More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG0512 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002950  PG0512  guanylate kinase  100 
 
 
188 aa  380  1e-105  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.101295 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2168  guanylate kinase  53.19 
 
 
188 aa  215  2.9999999999999998e-55  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.822318  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0742  guanylate kinase  51.61 
 
 
190 aa  202  2e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02200  guanylate kinase  54.05 
 
 
198 aa  201  4e-51  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5548  guanylate kinase  50.81 
 
 
199 aa  191  4e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4197  guanylate kinase  50.54 
 
 
189 aa  184  5e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00373006  normal  0.574711 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1016  guanylate kinase  47.31 
 
 
188 aa  180  1e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0599  guanylate kinase  49.73 
 
 
192 aa  174  7e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.68326  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3827  guanylate kinase  44.57 
 
 
189 aa  167  6e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.536013  normal  0.161762 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0012  guanylate kinase  44.09 
 
 
189 aa  164  6.9999999999999995e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.897517  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1456  guanylate kinase  43.78 
 
 
190 aa  158  5e-38  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000938556  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09810  Guanylate kinase  43.33 
 
 
194 aa  154  9e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0808  guanylate kinase  42.08 
 
 
192 aa  152  2e-36  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.116088  normal  0.89906 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3426  Guanylate kinase  43.41 
 
 
194 aa  151  5.9999999999999996e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0408  guanylate kinase  40.32 
 
 
191 aa  151  7e-36  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.308329  normal  0.957996 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2001  guanylate kinase  45.14 
 
 
216 aa  149  3e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1719  guanylate kinase  45.14 
 
 
216 aa  149  3e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3613  guanylate kinase  42.78 
 
 
207 aa  149  3e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0330  guanylate kinase  42.78 
 
 
224 aa  148  4e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0351596  normal  0.331396 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0373  guanylate kinase  44.09 
 
 
194 aa  147  7e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.282119 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3810  guanylate kinase  42.22 
 
 
207 aa  147  7e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.18291  normal 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0207  guanylate kinase  40.88 
 
 
190 aa  146  1.0000000000000001e-34  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.931421  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1315  guanylate kinase  42.46 
 
 
203 aa  147  1.0000000000000001e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.559001  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0404  guanylate kinase  40.86 
 
 
194 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0209165  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4384  guanylate kinase  44.32 
 
 
207 aa  145  4.0000000000000006e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3845  guanylate kinase  40 
 
 
202 aa  145  5e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3147  guanylate kinase  42.86 
 
 
206 aa  145  5e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0361  guanylate kinase  41.67 
 
 
207 aa  144  6e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1104  guanylate kinase  44.2 
 
 
211 aa  144  1e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.631702  normal  0.011032 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4581  guanylate kinase  43.24 
 
 
207 aa  143  1e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.877029  unclonable  0.0000000250462 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0110  guanylate kinase  43.72 
 
 
204 aa  144  1e-33  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.361568  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4124  Guanylate kinase  41.11 
 
 
233 aa  142  4e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0355  guanylate kinase  40.56 
 
 
210 aa  141  4e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.398163  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0336  guanylate kinase  42.61 
 
 
207 aa  142  4e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.57704 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1773  guanylate kinase  38.92 
 
 
197 aa  141  4e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.159684 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0353  guanylate kinase  40.56 
 
 
210 aa  141  4e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0360  guanylate kinase  40.56 
 
 
210 aa  141  4e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2138  guanylate kinase  41.48 
 
 
205 aa  141  5e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.585915  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4218  guanylate kinase  41.92 
 
 
214 aa  141  5e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1335  guanylate kinase  41.3 
 
 
206 aa  141  6e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1089  guanylate kinase  42.6 
 
 
204 aa  140  7e-33  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.350405  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1220  guanylate kinase  42.29 
 
 
218 aa  141  7e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.289802 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4981  guanylate kinase  39.01 
 
 
198 aa  140  9e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.023832  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0363  guanylate kinase  40 
 
 
210 aa  140  9e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000053777 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3630  guanylate kinase  40 
 
 
224 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.09026  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0811  guanylate kinase  40.76 
 
 
206 aa  139  1.9999999999999998e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.990051 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1266  guanylate kinase  40 
 
 
217 aa  139  1.9999999999999998e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.979121  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1529  guanylate kinase  39.89 
 
 
217 aa  139  1.9999999999999998e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.2579 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1475  guanylate kinase  41.67 
 
 
199 aa  139  3e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000468376  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1791  guanylate kinase  41.34 
 
 
201 aa  139  3e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.395222  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl195  guanylate kinase  43.75 
 
 
297 aa  138  3.9999999999999997e-32  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.0722226  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf715  guanylate kinase  39.57 
 
 
209 aa  138  3.9999999999999997e-32  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1563  guanylate kinase  41.44 
 
 
211 aa  138  3.9999999999999997e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.106259  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1035  guanylate kinase  44.69 
 
 
199 aa  138  4.999999999999999e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0195  guanylate kinase  40 
 
 
188 aa  138  4.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0190  guanylate kinase  40 
 
 
184 aa  138  4.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.160767 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1761  guanylate kinase  41.9 
 
 
207 aa  138  4.999999999999999e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2919  guanylate kinase  41.44 
 
 
211 aa  138  6e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0758  guanylate kinase  37.99 
 
 
204 aa  137  7.999999999999999e-32  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000183217  hitchhiker  0.0000103593 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3877  guanylate kinase  38.92 
 
 
210 aa  137  8.999999999999999e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2714  guanylate kinase  37.99 
 
 
213 aa  137  1e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2523  guanylate kinase  38.69 
 
 
214 aa  137  1e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1910  guanylate kinase  43.41 
 
 
210 aa  137  1e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000116154  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0962  guanylate kinase  43.02 
 
 
202 aa  136  2e-31  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0132271  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0947  guanylate kinase  39.78 
 
 
206 aa  135  2e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.0000973722  hitchhiker  0.000000351977 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4329  guanylate kinase  41.92 
 
 
206 aa  136  2e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.970942  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0862  guanylate kinase  39.78 
 
 
206 aa  135  2e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.693982  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3778  guanylate kinase  44.02 
 
 
233 aa  135  3.0000000000000003e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.208797 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3936  guanylate kinase  41.24 
 
 
212 aa  135  3.0000000000000003e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2902  guanylate kinase  46.33 
 
 
215 aa  135  4e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1138  Guanylate kinase  41.01 
 
 
209 aa  135  4e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05231  guanylate kinase  41.11 
 
 
184 aa  135  4e-31  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04671  guanylate kinase  38.46 
 
 
185 aa  135  4e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0895533  normal  0.75989 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2052  guanylate kinase  42.37 
 
 
206 aa  135  4e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2834  guanylate kinase  38.8 
 
 
186 aa  135  4e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.522471  normal  0.276726 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3583  guanylate kinase  42.01 
 
 
206 aa  135  4e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00415905  normal  0.118983 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2946  guanylate kinase  43.98 
 
 
181 aa  135  5e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.641883  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3497  guanylate kinase  41.42 
 
 
207 aa  134  5e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3433  guanylate kinase  39.44 
 
 
207 aa  135  5e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.21703  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1638  guanylate kinase  40.54 
 
 
208 aa  134  6.0000000000000005e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1176  guanylate kinase  40.22 
 
 
206 aa  134  9e-31  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000749098  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2084  guanylate kinase  41.57 
 
 
207 aa  134  9e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.338387  decreased coverage  0.00871463 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2472  guanylate kinase  37.5 
 
 
220 aa  134  9e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2974  guanylate kinase  38.55 
 
 
219 aa  134  9e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.291122 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1329  guanylate kinase  38.55 
 
 
204 aa  133  9.999999999999999e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000708025  normal  0.428768 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0294  guanylate kinase  41.48 
 
 
212 aa  133  9.999999999999999e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3479  guanylate kinase  36.87 
 
 
220 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2318  guanylate kinase  40.76 
 
 
198 aa  133  9.999999999999999e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000195285  hitchhiker  0.00462206 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0729  guanylate kinase  42.77 
 
 
209 aa  133  1.9999999999999998e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.148488 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04921  guanylate kinase  40.56 
 
 
184 aa  132  1.9999999999999998e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.032848  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2537  guanylate kinase  39.56 
 
 
183 aa  132  1.9999999999999998e-30  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1050  guanylate kinase  40.78 
 
 
202 aa  132  1.9999999999999998e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000462152 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0365  guanylate kinase  40.24 
 
 
207 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0985  guanylate kinase  39.77 
 
 
207 aa  133  1.9999999999999998e-30  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00175631  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3630  guanylate kinase  40.91 
 
 
209 aa  133  1.9999999999999998e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.601224  normal  0.100424 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0988  guanylate kinase  38.29 
 
 
234 aa  132  3e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0107524 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07800  guanylate kinase  41.48 
 
 
189 aa  132  3e-30  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.364153  normal  0.897368 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2692  guanylate kinase  40 
 
 
225 aa  132  3.9999999999999996e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3623  guanylate kinase  40.34 
 
 
207 aa  132  3.9999999999999996e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1003  guanylate kinase  40.56 
 
 
221 aa  132  3.9999999999999996e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>