More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_5548 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_5548  guanylate kinase  100 
 
 
199 aa  405  1.0000000000000001e-112  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0599  guanylate kinase  63.68 
 
 
192 aa  256  2e-67  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.68326  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3827  guanylate kinase  62.96 
 
 
189 aa  245  3e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.536013  normal  0.161762 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2168  guanylate kinase  56.45 
 
 
188 aa  219  3e-56  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.822318  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4197  guanylate kinase  56.15 
 
 
189 aa  214  5.9999999999999996e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00373006  normal  0.574711 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02200  guanylate kinase  56.45 
 
 
198 aa  202  2e-51  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0742  guanylate kinase  54.84 
 
 
190 aa  202  4e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0512  guanylate kinase  50.81 
 
 
188 aa  191  4e-48  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.101295 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1016  guanylate kinase  50.27 
 
 
188 aa  190  1e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0012  guanylate kinase  45.16 
 
 
189 aa  171  9e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.897517  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0408  guanylate kinase  45.95 
 
 
191 aa  167  9e-41  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.308329  normal  0.957996 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1456  guanylate kinase  43.24 
 
 
190 aa  165  5e-40  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000938556  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0808  guanylate kinase  46.74 
 
 
192 aa  163  1.0000000000000001e-39  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.116088  normal  0.89906 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0373  guanylate kinase  44.32 
 
 
194 aa  163  2.0000000000000002e-39  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.282119 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0404  guanylate kinase  43.78 
 
 
194 aa  158  5e-38  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0209165  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1719  guanylate kinase  42.71 
 
 
216 aa  153  1e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2001  guanylate kinase  42.71 
 
 
216 aa  153  2e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2052  guanylate kinase  42.93 
 
 
206 aa  150  1e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0985  guanylate kinase  40.98 
 
 
207 aa  149  2e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00175631  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1145  guanylate kinase  40.98 
 
 
207 aa  148  6e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.49439  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2946  guanylate kinase  43.48 
 
 
181 aa  146  2.0000000000000003e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.641883  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2692  guanylate kinase  41.85 
 
 
225 aa  144  7.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0099  guanylate kinase  42.62 
 
 
204 aa  144  1e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.261524  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0375  guanylate kinase  41.62 
 
 
194 aa  144  1e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0296296  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1773  guanylate kinase  40 
 
 
197 aa  143  2e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.159684 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2606  guanylate kinase  41.3 
 
 
226 aa  142  3e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.100354  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2787  guanylate kinase  41.3 
 
 
225 aa  142  3e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0306  guanylate kinase  41.95 
 
 
192 aa  141  7e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0726977  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0195  guanylate kinase  38.62 
 
 
188 aa  139  3e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1089  guanylate kinase  40.57 
 
 
204 aa  139  3.9999999999999997e-32  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.350405  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1761  guanylate kinase  39.23 
 
 
207 aa  137  7e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0190  guanylate kinase  38.46 
 
 
184 aa  137  7e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.160767 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2573  guanylate kinase  40.68 
 
 
223 aa  137  7.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0392077 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2158  guanylate kinase  39.56 
 
 
205 aa  136  2e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05231  guanylate kinase  38.89 
 
 
184 aa  135  3.0000000000000003e-31  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1597  guanylate kinase  38.8 
 
 
197 aa  136  3.0000000000000003e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00198885  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0483  guanylate kinase  40 
 
 
181 aa  134  7.000000000000001e-31  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3845  guanylate kinase  38.25 
 
 
202 aa  133  9.999999999999999e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04921  guanylate kinase  38.33 
 
 
184 aa  134  9.999999999999999e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.032848  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2537  guanylate kinase  36.81 
 
 
183 aa  133  9.999999999999999e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3208  guanylate kinase  38.12 
 
 
186 aa  133  1.9999999999999998e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.703275  normal  0.494303 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0467  guanylate kinase  37.02 
 
 
184 aa  133  1.9999999999999998e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0207  guanylate kinase  37.23 
 
 
190 aa  133  1.9999999999999998e-30  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.931421  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2411  guanylate kinase  38.46 
 
 
198 aa  131  6e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05311  guanylate kinase  38.33 
 
 
184 aa  131  6.999999999999999e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2523  guanylate kinase  36.99 
 
 
214 aa  130  9e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1473  guanylate kinase  37.84 
 
 
191 aa  130  9e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.110392  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2417  guanylate kinase  38.46 
 
 
198 aa  130  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.391978 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2370  guanylate kinase  38.46 
 
 
198 aa  130  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0470056  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1220  guanylate kinase  39.78 
 
 
218 aa  130  1.0000000000000001e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.289802 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1256  guanylate kinase  38.25 
 
 
203 aa  129  2.0000000000000002e-29  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2834  guanylate kinase  36.41 
 
 
186 aa  129  2.0000000000000002e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.522471  normal  0.276726 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04671  guanylate kinase  37.99 
 
 
185 aa  129  3e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0895533  normal  0.75989 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4124  Guanylate kinase  36.93 
 
 
233 aa  128  5.0000000000000004e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0177  guanylate kinase  37.5 
 
 
206 aa  127  7.000000000000001e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000695034 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0294  guanylate kinase  40.46 
 
 
212 aa  127  1.0000000000000001e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5344  guanylate kinase  38.86 
 
 
206 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0394211 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1660  guanylate kinase  37.16 
 
 
190 aa  126  2.0000000000000002e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000545308  hitchhiker  0.000108168 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1791  guanylate kinase  34.07 
 
 
201 aa  126  2.0000000000000002e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.395222  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0100  guanylate kinase  40.57 
 
 
202 aa  126  2.0000000000000002e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0912271  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0545  guanylate kinase  37.7 
 
 
203 aa  126  2.0000000000000002e-28  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.071067  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1205  guanylate kinase  35.5 
 
 
220 aa  126  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.197853  hitchhiker  0.00108752 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1436  guanylate kinase  34.67 
 
 
203 aa  126  2.0000000000000002e-28  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5296  guanylate kinase  38.51 
 
 
206 aa  126  3e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0446222  normal  0.471806 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2714  guanylate kinase  36.26 
 
 
213 aa  125  3e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0577  guanylate kinase  37.16 
 
 
204 aa  125  3e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.213259  normal  0.177715 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1266  guanylate kinase  37.91 
 
 
217 aa  125  3e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.979121  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3155  guanylate kinase  39.29 
 
 
220 aa  125  3e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11418  guanylate kinase  37.36 
 
 
217 aa  125  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000747341  normal  0.348875 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1104  guanylate kinase  38.46 
 
 
211 aa  125  4.0000000000000003e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.631702  normal  0.011032 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3426  Guanylate kinase  37.02 
 
 
194 aa  125  4.0000000000000003e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07800  guanylate kinase  39.18 
 
 
189 aa  125  4.0000000000000003e-28  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.364153  normal  0.897368 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1475  guanylate kinase  36.36 
 
 
199 aa  125  5e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000468376  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0251  guanylate kinase  35.94 
 
 
207 aa  125  5e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000337673  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4981  guanylate kinase  33.15 
 
 
198 aa  125  6e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.023832  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0464  guanylate kinase  35.75 
 
 
220 aa  124  7e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.328382  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_72675  guanylate kinase (GUK1)  38.12 
 
 
193 aa  124  7e-28  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.12779  normal  0.729563 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3613  guanylate kinase  36.81 
 
 
207 aa  124  7e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1062  guanylate kinase  34.5 
 
 
220 aa  124  7e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0143004 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0469  guanylate kinase  35.75 
 
 
220 aa  124  7e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.149667  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0759  guanylate kinase  33.85 
 
 
219 aa  124  8.000000000000001e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.784504  normal  0.122144 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3877  guanylate kinase  38.86 
 
 
210 aa  124  9e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09810  Guanylate kinase  36.46 
 
 
194 aa  124  9e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3894  guanylate kinase  34.81 
 
 
200 aa  124  9e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000112061  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2974  guanylate kinase  34.81 
 
 
219 aa  124  9e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.291122 
 
 
-
 
NC_002620  TC0299  guanylate kinase  40.91 
 
 
205 aa  124  1e-27  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1058  guanylate kinase  37.36 
 
 
204 aa  123  1e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000145749  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0729  guanylate kinase  36.78 
 
 
209 aa  123  1e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.148488 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0576  guanylate kinase  35.75 
 
 
220 aa  123  1e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.400734  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0052  guanylate kinase  37.57 
 
 
210 aa  124  1e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00408303  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1003  guanylate kinase  40.25 
 
 
221 aa  124  1e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0330  guanylate kinase  36.81 
 
 
224 aa  124  1e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0351596  normal  0.331396 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1535  guanylate kinase  35.36 
 
 
220 aa  122  2e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0748909  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1723  guanylate kinase  37.16 
 
 
208 aa  123  2e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.671499 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5204  guanylate kinase  37.93 
 
 
206 aa  123  2e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.952406  normal  0.288026 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5842  guanylate kinase  39.88 
 
 
259 aa  123  2e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.509377 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1529  guanylate kinase  37.91 
 
 
217 aa  123  2e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.2579 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1700  guanylate kinase  35.16 
 
 
200 aa  123  2e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2084  guanylate kinase  41.95 
 
 
207 aa  123  2e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.338387  decreased coverage  0.00871463 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1948  guanylate kinase  35.38 
 
 
205 aa  123  2e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>