More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TC0299 on replicon NC_002620
Organism: Chlamydia muridarum Nigg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002620  TC0299  guanylate kinase  100 
 
 
205 aa  426  1e-118  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0294  guanylate kinase  44.13 
 
 
212 aa  156  2e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5020  guanylate kinase  43.01 
 
 
207 aa  154  8e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0091  guanylate kinase  44.15 
 
 
207 aa  152  4e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001862  guanylate kinase  44.75 
 
 
207 aa  152  5e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03505  guanylate kinase  44.15 
 
 
207 aa  151  5.9999999999999996e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0057  Guanylate kinase  44.15 
 
 
207 aa  151  5.9999999999999996e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3859  guanylate kinase  44.15 
 
 
207 aa  151  5.9999999999999996e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0063  guanylate kinase  44.15 
 
 
207 aa  151  5.9999999999999996e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000240109 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4151  guanylate kinase  44.15 
 
 
207 aa  151  5.9999999999999996e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3983  guanylate kinase  44.15 
 
 
207 aa  151  5.9999999999999996e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4099  guanylate kinase  44.15 
 
 
207 aa  151  5.9999999999999996e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03457  hypothetical protein  44.15 
 
 
207 aa  151  5.9999999999999996e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4127  guanylate kinase  44.15 
 
 
207 aa  150  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.514606  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4066  guanylate kinase  44.15 
 
 
207 aa  150  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3957  guanylate kinase  44.15 
 
 
207 aa  150  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4020  guanylate kinase  44.15 
 
 
207 aa  150  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3948  guanylate kinase  44.15 
 
 
207 aa  150  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00531185 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0808  guanylate kinase  43.82 
 
 
192 aa  149  2e-35  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.116088  normal  0.89906 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0785  guanylate kinase  44.39 
 
 
201 aa  149  3e-35  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000101008  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2238  guanylate kinase  43.55 
 
 
203 aa  149  4e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4145  guanylate kinase  41.4 
 
 
207 aa  148  5e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2327  guanylate kinase  44.81 
 
 
203 aa  148  6e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000761567  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2280  guanylate kinase  42.63 
 
 
229 aa  147  7e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3894  guanylate kinase  40.32 
 
 
200 aa  147  1.0000000000000001e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000112061  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0330  guanylate kinase  40.45 
 
 
224 aa  146  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0351596  normal  0.331396 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09810  Guanylate kinase  42.16 
 
 
194 aa  145  3e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1311  guanylate kinase  39.13 
 
 
205 aa  145  4.0000000000000006e-34  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3497  guanylate kinase  42.13 
 
 
207 aa  145  4.0000000000000006e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0266  guanylate kinase  42.22 
 
 
207 aa  145  4.0000000000000006e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1192  guanylate kinase  39.13 
 
 
207 aa  145  4.0000000000000006e-34  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3613  guanylate kinase  39.89 
 
 
207 aa  145  4.0000000000000006e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0210  guanylate kinase  42.54 
 
 
207 aa  144  7.0000000000000006e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0336  guanylate kinase  40.45 
 
 
207 aa  144  7.0000000000000006e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.57704 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00630  guanylate kinase  43.72 
 
 
207 aa  144  7.0000000000000006e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0361  guanylate kinase  39.89 
 
 
207 aa  144  8.000000000000001e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07800  guanylate kinase  44.71 
 
 
189 aa  144  8.000000000000001e-34  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.364153  normal  0.897368 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0012  guanylate kinase  44.51 
 
 
189 aa  144  9e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.897517  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1329  guanylate kinase  39.46 
 
 
204 aa  144  1e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000708025  normal  0.428768 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_17617  predicted protein  41.08 
 
 
227 aa  144  1e-33  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.910339  hitchhiker  0.000867282 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3948  guanylate kinase  41.94 
 
 
207 aa  144  1e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.498976  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3810  guanylate kinase  40.45 
 
 
207 aa  144  1e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.18291  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1315  guanylate kinase  40.11 
 
 
203 aa  144  1e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.559001  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0347  guanylate kinase  42.25 
 
 
215 aa  143  2e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1761  guanylate kinase  37.97 
 
 
207 aa  142  3e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4581  guanylate kinase  42.35 
 
 
207 aa  142  3e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.877029  unclonable  0.0000000250462 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1089  guanylate kinase  40.88 
 
 
204 aa  142  4e-33  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.350405  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0365  guanylate kinase  41.01 
 
 
207 aa  142  5e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3630  guanylate kinase  39.89 
 
 
224 aa  141  6e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.09026  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1719  guanylate kinase  42.39 
 
 
216 aa  141  6e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0360  guanylate kinase  40.45 
 
 
210 aa  141  8e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0353  guanylate kinase  40.45 
 
 
210 aa  141  8e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2523  guanylate kinase  39.67 
 
 
214 aa  141  8e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0355  guanylate kinase  40.45 
 
 
210 aa  141  8e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.398163  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2001  guanylate kinase  42.39 
 
 
216 aa  141  8e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0976  guanylate kinase  41.24 
 
 
211 aa  140  9.999999999999999e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.194665  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0552  guanylate kinase  38.04 
 
 
205 aa  140  9.999999999999999e-33  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.713895  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2286  guanylate kinase  42.31 
 
 
202 aa  140  9.999999999999999e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.30068  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0363  guanylate kinase  40.45 
 
 
210 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000053777 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4867  guanylate kinase  41.44 
 
 
207 aa  139  1.9999999999999998e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.807857  hitchhiker  0.00555507 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1677  guanylate kinase  41.53 
 
 
217 aa  139  1.9999999999999998e-32  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1443  guanylate kinase  40.32 
 
 
210 aa  139  3e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.86751  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1597  guanylate kinase  39.34 
 
 
197 aa  139  3e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00198885  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4176  guanylate kinase  42.25 
 
 
207 aa  139  3.9999999999999997e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0297777  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0041  guanylate kinase  42.25 
 
 
207 aa  139  3.9999999999999997e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00153  guanylate kinase  40.31 
 
 
213 aa  138  4.999999999999999e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0558456  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1436  guanylate kinase  40.22 
 
 
203 aa  138  4.999999999999999e-32  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0045  guanylate kinase  42.25 
 
 
207 aa  138  6e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3845  guanylate kinase  41.11 
 
 
202 aa  138  6e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2401  guanylate kinase  39.01 
 
 
202 aa  138  6e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0298091  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0099  guanylate kinase  38.8 
 
 
204 aa  138  7e-32  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.261524  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2444  guanylate kinase  39.78 
 
 
203 aa  138  7e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.337517 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0681  guanylate kinase  38.34 
 
 
209 aa  137  8.999999999999999e-32  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2168  guanylate kinase  43.26 
 
 
188 aa  137  1e-31  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.822318  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2902  guanylate kinase  41.4 
 
 
215 aa  137  1e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3877  guanylate kinase  39.89 
 
 
210 aa  137  1e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2975  guanylate kinase  40.34 
 
 
204 aa  136  2e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0404  guanylate kinase  37.84 
 
 
194 aa  136  2e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0209165  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1683  guanylate kinase  37.57 
 
 
219 aa  136  2e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0408  guanylate kinase  40.94 
 
 
191 aa  136  2e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.308329  normal  0.957996 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1456  guanylate kinase  42.11 
 
 
190 aa  136  2e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000938556  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0322  guanylate kinase  38.46 
 
 
209 aa  137  2e-31  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.254004  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1406  Guanylate kinase  44.44 
 
 
202 aa  135  3.0000000000000003e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.77411  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10188  hypothetical protein similar to guanylate kinase (Broad)  39.33 
 
 
228 aa  135  4e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.585201 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2719  guanylate kinase  40.78 
 
 
206 aa  135  4e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00356396  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5842  guanylate kinase  37.5 
 
 
259 aa  135  4e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.509377 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1335  guanylate kinase  40.32 
 
 
206 aa  135  5e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2974  guanylate kinase  37.37 
 
 
219 aa  135  5e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.291122 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1016  guanylate kinase  41.34 
 
 
188 aa  135  6.0000000000000005e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1050  guanylate kinase  40.41 
 
 
202 aa  134  7.000000000000001e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000462152 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3213  guanylate kinase  40.54 
 
 
202 aa  134  8e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000935163  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3433  guanylate kinase  38.67 
 
 
207 aa  134  8e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.21703  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1078  guanylate kinase  40.98 
 
 
212 aa  134  9e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5296  guanylate kinase  40.11 
 
 
206 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0446222  normal  0.471806 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0765  Guanylate kinase  36.51 
 
 
216 aa  134  9.999999999999999e-31  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0958444  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3479  guanylate kinase  37.31 
 
 
220 aa  133  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0177  guanylate kinase  39.55 
 
 
206 aa  133  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000695034 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5344  guanylate kinase  39.55 
 
 
206 aa  133  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0394211 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2138  guanylate kinase  43.02 
 
 
205 aa  133  9.999999999999999e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.585915  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2000  guanylate kinase  36.46 
 
 
223 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0607745  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>