More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3827 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_3827  guanylate kinase  100 
 
 		 189 aa  387  1e-107  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.536013  normal  0.161762 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5548  guanylate kinase  62.96 
 
 		 199 aa  245  3e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0599  guanylate kinase  57.37 
 
 		 192 aa  238  2.9999999999999997e-62  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.68326  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02200  guanylate kinase  55.14 
 
 		 198 aa  212  1.9999999999999998e-54  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4197  guanylate kinase  55.61 
 
 		 189 aa  211  4.9999999999999996e-54  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00373006  normal  0.574711 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1016  guanylate kinase  52.94 
 
 		 188 aa  207  8e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2168  guanylate kinase  54.3 
 
 		 188 aa  207  8e-53  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.822318  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0742  guanylate kinase  53.23 
 
 		 190 aa  206  1e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0408  guanylate kinase  45.7 
 
 		 191 aa  169  3e-41  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.308329  normal  0.957996 
 
 
-
 
NC_002950  PG0512  guanylate kinase  44.57 
 
 		 188 aa  167  6e-41  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.101295 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1456  guanylate kinase  44.86 
 
 		 190 aa  160  1e-38  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000938556  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0012  guanylate kinase  45.41 
 
 		 189 aa  158  4e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.897517  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0404  guanylate kinase  41.49 
 
 		 194 aa  153  2e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0209165  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1719  guanylate kinase  41.76 
 
 		 216 aa  152  2.9999999999999998e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0195  guanylate kinase  41.44 
 
 		 188 aa  152  4e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2001  guanylate kinase  41.76 
 
 		 216 aa  152  4e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0190  guanylate kinase  41.44 
 
 		 184 aa  151  5e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.160767 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0373  guanylate kinase  42.02 
 
 		 194 aa  150  8.999999999999999e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.282119 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2946  guanylate kinase  40.22 
 
 		 181 aa  147  9e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.641883  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0808  guanylate kinase  41.53 
 
 		 192 aa  146  2.0000000000000003e-34  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.116088  normal  0.89906 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1773  guanylate kinase  39.57 
 
 		 197 aa  144  1e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.159684 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2052  guanylate kinase  41.76 
 
 		 206 aa  142  4e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3630  guanylate kinase  39.34 
 
 		 224 aa  142  4e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.09026  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4981  guanylate kinase  38.12 
 
 		 198 aa  141  7e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.023832  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0363  guanylate kinase  38.25 
 
 		 210 aa  140  8e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000053777 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3845  guanylate kinase  41.3 
 
 		 202 aa  140  9.999999999999999e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0483  guanylate kinase  38.83 
 
 		 181 aa  140  9.999999999999999e-33  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3877  guanylate kinase  41.24 
 
 		 210 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3810  guanylate kinase  38.25 
 
 		 207 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.18291  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0355  guanylate kinase  37.7 
 
 		 210 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.398163  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0985  guanylate kinase  38.59 
 
 		 207 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00175631  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4581  guanylate kinase  39.55 
 
 		 207 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.877029  unclonable  0.0000000250462 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0353  guanylate kinase  37.7 
 
 		 210 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2692  guanylate kinase  40.54 
 
 		 225 aa  139  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0360  guanylate kinase  37.7 
 
 		 210 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0336  guanylate kinase  40.68 
 
 		 207 aa  139  3e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.57704 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2606  guanylate kinase  40.54 
 
 		 226 aa  139  3e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.100354  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2902  guanylate kinase  42.05 
 
 		 215 aa  138  3.9999999999999997e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3613  guanylate kinase  37.7 
 
 		 207 aa  139  3.9999999999999997e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0330  guanylate kinase  37.7 
 
 		 224 aa  138  3.9999999999999997e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0351596  normal  0.331396 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2787  guanylate kinase  40.54 
 
 		 225 aa  138  6e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0207  guanylate kinase  35.64 
 
 		 190 aa  137  7.999999999999999e-32  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.931421  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2411  guanylate kinase  41.21 
 
 		 198 aa  137  7.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1145  guanylate kinase  36.96 
 
 		 207 aa  137  8.999999999999999e-32  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.49439  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3497  guanylate kinase  38.25 
 
 		 207 aa  137  8.999999999999999e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0361  guanylate kinase  36.61 
 
 		 207 aa  137  1e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1597  guanylate kinase  39.34 
 
 		 197 aa  137  1e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00198885  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2370  guanylate kinase  41.21 
 
 		 198 aa  137  1e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0470056  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0365  guanylate kinase  37.7 
 
 		 207 aa  137  1e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2417  guanylate kinase  41.21 
 
 		 198 aa  137  1e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.391978 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0100  guanylate kinase  38.74 
 
 		 202 aa  136  2e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0912271  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1761  guanylate kinase  37.91 
 
 		 207 aa  136  2e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0759  guanylate kinase  37.16 
 
 		 219 aa  136  2e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.784504  normal  0.122144 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3433  guanylate kinase  38.46 
 
 		 207 aa  135  3.0000000000000003e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.21703  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2158  guanylate kinase  39.89 
 
 		 205 aa  135  3.0000000000000003e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0347  guanylate kinase  39.04 
 
 		 215 aa  135  4e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0375  guanylate kinase  40.64 
 
 		 194 aa  135  4e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0296296  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3155  guanylate kinase  39.34 
 
 		 220 aa  134  9e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3630  guanylate kinase  38.8 
 
 		 209 aa  134  9e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.601224  normal  0.100424 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2084  guanylate kinase  43.18 
 
 		 207 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.338387  decreased coverage  0.00871463 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0306  guanylate kinase  38.3 
 
 		 192 aa  133  9.999999999999999e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0726977  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1266  guanylate kinase  40.46 
 
 		 217 aa  133  9.999999999999999e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.979121  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1220  guanylate kinase  38.8 
 
 		 218 aa  133  1.9999999999999998e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.289802 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1948  guanylate kinase  37.91 
 
 		 205 aa  132  3e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1535  guanylate kinase  36.07 
 
 		 220 aa  132  3e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0748909  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3936  guanylate kinase  41.28 
 
 		 212 aa  132  3.9999999999999996e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0099  guanylate kinase  37.16 
 
 		 204 aa  131  5e-30  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.261524  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1473  guanylate kinase  37.1 
 
 		 191 aa  131  5e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.110392  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0266  guanylate kinase  37.16 
 
 		 207 aa  131  5e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0962  guanylate kinase  34.43 
 
 		 202 aa  131  6e-30  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0132271  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1329  guanylate kinase  38.24 
 
 		 204 aa  131  6e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000708025  normal  0.428768 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0469  guanylate kinase  34.43 
 
 		 220 aa  131  6.999999999999999e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.149667  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0464  guanylate kinase  34.43 
 
 		 220 aa  131  6.999999999999999e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.328382  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2578  guanylate kinase  39.89 
 
 		 202 aa  131  6.999999999999999e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0638633  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1205  guanylate kinase  37.16 
 
 		 220 aa  131  7.999999999999999e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.197853  hitchhiker  0.00108752 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_72675  guanylate kinase (GUK1)  36.81 
 
 		 193 aa  130  9e-30  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.12779  normal  0.729563 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1406  Guanylate kinase  41.81 
 
 		 202 aa  130  9e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.77411  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2523  guanylate kinase  37.85 
 
 		 214 aa  130  1.0000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1062  guanylate kinase  36.07 
 
 		 220 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0143004 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1529  guanylate kinase  39.89 
 
 		 217 aa  130  1.0000000000000001e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.2579 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3426  Guanylate kinase  38.12 
 
 		 194 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0313  guanylate kinase  35.52 
 
 		 209 aa  130  2.0000000000000002e-29  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0875391  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3354  guanylate kinase  38.67 
 
 		 212 aa  129  2.0000000000000002e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05311  guanylate kinase  37.57 
 
 		 184 aa  129  3e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3740  guanylate kinase  40.57 
 
 		 203 aa  129  3e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0778245 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1398  guanylate kinase  35.52 
 
 		 209 aa  129  3e-29  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00115166  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04671  guanylate kinase  38.33 
 
 		 185 aa  129  3e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0895533  normal  0.75989 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1475  guanylate kinase  38.51 
 
 		 199 aa  128  4.0000000000000003e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000468376  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4162  guanylate kinase  39.9 
 
 		 194 aa  128  4.0000000000000003e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.13383  normal  0.396618 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1256  guanylate kinase  37.71 
 
 		 203 aa  129  4.0000000000000003e-29  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0052  guanylate kinase  38.25 
 
 		 210 aa  128  5.0000000000000004e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00408303  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2573  guanylate kinase  39.46 
 
 		 223 aa  128  6e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0392077 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1268  guanylate kinase  36.08 
 
 		 207 aa  127  8.000000000000001e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.33638  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1293  guanylate kinase  36.08 
 
 		 207 aa  127  8.000000000000001e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2537  guanylate kinase  35.71 
 
 		 183 aa  127  9.000000000000001e-29  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05231  guanylate kinase  37.02 
 
 		 184 aa  127  1.0000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04921  guanylate kinase  37.02 
 
 		 184 aa  127  1.0000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.032848  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2327  guanylate kinase  37.36 
 
 		 203 aa  127  1.0000000000000001e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000761567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0545  guanylate kinase  38.29 
 
 		 203 aa  127  1.0000000000000001e-28  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.071067  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2714  guanylate kinase  37.16 
 
 		 213 aa  127  1.0000000000000001e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>