More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_4197 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_4197  guanylate kinase  100 
 
 		 189 aa  384  1e-106  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00373006  normal  0.574711 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2168  guanylate kinase  57.22 
 
 		 188 aa  223  1e-57  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.822318  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5548  guanylate kinase  56.15 
 
 		 199 aa  214  5e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3827  guanylate kinase  55.61 
 
 		 189 aa  211  4.9999999999999996e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.536013  normal  0.161762 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0742  guanylate kinase  55.79 
 
 		 190 aa  208  4e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0599  guanylate kinase  51.6 
 
 		 192 aa  197  7.999999999999999e-50  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.68326  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1016  guanylate kinase  50.81 
 
 		 188 aa  191  5e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0512  guanylate kinase  50.54 
 
 		 188 aa  184  5e-46  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.101295 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02200  guanylate kinase  52.41 
 
 		 198 aa  184  7e-46  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0012  guanylate kinase  47.09 
 
 		 189 aa  181  5.0000000000000004e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.897517  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1456  guanylate kinase  43.48 
 
 		 190 aa  160  7e-39  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000938556  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0404  guanylate kinase  40.11 
 
 		 194 aa  154  6e-37  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0209165  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0408  guanylate kinase  42.55 
 
 		 191 aa  154  7e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.308329  normal  0.957996 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0306  guanylate kinase  44.25 
 
 		 192 aa  151  7e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0726977  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0985  guanylate kinase  45.66 
 
 		 207 aa  148  4e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00175631  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0373  guanylate kinase  40.64 
 
 		 194 aa  148  4e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.282119 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2052  guanylate kinase  46.55 
 
 		 206 aa  148  5e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1145  guanylate kinase  44.83 
 
 		 207 aa  147  8e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.49439  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2001  guanylate kinase  41.99 
 
 		 216 aa  147  9e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1719  guanylate kinase  41.99 
 
 		 216 aa  147  9e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1773  guanylate kinase  40 
 
 		 197 aa  146  2.0000000000000003e-34  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.159684 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0483  guanylate kinase  42.08 
 
 		 181 aa  145  3e-34  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0808  guanylate kinase  39.46 
 
 		 192 aa  143  1e-33  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.116088  normal  0.89906 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4124  Guanylate kinase  41.24 
 
 		 233 aa  142  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2537  guanylate kinase  40.88 
 
 		 183 aa  142  3e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0375  guanylate kinase  40.32 
 
 		 194 aa  142  3e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0296296  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2787  guanylate kinase  42.54 
 
 		 225 aa  140  9e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5842  guanylate kinase  42.53 
 
 		 259 aa  140  9.999999999999999e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.509377 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2692  guanylate kinase  42.54 
 
 		 225 aa  140  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2606  guanylate kinase  42.54 
 
 		 226 aa  139  3e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.100354  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3630  guanylate kinase  40.36 
 
 		 209 aa  137  7e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.601224  normal  0.100424 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1329  guanylate kinase  40.11 
 
 		 204 aa  137  1e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000708025  normal  0.428768 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1597  guanylate kinase  40.88 
 
 		 197 aa  136  2e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00198885  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1563  guanylate kinase  38.74 
 
 		 211 aa  135  4e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.106259  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2834  guanylate kinase  38.17 
 
 		 186 aa  135  4e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.522471  normal  0.276726 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3426  Guanylate kinase  39.44 
 
 		 194 aa  134  7.000000000000001e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0099  guanylate kinase  39.78 
 
 		 204 aa  134  7.000000000000001e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.261524  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4981  guanylate kinase  38.89 
 
 		 198 aa  134  9e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.023832  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1475  guanylate kinase  39.53 
 
 		 199 aa  134  9.999999999999999e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000468376  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2919  guanylate kinase  38.22 
 
 		 211 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1586  guanylate kinase  40.33 
 
 		 227 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0562043  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1473  guanylate kinase  39.43 
 
 		 191 aa  134  9.999999999999999e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.110392  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2084  guanylate kinase  42.53 
 
 		 207 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.338387  decreased coverage  0.00871463 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2949  guanylate kinase  40.88 
 
 		 227 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.391895  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2648  guanylate kinase  40.88 
 
 		 227 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2096  guanylate kinase  40.88 
 
 		 227 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3049  guanylate kinase  40.88 
 
 		 227 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.520623  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3015  guanylate kinase  40.88 
 
 		 227 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0815  guanylate kinase  40.88 
 
 		 227 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.605718  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1104  guanylate kinase  38.73 
 
 		 211 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.631702  normal  0.011032 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1964  guanylate kinase  40.88 
 
 		 227 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.736317  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3845  guanylate kinase  39.31 
 
 		 202 aa  132  3e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1220  guanylate kinase  38.5 
 
 		 218 aa  132  3e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.289802 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1700  guanylate kinase  38.46 
 
 		 200 aa  132  3.9999999999999996e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0634  guanylate kinase  38.15 
 
 		 210 aa  131  5e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2946  guanylate kinase  39.56 
 
 		 181 aa  131  5e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.641883  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2318  guanylate kinase  38.12 
 
 		 198 aa  131  5e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000195285  hitchhiker  0.00462206 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0190  guanylate kinase  36.61 
 
 		 184 aa  131  6e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.160767 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0195  guanylate kinase  36.61 
 
 		 188 aa  131  6e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0632  guanylate kinase  37.02 
 
 		 185 aa  131  6.999999999999999e-30  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0959  guanylate kinase  39.78 
 
 		 227 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.465114  normal  0.426596 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0520  guanylate kinase  39.78 
 
 		 227 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0999  guanylate kinase  39.78 
 
 		 227 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4107  guanylate kinase  39.78 
 
 		 227 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0130992  normal  0.288359 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3479  guanylate kinase  35.83 
 
 		 220 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0207  guanylate kinase  41.45 
 
 		 190 aa  129  3e-29  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.931421  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2974  guanylate kinase  36.9 
 
 		 219 aa  128  4.0000000000000003e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.291122 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1761  guanylate kinase  39.08 
 
 		 207 aa  128  4.0000000000000003e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2138  guanylate kinase  42.94 
 
 		 205 aa  128  5.0000000000000004e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.585915  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0759  guanylate kinase  37.37 
 
 		 219 aa  128  5.0000000000000004e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.784504  normal  0.122144 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3823  guanylate kinase  34.62 
 
 		 219 aa  128  6e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.162212 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2401  guanylate kinase  41.57 
 
 		 227 aa  127  7.000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1910  guanylate kinase  40.22 
 
 		 210 aa  127  7.000000000000001e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000116154  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06681  guanylate kinase  36.81 
 
 		 192 aa  127  8.000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0052  guanylate kinase  40.54 
 
 		 210 aa  127  8.000000000000001e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00408303  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5296  guanylate kinase  39.88 
 
 		 206 aa  127  9.000000000000001e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0446222  normal  0.471806 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1406  Guanylate kinase  39.08 
 
 		 202 aa  127  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.77411  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0473  guanylate kinase  41.62 
 
 		 209 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1683  guanylate kinase  34.62 
 
 		 219 aa  127  1.0000000000000001e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09810  Guanylate kinase  39.43 
 
 		 194 aa  127  1.0000000000000001e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2472  guanylate kinase  36.9 
 
 		 220 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4384  guanylate kinase  40.23 
 
 		 207 aa  127  1.0000000000000001e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3208  guanylate kinase  40.22 
 
 		 186 aa  127  1.0000000000000001e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.703275  normal  0.494303 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0871  guanylate kinase  41.57 
 
 		 227 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0859  guanylate kinase  41.57 
 
 		 227 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.675802  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3936  guanylate kinase  36.32 
 
 		 212 aa  126  1.0000000000000001e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1529  guanylate kinase  38.37 
 
 		 217 aa  126  2.0000000000000002e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.2579 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1138  Guanylate kinase  40.8 
 
 		 209 aa  126  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5204  guanylate kinase  41.01 
 
 		 206 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.952406  normal  0.288026 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0962  guanylate kinase  35.87 
 
 		 202 aa  125  3e-28  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0132271  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4581  guanylate kinase  39.78 
 
 		 207 aa  125  3e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.877029  unclonable  0.0000000250462 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1335  guanylate kinase  39.25 
 
 		 206 aa  125  3e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2573  guanylate kinase  39.31 
 
 		 223 aa  125  3e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0392077 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07800  guanylate kinase  38.89 
 
 		 189 aa  125  3e-28  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.364153  normal  0.897368 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0100  guanylate kinase  39.08 
 
 		 202 aa  125  3e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0912271  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05311  guanylate kinase  41.57 
 
 		 184 aa  125  3e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2277  guanylate kinase  35.45 
 
 		 223 aa  125  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.140709  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2000  guanylate kinase  35.45 
 
 		 223 aa  125  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0607745  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10188  hypothetical protein similar to guanylate kinase (Broad)  38.8 
 
 		 228 aa  125  5e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.585201 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0840  guanylate kinase  39.64 
 
 		 202 aa  125  5e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>