More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_2813 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_2813  Guanylate kinase  100 
 
 
234 aa  464  9.999999999999999e-131  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.672067 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1360  guanylate kinase  81.28 
 
 
199 aa  316  2e-85  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.288733  normal  0.0500423 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3007  guanylate kinase  70.37 
 
 
223 aa  294  1e-78  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000380844  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1062  guanylate kinase  76.54 
 
 
196 aa  278  6e-74  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3097  guanylate kinase  70.27 
 
 
195 aa  263  1e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5345  guanylate kinase  63.64 
 
 
204 aa  237  9e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.313334 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1715  guanylate kinase  61.26 
 
 
218 aa  231  7.000000000000001e-60  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.244891  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1713  guanylate kinase  65 
 
 
192 aa  230  2e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00781731 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3195  guanylate kinase  65.34 
 
 
184 aa  228  5e-59  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0922592  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5238  guanylate kinase  65.54 
 
 
199 aa  224  1e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18030  guanylate kinase  60.43 
 
 
199 aa  220  1.9999999999999999e-56  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0118922  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1293  guanylate kinase  62.5 
 
 
208 aa  216  2e-55  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.316602  normal  0.120188 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1730  guanylate kinase  61.85 
 
 
199 aa  213  1.9999999999999998e-54  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3157  guanylate kinase  56.91 
 
 
209 aa  213  2.9999999999999995e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.250425  hitchhiker  0.0000168585 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0632  guanylate kinase  54.14 
 
 
185 aa  209  2e-53  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06681  guanylate kinase  55.93 
 
 
192 aa  209  3e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3127  guanylate kinase  67.52 
 
 
203 aa  204  7e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.128924  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12720  guanylate kinase  56.84 
 
 
201 aa  204  1e-51  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0387967  normal  0.0253788 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2042  guanylate kinase  60.57 
 
 
180 aa  201  5e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.677493  decreased coverage  0.00281662 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14800  guanylate kinase  59.32 
 
 
199 aa  201  9.999999999999999e-51  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.338079  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1850  guanylate kinase  61.33 
 
 
188 aa  201  9.999999999999999e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.112941  normal  0.242923 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15620  guanylate kinase  57.3 
 
 
208 aa  199  3e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0579342  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2345  guanylate kinase  55.38 
 
 
193 aa  197  9e-50  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.849127  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4162  guanylate kinase  59.44 
 
 
194 aa  196  2.0000000000000003e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.13383  normal  0.396618 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1996  guanylate kinase  54.64 
 
 
197 aa  195  4.0000000000000005e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000144214 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1318  guanylate kinase  53.37 
 
 
183 aa  194  1e-48  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.117984  normal  0.348392 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2259  guanylate kinase  54.95 
 
 
190 aa  193  1e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.294995  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2411  guanylate kinase  55.31 
 
 
198 aa  193  2e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1475  guanylate kinase  52.3 
 
 
199 aa  192  4e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000468376  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2370  guanylate kinase  54.75 
 
 
198 aa  192  5e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0470056  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2417  guanylate kinase  54.75 
 
 
198 aa  192  5e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.391978 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11418  guanylate kinase  55 
 
 
217 aa  191  1e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000747341  normal  0.348875 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4981  guanylate kinase  50.87 
 
 
198 aa  188  5e-47  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.023832  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12550  guanylate kinase  54.01 
 
 
216 aa  188  7e-47  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2834  guanylate kinase  51.41 
 
 
186 aa  188  8e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.522471  normal  0.276726 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2578  guanylate kinase  52.26 
 
 
202 aa  187  1e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0638633  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05311  guanylate kinase  46.89 
 
 
184 aa  186  2e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07800  guanylate kinase  51.11 
 
 
189 aa  185  5e-46  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.364153  normal  0.897368 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4124  Guanylate kinase  47.94 
 
 
233 aa  185  6e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0087  guanylate kinase  55.19 
 
 
196 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.388944  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2436  guanylate kinase  59.56 
 
 
194 aa  183  2.0000000000000003e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3740  guanylate kinase  55.32 
 
 
203 aa  182  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0778245 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2992  Guanylate kinase  59.39 
 
 
173 aa  182  4.0000000000000006e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.40634 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04921  guanylate kinase  45.76 
 
 
184 aa  182  5.0000000000000004e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.032848  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0195  guanylate kinase  48.33 
 
 
188 aa  181  1e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2667  guanylate kinase  56.04 
 
 
203 aa  181  1e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.615305  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0190  guanylate kinase  48.04 
 
 
184 aa  179  4e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.160767 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0467  guanylate kinase  44.63 
 
 
184 aa  179  4.999999999999999e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04671  guanylate kinase  49.4 
 
 
185 aa  178  7e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0895533  normal  0.75989 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05231  guanylate kinase  44.63 
 
 
184 aa  177  9e-44  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1660  guanylate kinase  50 
 
 
190 aa  176  4e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000545308  hitchhiker  0.000108168 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1799  guanylate kinase  49.71 
 
 
186 aa  174  9e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05221  guanylate kinase  49.71 
 
 
186 aa  174  9e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.645705  normal  0.16422 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0915  guanylate kinase  49.18 
 
 
202 aa  171  6.999999999999999e-42  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1473  guanylate kinase  48.59 
 
 
191 aa  169  4e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.110392  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1948  guanylate kinase  48.88 
 
 
205 aa  168  5e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11910  guanylate kinase  50.97 
 
 
170 aa  168  7e-41  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000147119  normal  0.0183319 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3894  guanylate kinase  46.02 
 
 
200 aa  168  8e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000112061  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0808  guanylate kinase  45.81 
 
 
192 aa  167  1e-40  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.116088  normal  0.89906 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0099  guanylate kinase  44.58 
 
 
204 aa  167  1e-40  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.261524  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1329  guanylate kinase  44.32 
 
 
204 aa  166  2.9999999999999998e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000708025  normal  0.428768 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1398  guanylate kinase  48.55 
 
 
209 aa  166  2.9999999999999998e-40  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00115166  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1058  guanylate kinase  48.88 
 
 
204 aa  165  4e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000145749  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1597  guanylate kinase  48.02 
 
 
197 aa  165  5e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00198885  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09810  Guanylate kinase  44.63 
 
 
194 aa  164  1.0000000000000001e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0758  guanylate kinase  45.2 
 
 
204 aa  164  1.0000000000000001e-39  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000183217  hitchhiker  0.0000103593 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0840  guanylate kinase  50.3 
 
 
202 aa  163  2.0000000000000002e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1035  guanylate kinase  44.32 
 
 
199 aa  162  3e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3845  guanylate kinase  49.72 
 
 
202 aa  162  4.0000000000000004e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3155  guanylate kinase  48.59 
 
 
220 aa  162  4.0000000000000004e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3426  Guanylate kinase  46.82 
 
 
194 aa  162  6e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3877  guanylate kinase  45.56 
 
 
210 aa  161  8.000000000000001e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4209  guanylate kinase  48.17 
 
 
207 aa  160  1e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1845  guanylate kinase  50 
 
 
230 aa  160  1e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1191  guanylate kinase  52.76 
 
 
183 aa  160  1e-38  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0997306  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0091  guanylate kinase  47.56 
 
 
207 aa  160  2e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3948  guanylate kinase  45.51 
 
 
207 aa  159  3e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.498976  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03505  guanylate kinase  46.95 
 
 
207 aa  159  5e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0057  Guanylate kinase  46.95 
 
 
207 aa  159  5e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3208  guanylate kinase  46.24 
 
 
186 aa  158  5e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.703275  normal  0.494303 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03457  hypothetical protein  46.95 
 
 
207 aa  159  5e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0313  guanylate kinase  47.4 
 
 
209 aa  159  5e-38  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0875391  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4151  guanylate kinase  46.95 
 
 
207 aa  159  5e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4099  guanylate kinase  46.95 
 
 
207 aa  159  5e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0063  guanylate kinase  46.95 
 
 
207 aa  159  5e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000240109 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3983  guanylate kinase  46.95 
 
 
207 aa  159  5e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3859  guanylate kinase  46.95 
 
 
207 aa  159  5e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4145  guanylate kinase  46.95 
 
 
207 aa  158  6e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2158  guanylate kinase  45.45 
 
 
205 aa  158  7e-38  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1761  guanylate kinase  39.77 
 
 
207 aa  158  8e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4019  guanylate kinase  47.73 
 
 
204 aa  157  1e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.565127  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4492  guanylate kinase  47.56 
 
 
207 aa  157  1e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0294  guanylate kinase  49.4 
 
 
212 aa  157  1e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2523  guanylate kinase  48.31 
 
 
205 aa  157  2e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1677  guanylate kinase  39.09 
 
 
217 aa  157  2e-37  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3810  guanylate kinase  46.99 
 
 
207 aa  156  2e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.18291  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3948  guanylate kinase  46.95 
 
 
207 aa  156  3e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00531185 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4127  guanylate kinase  46.95 
 
 
207 aa  156  3e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.514606  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3957  guanylate kinase  46.95 
 
 
207 aa  156  3e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5020  guanylate kinase  46.34 
 
 
207 aa  156  3e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>