 aa  172  2.9999999999999996e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.398163  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0360  guanylate kinase  46.63 
 
 
210 aa  172  2.9999999999999996e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0052  guanylate kinase  43.92 
 
 
210 aa  172  2.9999999999999996e-42  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00408303  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0353  guanylate kinase  46.63 
 
 
210 aa  172  2.9999999999999996e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00153  guanylate kinase  46.84 
 
 
213 aa  172  2.9999999999999996e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0558456  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0759  guanylate kinase  46.23 
 
 
219 aa  171  6.999999999999999e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.784504  normal  0.122144 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3720  guanylate kinase  46.39 
 
 
220 aa  171  6.999999999999999e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0647286  normal  0.109171 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0363  guanylate kinase  46.11 
 
 
210 aa  171  6.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000053777 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2787  guanylate kinase  50.53 
 
 
225 aa  170  1e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1677  guanylate kinase  42.19 
 
 
217 aa  171  1e-41  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2606  guanylate kinase  50.53 
 
 
226 aa  170  1e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.100354  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0100  guanylate kinase  41.3 
 
 
202 aa  170  1e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0912271  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3433  guanylate kinase  46.99 
 
 
207 aa  170  1e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.21703  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1761  guanylate kinase  40.21 
 
 
207 aa  170  1e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2692  guanylate kinase  50.53 
 
 
225 aa  170  2e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1953  guanylate kinase  44.06 
 
 
223 aa  170  2e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.217119  normal  0.0786696 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1763  guanylate kinase  47.47 
 
 
218 aa  169  2e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.201865  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1597  guanylate kinase  46.03 
 
 
197 aa  169  2e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00198885  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1062  guanylate kinase  44.72 
 
 
220 aa  169  4e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0143004 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1535  guanylate kinase  45.95 
 
 
220 aa  169  4e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0748909  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4019  guanylate kinase  46.77 
 
 
204 aa  168  4e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.565127  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4124  Guanylate kinase  44.09 
 
 
233 aa  168  6e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0336  guanylate kinase  49.18 
 
 
207 aa  168  6e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.57704 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3623  guanylate kinase  45.36 
 
 
207 aa  167  8e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3155  guanylate kinase  45.95 
 
 
220 aa  167  8e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2473  guanylate kinase  42.79 
 
 
216 aa  167  1e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.276793  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4020  guanylate kinase  45.18 
 
 
207 aa  167  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3948  guanylate kinase  45.18 
 
 
207 aa  167  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00531185 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4127  guanylate kinase  45.18 
 
 
207 aa  167  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.514606  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3957  guanylate kinase  45.18 
 
 
207 aa  167  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4066  guanylate kinase  45.18 
 
 
207 aa  167  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0091  guanylate kinase  44.67 
 
 
207 aa  166  2e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70440  guanylate kinase  46.74 
 
 
203 aa  166  2e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4145  guanylate kinase  46.77 
 
 
207 aa  166  2.9999999999999998e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2919  guanylate kinase  47.31 
 
 
211 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1563  guanylate kinase  47.31 
 
 
211 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.106259  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1205  guanylate kinase  46.49 
 
 
220 aa  166  4e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.197853  hitchhiker  0.00108752 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4581  guanylate kinase  47.54 
 
 
207 aa  165  4e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.877029  unclonable  0.0000000250462 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0856  guanylate kinase  41.29 
 
 
216 aa  165  4e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6112  guanylate kinase  46.74 
 
 
203 aa  165  4e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.509466  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3354  guanylate kinase  47.75 
 
 
212 aa  165  5e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2000  guanylate kinase  43.15 
 
 
223 aa  164  6.9999999999999995e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0607745  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2277  guanylate kinase  43.15 
 
 
223 aa  164  6.9999999999999995e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.140709  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1104  guanylate kinase  45.16 
 
 
211 aa  164  6.9999999999999995e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.631702  normal  0.011032 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2345  guanylate kinase  46.07 
 
 
193 aa  164  6.9999999999999995e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.849127  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2276  guanylate kinase  42.29 
 
 
221 aa  163  1.0000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0318334  normal  0.859222 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1723  guanylate kinase  45.6 
 
 
208 aa  163  1.0000000000000001e-39  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.671499 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1475  guanylate kinase  43.68 
 
 
199 aa  164  1.0000000000000001e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000468376  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0717  guanylate kinase  45.6 
 
 
212 aa  164  1.0000000000000001e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000116826 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0563  guanylate kinase  45.6 
 
 
212 aa  164  1.0000000000000001e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3948  guanylate kinase  46.77 
 
 
207 aa  164  1.0000000000000001e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.498976  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0905  guanylate kinase  42.29 
 
 
225 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.247766  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2003  guanylate kinase  45.6 
 
 
208 aa  163  1.0000000000000001e-39  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.170887 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0473  guanylate kinase  49.15 
 
 
209 aa  163  2.0000000000000002e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_17617  predicted protein  43.88 
 
 
227 aa  163  2.0000000000000002e-39  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.910339  hitchhiker  0.000867282 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5344  guanylate kinase  42.21 
 
 
206 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0394211 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2444  guanylate kinase  45.65 
 
 
203 aa  163  2.0000000000000002e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.337517 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03505  guanylate kinase  43.65 
 
 
207 aa  162  3e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0057  Guanylate kinase  43.65 
 
 
207 aa  162  3e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4099  guanylate kinase  43.65 
 
 
207 aa  162  3e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_72675  guanylate kinase (GUK1)  44.2 
 
 
193 aa  162  3e-39  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.12779  normal  0.729563 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3877  guanylate kinase  43.43 
 
 
210 aa  162  3e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3859  guanylate kinase  43.65 
 
 
207 aa  162  3e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3983  guanylate kinase  43.65 
 
 
207 aa  162  3e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1845  guanylate kinase  49.18 
 
 
230 aa  162  3e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04671  guanylate kinase  42.08 
 
 
185 aa  162  3e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0895533  normal  0.75989 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4151  guanylate kinase  43.65 
 
 
207 aa  162  3e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0063  guanylate kinase  43.65 
 
 
207 aa  162  3e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000240109 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03457  hypothetical protein  43.65 
 
 
207 aa  162  3e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>