More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_1700 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_1700  guanylate kinase  100 
 
 		 200 aa  408  1e-113  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2318  guanylate kinase  60.61 
 
 		 198 aa  256  2e-67  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000195285  hitchhiker  0.00462206 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1761  guanylate kinase  56.99 
 
 		 207 aa  232  3e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1237  guanylate kinase  54.36 
 
 		 195 aa  221  6e-57  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.74814  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3894  guanylate kinase  57.3 
 
 		 200 aa  220  9.999999999999999e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000112061  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2001  guanylate kinase  54.59 
 
 		 216 aa  217  8.999999999999998e-56  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1719  guanylate kinase  54.59 
 
 		 216 aa  217  8.999999999999998e-56  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1597  guanylate kinase  54.5 
 
 		 197 aa  216  2.9999999999999998e-55  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00198885  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1713  guanylate kinase  53.97 
 
 		 198 aa  214  9.999999999999999e-55  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.463283  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1176  guanylate kinase  53.97 
 
 		 206 aa  211  3.9999999999999995e-54  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000749098  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1035  guanylate kinase  53.57 
 
 		 199 aa  212  3.9999999999999995e-54  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0962  guanylate kinase  50.76 
 
 		 202 aa  209  2e-53  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0132271  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09810  Guanylate kinase  54.59 
 
 		 194 aa  208  3e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1329  guanylate kinase  51.87 
 
 		 204 aa  208  3e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000708025  normal  0.428768 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1677  guanylate kinase  50.81 
 
 		 217 aa  208  4e-53  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0840  guanylate kinase  53.76 
 
 		 202 aa  206  2e-52  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1058  guanylate kinase  51.85 
 
 		 204 aa  205  4e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000145749  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0313  guanylate kinase  53.44 
 
 		 209 aa  204  1e-51  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0875391  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1791  guanylate kinase  48.42 
 
 		 201 aa  203  2e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.395222  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2158  guanylate kinase  51.06 
 
 		 205 aa  199  1.9999999999999998e-50  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2093  guanylate kinase  52.41 
 
 		 223 aa  197  7.999999999999999e-50  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.353708  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1948  guanylate kinase  49.46 
 
 		 205 aa  196  1.0000000000000001e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1398  guanylate kinase  51.32 
 
 		 209 aa  196  3e-49  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00115166  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3823  guanylate kinase  48.66 
 
 		 219 aa  192  3e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.162212 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1231  guanylate kinase  48.97 
 
 		 198 aa  192  3e-48  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.726797  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0634  guanylate kinase  48.19 
 
 		 210 aa  192  3e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0099  guanylate kinase  47.57 
 
 		 204 aa  191  5e-48  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.261524  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1319  guanylate kinase  51.89 
 
 		 224 aa  191  9e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.773987  normal  0.110661 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2138  guanylate kinase  48.35 
 
 		 205 aa  190  1e-47  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.585915  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2975  guanylate kinase  49.73 
 
 		 204 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4145  guanylate kinase  49.2 
 
 		 207 aa  188  4e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0758  guanylate kinase  48.68 
 
 		 204 aa  187  7e-47  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000183217  hitchhiker  0.0000103593 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1683  guanylate kinase  45.99 
 
 		 219 aa  187  8e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03505  guanylate kinase  49.73 
 
 		 207 aa  186  2e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0057  Guanylate kinase  49.73 
 
 		 207 aa  186  2e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0063  guanylate kinase  49.73 
 
 		 207 aa  186  2e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000240109 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03457  hypothetical protein  49.73 
 
 		 207 aa  186  2e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4151  guanylate kinase  49.73 
 
 		 207 aa  186  2e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3859  guanylate kinase  49.73 
 
 		 207 aa  186  2e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4099  guanylate kinase  49.73 
 
 		 207 aa  186  2e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3948  guanylate kinase  48.72 
 
 		 207 aa  186  2e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.498976  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3155  guanylate kinase  46.56 
 
 		 220 aa  186  2e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3983  guanylate kinase  49.73 
 
 		 207 aa  186  2e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2238  guanylate kinase  45.26 
 
 		 203 aa  185  4e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0976  guanylate kinase  48.13 
 
 		 211 aa  184  6e-46  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.194665  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2348  guanylate kinase  48.13 
 
 		 219 aa  184  6e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2714  guanylate kinase  47.09 
 
 		 213 aa  184  8e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3233  guanylate kinase  43.24 
 
 		 215 aa  184  8e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0759  guanylate kinase  46.03 
 
 		 219 aa  184  8e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.784504  normal  0.122144 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1457  guanylate kinase  48.66 
 
 		 212 aa  183  1.0000000000000001e-45  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0776  guanylate kinase  44.56 
 
 		 207 aa  183  2.0000000000000003e-45  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.753859  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3213  guanylate kinase  47.34 
 
 		 202 aa  182  2.0000000000000003e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000935163  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0052  guanylate kinase  44.21 
 
 		 210 aa  183  2.0000000000000003e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00408303  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5020  guanylate kinase  49.2 
 
 		 207 aa  183  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0785  guanylate kinase  50.54 
 
 		 201 aa  182  2.0000000000000003e-45  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000101008  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2444  guanylate kinase  45.11 
 
 		 203 aa  183  2.0000000000000003e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.337517 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1535  guanylate kinase  44.16 
 
 		 220 aa  183  2.0000000000000003e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0748909  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1315  guanylate kinase  47.89 
 
 		 203 aa  183  2.0000000000000003e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.559001  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3948  guanylate kinase  48.66 
 
 		 207 aa  182  3e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00531185 
 
 
-
 
NC_004310  BR0464  guanylate kinase  46.23 
 
 		 220 aa  182  3e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.328382  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4066  guanylate kinase  48.66 
 
 		 207 aa  182  3e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4020  guanylate kinase  48.66 
 
 		 207 aa  182  3e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1050  guanylate kinase  47.34 
 
 		 202 aa  182  3e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000462152 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0469  guanylate kinase  46.23 
 
 		 220 aa  182  3e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.149667  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3957  guanylate kinase  48.66 
 
 		 207 aa  182  3e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4127  guanylate kinase  48.66 
 
 		 207 aa  182  3e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.514606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4388  guanylate kinase  45.11 
 
 		 205 aa  182  3e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.11044 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3630  guanylate kinase  45.31 
 
 		 224 aa  182  4.0000000000000006e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.09026  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0717  guanylate kinase  47.85 
 
 		 212 aa  181  4.0000000000000006e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000116826 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0563  guanylate kinase  47.85 
 
 		 212 aa  181  4.0000000000000006e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07800  guanylate kinase  47.62 
 
 		 189 aa  182  4.0000000000000006e-45  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.364153  normal  0.897368 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4124  Guanylate kinase  46.37 
 
 		 233 aa  181  4.0000000000000006e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0985  guanylate kinase  46.49 
 
 		 207 aa  182  4.0000000000000006e-45  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00175631  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2523  guanylate kinase  48.94 
 
 		 205 aa  181  5.0000000000000004e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1763  guanylate kinase  43.92 
 
 		 218 aa  181  5.0000000000000004e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.201865  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0353  guanylate kinase  45.99 
 
 		 210 aa  181  6e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0355  guanylate kinase  45.99 
 
 		 210 aa  181  6e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.398163  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0360  guanylate kinase  45.99 
 
 		 210 aa  181  6e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1268  guanylate kinase  44.04 
 
 		 207 aa  180  1e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.33638  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1145  guanylate kinase  46.49 
 
 		 207 aa  180  1e-44  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.49439  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3623  guanylate kinase  45.18 
 
 		 207 aa  180  1e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4384  guanylate kinase  44.09 
 
 		 207 aa  180  1e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0363  guanylate kinase  45.45 
 
 		 210 aa  180  1e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000053777 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1293  guanylate kinase  44.04 
 
 		 207 aa  180  1e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1062  guanylate kinase  45.5 
 
 		 220 aa  180  1e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0143004 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0959  guanylate kinase  45.45 
 
 		 227 aa  179  2e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.465114  normal  0.426596 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1285  guanylate kinase  46.84 
 
 		 210 aa  179  2e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000194386  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4107  guanylate kinase  45.45 
 
 		 227 aa  179  2e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0130992  normal  0.288359 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0100  guanylate kinase  44.27 
 
 		 202 aa  179  2e-44  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0912271  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0091  guanylate kinase  48.13 
 
 		 207 aa  179  2e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0520  guanylate kinase  45.45 
 
 		 227 aa  179  2e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0999  guanylate kinase  45.45 
 
 		 227 aa  179  2e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4581  guanylate kinase  46.07 
 
 		 207 aa  179  2.9999999999999997e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.877029  unclonable  0.0000000250462 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0859  guanylate kinase  45.45 
 
 		 227 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.675802  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0871  guanylate kinase  45.45 
 
 		 227 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0361  guanylate kinase  43.23 
 
 		 207 aa  178  4.999999999999999e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0729  guanylate kinase  43.15 
 
 		 209 aa  178  4.999999999999999e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.148488 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3479  guanylate kinase  44.92 
 
 		 220 aa  178  4.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1205  guanylate kinase  45.5 
 
 		 220 aa  178  4.999999999999999e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.197853  hitchhiker  0.00108752 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3810  guanylate kinase  44.27 
 
 		 207 aa  178  4.999999999999999e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.18291  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>