More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_1050 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_1050  guanylate kinase  100 
 
 		 202 aa  415  9.999999999999999e-116  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000462152 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3213  guanylate kinase  98.51 
 
 		 202 aa  411  1e-114  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000935163  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2238  guanylate kinase  72.77 
 
 		 203 aa  317  5e-86  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2327  guanylate kinase  72.77 
 
 		 203 aa  315  4e-85  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000761567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3162  guanylate kinase  75.25 
 
 		 202 aa  300  7.000000000000001e-81  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0281521  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2401  guanylate kinase  58.91 
 
 		 202 aa  256  2e-67  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0298091  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1285  guanylate kinase  58.91 
 
 		 210 aa  252  3e-66  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000194386  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2286  guanylate kinase  58.42 
 
 		 202 aa  248  4e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.30068  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1406  Guanylate kinase  53.8 
 
 		 202 aa  202  2e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.77411  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09810  Guanylate kinase  48.91 
 
 		 194 aa  198  5e-50  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1335  guanylate kinase  48.5 
 
 		 206 aa  197  7.999999999999999e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3583  guanylate kinase  48.26 
 
 		 206 aa  197  1.0000000000000001e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00415905  normal  0.118983 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3894  guanylate kinase  48.13 
 
 		 200 aa  195  4.0000000000000005e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000112061  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0862  guanylate kinase  46.27 
 
 		 206 aa  194  1e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.693982  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0947  guanylate kinase  46.27 
 
 		 206 aa  194  1e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.0000973722  hitchhiker  0.000000351977 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0811  guanylate kinase  47.76 
 
 		 206 aa  193  2e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.990051 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2715  guanylate kinase  46.5 
 
 		 206 aa  191  6e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.446098  normal  0.772738 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4145  guanylate kinase  49.74 
 
 		 207 aa  189  2e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1138  Guanylate kinase  49.18 
 
 		 209 aa  189  2e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4329  guanylate kinase  46.5 
 
 		 206 aa  189  2.9999999999999997e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.970942  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02830  guanylate kinase  51.06 
 
 		 205 aa  189  2.9999999999999997e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1761  guanylate kinase  43.68 
 
 		 207 aa  189  2.9999999999999997e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3948  guanylate kinase  50.26 
 
 		 207 aa  188  4e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.498976  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1237  guanylate kinase  45.83 
 
 		 195 aa  188  4e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.74814  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3147  guanylate kinase  44.28 
 
 		 206 aa  188  5e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1910  guanylate kinase  48.91 
 
 		 210 aa  186  2e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000116154  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2084  guanylate kinase  47.26 
 
 		 207 aa  186  2e-46  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.338387  decreased coverage  0.00871463 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3778  guanylate kinase  51.34 
 
 		 233 aa  186  2e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.208797 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1329  guanylate kinase  42.86 
 
 		 204 aa  186  2e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000708025  normal  0.428768 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4218  guanylate kinase  45.77 
 
 		 214 aa  186  3e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0729  guanylate kinase  48.94 
 
 		 209 aa  185  5e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.148488 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2719  guanylate kinase  47.25 
 
 		 206 aa  184  6e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00356396  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0100  guanylate kinase  45.5 
 
 		 202 aa  184  6e-46  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0912271  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70440  guanylate kinase  50 
 
 		 203 aa  184  8e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0075  guanylate kinase  50.26 
 
 		 214 aa  184  9e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0099  guanylate kinase  46.03 
 
 		 204 aa  184  9e-46  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.261524  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2472  guanylate kinase  46.91 
 
 		 220 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2028  guanylate kinase  45.27 
 
 		 220 aa  182  2.0000000000000003e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.413126  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6112  guanylate kinase  50 
 
 		 203 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.509466  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0091  guanylate kinase  48.44 
 
 		 207 aa  182  3e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1700  guanylate kinase  47.34 
 
 		 200 aa  182  3e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5549  guanylate kinase  48.13 
 
 		 206 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.405224 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0717  guanylate kinase  50.27 
 
 		 212 aa  181  5.0000000000000004e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000116826 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0473  guanylate kinase  48.98 
 
 		 209 aa  181  5.0000000000000004e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0563  guanylate kinase  50.27 
 
 		 212 aa  181  5.0000000000000004e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5020  guanylate kinase  47.92 
 
 		 207 aa  181  6e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3948  guanylate kinase  48.44 
 
 		 207 aa  181  6e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00531185 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4127  guanylate kinase  48.44 
 
 		 207 aa  181  6e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.514606  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4020  guanylate kinase  48.44 
 
 		 207 aa  181  6e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2444  guanylate kinase  49.2 
 
 		 203 aa  181  6e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.337517 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4066  guanylate kinase  48.44 
 
 		 207 aa  181  6e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3957  guanylate kinase  48.44 
 
 		 207 aa  181  6e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03505  guanylate kinase  47.92 
 
 		 207 aa  181  7e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0057  Guanylate kinase  47.92 
 
 		 207 aa  181  7e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03457  hypothetical protein  47.92 
 
 		 207 aa  181  7e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4151  guanylate kinase  47.92 
 
 		 207 aa  181  7e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3859  guanylate kinase  47.92 
 
 		 207 aa  181  7e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4099  guanylate kinase  47.92 
 
 		 207 aa  181  7e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3983  guanylate kinase  47.92 
 
 		 207 aa  181  7e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0063  guanylate kinase  47.92 
 
 		 207 aa  181  7e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000240109 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3630  guanylate kinase  47.83 
 
 		 209 aa  181  9.000000000000001e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.601224  normal  0.100424 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0177  guanylate kinase  49.2 
 
 		 206 aa  180  1e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000695034 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0052  guanylate kinase  47.59 
 
 		 210 aa  179  2e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00408303  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3936  guanylate kinase  47.18 
 
 		 212 aa  179  2.9999999999999997e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0211  guanylate kinase  48.69 
 
 		 214 aa  179  4e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2001  guanylate kinase  44.79 
 
 		 216 aa  178  4e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1719  guanylate kinase  44.79 
 
 		 216 aa  178  4e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4388  guanylate kinase  48.9 
 
 		 205 aa  178  4.999999999999999e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.11044 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3845  guanylate kinase  45.56 
 
 		 202 aa  178  5.999999999999999e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1791  guanylate kinase  41.79 
 
 		 201 aa  177  8e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.395222  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0347  guanylate kinase  44.61 
 
 		 215 aa  177  8e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0330  guanylate kinase  46.81 
 
 		 224 aa  177  8e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0351596  normal  0.331396 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0577  guanylate kinase  44.92 
 
 		 204 aa  177  1e-43  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.213259  normal  0.177715 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5344  guanylate kinase  48.63 
 
 		 206 aa  177  1e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0394211 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1176  guanylate kinase  45.36 
 
 		 206 aa  177  1e-43  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000749098  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0048  guanylate kinase  45.65 
 
 		 202 aa  177  1e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2974  guanylate kinase  45.88 
 
 		 219 aa  177  1e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.291122 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3613  guanylate kinase  46.28 
 
 		 207 aa  177  1e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4384  guanylate kinase  45.21 
 
 		 207 aa  176  2e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00630  guanylate kinase  48.15 
 
 		 207 aa  176  3e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3810  guanylate kinase  46.28 
 
 		 207 aa  176  3e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.18291  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3479  guanylate kinase  44.85 
 
 		 220 aa  175  4e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4867  guanylate kinase  48.09 
 
 		 207 aa  175  4e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.807857  hitchhiker  0.00555507 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0361  guanylate kinase  45.21 
 
 		 207 aa  175  5e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0313  guanylate kinase  48.21 
 
 		 209 aa  174  6e-43  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0875391  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5296  guanylate kinase  48.09 
 
 		 206 aa  174  8e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0446222  normal  0.471806 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001862  guanylate kinase  47.62 
 
 		 207 aa  174  8e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2975  guanylate kinase  47.59 
 
 		 204 aa  174  9e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0035  guanylate kinase  49.2 
 
 		 209 aa  174  9e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0856  guanylate kinase  45.65 
 
 		 216 aa  173  9.999999999999999e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0353  guanylate kinase  44.39 
 
 		 210 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5204  guanylate kinase  48.09 
 
 		 206 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.952406  normal  0.288026 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0360  guanylate kinase  44.39 
 
 		 210 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2003  guanylate kinase  47.57 
 
 		 216 aa  172  1.9999999999999998e-42  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0355  guanylate kinase  44.39 
 
 		 210 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.398163  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3630  guanylate kinase  45.74 
 
 		 224 aa  172  2.9999999999999996e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.09026  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0294  guanylate kinase  47.06 
 
 		 212 aa  172  2.9999999999999996e-42  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3623  guanylate kinase  43.01 
 
 		 207 aa  172  3.9999999999999995e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4492  guanylate kinase  48.68 
 
 		 207 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0363  guanylate kinase  43.88 
 
 		 210 aa  172  3.9999999999999995e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000053777 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>