More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0808 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_0808  guanylate kinase  100 
 
 		 192 aa  395  1e-109  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.116088  normal  0.89906 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0785  guanylate kinase  52.49 
 
 		 201 aa  191  4e-48  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000101008  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2946  guanylate kinase  52.51 
 
 		 181 aa  191  6e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.641883  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09810  Guanylate kinase  51.12 
 
 		 194 aa  189  1e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0483  guanylate kinase  49.44 
 
 		 181 aa  189  2e-47  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0632  guanylate kinase  47.49 
 
 		 185 aa  188  4e-47  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0962  guanylate kinase  47.46 
 
 		 202 aa  185  4e-46  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0132271  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07800  guanylate kinase  49.44 
 
 		 189 aa  184  5e-46  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.364153  normal  0.897368 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2001  guanylate kinase  47.73 
 
 		 216 aa  184  6e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1719  guanylate kinase  47.73 
 
 		 216 aa  184  6e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3894  guanylate kinase  47.73 
 
 		 200 aa  184  1.0000000000000001e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000112061  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1660  guanylate kinase  51.7 
 
 		 190 aa  183  2.0000000000000003e-45  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000545308  hitchhiker  0.000108168 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2168  guanylate kinase  50.82 
 
 		 188 aa  180  9.000000000000001e-45  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.822318  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1730  guanylate kinase  48.04 
 
 		 199 aa  180  1e-44  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1597  guanylate kinase  48.86 
 
 		 197 aa  179  2e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00198885  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1761  guanylate kinase  46.02 
 
 		 207 aa  179  2e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0985  guanylate kinase  47.65 
 
 		 207 aa  179  2.9999999999999997e-44  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00175631  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1475  guanylate kinase  48.86 
 
 		 199 aa  179  2.9999999999999997e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000468376  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2834  guanylate kinase  44.44 
 
 		 186 aa  178  4e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.522471  normal  0.276726 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1145  guanylate kinase  47.65 
 
 		 207 aa  177  7e-44  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.49439  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0190  guanylate kinase  49.16 
 
 		 184 aa  177  8e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.160767 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0195  guanylate kinase  49.16 
 
 		 188 aa  177  1e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4124  Guanylate kinase  48.85 
 
 		 233 aa  176  2e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04671  guanylate kinase  46.41 
 
 		 185 aa  176  2e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0895533  normal  0.75989 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3630  guanylate kinase  49.72 
 
 		 209 aa  176  2e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.601224  normal  0.100424 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0099  guanylate kinase  46.86 
 
 		 204 aa  174  6e-43  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.261524  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4981  guanylate kinase  47.46 
 
 		 198 aa  174  9e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.023832  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3208  guanylate kinase  49.72 
 
 		 186 aa  173  9.999999999999999e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.703275  normal  0.494303 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1360  guanylate kinase  48.3 
 
 		 199 aa  172  1.9999999999999998e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.288733  normal  0.0500423 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3426  Guanylate kinase  46.33 
 
 		 194 aa  173  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05311  guanylate kinase  45.3 
 
 		 184 aa  172  2.9999999999999996e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1329  guanylate kinase  47.37 
 
 		 204 aa  171  5e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000708025  normal  0.428768 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2138  guanylate kinase  47.16 
 
 		 205 aa  171  6.999999999999999e-42  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.585915  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1315  guanylate kinase  47.54 
 
 		 203 aa  171  6.999999999999999e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.559001  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1996  guanylate kinase  46.93 
 
 		 197 aa  171  6.999999999999999e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000144214 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02200  guanylate kinase  48.4 
 
 		 198 aa  171  6.999999999999999e-42  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1293  guanylate kinase  48.3 
 
 		 208 aa  170  1e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.316602  normal  0.120188 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1062  guanylate kinase  48.55 
 
 		 196 aa  169  3e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2411  guanylate kinase  45.7 
 
 		 198 aa  169  3e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1406  Guanylate kinase  48.9 
 
 		 202 aa  168  4e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.77411  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1078  guanylate kinase  44.89 
 
 		 212 aa  168  4e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1473  guanylate kinase  44.44 
 
 		 191 aa  168  4e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.110392  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1715  guanylate kinase  49.14 
 
 		 218 aa  168  5e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.244891  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5345  guanylate kinase  48.59 
 
 		 204 aa  167  6e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.313334 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2813  Guanylate kinase  45.81 
 
 		 234 aa  167  6e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.672067 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2370  guanylate kinase  45.7 
 
 		 198 aa  167  6e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0470056  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2417  guanylate kinase  45.7 
 
 		 198 aa  167  6e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.391978 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0330  guanylate kinase  44.81 
 
 		 224 aa  167  7e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0351596  normal  0.331396 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06681  guanylate kinase  44.32 
 
 		 192 aa  167  8e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3845  guanylate kinase  46.63 
 
 		 202 aa  167  8e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1035  guanylate kinase  43.09 
 
 		 199 aa  167  8e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3613  guanylate kinase  44.26 
 
 		 207 aa  167  8e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04921  guanylate kinase  44.38 
 
 		 184 aa  167  1e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.032848  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0840  guanylate kinase  46.37 
 
 		 202 aa  167  1e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3155  guanylate kinase  43.6 
 
 		 220 aa  167  1e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2259  guanylate kinase  48.04 
 
 		 190 aa  167  1e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.294995  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1700  guanylate kinase  43.17 
 
 		 200 aa  167  1e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2318  guanylate kinase  43.41 
 
 		 198 aa  166  2e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000195285  hitchhiker  0.00462206 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3810  guanylate kinase  44.81 
 
 		 207 aa  166  2e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.18291  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11418  guanylate kinase  45.71 
 
 		 217 aa  165  4e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000747341  normal  0.348875 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0361  guanylate kinase  44.26 
 
 		 207 aa  165  4e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1443  guanylate kinase  49.11 
 
 		 210 aa  165  4e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.86751  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0355  guanylate kinase  44.26 
 
 		 210 aa  164  5e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.398163  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05231  guanylate kinase  43.82 
 
 		 184 aa  164  5e-40  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0353  guanylate kinase  44.26 
 
 		 210 aa  164  5e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0360  guanylate kinase  44.26 
 
 		 210 aa  164  5e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3630  guanylate kinase  43.96 
 
 		 224 aa  164  5.9999999999999996e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.09026  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3433  guanylate kinase  45.6 
 
 		 207 aa  164  6.9999999999999995e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.21703  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1191  guanylate kinase  49.43 
 
 		 183 aa  163  1.0000000000000001e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0997306  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0363  guanylate kinase  43.72 
 
 		 210 aa  163  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000053777 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5548  guanylate kinase  46.74 
 
 		 199 aa  163  1.0000000000000001e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0793  guanylate kinase  44.89 
 
 		 212 aa  162  2.0000000000000002e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.637166 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_17617  predicted protein  47.25 
 
 		 227 aa  162  2.0000000000000002e-39  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.910339  hitchhiker  0.000867282 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0266  guanylate kinase  45.36 
 
 		 207 aa  162  2.0000000000000002e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2238  guanylate kinase  42.54 
 
 		 203 aa  162  3e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2155  guanylate kinase  46.86 
 
 		 221 aa  162  3e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000431933  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1791  guanylate kinase  42.08 
 
 		 201 aa  162  3e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.395222  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0100  guanylate kinase  44.77 
 
 		 202 aa  162  3e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0912271  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4019  guanylate kinase  45.51 
 
 		 204 aa  162  4.0000000000000004e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.565127  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18030  guanylate kinase  46.67 
 
 		 199 aa  162  4.0000000000000004e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0118922  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14800  guanylate kinase  44.69 
 
 		 199 aa  161  6e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.338079  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0087  guanylate kinase  46.74 
 
 		 196 aa  161  6e-39  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.388944  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4107  guanylate kinase  46.82 
 
 		 227 aa  161  6e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0130992  normal  0.288359 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3007  guanylate kinase  44.81 
 
 		 223 aa  161  6e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000380844  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0856  guanylate kinase  44.44 
 
 		 216 aa  161  6e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0365  guanylate kinase  44.81 
 
 		 207 aa  161  6e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3195  guanylate kinase  45.93 
 
 		 184 aa  160  8.000000000000001e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0922592  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3877  guanylate kinase  44.69 
 
 		 210 aa  160  8.000000000000001e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2028  guanylate kinase  45.71 
 
 		 220 aa  160  8.000000000000001e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.413126  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2276  guanylate kinase  46.86 
 
 		 221 aa  160  8.000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0318334  normal  0.859222 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4581  guanylate kinase  45.45 
 
 		 207 aa  160  8.000000000000001e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.877029  unclonable  0.0000000250462 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0336  guanylate kinase  44.69 
 
 		 207 aa  160  8.000000000000001e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.57704 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2537  guanylate kinase  40.78 
 
 		 183 aa  160  1e-38  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3097  guanylate kinase  46.71 
 
 		 195 aa  160  1e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2052  guanylate kinase  48.86 
 
 		 206 aa  160  1e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1335  guanylate kinase  45.14 
 
 		 206 aa  160  1e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0520  guanylate kinase  45.98 
 
 		 227 aa  160  1e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0959  guanylate kinase  45.98 
 
 		 227 aa  160  1e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.465114  normal  0.426596 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0999  guanylate kinase  45.98 
 
 		 227 aa  160  1e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2578  guanylate kinase  45.51 
 
 		 202 aa  160  1e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0638633  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>