More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_4329 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_4329  guanylate kinase  100 
 
 		 206 aa  420  1e-117  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.970942  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3583  guanylate kinase  82.93 
 
 		 206 aa  365  1e-100  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00415905  normal  0.118983 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0811  guanylate kinase  83.5 
 
 		 206 aa  365  1e-100  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.990051 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1335  guanylate kinase  83.01 
 
 		 206 aa  363  1e-100  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0947  guanylate kinase  80.1 
 
 		 206 aa  357  6e-98  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.0000973722  hitchhiker  0.000000351977 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0862  guanylate kinase  80.1 
 
 		 206 aa  357  6e-98  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.693982  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4218  guanylate kinase  81.95 
 
 		 214 aa  354  5e-97  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3147  guanylate kinase  80.98 
 
 		 206 aa  348  3e-95  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2028  guanylate kinase  72.2 
 
 		 220 aa  321  5e-87  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.413126  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0729  guanylate kinase  64.39 
 
 		 209 aa  273  1.0000000000000001e-72  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.148488 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2715  guanylate kinase  63.9 
 
 		 206 aa  271  4.0000000000000004e-72  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.446098  normal  0.772738 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0856  guanylate kinase  55.67 
 
 		 216 aa  222  3e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2473  guanylate kinase  53.2 
 
 		 216 aa  213  9.999999999999999e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.276793  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2155  guanylate kinase  54.19 
 
 		 221 aa  211  5.999999999999999e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000431933  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3845  guanylate kinase  55.61 
 
 		 202 aa  210  1e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1956  guanylate kinase  52.71 
 
 		 221 aa  208  5e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.414906 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2276  guanylate kinase  52.22 
 
 		 221 aa  207  8e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0318334  normal  0.859222 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2401  guanylate kinase  52.22 
 
 		 227 aa  206  2e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0959  guanylate kinase  51.72 
 
 		 227 aa  205  4e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.465114  normal  0.426596 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0520  guanylate kinase  51.72 
 
 		 227 aa  205  4e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0999  guanylate kinase  51.72 
 
 		 227 aa  205  4e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0871  guanylate kinase  52.22 
 
 		 227 aa  205  5e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0859  guanylate kinase  52.22 
 
 		 227 aa  205  5e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.675802  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4107  guanylate kinase  51.72 
 
 		 227 aa  204  7e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0130992  normal  0.288359 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1586  guanylate kinase  51.72 
 
 		 227 aa  203  1e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0562043  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3085  guanylate kinase  51.72 
 
 		 226 aa  203  1e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.831514  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0905  guanylate kinase  51.23 
 
 		 225 aa  201  6e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.247766  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0669  guanylate kinase  50.74 
 
 		 228 aa  198  5e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.877591  normal  0.744923 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3015  guanylate kinase  51.23 
 
 		 227 aa  198  6e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2096  guanylate kinase  51.23 
 
 		 227 aa  198  6e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2648  guanylate kinase  51.23 
 
 		 227 aa  198  6e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0815  guanylate kinase  51.23 
 
 		 227 aa  198  6e-50  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.605718  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3049  guanylate kinase  51.23 
 
 		 227 aa  198  6e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.520623  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1964  guanylate kinase  51.23 
 
 		 227 aa  198  6e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.736317  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2949  guanylate kinase  51.23 
 
 		 227 aa  198  6e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.391895  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0361  guanylate kinase  49.5 
 
 		 207 aa  196  2.0000000000000003e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0363  guanylate kinase  49.5 
 
 		 210 aa  195  5.000000000000001e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000053777 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0355  guanylate kinase  49.5 
 
 		 210 aa  195  5.000000000000001e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.398163  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0353  guanylate kinase  49.5 
 
 		 210 aa  195  5.000000000000001e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0360  guanylate kinase  49.5 
 
 		 210 aa  195  5.000000000000001e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3810  guanylate kinase  49.75 
 
 		 207 aa  194  9e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.18291  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2444  guanylate kinase  49 
 
 		 203 aa  193  1e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.337517 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0365  guanylate kinase  47.06 
 
 		 207 aa  193  1e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4581  guanylate kinase  51 
 
 		 207 aa  193  1e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.877029  unclonable  0.0000000250462 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0048  guanylate kinase  51.6 
 
 		 202 aa  192  2e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0330  guanylate kinase  49 
 
 		 224 aa  193  2e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0351596  normal  0.331396 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03505  guanylate kinase  52.06 
 
 		 207 aa  192  3e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0057  Guanylate kinase  52.06 
 
 		 207 aa  192  3e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4151  guanylate kinase  52.06 
 
 		 207 aa  192  3e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3983  guanylate kinase  52.06 
 
 		 207 aa  192  3e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4099  guanylate kinase  52.06 
 
 		 207 aa  192  3e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03457  hypothetical protein  52.06 
 
 		 207 aa  192  3e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0063  guanylate kinase  52.06 
 
 		 207 aa  192  3e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000240109 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3877  guanylate kinase  50.26 
 
 		 210 aa  192  3e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3613  guanylate kinase  48.5 
 
 		 207 aa  192  3e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3859  guanylate kinase  52.06 
 
 		 207 aa  192  3e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0976  guanylate kinase  50.75 
 
 		 211 aa  192  4e-48  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.194665  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4971  guanylate kinase  48.08 
 
 		 218 aa  191  5e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0266  guanylate kinase  49.51 
 
 		 207 aa  191  5e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3630  guanylate kinase  49.5 
 
 		 224 aa  191  7e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.09026  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4384  guanylate kinase  51.63 
 
 		 207 aa  191  9e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3433  guanylate kinase  49.02 
 
 		 207 aa  191  9e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.21703  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3497  guanylate kinase  49 
 
 		 207 aa  190  1e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4145  guanylate kinase  51.81 
 
 		 207 aa  190  1e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5296  guanylate kinase  49.74 
 
 		 206 aa  189  2e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0446222  normal  0.471806 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5020  guanylate kinase  51.55 
 
 		 207 aa  189  2e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0336  guanylate kinase  48.04 
 
 		 207 aa  189  2e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.57704 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1050  guanylate kinase  46.5 
 
 		 202 aa  189  2.9999999999999997e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000462152 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3213  guanylate kinase  46.5 
 
 		 202 aa  189  4e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000935163  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0091  guanylate kinase  51.03 
 
 		 207 aa  188  5e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3957  guanylate kinase  51.03 
 
 		 207 aa  188  5.999999999999999e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3948  guanylate kinase  51.03 
 
 		 207 aa  188  5.999999999999999e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00531185 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3948  guanylate kinase  52.33 
 
 		 207 aa  188  5.999999999999999e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.498976  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4127  guanylate kinase  51.03 
 
 		 207 aa  188  5.999999999999999e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.514606  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4020  guanylate kinase  51.03 
 
 		 207 aa  188  5.999999999999999e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4066  guanylate kinase  51.03 
 
 		 207 aa  188  5.999999999999999e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1723  guanylate kinase  49.02 
 
 		 208 aa  187  9e-47  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.671499 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2003  guanylate kinase  49.49 
 
 		 208 aa  187  9e-47  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.170887 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0052  guanylate kinase  47.62 
 
 		 210 aa  187  1e-46  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00408303  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70440  guanylate kinase  50.25 
 
 		 203 aa  187  1e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0756  guanylate kinase  47.52 
 
 		 204 aa  186  2e-46  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5344  guanylate kinase  49.22 
 
 		 206 aa  186  2e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0394211 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5204  guanylate kinase  49.22 
 
 		 206 aa  186  2e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.952406  normal  0.288026 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1212  guanylate kinase  48.45 
 
 		 203 aa  186  3e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4019  guanylate kinase  48.74 
 
 		 204 aa  185  4e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.565127  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2238  guanylate kinase  45.77 
 
 		 203 aa  185  5e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1992  guanylate kinase  45.54 
 
 		 209 aa  184  6e-46  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0634  guanylate kinase  51.85 
 
 		 210 aa  184  8e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0045  guanylate kinase  51.03 
 
 		 207 aa  184  8e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00153  guanylate kinase  51.55 
 
 		 213 aa  184  9e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0558456  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1987  guanylate kinase  45.54 
 
 		 209 aa  183  1.0000000000000001e-45  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0843  guanylate kinase  46.53 
 
 		 204 aa  183  1.0000000000000001e-45  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0041  guanylate kinase  51.03 
 
 		 207 aa  183  1.0000000000000001e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4176  guanylate kinase  51.03 
 
 		 207 aa  183  1.0000000000000001e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0297777  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3778  guanylate kinase  49.47 
 
 		 233 aa  183  1.0000000000000001e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.208797 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6112  guanylate kinase  49.25 
 
 		 203 aa  182  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.509466  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3187  Guanylate kinase  49.01 
 
 		 210 aa  182  4.0000000000000006e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1078  guanylate kinase  50 
 
 		 212 aa  181  7e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1761  guanylate kinase  45.65 
 
 		 207 aa  181  8.000000000000001e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0577  guanylate kinase  46.23 
 
 		 204 aa  180  1e-44  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.213259  normal  0.177715 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>