More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_3778 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_3778  guanylate kinase  100 
 
 
233 aa  478  1e-134  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.208797 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0361  guanylate kinase  47.98 
 
 
207 aa  190  1e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3810  guanylate kinase  48.48 
 
 
207 aa  190  1e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.18291  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0360  guanylate kinase  47.98 
 
 
210 aa  189  2.9999999999999997e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0355  guanylate kinase  47.98 
 
 
210 aa  189  2.9999999999999997e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.398163  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0353  guanylate kinase  47.98 
 
 
210 aa  189  2.9999999999999997e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5020  guanylate kinase  48.69 
 
 
207 aa  189  4e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0363  guanylate kinase  47.47 
 
 
210 aa  188  5.999999999999999e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000053777 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0330  guanylate kinase  47.98 
 
 
224 aa  188  5.999999999999999e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0351596  normal  0.331396 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3613  guanylate kinase  47.47 
 
 
207 aa  188  8e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3957  guanylate kinase  48.17 
 
 
207 aa  187  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4020  guanylate kinase  48.17 
 
 
207 aa  187  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3948  guanylate kinase  48.17 
 
 
207 aa  187  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00531185 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4066  guanylate kinase  48.17 
 
 
207 aa  187  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4127  guanylate kinase  48.17 
 
 
207 aa  187  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.514606  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03505  guanylate kinase  48.17 
 
 
207 aa  187  2e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0057  Guanylate kinase  48.17 
 
 
207 aa  187  2e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0063  guanylate kinase  48.17 
 
 
207 aa  187  2e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000240109 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4151  guanylate kinase  48.17 
 
 
207 aa  187  2e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03457  hypothetical protein  48.17 
 
 
207 aa  187  2e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3983  guanylate kinase  48.17 
 
 
207 aa  187  2e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4099  guanylate kinase  48.17 
 
 
207 aa  187  2e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3859  guanylate kinase  48.17 
 
 
207 aa  187  2e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3213  guanylate kinase  51.34 
 
 
202 aa  186  3e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000935163  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3630  guanylate kinase  46.97 
 
 
224 aa  186  3e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.09026  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1050  guanylate kinase  51.34 
 
 
202 aa  186  3e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000462152 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2444  guanylate kinase  45.37 
 
 
203 aa  186  3e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.337517 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70440  guanylate kinase  47.42 
 
 
203 aa  186  3e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2238  guanylate kinase  50.27 
 
 
203 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1285  guanylate kinase  51.05 
 
 
210 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000194386  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0091  guanylate kinase  47.12 
 
 
207 aa  184  1.0000000000000001e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4329  guanylate kinase  49.47 
 
 
206 aa  183  2.0000000000000003e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.970942  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0947  guanylate kinase  47.37 
 
 
206 aa  183  2.0000000000000003e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.0000973722  hitchhiker  0.000000351977 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3845  guanylate kinase  48.11 
 
 
202 aa  183  2.0000000000000003e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0862  guanylate kinase  47.37 
 
 
206 aa  183  2.0000000000000003e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.693982  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001862  guanylate kinase  47.09 
 
 
207 aa  182  3e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0052  guanylate kinase  47.59 
 
 
210 aa  182  3e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00408303  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6112  guanylate kinase  46.91 
 
 
203 aa  182  3e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.509466  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3623  guanylate kinase  48.13 
 
 
207 aa  182  4.0000000000000006e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3147  guanylate kinase  47.37 
 
 
206 aa  182  4.0000000000000006e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0634  guanylate kinase  47.67 
 
 
210 aa  181  6e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4145  guanylate kinase  47.18 
 
 
207 aa  181  6e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0843  guanylate kinase  43.72 
 
 
204 aa  181  9.000000000000001e-45  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2327  guanylate kinase  49.2 
 
 
203 aa  180  1e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000761567  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4019  guanylate kinase  48.68 
 
 
204 aa  180  2e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.565127  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2974  guanylate kinase  49.74 
 
 
219 aa  180  2e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.291122 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00630  guanylate kinase  46.56 
 
 
207 aa  180  2e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1212  guanylate kinase  48.42 
 
 
203 aa  179  2.9999999999999997e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1586  guanylate kinase  48.95 
 
 
227 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0562043  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2472  guanylate kinase  49.21 
 
 
220 aa  179  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0959  guanylate kinase  50 
 
 
227 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.465114  normal  0.426596 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1335  guanylate kinase  46.84 
 
 
206 aa  179  2.9999999999999997e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0756  guanylate kinase  44.22 
 
 
204 aa  179  4e-44  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0520  guanylate kinase  50 
 
 
227 aa  179  4e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0999  guanylate kinase  50 
 
 
227 aa  179  4e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2028  guanylate kinase  47.59 
 
 
220 aa  178  4.999999999999999e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.413126  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2401  guanylate kinase  48.95 
 
 
227 aa  178  4.999999999999999e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3948  guanylate kinase  45.96 
 
 
207 aa  178  7e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.498976  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3583  guanylate kinase  45.79 
 
 
206 aa  178  8e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00415905  normal  0.118983 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2473  guanylate kinase  48.44 
 
 
216 aa  178  8e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.276793  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2975  guanylate kinase  47.85 
 
 
204 aa  177  1e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0045  guanylate kinase  46.6 
 
 
207 aa  177  1e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0266  guanylate kinase  49.2 
 
 
207 aa  177  1e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3877  guanylate kinase  44.28 
 
 
210 aa  177  1e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02830  guanylate kinase  46.63 
 
 
205 aa  177  1e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4218  guanylate kinase  45.79 
 
 
214 aa  177  1e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0859  guanylate kinase  48.95 
 
 
227 aa  177  1e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.675802  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0871  guanylate kinase  48.95 
 
 
227 aa  177  1e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4176  guanylate kinase  46.6 
 
 
207 aa  177  2e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0297777  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0041  guanylate kinase  46.6 
 
 
207 aa  177  2e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0811  guanylate kinase  46.32 
 
 
206 aa  177  2e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.990051 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0210  guanylate kinase  44.74 
 
 
207 aa  176  2e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4107  guanylate kinase  48.95 
 
 
227 aa  176  2e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0130992  normal  0.288359 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3433  guanylate kinase  44.5 
 
 
207 aa  176  2e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.21703  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0336  guanylate kinase  45.27 
 
 
207 aa  176  2e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.57704 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4867  guanylate kinase  46.77 
 
 
207 aa  176  2e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.807857  hitchhiker  0.00555507 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3260  guanylate kinase  45.08 
 
 
221 aa  176  3e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2003  guanylate kinase  48.19 
 
 
216 aa  176  3e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2138  guanylate kinase  45.99 
 
 
205 aa  176  4e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.585915  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4581  guanylate kinase  45.96 
 
 
207 aa  176  4e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.877029  unclonable  0.0000000250462 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2280  guanylate kinase  45.26 
 
 
229 aa  175  5e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3187  Guanylate kinase  47.52 
 
 
210 aa  175  5e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2401  guanylate kinase  50.54 
 
 
202 aa  175  5e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0298091  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3479  guanylate kinase  48.68 
 
 
220 aa  175  6e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0856  guanylate kinase  46.88 
 
 
216 aa  175  6e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4384  guanylate kinase  44.9 
 
 
207 aa  175  6e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0815  guanylate kinase  48.42 
 
 
227 aa  175  7e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.605718  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2096  guanylate kinase  48.42 
 
 
227 aa  175  7e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2949  guanylate kinase  48.42 
 
 
227 aa  175  7e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.391895  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1964  guanylate kinase  48.42 
 
 
227 aa  175  7e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.736317  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3049  guanylate kinase  48.42 
 
 
227 aa  175  7e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.520623  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2648  guanylate kinase  48.42 
 
 
227 aa  175  7e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3015  guanylate kinase  48.42 
 
 
227 aa  175  7e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3497  guanylate kinase  46.46 
 
 
207 aa  174  9e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0729  guanylate kinase  47.94 
 
 
209 aa  174  9.999999999999999e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.148488 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3936  guanylate kinase  46.88 
 
 
212 aa  173  1.9999999999999998e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1761  guanylate kinase  45.45 
 
 
207 aa  173  1.9999999999999998e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5296  guanylate kinase  44.92 
 
 
206 aa  172  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0446222  normal  0.471806 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0365  guanylate kinase  42.79 
 
 
207 aa  172  2.9999999999999996e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1723  guanylate kinase  45.99 
 
 
208 aa  172  3.9999999999999995e-42  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.671499 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>