More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_33 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013552  DhcVS_33  guanylate kinase  100 
 
 
205 aa  419  1e-116  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0032  guanylate kinase  93.66 
 
 
205 aa  399  9.999999999999999e-111  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0035  guanylate kinase  92.68 
 
 
206 aa  370  1e-102  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0619  guanylate kinase  53.77 
 
 
210 aa  221  7e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1870  guanylate kinase  51.26 
 
 
209 aa  219  1.9999999999999999e-56  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.786175  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3599  guanylate kinase  50 
 
 
210 aa  216  2e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0365546 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4286  guanylate kinase  48.97 
 
 
210 aa  212  2.9999999999999995e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0368614 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1638  guanylate kinase  50.54 
 
 
208 aa  191  5e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09810  Guanylate kinase  42.27 
 
 
194 aa  170  1e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3894  guanylate kinase  45.99 
 
 
200 aa  169  2e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000112061  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1597  guanylate kinase  43.85 
 
 
197 aa  168  4e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00198885  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0758  guanylate kinase  44.9 
 
 
204 aa  167  8e-41  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000183217  hitchhiker  0.0000103593 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1329  guanylate kinase  41.94 
 
 
204 aa  167  9e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000708025  normal  0.428768 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1948  guanylate kinase  45.55 
 
 
205 aa  167  1e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1443  guanylate kinase  45.03 
 
 
210 aa  166  2e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.86751  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1719  guanylate kinase  40.1 
 
 
216 aa  165  4e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2001  guanylate kinase  40.1 
 
 
216 aa  165  5e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1058  guanylate kinase  44.74 
 
 
204 aa  164  6.9999999999999995e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000145749  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0962  guanylate kinase  42.86 
 
 
202 aa  164  8e-40  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0132271  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1761  guanylate kinase  40.93 
 
 
207 aa  164  9e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1677  guanylate kinase  41.08 
 
 
217 aa  163  1.0000000000000001e-39  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1700  guanylate kinase  43.24 
 
 
200 aa  162  3e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1237  guanylate kinase  40.96 
 
 
195 aa  161  7e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.74814  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0100  guanylate kinase  42.16 
 
 
202 aa  160  9e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0912271  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2158  guanylate kinase  44.44 
 
 
205 aa  160  1e-38  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1285  guanylate kinase  41.08 
 
 
210 aa  159  4e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000194386  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0313  guanylate kinase  43.01 
 
 
209 aa  157  1e-37  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0875391  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1062  guanylate kinase  42.78 
 
 
196 aa  156  2e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2277  guanylate kinase  38.27 
 
 
223 aa  154  7e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.140709  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2000  guanylate kinase  38.27 
 
 
223 aa  154  7e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0607745  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1398  guanylate kinase  41.88 
 
 
209 aa  154  8e-37  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00115166  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0840  guanylate kinase  42.78 
 
 
202 aa  154  9e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0765  Guanylate kinase  42.39 
 
 
216 aa  153  2e-36  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0958444  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2318  guanylate kinase  39.04 
 
 
198 aa  152  2e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000195285  hitchhiker  0.00462206 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2411  guanylate kinase  42.78 
 
 
198 aa  153  2e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0776  guanylate kinase  41.8 
 
 
207 aa  152  2.9999999999999998e-36  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.753859  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11418  guanylate kinase  43.89 
 
 
217 aa  152  4e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000747341  normal  0.348875 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1763  guanylate kinase  38.83 
 
 
218 aa  152  4e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.201865  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2370  guanylate kinase  42.78 
 
 
198 aa  152  5e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0470056  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2417  guanylate kinase  42.78 
 
 
198 aa  152  5e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.391978 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3845  guanylate kinase  39.44 
 
 
202 aa  151  5.9999999999999996e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1035  guanylate kinase  40 
 
 
199 aa  151  5.9999999999999996e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1535  guanylate kinase  39.36 
 
 
220 aa  150  1e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0748909  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1791  guanylate kinase  38.58 
 
 
201 aa  150  1e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.395222  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2523  guanylate kinase  42.93 
 
 
205 aa  150  1e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1293  guanylate kinase  41.27 
 
 
207 aa  149  2e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1268  guanylate kinase  41.27 
 
 
207 aa  149  2e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.33638  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2138  guanylate kinase  36.67 
 
 
205 aa  149  2e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.585915  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2093  guanylate kinase  40.31 
 
 
223 aa  149  2e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.353708  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1953  guanylate kinase  37.24 
 
 
223 aa  149  4e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.217119  normal  0.0786696 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0634  guanylate kinase  36.84 
 
 
210 aa  149  4e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2284  guanylate kinase  41 
 
 
242 aa  148  5e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.429726  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18030  guanylate kinase  40.22 
 
 
199 aa  147  1.0000000000000001e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0118922  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2345  guanylate kinase  43.43 
 
 
193 aa  147  1.0000000000000001e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.849127  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2578  guanylate kinase  43.55 
 
 
202 aa  147  1.0000000000000001e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0638633  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3213  guanylate kinase  38.38 
 
 
202 aa  147  1.0000000000000001e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000935163  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1231  guanylate kinase  40.32 
 
 
198 aa  147  1.0000000000000001e-34  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.726797  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0988  guanylate kinase  39.47 
 
 
234 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0107524 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3914  guanylate kinase  40.51 
 
 
214 aa  146  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07800  guanylate kinase  40.22 
 
 
189 aa  146  2.0000000000000003e-34  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.364153  normal  0.897368 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3612  guanylate kinase  40.51 
 
 
214 aa  146  2.0000000000000003e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3630  guanylate kinase  40.51 
 
 
214 aa  146  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1050  guanylate kinase  37.84 
 
 
202 aa  146  2.0000000000000003e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000462152 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0099  guanylate kinase  39.13 
 
 
204 aa  146  2.0000000000000003e-34  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.261524  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05231  guanylate kinase  39.44 
 
 
184 aa  146  2.0000000000000003e-34  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1996  guanylate kinase  40.54 
 
 
197 aa  146  2.0000000000000003e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000144214 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1319  guanylate kinase  42.93 
 
 
224 aa  147  2.0000000000000003e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.773987  normal  0.110661 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1205  guanylate kinase  38.95 
 
 
220 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.197853  hitchhiker  0.00108752 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3740  guanylate kinase  42.63 
 
 
203 aa  146  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0778245 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1683  guanylate kinase  37.5 
 
 
219 aa  145  3e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1062  guanylate kinase  37.89 
 
 
220 aa  145  3e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0143004 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5238  guanylate kinase  40.33 
 
 
199 aa  145  3e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3007  guanylate kinase  39.33 
 
 
223 aa  145  4.0000000000000006e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000380844  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04921  guanylate kinase  39.44 
 
 
184 aa  145  4.0000000000000006e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.032848  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3823  guanylate kinase  37 
 
 
219 aa  145  5e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.162212 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl195  guanylate kinase  41.18 
 
 
297 aa  145  6e-34  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.0722226  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2523  guanylate kinase  38.46 
 
 
214 aa  144  6e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0985  guanylate kinase  38.3 
 
 
207 aa  145  6e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00175631  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1845  guanylate kinase  37.63 
 
 
230 aa  145  6e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3970  guanylate kinase  41.36 
 
 
205 aa  145  6e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0125676  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3694  guanylate kinase  41.36 
 
 
205 aa  144  7.0000000000000006e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1273  guanylate kinase  41.36 
 
 
205 aa  144  8.000000000000001e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.213463  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3919  guanylate kinase  40.84 
 
 
205 aa  144  9e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.364605  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3722  guanylate kinase  40.84 
 
 
205 aa  144  9e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4009  guanylate kinase  40.84 
 
 
205 aa  144  9e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3885  guanylate kinase  40.84 
 
 
205 aa  144  9e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000575833 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2715  guanylate kinase  38.04 
 
 
206 aa  144  1e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.446098  normal  0.772738 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0759  guanylate kinase  39.47 
 
 
219 aa  144  1e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.784504  normal  0.122144 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1335  guanylate kinase  38.38 
 
 
206 aa  144  1e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1713  guanylate kinase  39.47 
 
 
198 aa  144  1e-33  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.463283  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1176  guanylate kinase  38.81 
 
 
206 aa  143  1e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000749098  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2286  guanylate kinase  39.57 
 
 
202 aa  142  2e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.30068  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2305  guanylate kinase  38.34 
 
 
219 aa  142  2e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00214709  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4162  guanylate kinase  44.85 
 
 
194 aa  143  2e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.13383  normal  0.396618 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3810  guanylate kinase  36.81 
 
 
207 aa  142  2e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.18291  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2401  guanylate kinase  36.13 
 
 
202 aa  143  2e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0298091  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0266  guanylate kinase  39.78 
 
 
207 aa  143  2e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001862  guanylate kinase  38.1 
 
 
207 aa  142  3e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0785  guanylate kinase  39.27 
 
 
201 aa  142  3e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000101008  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3720  guanylate kinase  38.59 
 
 
220 aa  142  3e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0647286  normal  0.109171 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>