More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_2093 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_2093  guanylate kinase  100 
 
 
223 aa  450  1.0000000000000001e-126  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.353708  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1319  guanylate kinase  76.34 
 
 
224 aa  321  6e-87  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.773987  normal  0.110661 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2284  guanylate kinase  59.14 
 
 
242 aa  217  8.999999999999998e-56  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.429726  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1176  guanylate kinase  50 
 
 
206 aa  204  1e-51  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000749098  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1700  guanylate kinase  52.41 
 
 
200 aa  197  9e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1058  guanylate kinase  47.98 
 
 
204 aa  192  2e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000145749  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09810  Guanylate kinase  47.31 
 
 
194 aa  192  3e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1948  guanylate kinase  48.24 
 
 
205 aa  192  3e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1035  guanylate kinase  49.21 
 
 
199 aa  192  3e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2318  guanylate kinase  49.46 
 
 
198 aa  190  1e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000195285  hitchhiker  0.00462206 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2158  guanylate kinase  50.77 
 
 
205 aa  190  2e-47  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0313  guanylate kinase  47.14 
 
 
209 aa  189  2.9999999999999997e-47  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0875391  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0190  guanylate kinase  52.49 
 
 
184 aa  189  4e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.160767 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0195  guanylate kinase  52.49 
 
 
188 aa  188  4e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1231  guanylate kinase  48.72 
 
 
198 aa  185  4e-46  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.726797  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1713  guanylate kinase  48.21 
 
 
198 aa  183  2.0000000000000003e-45  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.463283  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0776  guanylate kinase  45.45 
 
 
207 aa  182  3e-45  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.753859  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4981  guanylate kinase  49.44 
 
 
198 aa  182  3e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.023832  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3894  guanylate kinase  46.49 
 
 
200 aa  182  3e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000112061  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1398  guanylate kinase  48.95 
 
 
209 aa  182  3e-45  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00115166  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1791  guanylate kinase  43.3 
 
 
201 aa  182  4.0000000000000006e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.395222  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3426  Guanylate kinase  52.25 
 
 
194 aa  181  5.0000000000000004e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4581  guanylate kinase  47.31 
 
 
207 aa  180  1e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.877029  unclonable  0.0000000250462 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1475  guanylate kinase  51.1 
 
 
199 aa  181  1e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000468376  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1329  guanylate kinase  45.83 
 
 
204 aa  180  2e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000708025  normal  0.428768 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0632  guanylate kinase  46.67 
 
 
185 aa  179  2e-44  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3877  guanylate kinase  47.31 
 
 
210 aa  179  2e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3810  guanylate kinase  47.85 
 
 
207 aa  179  2e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.18291  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0361  guanylate kinase  47.85 
 
 
207 aa  179  2.9999999999999997e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1730  guanylate kinase  49.16 
 
 
199 aa  179  2.9999999999999997e-44  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1268  guanylate kinase  46.32 
 
 
207 aa  179  2.9999999999999997e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.33638  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1293  guanylate kinase  46.32 
 
 
207 aa  179  2.9999999999999997e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0266  guanylate kinase  45.85 
 
 
207 aa  179  4e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1677  guanylate kinase  48.39 
 
 
217 aa  178  4.999999999999999e-44  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1237  guanylate kinase  48.91 
 
 
195 aa  178  5.999999999999999e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.74814  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0758  guanylate kinase  44.74 
 
 
204 aa  178  5.999999999999999e-44  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000183217  hitchhiker  0.0000103593 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4124  Guanylate kinase  46.08 
 
 
233 aa  177  8e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3613  guanylate kinase  47.31 
 
 
207 aa  177  1e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0330  guanylate kinase  47.31 
 
 
224 aa  177  1e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0351596  normal  0.331396 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3885  guanylate kinase  49.47 
 
 
205 aa  176  2e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000575833 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3722  guanylate kinase  49.47 
 
 
205 aa  176  2e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1273  guanylate kinase  49.47 
 
 
205 aa  176  2e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.213463  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001862  guanylate kinase  46.88 
 
 
207 aa  176  2e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4009  guanylate kinase  49.47 
 
 
205 aa  176  2e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3919  guanylate kinase  49.47 
 
 
205 aa  176  2e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.364605  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3970  guanylate kinase  49.47 
 
 
205 aa  177  2e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0125676  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2523  guanylate kinase  48.42 
 
 
205 aa  177  2e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2001  guanylate kinase  42.27 
 
 
216 aa  176  2e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1719  guanylate kinase  42.27 
 
 
216 aa  176  2e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3914  guanylate kinase  49.47 
 
 
214 aa  176  3e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3612  guanylate kinase  49.47 
 
 
214 aa  176  3e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3630  guanylate kinase  49.47 
 
 
214 aa  176  3e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00630  guanylate kinase  46.35 
 
 
207 aa  176  3e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2523  guanylate kinase  46.49 
 
 
214 aa  176  3e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1761  guanylate kinase  45.65 
 
 
207 aa  175  5e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3694  guanylate kinase  48.95 
 
 
205 aa  175  6e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3630  guanylate kinase  45.7 
 
 
224 aa  174  7e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.09026  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0363  guanylate kinase  45.7 
 
 
210 aa  174  7e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000053777 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0355  guanylate kinase  45.7 
 
 
210 aa  174  8e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.398163  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0353  guanylate kinase  45.7 
 
 
210 aa  174  8e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0360  guanylate kinase  45.7 
 
 
210 aa  174  8e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2138  guanylate kinase  44.74 
 
 
205 aa  174  9.999999999999999e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.585915  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0207  guanylate kinase  46.52 
 
 
190 aa  174  9.999999999999999e-43  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.931421  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1315  guanylate kinase  44.04 
 
 
203 aa  173  1.9999999999999998e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.559001  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2834  guanylate kinase  46.96 
 
 
186 aa  173  1.9999999999999998e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.522471  normal  0.276726 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3845  guanylate kinase  49.18 
 
 
202 aa  172  3.9999999999999995e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07800  guanylate kinase  50 
 
 
189 aa  172  3.9999999999999995e-42  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.364153  normal  0.897368 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0099  guanylate kinase  43.38 
 
 
204 aa  172  5e-42  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.261524  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1597  guanylate kinase  50.54 
 
 
197 aa  171  5.999999999999999e-42  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00198885  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl195  guanylate kinase  43.16 
 
 
297 aa  171  7.999999999999999e-42  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.0722226  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3155  guanylate kinase  47.62 
 
 
220 aa  170  2e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0336  guanylate kinase  45.16 
 
 
207 aa  169  2e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.57704 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0365  guanylate kinase  43.3 
 
 
207 aa  169  2e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0208  guanylate kinase  40.98 
 
 
297 aa  168  5e-41  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3433  guanylate kinase  45.7 
 
 
207 aa  168  5e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.21703  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0210  guanylate kinase  46.35 
 
 
207 aa  168  5e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05311  guanylate kinase  47.19 
 
 
184 aa  168  6e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2280  guanylate kinase  45.83 
 
 
229 aa  167  8e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0862  guanylate kinase  45.36 
 
 
206 aa  167  9e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.693982  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0947  guanylate kinase  45.36 
 
 
206 aa  167  9e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.0000973722  hitchhiker  0.000000351977 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0634  guanylate kinase  46.2 
 
 
210 aa  167  1e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1457  guanylate kinase  45.5 
 
 
212 aa  167  1e-40  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0976  guanylate kinase  46.2 
 
 
211 aa  167  1e-40  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.194665  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03505  guanylate kinase  42.51 
 
 
207 aa  166  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0057  Guanylate kinase  42.51 
 
 
207 aa  166  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4099  guanylate kinase  42.51 
 
 
207 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3859  guanylate kinase  42.51 
 
 
207 aa  166  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3983  guanylate kinase  42.51 
 
 
207 aa  166  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4151  guanylate kinase  42.51 
 
 
207 aa  166  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0063  guanylate kinase  42.51 
 
 
207 aa  166  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000240109 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03457  hypothetical protein  42.51 
 
 
207 aa  166  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4329  guanylate kinase  43.17 
 
 
206 aa  166  2.9999999999999998e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.970942  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0840  guanylate kinase  44.79 
 
 
202 aa  165  4e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4127  guanylate kinase  42.51 
 
 
207 aa  165  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.514606  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3957  guanylate kinase  42.51 
 
 
207 aa  165  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4020  guanylate kinase  42.51 
 
 
207 aa  165  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3583  guanylate kinase  44.26 
 
 
206 aa  165  4e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00415905  normal  0.118983 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4066  guanylate kinase  42.51 
 
 
207 aa  165  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3948  guanylate kinase  42.51 
 
 
207 aa  165  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00531185 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0347  guanylate kinase  43.23 
 
 
215 aa  165  5e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>