More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_3127 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_3127  guanylate kinase  100 
 
 		 203 aa  393  1e-109  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.128924  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1062  guanylate kinase  67.76 
 
 		 196 aa  241  3.9999999999999997e-63  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3097  guanylate kinase  66.3 
 
 		 195 aa  236  2e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1360  guanylate kinase  67.42 
 
 		 199 aa  233  1.0000000000000001e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.288733  normal  0.0500423 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3007  guanylate kinase  65.41 
 
 		 223 aa  228  6e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000380844  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1715  guanylate kinase  65.56 
 
 		 218 aa  224  5.0000000000000005e-58  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.244891  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5238  guanylate kinase  65.38 
 
 		 199 aa  223  1e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2813  Guanylate kinase  63.28 
 
 		 234 aa  216  1e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.672067 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18030  guanylate kinase  61.26 
 
 		 199 aa  213  9.999999999999999e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0118922  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5345  guanylate kinase  62.37 
 
 		 204 aa  212  1.9999999999999998e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.313334 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1713  guanylate kinase  59.47 
 
 		 192 aa  206  3e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00781731 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1293  guanylate kinase  62.57 
 
 		 208 aa  204  6e-52  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.316602  normal  0.120188 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3157  guanylate kinase  56.38 
 
 		 209 aa  204  7e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.250425  hitchhiker  0.0000168585 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3195  guanylate kinase  62.01 
 
 		 184 aa  202  3e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0922592  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2042  guanylate kinase  60.34 
 
 		 180 aa  202  3e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.677493  decreased coverage  0.00281662 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1996  guanylate kinase  60.45 
 
 		 197 aa  201  6e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000144214 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1850  guanylate kinase  64.41 
 
 		 188 aa  201  6e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.112941  normal  0.242923 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14800  guanylate kinase  60.23 
 
 		 199 aa  199  1.9999999999999998e-50  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.338079  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1730  guanylate kinase  57.69 
 
 		 199 aa  196  1.0000000000000001e-49  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0632  guanylate kinase  54.02 
 
 		 185 aa  193  1e-48  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2345  guanylate kinase  60.34 
 
 		 193 aa  194  1e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.849127  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15620  guanylate kinase  58.89 
 
 		 208 aa  193  1e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0579342  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1318  guanylate kinase  56.11 
 
 		 183 aa  193  2e-48  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.117984  normal  0.348392 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2259  guanylate kinase  57.92 
 
 		 190 aa  191  6e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.294995  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06681  guanylate kinase  52.72 
 
 		 192 aa  191  7e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07800  guanylate kinase  53.55 
 
 		 189 aa  190  1e-47  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.364153  normal  0.897368 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2992  Guanylate kinase  60.82 
 
 		 173 aa  190  1e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.40634 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12720  guanylate kinase  59.02 
 
 		 201 aa  188  5.999999999999999e-47  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0387967  normal  0.0253788 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12550  guanylate kinase  59.24 
 
 		 216 aa  186  1e-46  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1799  guanylate kinase  50 
 
 		 186 aa  186  2e-46  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3894  guanylate kinase  48.7 
 
 		 200 aa  184  5e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000112061  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4162  guanylate kinase  58.51 
 
 		 194 aa  184  6e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.13383  normal  0.396618 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2578  guanylate kinase  54.84 
 
 		 202 aa  184  9e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0638633  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05221  guanylate kinase  49.44 
 
 		 186 aa  184  9e-46  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.645705  normal  0.16422 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2436  guanylate kinase  60.96 
 
 		 194 aa  182  3e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4981  guanylate kinase  50.29 
 
 		 198 aa  181  8.000000000000001e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.023832  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4124  Guanylate kinase  50 
 
 		 233 aa  180  1e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2411  guanylate kinase  56.42 
 
 		 198 aa  179  2e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1660  guanylate kinase  50 
 
 		 190 aa  179  2.9999999999999997e-44  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000545308  hitchhiker  0.000108168 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2417  guanylate kinase  55.87 
 
 		 198 aa  178  4.999999999999999e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.391978 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2370  guanylate kinase  55.87 
 
 		 198 aa  178  4.999999999999999e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0470056  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11418  guanylate kinase  51.79 
 
 		 217 aa  172  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000747341  normal  0.348875 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04921  guanylate kinase  43.68 
 
 		 184 aa  172  2.9999999999999996e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.032848  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2834  guanylate kinase  51.15 
 
 		 186 aa  172  3.9999999999999995e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.522471  normal  0.276726 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1475  guanylate kinase  50 
 
 		 199 aa  171  5.999999999999999e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000468376  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0087  guanylate kinase  55.62 
 
 		 196 aa  170  1e-41  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.388944  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05231  guanylate kinase  41.9 
 
 		 184 aa  170  1e-41  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0195  guanylate kinase  49.71 
 
 		 188 aa  169  2e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2001  guanylate kinase  43.39 
 
 		 216 aa  169  2e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1719  guanylate kinase  43.39 
 
 		 216 aa  170  2e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04671  guanylate kinase  47.09 
 
 		 185 aa  169  3e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0895533  normal  0.75989 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0915  guanylate kinase  50.54 
 
 		 202 aa  168  5e-41  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0190  guanylate kinase  49.13 
 
 		 184 aa  167  7e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.160767 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05311  guanylate kinase  42.94 
 
 		 184 aa  165  4e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1191  guanylate kinase  53.18 
 
 		 183 aa  164  5.9999999999999996e-40  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0997306  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3426  Guanylate kinase  47.7 
 
 		 194 aa  163  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1948  guanylate kinase  48.13 
 
 		 205 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3740  guanylate kinase  54.59 
 
 		 203 aa  163  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0778245 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0467  guanylate kinase  41.38 
 
 		 184 aa  163  2.0000000000000002e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2667  guanylate kinase  55.68 
 
 		 203 aa  163  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.615305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3208  guanylate kinase  48.85 
 
 		 186 aa  161  5.0000000000000005e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.703275  normal  0.494303 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0758  guanylate kinase  45.9 
 
 		 204 aa  160  8.000000000000001e-39  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000183217  hitchhiker  0.0000103593 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1398  guanylate kinase  47.09 
 
 		 209 aa  160  9e-39  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00115166  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0313  guanylate kinase  47.62 
 
 		 209 aa  160  1e-38  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0875391  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2158  guanylate kinase  46.7 
 
 		 205 aa  160  1e-38  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09810  Guanylate kinase  45.11 
 
 		 194 aa  159  2e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1035  guanylate kinase  43.78 
 
 		 199 aa  159  2e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0962  guanylate kinase  39.46 
 
 		 202 aa  159  4e-38  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0132271  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1058  guanylate kinase  47.06 
 
 		 204 aa  159  4e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000145749  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3623  guanylate kinase  43.89 
 
 		 207 aa  158  6e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11910  guanylate kinase  50.66 
 
 		 170 aa  158  6e-38  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000147119  normal  0.0183319 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0808  guanylate kinase  45.98 
 
 		 192 aa  157  1e-37  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.116088  normal  0.89906 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1473  guanylate kinase  50.57 
 
 		 191 aa  157  1e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.110392  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0776  guanylate kinase  45.09 
 
 		 207 aa  156  2e-37  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.753859  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0347  guanylate kinase  45 
 
 		 215 aa  156  2e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1329  guanylate kinase  42.7 
 
 		 204 aa  156  2e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000708025  normal  0.428768 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1700  guanylate kinase  41.21 
 
 		 200 aa  155  3e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1597  guanylate kinase  46.81 
 
 		 197 aa  154  6e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00198885  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3845  guanylate kinase  49.42 
 
 		 202 aa  154  6e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1268  guanylate kinase  44.57 
 
 		 207 aa  154  1e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.33638  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1293  guanylate kinase  44.57 
 
 		 207 aa  154  1e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1231  guanylate kinase  45.66 
 
 		 198 aa  153  2e-36  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.726797  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1176  guanylate kinase  42.71 
 
 		 206 aa  152  2.9999999999999998e-36  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000749098  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1535  guanylate kinase  42.86 
 
 		 220 aa  152  2.9999999999999998e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0748909  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1677  guanylate kinase  40.96 
 
 		 217 aa  152  4e-36  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2003  guanylate kinase  47.28 
 
 		 216 aa  152  4e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1457  guanylate kinase  41.21 
 
 		 212 aa  152  4e-36  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0840  guanylate kinase  49.7 
 
 		 202 aa  151  5.9999999999999996e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2318  guanylate kinase  40.66 
 
 		 198 aa  151  7e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000195285  hitchhiker  0.00462206 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0363  guanylate kinase  45.4 
 
 		 210 aa  150  1e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000053777 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0360  guanylate kinase  45.4 
 
 		 210 aa  150  1e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0353  guanylate kinase  45.4 
 
 		 210 aa  150  1e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0355  guanylate kinase  45.4 
 
 		 210 aa  150  1e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.398163  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3630  guanylate kinase  42.49 
 
 		 224 aa  149  3e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.09026  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3970  guanylate kinase  46.24 
 
 		 205 aa  149  3e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0125676  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1796  guanylate kinase  40 
 
 		 206 aa  148  4e-35  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1761  guanylate kinase  37.43 
 
 		 207 aa  149  4e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1791  guanylate kinase  40.83 
 
 		 201 aa  149  4e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.395222  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00630  guanylate kinase  44.12 
 
 		 207 aa  148  5e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2523  guanylate kinase  44.09 
 
 		 205 aa  148  5e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>