More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_5238 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_5238  guanylate kinase  100 
 
 		 199 aa  389  1e-107  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1062  guanylate kinase  66.67 
 
 		 196 aa  240  1e-62  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15620  guanylate kinase  68.28 
 
 		 208 aa  240  1e-62  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0579342  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1360  guanylate kinase  65.8 
 
 		 199 aa  239  2e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.288733  normal  0.0500423 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3195  guanylate kinase  67.98 
 
 		 184 aa  237  6.999999999999999e-62  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0922592  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1713  guanylate kinase  67.98 
 
 		 192 aa  234  5.0000000000000005e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00781731 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3097  guanylate kinase  65.03 
 
 		 195 aa  234  8e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3007  guanylate kinase  68.33 
 
 		 223 aa  231  4.0000000000000004e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000380844  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2813  Guanylate kinase  65.54 
 
 		 234 aa  224  8e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.672067 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5345  guanylate kinase  59.07 
 
 		 204 aa  215  2.9999999999999998e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.313334 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4162  guanylate kinase  62.43 
 
 		 194 aa  212  3.9999999999999995e-54  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.13383  normal  0.396618 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2042  guanylate kinase  65.14 
 
 		 180 aa  211  5.999999999999999e-54  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.677493  decreased coverage  0.00281662 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3157  guanylate kinase  57.22 
 
 		 209 aa  209  3e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.250425  hitchhiker  0.0000168585 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1715  guanylate kinase  58.55 
 
 		 218 aa  206  1e-52  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.244891  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11418  guanylate kinase  57.53 
 
 		 217 aa  206  1e-52  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000747341  normal  0.348875 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2345  guanylate kinase  61.24 
 
 		 193 aa  206  3e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.849127  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3127  guanylate kinase  65.38 
 
 		 203 aa  205  5e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.128924  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1293  guanylate kinase  60.96 
 
 		 208 aa  204  8e-52  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.316602  normal  0.120188 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18030  guanylate kinase  60.67 
 
 		 199 aa  203  1e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0118922  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12720  guanylate kinase  58.47 
 
 		 201 aa  202  2e-51  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0387967  normal  0.0253788 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14800  guanylate kinase  56.48 
 
 		 199 aa  201  7e-51  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.338079  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2259  guanylate kinase  58.89 
 
 		 190 aa  201  8e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.294995  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1850  guanylate kinase  63.48 
 
 		 188 aa  198  5e-50  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.112941  normal  0.242923 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1996  guanylate kinase  56.11 
 
 		 197 aa  197  7e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000144214 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1318  guanylate kinase  56.9 
 
 		 183 aa  194  7e-49  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.117984  normal  0.348392 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2411  guanylate kinase  55.1 
 
 		 198 aa  193  1e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2417  guanylate kinase  54.59 
 
 		 198 aa  191  5e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.391978 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2370  guanylate kinase  54.59 
 
 		 198 aa  191  5e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0470056  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06681  guanylate kinase  53.33 
 
 		 192 aa  187  5.999999999999999e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0632  guanylate kinase  51.98 
 
 		 185 aa  187  1e-46  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12550  guanylate kinase  59.78 
 
 		 216 aa  187  1e-46  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2578  guanylate kinase  54.59 
 
 		 202 aa  187  1e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0638633  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1730  guanylate kinase  57.8 
 
 		 199 aa  184  7e-46  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2992  Guanylate kinase  63.03 
 
 		 173 aa  184  1.0000000000000001e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.40634 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2667  guanylate kinase  55.78 
 
 		 203 aa  183  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.615305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3740  guanylate kinase  54.27 
 
 		 203 aa  182  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0778245 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4124  Guanylate kinase  52 
 
 		 233 aa  181  5.0000000000000004e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1475  guanylate kinase  50.89 
 
 		 199 aa  175  3e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000468376  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4981  guanylate kinase  48.04 
 
 		 198 aa  174  6e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.023832  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3208  guanylate kinase  50.55 
 
 		 186 aa  174  9e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.703275  normal  0.494303 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3894  guanylate kinase  47.19 
 
 		 200 aa  173  9.999999999999999e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000112061  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1948  guanylate kinase  50.28 
 
 		 205 aa  170  1e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0195  guanylate kinase  47.51 
 
 		 188 aa  167  7e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1191  guanylate kinase  52.02 
 
 		 183 aa  167  1e-40  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0997306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2523  guanylate kinase  50 
 
 		 205 aa  166  2e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2158  guanylate kinase  46.7 
 
 		 205 aa  166  2e-40  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1058  guanylate kinase  48.9 
 
 		 204 aa  166  2.9999999999999998e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000145749  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0190  guanylate kinase  47.49 
 
 		 184 aa  166  2.9999999999999998e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.160767 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2834  guanylate kinase  49.13 
 
 		 186 aa  166  2.9999999999999998e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.522471  normal  0.276726 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2436  guanylate kinase  60.56 
 
 		 194 aa  166  2.9999999999999998e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1845  guanylate kinase  48.09 
 
 		 230 aa  164  6.9999999999999995e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1473  guanylate kinase  49.72 
 
 		 191 aa  164  6.9999999999999995e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.110392  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04921  guanylate kinase  39.56 
 
 		 184 aa  163  2.0000000000000002e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.032848  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4388  guanylate kinase  45.93 
 
 		 205 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.11044 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1638  guanylate kinase  46.41 
 
 		 208 aa  163  2.0000000000000002e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09810  Guanylate kinase  46.63 
 
 		 194 aa  162  3e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2280  guanylate kinase  44.63 
 
 		 229 aa  162  3e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1799  guanylate kinase  45.09 
 
 		 186 aa  162  4.0000000000000004e-39  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3970  guanylate kinase  50.55 
 
 		 205 aa  161  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0125676  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04671  guanylate kinase  44.89 
 
 		 185 aa  161  7e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0895533  normal  0.75989 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1273  guanylate kinase  50.55 
 
 		 205 aa  161  8.000000000000001e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.213463  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3914  guanylate kinase  50.55 
 
 		 214 aa  160  8.000000000000001e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3612  guanylate kinase  50.55 
 
 		 214 aa  160  8.000000000000001e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3630  guanylate kinase  50.55 
 
 		 214 aa  160  8.000000000000001e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05231  guanylate kinase  39.01 
 
 		 184 aa  161  8.000000000000001e-39  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3722  guanylate kinase  50.55 
 
 		 205 aa  160  1e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3885  guanylate kinase  50.55 
 
 		 205 aa  160  1e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000575833 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4009  guanylate kinase  50.55 
 
 		 205 aa  160  1e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1398  guanylate kinase  45.56 
 
 		 209 aa  160  1e-38  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00115166  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3919  guanylate kinase  50.55 
 
 		 205 aa  160  1e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.364605  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0313  guanylate kinase  46.82 
 
 		 209 aa  159  2e-38  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0875391  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1035  guanylate kinase  43.75 
 
 		 199 aa  160  2e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05221  guanylate kinase  44.77 
 
 		 186 aa  159  2e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.645705  normal  0.16422 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0634  guanylate kinase  48.86 
 
 		 210 aa  159  2e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05311  guanylate kinase  42.37 
 
 		 184 aa  159  2e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07800  guanylate kinase  46.59 
 
 		 189 aa  159  3e-38  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.364153  normal  0.897368 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2003  guanylate kinase  48 
 
 		 216 aa  159  3e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3694  guanylate kinase  50 
 
 		 205 aa  158  4e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2444  guanylate kinase  50.91 
 
 		 203 aa  158  4e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.337517 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3426  Guanylate kinase  43.09 
 
 		 194 aa  158  5e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0087  guanylate kinase  49.24 
 
 		 196 aa  158  5e-38  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.388944  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6112  guanylate kinase  48.84 
 
 		 203 aa  157  8e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.509466  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70440  guanylate kinase  48.84 
 
 		 203 aa  157  8e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0347  guanylate kinase  45.41 
 
 		 215 aa  157  9e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0361  guanylate kinase  45.2 
 
 		 207 aa  157  1e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001862  guanylate kinase  44.63 
 
 		 207 aa  157  1e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0467  guanylate kinase  38.46 
 
 		 184 aa  157  1e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3877  guanylate kinase  45.86 
 
 		 210 aa  157  1e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1763  guanylate kinase  46.45 
 
 		 218 aa  157  1e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.201865  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0330  guanylate kinase  45.2 
 
 		 224 aa  157  1e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0351596  normal  0.331396 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1660  guanylate kinase  50 
 
 		 190 aa  156  2e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000545308  hitchhiker  0.000108168 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1176  guanylate kinase  43.89 
 
 		 206 aa  156  2e-37  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000749098  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0808  guanylate kinase  45.09 
 
 		 192 aa  156  2e-37  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.116088  normal  0.89906 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3613  guanylate kinase  45.66 
 
 		 207 aa  156  2e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0057  Guanylate kinase  43.96 
 
 		 207 aa  155  3e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4151  guanylate kinase  43.96 
 
 		 207 aa  155  3e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4099  guanylate kinase  43.96 
 
 		 207 aa  155  3e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3233  guanylate kinase  46.59 
 
 		 215 aa  155  3e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3983  guanylate kinase  43.96 
 
 		 207 aa  155  3e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03457  hypothetical protein  43.96 
 
 		 207 aa  155  3e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>