More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_2168 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013162  Coch_2168  guanylate kinase  100 
 
 
188 aa  390  1e-108  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.822318  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0742  guanylate kinase  65.24 
 
 
190 aa  263  1e-69  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02200  guanylate kinase  66.3 
 
 
198 aa  250  7e-66  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4197  guanylate kinase  57.22 
 
 
189 aa  223  1e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00373006  normal  0.574711 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5548  guanylate kinase  56.45 
 
 
199 aa  219  3e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0512  guanylate kinase  53.19 
 
 
188 aa  215  2.9999999999999998e-55  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.101295 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3827  guanylate kinase  54.3 
 
 
189 aa  207  8e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.536013  normal  0.161762 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0599  guanylate kinase  53.51 
 
 
192 aa  206  1e-52  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.68326  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1016  guanylate kinase  48.13 
 
 
188 aa  189  2e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0012  guanylate kinase  47.06 
 
 
189 aa  185  4e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.897517  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0808  guanylate kinase  50.82 
 
 
192 aa  180  9.000000000000001e-45  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.116088  normal  0.89906 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0408  guanylate kinase  44.39 
 
 
191 aa  169  2e-41  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.308329  normal  0.957996 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1456  guanylate kinase  44.62 
 
 
190 aa  166  2e-40  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000938556  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0404  guanylate kinase  40.86 
 
 
194 aa  158  3e-38  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0209165  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0373  guanylate kinase  41.62 
 
 
194 aa  157  1e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.282119 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2787  guanylate kinase  45 
 
 
225 aa  155  4e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2692  guanylate kinase  45 
 
 
225 aa  155  4e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2052  guanylate kinase  47.43 
 
 
206 aa  154  7e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2946  guanylate kinase  45.41 
 
 
181 aa  153  1e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.641883  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2606  guanylate kinase  44.44 
 
 
226 aa  153  1e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.100354  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1773  guanylate kinase  38.5 
 
 
197 aa  152  2.9999999999999998e-36  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.159684 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3426  Guanylate kinase  39.57 
 
 
194 aa  151  4e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1329  guanylate kinase  44.05 
 
 
204 aa  151  5e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000708025  normal  0.428768 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4384  guanylate kinase  42.78 
 
 
207 aa  150  1e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1220  guanylate kinase  43.02 
 
 
218 aa  150  1e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.289802 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0195  guanylate kinase  39.89 
 
 
188 aa  149  2e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0190  guanylate kinase  39.89 
 
 
184 aa  149  3e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.160767 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09810  Guanylate kinase  42.22 
 
 
194 aa  149  3e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0207  guanylate kinase  42.78 
 
 
190 aa  148  4e-35  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.931421  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2573  guanylate kinase  40.33 
 
 
223 aa  146  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0392077 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1145  guanylate kinase  41.76 
 
 
207 aa  146  2.0000000000000003e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.49439  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05311  guanylate kinase  42.31 
 
 
184 aa  145  3e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1761  guanylate kinase  39.66 
 
 
207 aa  145  4.0000000000000006e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0467  guanylate kinase  42.78 
 
 
184 aa  145  5e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0985  guanylate kinase  41.76 
 
 
207 aa  145  5e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00175631  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4981  guanylate kinase  38.46 
 
 
198 aa  144  9e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.023832  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1948  guanylate kinase  38.55 
 
 
205 aa  143  1e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0306  guanylate kinase  40.8 
 
 
192 aa  142  2e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0726977  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0375  guanylate kinase  38.71 
 
 
194 aa  143  2e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0296296  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1058  guanylate kinase  40.22 
 
 
204 aa  142  3e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000145749  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2719  guanylate kinase  43.68 
 
 
206 aa  142  4e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00356396  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2523  guanylate kinase  38.76 
 
 
214 aa  142  4e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2001  guanylate kinase  40.22 
 
 
216 aa  141  7e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1719  guanylate kinase  40.22 
 
 
216 aa  141  7e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1475  guanylate kinase  41.01 
 
 
199 aa  140  8e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000468376  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0862  guanylate kinase  42.46 
 
 
206 aa  140  9.999999999999999e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.693982  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0947  guanylate kinase  42.46 
 
 
206 aa  140  9.999999999999999e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.0000973722  hitchhiker  0.000000351977 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3208  guanylate kinase  40.11 
 
 
186 aa  140  9.999999999999999e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.703275  normal  0.494303 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3877  guanylate kinase  38.67 
 
 
210 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2028  guanylate kinase  40.78 
 
 
220 aa  139  1.9999999999999998e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.413126  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3845  guanylate kinase  40.33 
 
 
202 aa  139  1.9999999999999998e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4124  Guanylate kinase  42.13 
 
 
233 aa  139  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2834  guanylate kinase  37.5 
 
 
186 aa  139  1.9999999999999998e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.522471  normal  0.276726 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1597  guanylate kinase  39.44 
 
 
197 aa  139  3e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00198885  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1089  guanylate kinase  40.78 
 
 
204 aa  139  3e-32  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.350405  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1335  guanylate kinase  39.23 
 
 
206 aa  139  3e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3155  guanylate kinase  40.78 
 
 
220 aa  139  3e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1700  guanylate kinase  40.22 
 
 
200 aa  139  3e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3810  guanylate kinase  39.23 
 
 
207 aa  139  3e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.18291  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4218  guanylate kinase  41.44 
 
 
214 aa  139  3.9999999999999997e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3613  guanylate kinase  39.23 
 
 
207 aa  139  3.9999999999999997e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0330  guanylate kinase  39.23 
 
 
224 aa  138  3.9999999999999997e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0351596  normal  0.331396 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl195  guanylate kinase  38.71 
 
 
297 aa  138  4.999999999999999e-32  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.0722226  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5842  guanylate kinase  42.11 
 
 
259 aa  138  4.999999999999999e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.509377 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2327  guanylate kinase  39.44 
 
 
203 aa  138  4.999999999999999e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000761567  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04921  guanylate kinase  39.44 
 
 
184 aa  138  4.999999999999999e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.032848  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0294  guanylate kinase  42.69 
 
 
212 aa  138  6e-32  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0052  guanylate kinase  40.22 
 
 
210 aa  137  7e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00408303  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0347  guanylate kinase  40.21 
 
 
215 aa  137  7e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4066  guanylate kinase  39.44 
 
 
207 aa  137  7.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3948  guanylate kinase  39.44 
 
 
207 aa  137  7.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00531185 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3957  guanylate kinase  39.44 
 
 
207 aa  137  7.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4127  guanylate kinase  39.44 
 
 
207 aa  137  7.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.514606  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4020  guanylate kinase  39.44 
 
 
207 aa  137  7.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4145  guanylate kinase  38.89 
 
 
207 aa  137  8.999999999999999e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0299  guanylate kinase  43.26 
 
 
205 aa  137  1e-31  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0099  guanylate kinase  42.22 
 
 
204 aa  137  1e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.261524  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5020  guanylate kinase  38.89 
 
 
207 aa  137  1e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1791  guanylate kinase  37.43 
 
 
201 aa  137  1e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.395222  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03505  guanylate kinase  38.89 
 
 
207 aa  136  2e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0057  Guanylate kinase  38.89 
 
 
207 aa  136  2e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0063  guanylate kinase  38.89 
 
 
207 aa  136  2e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000240109 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3983  guanylate kinase  38.89 
 
 
207 aa  136  2e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0361  guanylate kinase  38.67 
 
 
207 aa  136  2e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1406  Guanylate kinase  43.35 
 
 
202 aa  136  2e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.77411  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0756  guanylate kinase  41.11 
 
 
204 aa  136  2e-31  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4151  guanylate kinase  38.89 
 
 
207 aa  136  2e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03457  hypothetical protein  38.89 
 
 
207 aa  136  2e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2974  guanylate kinase  37.99 
 
 
219 aa  136  2e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.291122 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05231  guanylate kinase  38.89 
 
 
184 aa  136  2e-31  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4099  guanylate kinase  38.89 
 
 
207 aa  136  2e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3630  guanylate kinase  40.33 
 
 
209 aa  136  2e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.601224  normal  0.100424 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3859  guanylate kinase  38.89 
 
 
207 aa  136  2e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1319  guanylate kinase  42.54 
 
 
224 aa  135  3.0000000000000003e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.773987  normal  0.110661 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3147  guanylate kinase  38.55 
 
 
206 aa  135  3.0000000000000003e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04671  guanylate kinase  37.36 
 
 
185 aa  135  3.0000000000000003e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0895533  normal  0.75989 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07800  guanylate kinase  42.2 
 
 
189 aa  135  3.0000000000000003e-31  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.364153  normal  0.897368 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0251  guanylate kinase  39.77 
 
 
207 aa  135  3.0000000000000003e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000337673  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2238  guanylate kinase  38.55 
 
 
203 aa  135  4e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3630  guanylate kinase  38.67 
 
 
224 aa  135  4e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.09026  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>