More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1016 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_1016  guanylate kinase  100 
 
 
188 aa  385  1e-106  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3827  guanylate kinase  52.94 
 
 
189 aa  207  8e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.536013  normal  0.161762 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0599  guanylate kinase  49.2 
 
 
192 aa  196  1.0000000000000001e-49  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.68326  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4197  guanylate kinase  50.81 
 
 
189 aa  191  5e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00373006  normal  0.574711 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5548  guanylate kinase  50.27 
 
 
199 aa  190  1e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0012  guanylate kinase  50.82 
 
 
189 aa  189  2e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.897517  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2168  guanylate kinase  48.13 
 
 
188 aa  189  2e-47  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.822318  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0512  guanylate kinase  47.31 
 
 
188 aa  180  1e-44  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.101295 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02200  guanylate kinase  46.49 
 
 
198 aa  171  3.9999999999999995e-42  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0742  guanylate kinase  46.24 
 
 
190 aa  169  3e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1456  guanylate kinase  44.62 
 
 
190 aa  167  6e-41  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000938556  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0408  guanylate kinase  43.78 
 
 
191 aa  162  2.0000000000000002e-39  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.308329  normal  0.957996 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2537  guanylate kinase  46.24 
 
 
183 aa  162  2.0000000000000002e-39  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0404  guanylate kinase  41.53 
 
 
194 aa  159  3e-38  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0209165  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1773  guanylate kinase  40.98 
 
 
197 aa  158  5e-38  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.159684 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0373  guanylate kinase  42.16 
 
 
194 aa  151  7e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.282119 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0985  guanylate kinase  41.76 
 
 
207 aa  149  3e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00175631  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1145  guanylate kinase  42.31 
 
 
207 aa  148  5e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.49439  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0306  guanylate kinase  41.85 
 
 
192 aa  147  6e-35  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0726977  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10188  hypothetical protein similar to guanylate kinase (Broad)  40.44 
 
 
228 aa  145  2.0000000000000003e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.585201 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0195  guanylate kinase  41.94 
 
 
188 aa  142  2e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_72675  guanylate kinase (GUK1)  41.11 
 
 
193 aa  142  2e-33  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.12779  normal  0.729563 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0375  guanylate kinase  42.25 
 
 
194 aa  143  2e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0296296  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0190  guanylate kinase  41.44 
 
 
184 aa  142  3e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.160767 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1761  guanylate kinase  39.89 
 
 
207 aa  141  5e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1719  guanylate kinase  41.01 
 
 
216 aa  141  7e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2001  guanylate kinase  41.01 
 
 
216 aa  140  8e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0099  guanylate kinase  38.46 
 
 
204 aa  140  9.999999999999999e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.261524  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1220  guanylate kinase  39.33 
 
 
218 aa  140  1.9999999999999998e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.289802 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3894  guanylate kinase  37.08 
 
 
200 aa  139  3e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000112061  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0808  guanylate kinase  37.78 
 
 
192 aa  139  3e-32  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.116088  normal  0.89906 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0962  guanylate kinase  38.33 
 
 
202 aa  138  3.9999999999999997e-32  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0132271  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0632  guanylate kinase  37.57 
 
 
185 aa  138  4.999999999999999e-32  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1677  guanylate kinase  42.35 
 
 
217 aa  137  7e-32  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3426  Guanylate kinase  40.78 
 
 
194 aa  137  7.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2238  guanylate kinase  39.77 
 
 
203 aa  137  7.999999999999999e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5842  guanylate kinase  37.85 
 
 
259 aa  137  1e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.509377 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2084  guanylate kinase  40.78 
 
 
207 aa  136  2e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.338387  decreased coverage  0.00871463 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1138  Guanylate kinase  40.78 
 
 
209 aa  136  2e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2327  guanylate kinase  41.01 
 
 
203 aa  135  3.0000000000000003e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000761567  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0299  guanylate kinase  41.34 
 
 
205 aa  135  5e-31  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05231  guanylate kinase  40.22 
 
 
184 aa  135  5e-31  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1329  guanylate kinase  39.52 
 
 
204 aa  135  5e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000708025  normal  0.428768 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2719  guanylate kinase  38.2 
 
 
206 aa  134  9e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00356396  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2158  guanylate kinase  40.45 
 
 
205 aa  134  9.999999999999999e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04671  guanylate kinase  38.2 
 
 
185 aa  133  1.9999999999999998e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0895533  normal  0.75989 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0759  guanylate kinase  36.52 
 
 
219 aa  132  1.9999999999999998e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.784504  normal  0.122144 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1700  guanylate kinase  39.44 
 
 
200 aa  133  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0294  guanylate kinase  36.16 
 
 
212 aa  132  3e-30  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4124  Guanylate kinase  37.29 
 
 
233 aa  132  3e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1660  guanylate kinase  38.67 
 
 
190 aa  131  5e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000545308  hitchhiker  0.000108168 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4981  guanylate kinase  35.71 
 
 
198 aa  131  5e-30  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.023832  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2411  guanylate kinase  36.07 
 
 
198 aa  131  5e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04921  guanylate kinase  39.11 
 
 
184 aa  131  5e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.032848  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1723  guanylate kinase  38.59 
 
 
208 aa  131  6e-30  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.671499 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0100  guanylate kinase  39.08 
 
 
202 aa  131  6e-30  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0912271  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3208  guanylate kinase  41.11 
 
 
186 aa  130  7.999999999999999e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.703275  normal  0.494303 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2370  guanylate kinase  36.07 
 
 
198 aa  130  7.999999999999999e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0470056  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2417  guanylate kinase  36.07 
 
 
198 aa  130  7.999999999999999e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.391978 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2286  guanylate kinase  40 
 
 
202 aa  130  9e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.30068  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1791  guanylate kinase  37.64 
 
 
201 aa  130  1.0000000000000001e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.395222  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11418  guanylate kinase  38.04 
 
 
217 aa  130  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000747341  normal  0.348875 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4384  guanylate kinase  38.67 
 
 
207 aa  130  1.0000000000000001e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3630  guanylate kinase  38.73 
 
 
209 aa  130  1.0000000000000001e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.601224  normal  0.100424 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1406  Guanylate kinase  38.64 
 
 
202 aa  129  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.77411  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2523  guanylate kinase  34.88 
 
 
214 aa  129  2.0000000000000002e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1475  guanylate kinase  36.61 
 
 
199 aa  129  2.0000000000000002e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000468376  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1256  guanylate kinase  37.36 
 
 
203 aa  129  2.0000000000000002e-29  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0765  Guanylate kinase  42.86 
 
 
216 aa  129  2.0000000000000002e-29  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0958444  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1237  guanylate kinase  39.33 
 
 
195 aa  130  2.0000000000000002e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.74814  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1062  guanylate kinase  35 
 
 
220 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0143004 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2401  guanylate kinase  38.76 
 
 
202 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0298091  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1473  guanylate kinase  36.56 
 
 
191 aa  129  3e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.110392  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf715  guanylate kinase  37.1 
 
 
209 aa  128  4.0000000000000003e-29  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07800  guanylate kinase  39.31 
 
 
189 aa  128  5.0000000000000004e-29  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.364153  normal  0.897368 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0467  guanylate kinase  39.11 
 
 
184 aa  128  5.0000000000000004e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0545  guanylate kinase  37.36 
 
 
203 aa  128  6e-29  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.071067  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1078  guanylate kinase  39.11 
 
 
212 aa  128  6e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2003  guanylate kinase  38.04 
 
 
208 aa  127  7.000000000000001e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.170887 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2902  guanylate kinase  37.29 
 
 
215 aa  127  7.000000000000001e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1205  guanylate kinase  35.96 
 
 
220 aa  127  7.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.197853  hitchhiker  0.00108752 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1104  guanylate kinase  37.02 
 
 
211 aa  127  9.000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.631702  normal  0.011032 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09810  Guanylate kinase  36.87 
 
 
194 aa  127  1.0000000000000001e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06681  guanylate kinase  34.44 
 
 
192 aa  127  1.0000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1796  guanylate kinase  37.65 
 
 
206 aa  127  1.0000000000000001e-28  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0177  guanylate kinase  36.67 
 
 
206 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000695034 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1089  guanylate kinase  38.29 
 
 
204 aa  127  1.0000000000000001e-28  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.350405  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0251  guanylate kinase  38.82 
 
 
207 aa  127  1.0000000000000001e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000337673  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1268  guanylate kinase  40 
 
 
207 aa  126  2.0000000000000002e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.33638  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1293  guanylate kinase  40 
 
 
207 aa  126  2.0000000000000002e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0035  guanylate kinase  36.31 
 
 
209 aa  126  2.0000000000000002e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1231  guanylate kinase  39.66 
 
 
198 aa  126  2.0000000000000002e-28  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.726797  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1311  guanylate kinase  37.16 
 
 
205 aa  125  3e-28  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2318  guanylate kinase  35.96 
 
 
198 aa  125  3e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000195285  hitchhiker  0.00462206 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1535  guanylate kinase  34.83 
 
 
220 aa  125  3e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0748909  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0464  guanylate kinase  36.46 
 
 
220 aa  125  4.0000000000000003e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.328382  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3740  guanylate kinase  37.43 
 
 
203 aa  125  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0778245 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2052  guanylate kinase  36.56 
 
 
206 aa  125  4.0000000000000003e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0577  guanylate kinase  38.04 
 
 
204 aa  125  4.0000000000000003e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.213259  normal  0.177715 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0469  guanylate kinase  36.46 
 
 
220 aa  125  4.0000000000000003e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.149667  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>