More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_11910 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_11910  guanylate kinase  100 
 
 		 170 aa  352  2e-96  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000147119  normal  0.0183319 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1660  guanylate kinase  63.19 
 
 		 190 aa  218  3e-56  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000545308  hitchhiker  0.000108168 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07800  guanylate kinase  61.73 
 
 		 189 aa  211  5.999999999999999e-54  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.364153  normal  0.897368 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1715  guanylate kinase  54.04 
 
 		 218 aa  177  5.999999999999999e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.244891  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2042  guanylate kinase  56.25 
 
 		 180 aa  172  1.9999999999999998e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.677493  decreased coverage  0.00281662 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3097  guanylate kinase  53.95 
 
 		 195 aa  170  7.999999999999999e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3894  guanylate kinase  54.86 
 
 		 200 aa  169  1e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000112061  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1062  guanylate kinase  51.92 
 
 		 196 aa  169  2e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2813  Guanylate kinase  50.97 
 
 		 234 aa  168  4e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.672067 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5345  guanylate kinase  52 
 
 		 204 aa  167  4e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.313334 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1360  guanylate kinase  50.97 
 
 		 199 aa  166  2e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.288733  normal  0.0500423 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0195  guanylate kinase  50.97 
 
 		 188 aa  166  2e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0190  guanylate kinase  50.32 
 
 		 184 aa  164  5.9999999999999996e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.160767 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1730  guanylate kinase  51.95 
 
 		 199 aa  163  9e-40  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14800  guanylate kinase  50.66 
 
 		 199 aa  162  1.0000000000000001e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.338079  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18030  guanylate kinase  52.56 
 
 		 199 aa  162  2.0000000000000002e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0118922  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1761  guanylate kinase  46.5 
 
 		 207 aa  162  3e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0632  guanylate kinase  50.97 
 
 		 185 aa  161  4.0000000000000004e-39  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4124  Guanylate kinase  53.96 
 
 		 233 aa  161  4.0000000000000004e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2259  guanylate kinase  53.59 
 
 		 190 aa  160  6e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.294995  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3957  guanylate kinase  52.63 
 
 		 207 aa  159  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4020  guanylate kinase  52.63 
 
 		 207 aa  159  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1996  guanylate kinase  52.29 
 
 		 197 aa  160  1e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000144214 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0091  guanylate kinase  51.97 
 
 		 207 aa  159  1e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3948  guanylate kinase  52.63 
 
 		 207 aa  159  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00531185 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3007  guanylate kinase  50 
 
 		 223 aa  159  1e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000380844  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4127  guanylate kinase  52.63 
 
 		 207 aa  159  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.514606  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4066  guanylate kinase  52.63 
 
 		 207 aa  159  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05231  guanylate kinase  44.44 
 
 		 184 aa  159  2e-38  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0785  guanylate kinase  50 
 
 		 201 aa  159  2e-38  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000101008  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03505  guanylate kinase  53.47 
 
 		 207 aa  158  3e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0057  Guanylate kinase  53.47 
 
 		 207 aa  158  3e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4099  guanylate kinase  53.47 
 
 		 207 aa  158  3e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03457  hypothetical protein  53.47 
 
 		 207 aa  158  3e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3983  guanylate kinase  53.47 
 
 		 207 aa  158  3e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3859  guanylate kinase  53.47 
 
 		 207 aa  158  3e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0063  guanylate kinase  53.47 
 
 		 207 aa  158  3e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000240109 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4151  guanylate kinase  53.47 
 
 		 207 aa  158  3e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1237  guanylate kinase  50.66 
 
 		 195 aa  158  4e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.74814  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4145  guanylate kinase  53.52 
 
 		 207 aa  157  8e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0808  guanylate kinase  51.03 
 
 		 192 aa  157  9e-38  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.116088  normal  0.89906 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04921  guanylate kinase  43.79 
 
 		 184 aa  157  1e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.032848  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0099  guanylate kinase  45.34 
 
 		 204 aa  156  1e-37  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.261524  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3948  guanylate kinase  54.93 
 
 		 207 aa  156  2e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.498976  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5020  guanylate kinase  52.78 
 
 		 207 aa  155  3e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1677  guanylate kinase  46.84 
 
 		 217 aa  154  5.0000000000000005e-37  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2992  Guanylate kinase  51.92 
 
 		 173 aa  154  6e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.40634 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12550  guanylate kinase  51.33 
 
 		 216 aa  153  8e-37  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3426  Guanylate kinase  44.72 
 
 		 194 aa  153  1e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4867  guanylate kinase  54.23 
 
 		 207 aa  152  2e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.807857  hitchhiker  0.00555507 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3877  guanylate kinase  50.66 
 
 		 210 aa  152  2e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4981  guanylate kinase  45.7 
 
 		 198 aa  152  2e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.023832  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2003  guanylate kinase  50.32 
 
 		 216 aa  151  4e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09810  Guanylate kinase  48.68 
 
 		 194 aa  151  4e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0330  guanylate kinase  50.66 
 
 		 224 aa  151  4e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0351596  normal  0.331396 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06681  guanylate kinase  47.89 
 
 		 192 aa  151  5e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05311  guanylate kinase  45.75 
 
 		 184 aa  151  5e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3613  guanylate kinase  50 
 
 		 207 aa  151  5e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4581  guanylate kinase  49.34 
 
 		 207 aa  150  5.9999999999999996e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.877029  unclonable  0.0000000250462 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0336  guanylate kinase  49.34 
 
 		 207 aa  150  1e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.57704 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3810  guanylate kinase  50 
 
 		 207 aa  149  1e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.18291  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0467  guanylate kinase  42.48 
 
 		 184 aa  149  2e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0962  guanylate kinase  46.53 
 
 		 202 aa  149  2e-35  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0132271  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1597  guanylate kinase  50.71 
 
 		 197 aa  148  3e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00198885  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1329  guanylate kinase  41.14 
 
 		 204 aa  148  3e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000708025  normal  0.428768 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0361  guanylate kinase  49.34 
 
 		 207 aa  148  4e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2411  guanylate kinase  45.22 
 
 		 198 aa  147  5e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3623  guanylate kinase  45 
 
 		 207 aa  147  5e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1799  guanylate kinase  44.08 
 
 		 186 aa  147  6e-35  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1335  guanylate kinase  51.85 
 
 		 206 aa  147  8e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3155  guanylate kinase  49.02 
 
 		 220 aa  147  8e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0355  guanylate kinase  49.34 
 
 		 210 aa  146  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.398163  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12720  guanylate kinase  50.67 
 
 		 201 aa  146  1.0000000000000001e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0387967  normal  0.0253788 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1475  guanylate kinase  43.31 
 
 		 199 aa  146  1.0000000000000001e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000468376  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0353  guanylate kinase  49.34 
 
 		 210 aa  146  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3433  guanylate kinase  50.69 
 
 		 207 aa  146  1.0000000000000001e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.21703  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0360  guanylate kinase  49.34 
 
 		 210 aa  146  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2834  guanylate kinase  45.22 
 
 		 186 aa  146  1.0000000000000001e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.522471  normal  0.276726 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0363  guanylate kinase  49.34 
 
 		 210 aa  146  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000053777 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0045  guanylate kinase  51.41 
 
 		 207 aa  145  2.0000000000000003e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05221  guanylate kinase  43.42 
 
 		 186 aa  145  2.0000000000000003e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.645705  normal  0.16422 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2370  guanylate kinase  44.59 
 
 		 198 aa  145  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0470056  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2417  guanylate kinase  44.59 
 
 		 198 aa  145  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.391978 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00153  guanylate kinase  51.45 
 
 		 213 aa  145  3e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0558456  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1850  guanylate kinase  52.94 
 
 		 188 aa  145  3e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.112941  normal  0.242923 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3147  guanylate kinase  50.35 
 
 		 206 aa  145  3e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1948  guanylate kinase  45.27 
 
 		 205 aa  145  3e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2578  guanylate kinase  46.79 
 
 		 202 aa  145  3e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0638633  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15620  guanylate kinase  47.37 
 
 		 208 aa  145  3e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0579342  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0266  guanylate kinase  50 
 
 		 207 aa  145  3e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0041  guanylate kinase  51.41 
 
 		 207 aa  144  4.0000000000000006e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4176  guanylate kinase  51.41 
 
 		 207 aa  144  4.0000000000000006e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0297777  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3630  guanylate kinase  48.68 
 
 		 224 aa  144  5e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.09026  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1191  guanylate kinase  50 
 
 		 183 aa  144  6e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0997306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3497  guanylate kinase  48.68 
 
 		 207 aa  144  6e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5238  guanylate kinase  51.72 
 
 		 199 aa  144  6e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4218  guanylate kinase  51.11 
 
 		 214 aa  144  6e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1058  guanylate kinase  46.62 
 
 		 204 aa  144  6e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000145749  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1700  guanylate kinase  47.18 
 
 		 200 aa  144  7.0000000000000006e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3740  guanylate kinase  44.31 
 
 		 203 aa  144  7.0000000000000006e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0778245 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>