More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_0408 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_0408  guanylate kinase  100 
 
 
191 aa  386  1e-106  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.308329  normal  0.957996 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0373  guanylate kinase  68.98 
 
 
194 aa  268  5e-71  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.282119 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0404  guanylate kinase  62.7 
 
 
194 aa  241  3.9999999999999997e-63  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0209165  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1456  guanylate kinase  62.3 
 
 
190 aa  239  2e-62  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000938556  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0375  guanylate kinase  64.67 
 
 
194 aa  238  2.9999999999999997e-62  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0296296  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1773  guanylate kinase  59.79 
 
 
197 aa  229  2e-59  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.159684 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0306  guanylate kinase  59.46 
 
 
192 aa  217  8.999999999999998e-56  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0726977  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02200  guanylate kinase  48.13 
 
 
198 aa  175  3e-43  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0742  guanylate kinase  47.34 
 
 
190 aa  173  9.999999999999999e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2168  guanylate kinase  44.39 
 
 
188 aa  169  2e-41  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.822318  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3827  guanylate kinase  45.7 
 
 
189 aa  169  3e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.536013  normal  0.161762 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5548  guanylate kinase  45.95 
 
 
199 aa  167  8e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07800  guanylate kinase  42.02 
 
 
189 aa  165  4e-40  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.364153  normal  0.897368 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1016  guanylate kinase  43.78 
 
 
188 aa  162  3e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2974  guanylate kinase  39.89 
 
 
219 aa  160  7e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.291122 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0190  guanylate kinase  41.44 
 
 
184 aa  160  1e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.160767 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0195  guanylate kinase  41.44 
 
 
188 aa  160  1e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0012  guanylate kinase  44.68 
 
 
189 aa  159  3e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.897517  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3894  guanylate kinase  38.04 
 
 
200 aa  158  4e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000112061  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0632  guanylate kinase  41.34 
 
 
185 aa  158  5e-38  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1799  guanylate kinase  42.46 
 
 
186 aa  157  6e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0599  guanylate kinase  44.62 
 
 
192 aa  157  9e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.68326  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0464  guanylate kinase  40.11 
 
 
220 aa  156  2e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.328382  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1700  guanylate kinase  40.33 
 
 
200 aa  156  2e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1683  guanylate kinase  38.8 
 
 
219 aa  156  2e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0962  guanylate kinase  41.21 
 
 
202 aa  155  2e-37  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0132271  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0467  guanylate kinase  41.11 
 
 
184 aa  156  2e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1329  guanylate kinase  39.78 
 
 
204 aa  155  2e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000708025  normal  0.428768 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05221  guanylate kinase  41.9 
 
 
186 aa  156  2e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.645705  normal  0.16422 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0469  guanylate kinase  40.11 
 
 
220 aa  156  2e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.149667  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04671  guanylate kinase  41.81 
 
 
185 aa  156  2e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0895533  normal  0.75989 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1473  guanylate kinase  39.78 
 
 
191 aa  155  3e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.110392  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0576  guanylate kinase  40.11 
 
 
220 aa  155  3e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.400734  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1761  guanylate kinase  38.12 
 
 
207 aa  155  4e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0759  guanylate kinase  40.88 
 
 
219 aa  155  4e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.784504  normal  0.122144 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4981  guanylate kinase  40.78 
 
 
198 aa  155  5.0000000000000005e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.023832  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05231  guanylate kinase  40 
 
 
184 aa  154  7e-37  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4197  guanylate kinase  42.55 
 
 
189 aa  154  7e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00373006  normal  0.574711 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04921  guanylate kinase  40 
 
 
184 aa  154  7e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.032848  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1791  guanylate kinase  36.78 
 
 
201 aa  154  8e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.395222  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4162  guanylate kinase  42.62 
 
 
194 aa  154  8e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.13383  normal  0.396618 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0808  guanylate kinase  39.78 
 
 
192 aa  153  1e-36  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.116088  normal  0.89906 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3479  guanylate kinase  38.8 
 
 
220 aa  153  1e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1948  guanylate kinase  39.46 
 
 
205 aa  152  2e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1475  guanylate kinase  41.71 
 
 
199 aa  152  2e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000468376  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1062  guanylate kinase  38.67 
 
 
220 aa  153  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0143004 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2001  guanylate kinase  40.66 
 
 
216 aa  152  2e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3426  Guanylate kinase  39.78 
 
 
194 aa  152  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2440  guanylate kinase  39.89 
 
 
218 aa  152  2.9999999999999998e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000682251 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1058  guanylate kinase  41.62 
 
 
204 aa  152  2.9999999999999998e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000145749  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2158  guanylate kinase  41.67 
 
 
205 aa  152  2.9999999999999998e-36  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0294  guanylate kinase  43.09 
 
 
212 aa  151  5e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2472  guanylate kinase  37.91 
 
 
220 aa  151  5e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2401  guanylate kinase  36.81 
 
 
202 aa  151  5e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0298091  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09810  Guanylate kinase  41.99 
 
 
194 aa  151  5.9999999999999996e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0512  guanylate kinase  40.32 
 
 
188 aa  151  7e-36  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.101295 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1763  guanylate kinase  39.01 
 
 
218 aa  150  8e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.201865  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1719  guanylate kinase  40.11 
 
 
216 aa  150  8e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11418  guanylate kinase  41.99 
 
 
217 aa  150  1e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000747341  normal  0.348875 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3823  guanylate kinase  37.7 
 
 
219 aa  150  1e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.162212 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06681  guanylate kinase  38.89 
 
 
192 aa  150  1e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1205  guanylate kinase  38.12 
 
 
220 aa  149  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.197853  hitchhiker  0.00108752 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2348  guanylate kinase  38.8 
 
 
219 aa  149  2e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2834  guanylate kinase  40.11 
 
 
186 aa  149  2e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.522471  normal  0.276726 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1398  guanylate kinase  39.46 
 
 
209 aa  149  3e-35  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00115166  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2238  guanylate kinase  38.12 
 
 
203 aa  148  4e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5842  guanylate kinase  40 
 
 
259 aa  148  4e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.509377 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1535  guanylate kinase  35.91 
 
 
220 aa  148  5e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0748909  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1529  guanylate kinase  36.51 
 
 
217 aa  148  5e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.2579 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2318  guanylate kinase  38.89 
 
 
198 aa  147  6e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000195285  hitchhiker  0.00462206 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3630  guanylate kinase  40.22 
 
 
209 aa  147  6e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.601224  normal  0.100424 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1443  guanylate kinase  42.78 
 
 
210 aa  147  7e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.86751  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1035  guanylate kinase  40.33 
 
 
199 aa  147  1.0000000000000001e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2084  guanylate kinase  43.89 
 
 
207 aa  147  1.0000000000000001e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.338387  decreased coverage  0.00871463 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2284  guanylate kinase  40.78 
 
 
242 aa  147  1.0000000000000001e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.429726  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1266  guanylate kinase  37.16 
 
 
217 aa  147  1.0000000000000001e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.979121  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2411  guanylate kinase  40.86 
 
 
198 aa  147  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0765  Guanylate kinase  41.85 
 
 
216 aa  146  2.0000000000000003e-34  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0958444  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3354  guanylate kinase  39.44 
 
 
212 aa  146  2.0000000000000003e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2327  guanylate kinase  37.36 
 
 
203 aa  146  2.0000000000000003e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000761567  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1145  guanylate kinase  38.89 
 
 
207 aa  146  2.0000000000000003e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.49439  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2305  guanylate kinase  38.46 
 
 
219 aa  146  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00214709  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0785  guanylate kinase  40.33 
 
 
201 aa  145  3e-34  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000101008  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2719  guanylate kinase  42.46 
 
 
206 aa  145  4.0000000000000006e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00356396  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1319  guanylate kinase  42.22 
 
 
224 aa  145  4.0000000000000006e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.773987  normal  0.110661 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2370  guanylate kinase  40.32 
 
 
198 aa  145  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0470056  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2417  guanylate kinase  40.32 
 
 
198 aa  145  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.391978 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0776  guanylate kinase  38.38 
 
 
207 aa  145  5e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.753859  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05311  guanylate kinase  39.33 
 
 
184 aa  145  5e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3970  guanylate kinase  40.86 
 
 
205 aa  145  5e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0125676  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1273  guanylate kinase  40.86 
 
 
205 aa  144  6e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.213463  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1268  guanylate kinase  38.38 
 
 
207 aa  144  8.000000000000001e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.33638  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1293  guanylate kinase  38.38 
 
 
207 aa  144  8.000000000000001e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1660  guanylate kinase  37.97 
 
 
190 aa  144  9e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000545308  hitchhiker  0.000108168 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0483  guanylate kinase  37.91 
 
 
181 aa  144  9e-34  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1845  guanylate kinase  37.36 
 
 
230 aa  143  1e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2099  guanylate kinase  37.3 
 
 
210 aa  144  1e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1315  guanylate kinase  40.11 
 
 
203 aa  143  1e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.559001  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3936  guanylate kinase  36.61 
 
 
212 aa  144  1e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2523  guanylate kinase  35.2 
 
 
214 aa  144  1e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>