More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_1719 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008262  CPR_1719  guanylate kinase  100 
 
 		 216 aa  441  1e-123  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2001  guanylate kinase  99.54 
 
 		 216 aa  439  9.999999999999999e-123  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1761  guanylate kinase  67 
 
 		 207 aa  281  7.000000000000001e-75  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2318  guanylate kinase  59.46 
 
 		 198 aa  240  1e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000195285  hitchhiker  0.00462206 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3894  guanylate kinase  57.07 
 
 		 200 aa  235  4e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000112061  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1329  guanylate kinase  54.12 
 
 		 204 aa  228  4e-59  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000708025  normal  0.428768 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1597  guanylate kinase  55.68 
 
 		 197 aa  228  6e-59  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00198885  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1700  guanylate kinase  54.59 
 
 		 200 aa  217  1e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0840  guanylate kinase  51.28 
 
 		 202 aa  213  1.9999999999999998e-54  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1058  guanylate kinase  54.17 
 
 		 204 aa  210  1e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000145749  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1948  guanylate kinase  52.04 
 
 		 205 aa  207  7e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1237  guanylate kinase  49.74 
 
 		 195 aa  207  1e-52  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.74814  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1176  guanylate kinase  50.76 
 
 		 206 aa  204  7e-52  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000749098  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09810  Guanylate kinase  52.69 
 
 		 194 aa  203  2e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2158  guanylate kinase  49.75 
 
 		 205 aa  203  2e-51  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0962  guanylate kinase  51.3 
 
 		 202 aa  202  3e-51  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0132271  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2444  guanylate kinase  45.45 
 
 		 203 aa  199  3e-50  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.337517 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0313  guanylate kinase  51.56 
 
 		 209 aa  198  5e-50  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0875391  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1035  guanylate kinase  50.53 
 
 		 199 aa  196  2.0000000000000003e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07800  guanylate kinase  52.17 
 
 		 189 aa  193  2e-48  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.364153  normal  0.897368 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3155  guanylate kinase  46.46 
 
 		 220 aa  193  2e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1791  guanylate kinase  47.37 
 
 		 201 aa  192  3e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.395222  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1713  guanylate kinase  46.88 
 
 		 198 aa  191  9e-48  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.463283  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2523  guanylate kinase  50.5 
 
 		 205 aa  191  1e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3426  Guanylate kinase  48.9 
 
 		 194 aa  190  1e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0099  guanylate kinase  45.41 
 
 		 204 aa  189  2e-47  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.261524  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0758  guanylate kinase  48.17 
 
 		 204 aa  189  2e-47  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000183217  hitchhiker  0.0000103593 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3885  guanylate kinase  51.81 
 
 		 205 aa  188  7e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000575833 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3722  guanylate kinase  51.81 
 
 		 205 aa  188  7e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3919  guanylate kinase  51.81 
 
 		 205 aa  188  7e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.364605  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4009  guanylate kinase  51.81 
 
 		 205 aa  188  7e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3914  guanylate kinase  51.81 
 
 		 214 aa  187  8e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3612  guanylate kinase  51.81 
 
 		 214 aa  187  8e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3630  guanylate kinase  51.81 
 
 		 214 aa  187  8e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1315  guanylate kinase  50.26 
 
 		 203 aa  187  9e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.559001  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3970  guanylate kinase  51.81 
 
 		 205 aa  187  1e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0125676  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1273  guanylate kinase  51.81 
 
 		 205 aa  186  2e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.213463  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0985  guanylate kinase  45.08 
 
 		 207 aa  185  4e-46  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00175631  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3694  guanylate kinase  51.81 
 
 		 205 aa  185  4e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1220  guanylate kinase  45.89 
 
 		 218 aa  185  4e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.289802 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0785  guanylate kinase  48.72 
 
 		 201 aa  185  5e-46  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000101008  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1723  guanylate kinase  45.79 
 
 		 208 aa  184  7e-46  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.671499 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0808  guanylate kinase  47.73 
 
 		 192 aa  184  8e-46  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.116088  normal  0.89906 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0190  guanylate kinase  45.25 
 
 		 184 aa  184  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.160767 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0195  guanylate kinase  45.25 
 
 		 188 aa  184  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2003  guanylate kinase  44.17 
 
 		 208 aa  183  1.0000000000000001e-45  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.170887 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0347  guanylate kinase  43.54 
 
 		 215 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1398  guanylate kinase  47.4 
 
 		 209 aa  184  1.0000000000000001e-45  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00115166  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0759  guanylate kinase  48.15 
 
 		 219 aa  183  2.0000000000000003e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.784504  normal  0.122144 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1145  guanylate kinase  46.28 
 
 		 207 aa  183  2.0000000000000003e-45  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.49439  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0520  guanylate kinase  47.83 
 
 		 227 aa  182  3e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70440  guanylate kinase  46.77 
 
 		 203 aa  182  3e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0999  guanylate kinase  47.83 
 
 		 227 aa  182  3e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0959  guanylate kinase  47.83 
 
 		 227 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.465114  normal  0.426596 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6112  guanylate kinase  46.77 
 
 		 203 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.509466  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1535  guanylate kinase  44.44 
 
 		 220 aa  182  4.0000000000000006e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0748909  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0776  guanylate kinase  45.05 
 
 		 207 aa  182  5.0000000000000004e-45  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.753859  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1268  guanylate kinase  44.61 
 
 		 207 aa  181  5.0000000000000004e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.33638  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1293  guanylate kinase  44.61 
 
 		 207 aa  181  5.0000000000000004e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4107  guanylate kinase  47.28 
 
 		 227 aa  181  9.000000000000001e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0130992  normal  0.288359 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5549  guanylate kinase  45.26 
 
 		 206 aa  181  1e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.405224 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1529  guanylate kinase  40.62 
 
 		 217 aa  179  2e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.2579 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0177  guanylate kinase  42.51 
 
 		 206 aa  180  2e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000695034 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1266  guanylate kinase  42.78 
 
 		 217 aa  180  2e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.979121  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1285  guanylate kinase  43.92 
 
 		 210 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000194386  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2138  guanylate kinase  47.25 
 
 		 205 aa  179  2.9999999999999997e-44  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.585915  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4124  Guanylate kinase  43.78 
 
 		 233 aa  179  4e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05311  guanylate kinase  47.73 
 
 		 184 aa  178  4.999999999999999e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3630  guanylate kinase  45.7 
 
 		 209 aa  178  4.999999999999999e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.601224  normal  0.100424 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1050  guanylate kinase  44.79 
 
 		 202 aa  178  4.999999999999999e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000462152 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0266  guanylate kinase  46.24 
 
 		 207 aa  178  4.999999999999999e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2003  guanylate kinase  43.81 
 
 		 216 aa  177  8e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1475  guanylate kinase  44.44 
 
 		 199 aa  177  8e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000468376  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3936  guanylate kinase  40.21 
 
 		 212 aa  177  8e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3497  guanylate kinase  42.79 
 
 		 207 aa  177  9e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2284  guanylate kinase  43.62 
 
 		 242 aa  177  9e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.429726  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5296  guanylate kinase  41.55 
 
 		 206 aa  177  1e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0446222  normal  0.471806 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1062  guanylate kinase  43.92 
 
 		 220 aa  177  1e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0143004 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2401  guanylate kinase  46.2 
 
 		 227 aa  177  1e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1205  guanylate kinase  44.21 
 
 		 220 aa  177  1e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.197853  hitchhiker  0.00108752 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3213  guanylate kinase  44.27 
 
 		 202 aa  177  1e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000935163  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03505  guanylate kinase  43.3 
 
 		 207 aa  176  2e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0057  Guanylate kinase  43.3 
 
 		 207 aa  176  2e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0091  guanylate kinase  43.52 
 
 		 207 aa  176  2e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03457  hypothetical protein  43.3 
 
 		 207 aa  176  2e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1677  guanylate kinase  43.92 
 
 		 217 aa  176  2e-43  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2093  guanylate kinase  42.27 
 
 		 223 aa  176  2e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.353708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4151  guanylate kinase  43.3 
 
 		 207 aa  176  2e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0063  guanylate kinase  43.3 
 
 		 207 aa  176  2e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000240109 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4099  guanylate kinase  43.3 
 
 		 207 aa  176  2e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3859  guanylate kinase  43.3 
 
 		 207 aa  176  2e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5204  guanylate kinase  41.55 
 
 		 206 aa  176  2e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.952406  normal  0.288026 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4145  guanylate kinase  43.75 
 
 		 207 aa  176  2e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1763  guanylate kinase  43.46 
 
 		 218 aa  176  2e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.201865  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3983  guanylate kinase  43.3 
 
 		 207 aa  176  2e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0859  guanylate kinase  46.2 
 
 		 227 aa  176  2e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.675802  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0871  guanylate kinase  46.2 
 
 		 227 aa  176  2e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2286  guanylate kinase  44.68 
 
 		 202 aa  176  3e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.30068  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0048  guanylate kinase  44.32 
 
 		 202 aa  176  3e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5344  guanylate kinase  43.55 
 
 		 206 aa  176  3e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0394211 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>