More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_0742 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_0742  guanylate kinase  100 
 
 
190 aa  386  1e-106  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02200  guanylate kinase  74.05 
 
 
198 aa  276  1e-73  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2168  guanylate kinase  65.24 
 
 
188 aa  263  1e-69  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.822318  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4197  guanylate kinase  55.79 
 
 
189 aa  208  4e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00373006  normal  0.574711 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3827  guanylate kinase  53.23 
 
 
189 aa  206  1e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.536013  normal  0.161762 
 
 
-
 
NC_002950  PG0512  guanylate kinase  51.61 
 
 
188 aa  202  2e-51  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.101295 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5548  guanylate kinase  54.84 
 
 
199 aa  202  3e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0599  guanylate kinase  51.87 
 
 
192 aa  199  3e-50  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.68326  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0408  guanylate kinase  47.34 
 
 
191 aa  173  9.999999999999999e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.308329  normal  0.957996 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1016  guanylate kinase  46.24 
 
 
188 aa  169  3e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0012  guanylate kinase  44.5 
 
 
189 aa  167  6e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.897517  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0195  guanylate kinase  42.93 
 
 
188 aa  157  7e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0190  guanylate kinase  42.93 
 
 
184 aa  157  9e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.160767 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0373  guanylate kinase  43.09 
 
 
194 aa  156  2e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.282119 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0808  guanylate kinase  44.86 
 
 
192 aa  154  7e-37  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.116088  normal  0.89906 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1456  guanylate kinase  41.4 
 
 
190 aa  148  4e-35  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000938556  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0404  guanylate kinase  41.27 
 
 
194 aa  148  5e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0209165  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1473  guanylate kinase  40.74 
 
 
191 aa  147  7e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.110392  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1329  guanylate kinase  38.8 
 
 
204 aa  145  3e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000708025  normal  0.428768 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2946  guanylate kinase  41.18 
 
 
181 aa  145  4.0000000000000006e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.641883  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3426  Guanylate kinase  40.98 
 
 
194 aa  145  4.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1791  guanylate kinase  42.6 
 
 
201 aa  145  4.0000000000000006e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.395222  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3845  guanylate kinase  42.31 
 
 
202 aa  145  5e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2052  guanylate kinase  43.17 
 
 
206 aa  144  8.000000000000001e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1948  guanylate kinase  40.11 
 
 
205 aa  144  9e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0361  guanylate kinase  39.34 
 
 
207 aa  143  1e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0207  guanylate kinase  41.36 
 
 
190 aa  144  1e-33  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.931421  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1761  guanylate kinase  42.86 
 
 
207 aa  144  1e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4145  guanylate kinase  38.17 
 
 
207 aa  143  1e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3810  guanylate kinase  39.34 
 
 
207 aa  142  2e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.18291  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3147  guanylate kinase  43.11 
 
 
206 aa  142  3e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3948  guanylate kinase  38.71 
 
 
207 aa  142  3e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.498976  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3613  guanylate kinase  39.34 
 
 
207 aa  142  3e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1773  guanylate kinase  39.78 
 
 
197 aa  142  4e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.159684 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0330  guanylate kinase  39.34 
 
 
224 aa  142  4e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0351596  normal  0.331396 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1058  guanylate kinase  41.21 
 
 
204 aa  141  5e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000145749  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0483  guanylate kinase  42.93 
 
 
181 aa  141  5e-33  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0091  guanylate kinase  39.25 
 
 
207 aa  141  6e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3894  guanylate kinase  40.68 
 
 
200 aa  141  6e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000112061  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2692  guanylate kinase  42.08 
 
 
225 aa  141  6e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2787  guanylate kinase  42.08 
 
 
225 aa  141  6e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4127  guanylate kinase  39.78 
 
 
207 aa  141  7e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.514606  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4066  guanylate kinase  39.78 
 
 
207 aa  141  7e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3957  guanylate kinase  39.78 
 
 
207 aa  141  7e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4020  guanylate kinase  39.78 
 
 
207 aa  141  7e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3948  guanylate kinase  39.78 
 
 
207 aa  141  7e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00531185 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2327  guanylate kinase  41.85 
 
 
203 aa  140  9.999999999999999e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000761567  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2606  guanylate kinase  41.53 
 
 
226 aa  140  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.100354  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1315  guanylate kinase  40.98 
 
 
203 aa  140  9.999999999999999e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.559001  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3630  guanylate kinase  40.11 
 
 
209 aa  139  1.9999999999999998e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.601224  normal  0.100424 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0467  guanylate kinase  40.76 
 
 
184 aa  139  3e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2919  guanylate kinase  39.89 
 
 
211 aa  138  4.999999999999999e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1563  guanylate kinase  39.89 
 
 
211 aa  138  4.999999999999999e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.106259  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03505  guanylate kinase  38.71 
 
 
207 aa  138  6e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0057  Guanylate kinase  38.71 
 
 
207 aa  138  6e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0063  guanylate kinase  38.71 
 
 
207 aa  138  6e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000240109 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4151  guanylate kinase  38.71 
 
 
207 aa  138  6e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4099  guanylate kinase  38.71 
 
 
207 aa  138  6e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3859  guanylate kinase  38.71 
 
 
207 aa  138  6e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5020  guanylate kinase  38.71 
 
 
207 aa  138  6e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03457  hypothetical protein  38.71 
 
 
207 aa  138  6e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3983  guanylate kinase  38.71 
 
 
207 aa  138  6e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05311  guanylate kinase  40.22 
 
 
184 aa  137  1e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4218  guanylate kinase  43.71 
 
 
214 aa  137  1e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0862  guanylate kinase  44.31 
 
 
206 aa  137  1e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.693982  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2537  guanylate kinase  45.05 
 
 
183 aa  137  1e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0947  guanylate kinase  44.31 
 
 
206 aa  137  1e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.0000973722  hitchhiker  0.000000351977 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2238  guanylate kinase  39.67 
 
 
203 aa  136  2e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1089  guanylate kinase  41.48 
 
 
204 aa  136  2e-31  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.350405  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09810  Guanylate kinase  39.13 
 
 
194 aa  136  2e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1597  guanylate kinase  42.26 
 
 
197 aa  136  2e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00198885  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2523  guanylate kinase  39.33 
 
 
214 aa  136  2e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1145  guanylate kinase  41.53 
 
 
207 aa  136  2e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.49439  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0306  guanylate kinase  43.27 
 
 
192 aa  136  2e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0726977  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1035  guanylate kinase  40.22 
 
 
199 aa  135  2e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2974  guanylate kinase  37.16 
 
 
219 aa  136  2e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.291122 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0355  guanylate kinase  38.25 
 
 
210 aa  135  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.398163  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0052  guanylate kinase  39.56 
 
 
210 aa  135  3.0000000000000003e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00408303  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0360  guanylate kinase  38.25 
 
 
210 aa  135  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2305  guanylate kinase  37.16 
 
 
219 aa  135  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00214709  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0353  guanylate kinase  38.25 
 
 
210 aa  135  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3630  guanylate kinase  38.25 
 
 
224 aa  135  4e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.09026  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2001  guanylate kinase  41.48 
 
 
216 aa  135  4e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1719  guanylate kinase  41.48 
 
 
216 aa  135  4e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4867  guanylate kinase  37.63 
 
 
207 aa  135  5e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.807857  hitchhiker  0.00555507 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1176  guanylate kinase  38.04 
 
 
206 aa  135  5e-31  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000749098  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3354  guanylate kinase  39.78 
 
 
212 aa  135  5e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0985  guanylate kinase  40.98 
 
 
207 aa  135  5e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00175631  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4124  Guanylate kinase  40.68 
 
 
233 aa  135  5e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1713  guanylate kinase  39.56 
 
 
198 aa  135  5e-31  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.463283  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1062  guanylate kinase  36.61 
 
 
220 aa  134  6.0000000000000005e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0143004 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3433  guanylate kinase  39.56 
 
 
207 aa  134  6.0000000000000005e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.21703  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0363  guanylate kinase  37.7 
 
 
210 aa  134  7.000000000000001e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000053777 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1677  guanylate kinase  43.17 
 
 
217 aa  134  9e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3479  guanylate kinase  37.16 
 
 
220 aa  133  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2472  guanylate kinase  36.61 
 
 
220 aa  133  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1406  Guanylate kinase  42.94 
 
 
202 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.77411  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1050  guanylate kinase  42.13 
 
 
202 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000462152 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2000  guanylate kinase  36.26 
 
 
223 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0607745  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2277  guanylate kinase  36.26 
 
 
223 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.140709  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>