More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_0758 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008530  LGAS_0758  guanylate kinase  100 
 
 
204 aa  417  1e-116  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000183217  hitchhiker  0.0000103593 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1398  guanylate kinase  59.61 
 
 
209 aa  260  1e-68  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00115166  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2158  guanylate kinase  60.2 
 
 
205 aa  251  4.0000000000000004e-66  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0313  guanylate kinase  58.62 
 
 
209 aa  249  2e-65  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0875391  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1176  guanylate kinase  59.2 
 
 
206 aa  243  1.9999999999999999e-63  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000749098  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1058  guanylate kinase  56.22 
 
 
204 aa  241  7e-63  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000145749  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1713  guanylate kinase  55.38 
 
 
198 aa  234  6e-61  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.463283  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1948  guanylate kinase  53.27 
 
 
205 aa  228  4e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1293  guanylate kinase  54.73 
 
 
207 aa  226  1e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1268  guanylate kinase  54.73 
 
 
207 aa  226  1e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.33638  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0776  guanylate kinase  53.73 
 
 
207 aa  226  2e-58  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.753859  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2523  guanylate kinase  55.22 
 
 
205 aa  221  6e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3970  guanylate kinase  55.22 
 
 
205 aa  218  5e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0125676  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1273  guanylate kinase  55.22 
 
 
205 aa  218  5e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.213463  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3694  guanylate kinase  55.22 
 
 
205 aa  217  7.999999999999999e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3919  guanylate kinase  54.73 
 
 
205 aa  216  1e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.364605  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3722  guanylate kinase  54.73 
 
 
205 aa  216  1e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3885  guanylate kinase  54.73 
 
 
205 aa  216  1e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000575833 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4009  guanylate kinase  54.73 
 
 
205 aa  216  1e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3914  guanylate kinase  54.73 
 
 
214 aa  216  2e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3612  guanylate kinase  54.73 
 
 
214 aa  216  2e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3630  guanylate kinase  54.73 
 
 
214 aa  216  2e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1231  guanylate kinase  51.56 
 
 
198 aa  213  9.999999999999999e-55  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.726797  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1329  guanylate kinase  53.37 
 
 
204 aa  209  2e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000708025  normal  0.428768 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3894  guanylate kinase  51.06 
 
 
200 aa  202  3e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000112061  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09810  Guanylate kinase  50.27 
 
 
194 aa  195  4.0000000000000005e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2001  guanylate kinase  48.17 
 
 
216 aa  189  2e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1719  guanylate kinase  48.17 
 
 
216 aa  189  2e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1700  guanylate kinase  48.68 
 
 
200 aa  187  7e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1761  guanylate kinase  47.09 
 
 
207 aa  187  1e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl195  guanylate kinase  46.53 
 
 
297 aa  185  4e-46  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.0722226  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1597  guanylate kinase  48.39 
 
 
197 aa  183  1.0000000000000001e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00198885  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2318  guanylate kinase  47.62 
 
 
198 aa  183  1.0000000000000001e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000195285  hitchhiker  0.00462206 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1035  guanylate kinase  45.27 
 
 
199 aa  182  4.0000000000000006e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0962  guanylate kinase  48.15 
 
 
202 aa  181  8.000000000000001e-45  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0132271  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0840  guanylate kinase  51.06 
 
 
202 aa  181  9.000000000000001e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1062  guanylate kinase  48.6 
 
 
196 aa  180  1e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1104  guanylate kinase  44.23 
 
 
211 aa  179  2e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.631702  normal  0.011032 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1791  guanylate kinase  41.58 
 
 
201 aa  179  2e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.395222  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2834  guanylate kinase  43.58 
 
 
186 aa  178  4e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.522471  normal  0.276726 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2093  guanylate kinase  44.74 
 
 
223 aa  178  4.999999999999999e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.353708  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1563  guanylate kinase  45.88 
 
 
211 aa  175  4e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.106259  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1237  guanylate kinase  45.26 
 
 
195 aa  175  5e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.74814  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2919  guanylate kinase  45.88 
 
 
211 aa  174  6e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2284  guanylate kinase  43.68 
 
 
242 aa  174  8e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.429726  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1315  guanylate kinase  43.23 
 
 
203 aa  174  9e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.559001  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04921  guanylate kinase  44.09 
 
 
184 aa  173  9.999999999999999e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.032848  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4124  Guanylate kinase  42.78 
 
 
233 aa  173  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0336  guanylate kinase  39.9 
 
 
207 aa  172  1.9999999999999998e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.57704 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0207  guanylate kinase  46.15 
 
 
190 aa  172  2.9999999999999996e-42  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.931421  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3097  guanylate kinase  45.41 
 
 
195 aa  172  2.9999999999999996e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05231  guanylate kinase  44.62 
 
 
184 aa  172  2.9999999999999996e-42  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0266  guanylate kinase  42.57 
 
 
207 aa  172  3.9999999999999995e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0355  guanylate kinase  39.9 
 
 
210 aa  171  5e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.398163  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0360  guanylate kinase  39.9 
 
 
210 aa  171  5e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0353  guanylate kinase  39.9 
 
 
210 aa  171  5e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4145  guanylate kinase  44.21 
 
 
207 aa  171  5.999999999999999e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0363  guanylate kinase  39.9 
 
 
210 aa  171  7.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000053777 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4162  guanylate kinase  47.67 
 
 
194 aa  171  1e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.13383  normal  0.396618 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3426  Guanylate kinase  43.02 
 
 
194 aa  171  1e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0032  guanylate kinase  44.9 
 
 
205 aa  170  1e-41  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1319  guanylate kinase  46.84 
 
 
224 aa  170  1e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.773987  normal  0.110661 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03505  guanylate kinase  44.21 
 
 
207 aa  169  2e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0057  Guanylate kinase  44.21 
 
 
207 aa  169  2e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0063  guanylate kinase  44.21 
 
 
207 aa  169  2e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000240109 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4981  guanylate kinase  44.13 
 
 
198 aa  170  2e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.023832  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3859  guanylate kinase  44.21 
 
 
207 aa  169  2e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1475  guanylate kinase  44.89 
 
 
199 aa  170  2e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000468376  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03457  hypothetical protein  44.21 
 
 
207 aa  169  2e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4099  guanylate kinase  44.21 
 
 
207 aa  169  2e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3983  guanylate kinase  44.21 
 
 
207 aa  169  2e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4151  guanylate kinase  44.21 
 
 
207 aa  169  2e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4581  guanylate kinase  39.41 
 
 
207 aa  169  3e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.877029  unclonable  0.0000000250462 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0208  guanylate kinase  44.04 
 
 
297 aa  169  3e-41  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3433  guanylate kinase  39.8 
 
 
207 aa  169  3e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.21703  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3155  guanylate kinase  44.56 
 
 
220 aa  169  3e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1406  Guanylate kinase  45.5 
 
 
202 aa  168  5e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.77411  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3877  guanylate kinase  37.93 
 
 
210 aa  168  5e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3936  guanylate kinase  40.1 
 
 
212 aa  167  7e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_33  guanylate kinase  44.9 
 
 
205 aa  167  8e-41  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2238  guanylate kinase  41.54 
 
 
203 aa  167  9e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3630  guanylate kinase  38.92 
 
 
224 aa  167  9e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.09026  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3007  guanylate kinase  46.33 
 
 
223 aa  167  1e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000380844  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0195  guanylate kinase  42.22 
 
 
188 aa  167  1e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5020  guanylate kinase  43.68 
 
 
207 aa  166  2e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0632  guanylate kinase  41.53 
 
 
185 aa  166  2e-40  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3948  guanylate kinase  44.74 
 
 
207 aa  166  2e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.498976  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3497  guanylate kinase  39.9 
 
 
207 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00153  guanylate kinase  43.16 
 
 
213 aa  166  2.9999999999999998e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0558456  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0330  guanylate kinase  38.42 
 
 
224 aa  165  2.9999999999999998e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0351596  normal  0.331396 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2444  guanylate kinase  44.15 
 
 
203 aa  166  2.9999999999999998e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.337517 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3810  guanylate kinase  38.42 
 
 
207 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.18291  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4066  guanylate kinase  43.68 
 
 
207 aa  165  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2277  guanylate kinase  39.38 
 
 
223 aa  165  4e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.140709  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4020  guanylate kinase  43.68 
 
 
207 aa  165  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4127  guanylate kinase  43.68 
 
 
207 aa  165  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.514606  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6112  guanylate kinase  45.41 
 
 
203 aa  165  4e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.509466  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3613  guanylate kinase  38.42 
 
 
207 aa  165  4e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70440  guanylate kinase  45.41 
 
 
203 aa  165  4e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3957  guanylate kinase  43.68 
 
 
207 aa  165  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>