More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_0404 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_0404  guanylate kinase  100 
 
 		 194 aa  394  1e-109  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0209165  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1773  guanylate kinase  68.91 
 
 		 197 aa  279  2e-74  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.159684 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0375  guanylate kinase  69.89 
 
 		 194 aa  271  4.0000000000000004e-72  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0296296  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1456  guanylate kinase  63.83 
 
 		 190 aa  254  5e-67  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000938556  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0373  guanylate kinase  61.14 
 
 		 194 aa  247  8e-65  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.282119 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0306  guanylate kinase  63.44 
 
 		 192 aa  242  3e-63  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0726977  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0408  guanylate kinase  62.7 
 
 		 191 aa  241  5e-63  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.308329  normal  0.957996 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0012  guanylate kinase  48.09 
 
 		 189 aa  175  3e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.897517  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02200  guanylate kinase  45.41 
 
 		 198 aa  167  1e-40  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1035  guanylate kinase  43.09 
 
 		 199 aa  164  6.9999999999999995e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0599  guanylate kinase  43.39 
 
 		 192 aa  164  1.0000000000000001e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.68326  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0808  guanylate kinase  40.21 
 
 		 192 aa  160  2e-38  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.116088  normal  0.89906 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2001  guanylate kinase  42.54 
 
 		 216 aa  159  2e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1719  guanylate kinase  42.31 
 
 		 216 aa  159  2e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1016  guanylate kinase  41.53 
 
 		 188 aa  159  3e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0632  guanylate kinase  43.17 
 
 		 185 aa  159  3e-38  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4162  guanylate kinase  44.57 
 
 		 194 aa  159  3e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.13383  normal  0.396618 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2168  guanylate kinase  40.86 
 
 		 188 aa  158  4e-38  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.822318  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5548  guanylate kinase  43.78 
 
 		 199 aa  158  5e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0195  guanylate kinase  44.57 
 
 		 188 aa  157  6e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1761  guanylate kinase  41.21 
 
 		 207 aa  157  1e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2158  guanylate kinase  42.62 
 
 		 205 aa  157  1e-37  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0765  Guanylate kinase  42.46 
 
 		 216 aa  157  1e-37  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0958444  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09810  Guanylate kinase  43.33 
 
 		 194 aa  155  2e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05311  guanylate kinase  41.53 
 
 		 184 aa  156  2e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0190  guanylate kinase  43.02 
 
 		 184 aa  155  4e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.160767 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1145  guanylate kinase  43.33 
 
 		 207 aa  155  4e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.49439  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1597  guanylate kinase  43.33 
 
 		 197 aa  154  6e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00198885  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4197  guanylate kinase  40.11 
 
 		 189 aa  154  6e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00373006  normal  0.574711 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0985  guanylate kinase  42.78 
 
 		 207 aa  154  8e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00175631  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3894  guanylate kinase  41.21 
 
 		 200 aa  154  9e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000112061  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1730  guanylate kinase  43.5 
 
 		 199 aa  153  1e-36  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3827  guanylate kinase  41.49 
 
 		 189 aa  153  2e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.536013  normal  0.161762 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5344  guanylate kinase  42.7 
 
 		 206 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0394211 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1398  guanylate kinase  41.85 
 
 		 209 aa  152  2.9999999999999998e-36  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00115166  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1948  guanylate kinase  43.41 
 
 		 205 aa  151  5e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0785  guanylate kinase  42.31 
 
 		 201 aa  151  5e-36  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000101008  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3630  guanylate kinase  43.65 
 
 		 209 aa  151  5e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.601224  normal  0.100424 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1058  guanylate kinase  42.39 
 
 		 204 aa  151  5.9999999999999996e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000145749  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06681  guanylate kinase  45.09 
 
 		 192 aa  151  5.9999999999999996e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0962  guanylate kinase  41.99 
 
 		 202 aa  151  7e-36  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0132271  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5296  guanylate kinase  42.7 
 
 		 206 aa  150  8e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0446222  normal  0.471806 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5345  guanylate kinase  44.38 
 
 		 204 aa  150  8.999999999999999e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.313334 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3208  guanylate kinase  41.62 
 
 		 186 aa  150  1e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.703275  normal  0.494303 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1475  guanylate kinase  44 
 
 		 199 aa  150  1e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000468376  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1660  guanylate kinase  43.09 
 
 		 190 aa  150  1e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000545308  hitchhiker  0.000108168 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4124  Guanylate kinase  41.67 
 
 		 233 aa  149  2e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5842  guanylate kinase  41.9 
 
 		 259 aa  149  2e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.509377 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4384  guanylate kinase  38.1 
 
 		 207 aa  149  2e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2284  guanylate kinase  43.89 
 
 		 242 aa  149  3e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.429726  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0177  guanylate kinase  40.54 
 
 		 206 aa  149  4e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000695034 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0407  guanylate kinase  39.56 
 
 		 206 aa  149  4e-35  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.360667  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1780  guanylate kinase  39.56 
 
 		 206 aa  149  4e-35  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0438453  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3233  guanylate kinase  40.56 
 
 		 215 aa  148  4e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0742  guanylate kinase  41.27 
 
 		 190 aa  148  5e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3426  Guanylate kinase  40.22 
 
 		 194 aa  148  5e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5204  guanylate kinase  42.16 
 
 		 206 aa  148  5e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.952406  normal  0.288026 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07800  guanylate kinase  39.34 
 
 		 189 aa  148  6e-35  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.364153  normal  0.897368 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1700  guanylate kinase  38.59 
 
 		 200 aa  147  7e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3695  guanylate kinase  40.76 
 
 		 225 aa  147  7e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.241605 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04921  guanylate kinase  39.34 
 
 		 184 aa  147  8e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.032848  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1473  guanylate kinase  39.57 
 
 		 191 aa  147  8e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.110392  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0467  guanylate kinase  40.44 
 
 		 184 aa  147  1.0000000000000001e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0483  guanylate kinase  41.11 
 
 		 181 aa  146  1.0000000000000001e-34  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0512  guanylate kinase  40.86 
 
 		 188 aa  146  2.0000000000000003e-34  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.101295 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2052  guanylate kinase  41.44 
 
 		 206 aa  146  2.0000000000000003e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05231  guanylate kinase  39.34 
 
 		 184 aa  146  2.0000000000000003e-34  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1791  guanylate kinase  38.64 
 
 		 201 aa  146  2.0000000000000003e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.395222  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0313  guanylate kinase  40.54 
 
 		 209 aa  145  3e-34  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0875391  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0563  guanylate kinase  40.56 
 
 		 212 aa  145  4.0000000000000006e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0717  guanylate kinase  40.56 
 
 		 212 aa  145  4.0000000000000006e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000116826 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00153  guanylate kinase  41.08 
 
 		 213 aa  145  5e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0558456  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1677  guanylate kinase  40.78 
 
 		 217 aa  144  5e-34  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0251  guanylate kinase  39.67 
 
 		 207 aa  145  5e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000337673  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1638  guanylate kinase  44.94 
 
 		 208 aa  144  7.0000000000000006e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2401  guanylate kinase  37.7 
 
 		 202 aa  144  8.000000000000001e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0298091  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0776  guanylate kinase  40.44 
 
 		 207 aa  142  2e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.753859  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2286  guanylate kinase  41.85 
 
 		 202 aa  142  2e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.30068  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1315  guanylate kinase  42.93 
 
 		 203 aa  142  2e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.559001  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2138  guanylate kinase  37.84 
 
 		 205 aa  143  2e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.585915  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1443  guanylate kinase  41.11 
 
 		 210 aa  142  3e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.86751  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3155  guanylate kinase  38.8 
 
 		 220 aa  142  3e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04671  guanylate kinase  41.24 
 
 		 185 aa  142  3e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0895533  normal  0.75989 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0634  guanylate kinase  41.67 
 
 		 210 aa  141  5e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1268  guanylate kinase  40.88 
 
 		 207 aa  141  5e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.33638  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1293  guanylate kinase  40.88 
 
 		 207 aa  141  5e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0099  guanylate kinase  40.78 
 
 		 204 aa  141  5e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.261524  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2834  guanylate kinase  40.22 
 
 		 186 aa  141  5e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.522471  normal  0.276726 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4981  guanylate kinase  40.22 
 
 		 198 aa  141  5e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.023832  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3479  guanylate kinase  36.41 
 
 		 220 aa  141  6e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0035  guanylate kinase  38.55 
 
 		 209 aa  141  7e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl195  guanylate kinase  39.13 
 
 		 297 aa  140  8e-33  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.0722226  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1529  guanylate kinase  37.91 
 
 		 217 aa  141  8e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.2579 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0207  guanylate kinase  41.76 
 
 		 190 aa  140  9e-33  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.931421  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1266  guanylate kinase  38.59 
 
 		 217 aa  140  9e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.979121  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3936  guanylate kinase  39.13 
 
 		 212 aa  140  9e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15620  guanylate kinase  39.78 
 
 		 208 aa  140  9.999999999999999e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0579342  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0208  guanylate kinase  41.21 
 
 		 297 aa  140  9.999999999999999e-33  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3195  guanylate kinase  41.81 
 
 		 184 aa  140  9.999999999999999e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0922592  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2472  guanylate kinase  35.48 
 
 		 220 aa  140  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>