More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3195 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_3195  guanylate kinase  100 
 
 		 184 aa  364  1e-100  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0922592  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1713  guanylate kinase  86.11 
 
 		 192 aa  306  1.0000000000000001e-82  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00781731 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1062  guanylate kinase  68.72 
 
 		 196 aa  241  3.9999999999999997e-63  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1360  guanylate kinase  67.6 
 
 		 199 aa  239  2e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.288733  normal  0.0500423 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5238  guanylate kinase  67.98 
 
 		 199 aa  237  5.999999999999999e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3097  guanylate kinase  67.61 
 
 		 195 aa  234  4e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3007  guanylate kinase  67.23 
 
 		 223 aa  234  7e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000380844  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2813  Guanylate kinase  65.34 
 
 		 234 aa  228  3e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.672067 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2042  guanylate kinase  65.71 
 
 		 180 aa  217  8.999999999999998e-56  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.677493  decreased coverage  0.00281662 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5345  guanylate kinase  61.54 
 
 		 204 aa  216  1e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.313334 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12720  guanylate kinase  62.36 
 
 		 201 aa  215  2.9999999999999998e-55  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0387967  normal  0.0253788 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4162  guanylate kinase  63.74 
 
 		 194 aa  214  4e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.13383  normal  0.396618 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1715  guanylate kinase  63.33 
 
 		 218 aa  213  9.999999999999999e-55  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.244891  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1293  guanylate kinase  62.01 
 
 		 208 aa  212  2.9999999999999995e-54  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.316602  normal  0.120188 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1996  guanylate kinase  59.55 
 
 		 197 aa  211  3.9999999999999995e-54  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000144214 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18030  guanylate kinase  61.58 
 
 		 199 aa  211  5.999999999999999e-54  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0118922  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1318  guanylate kinase  58.62 
 
 		 183 aa  210  7.999999999999999e-54  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.117984  normal  0.348392 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3157  guanylate kinase  59.66 
 
 		 209 aa  208  3e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.250425  hitchhiker  0.0000168585 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0632  guanylate kinase  56.82 
 
 		 185 aa  204  4e-52  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14800  guanylate kinase  58.89 
 
 		 199 aa  203  1e-51  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.338079  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12550  guanylate kinase  61.8 
 
 		 216 aa  202  3e-51  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15620  guanylate kinase  58.99 
 
 		 208 aa  200  8e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0579342  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2345  guanylate kinase  58.76 
 
 		 193 aa  200  9.999999999999999e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.849127  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1850  guanylate kinase  62.22 
 
 		 188 aa  199  9.999999999999999e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.112941  normal  0.242923 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2259  guanylate kinase  57.87 
 
 		 190 aa  199  9.999999999999999e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.294995  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2411  guanylate kinase  55.56 
 
 		 198 aa  195  4.0000000000000005e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1730  guanylate kinase  57.95 
 
 		 199 aa  194  5.000000000000001e-49  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2417  guanylate kinase  55 
 
 		 198 aa  193  1e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.391978 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2370  guanylate kinase  55 
 
 		 198 aa  193  1e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0470056  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06681  guanylate kinase  53.98 
 
 		 192 aa  192  2e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2992  Guanylate kinase  64.29 
 
 		 173 aa  191  4e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.40634 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1475  guanylate kinase  50 
 
 		 199 aa  187  5e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000468376  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11418  guanylate kinase  53.59 
 
 		 217 aa  187  7e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000747341  normal  0.348875 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0087  guanylate kinase  56.35 
 
 		 196 aa  186  1e-46  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.388944  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3127  guanylate kinase  62.01 
 
 		 203 aa  184  7e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.128924  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0195  guanylate kinase  49.16 
 
 		 188 aa  182  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0915  guanylate kinase  52.54 
 
 		 202 aa  182  2.0000000000000003e-45  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4124  Guanylate kinase  50.85 
 
 		 233 aa  181  4.0000000000000006e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0190  guanylate kinase  48.31 
 
 		 184 aa  180  1e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.160767 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04921  guanylate kinase  44.89 
 
 		 184 aa  177  8e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.032848  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05231  guanylate kinase  44.89 
 
 		 184 aa  177  9e-44  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4981  guanylate kinase  48.31 
 
 		 198 aa  177  9e-44  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.023832  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3740  guanylate kinase  54.8 
 
 		 203 aa  176  2e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0778245 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2578  guanylate kinase  50.26 
 
 		 202 aa  176  2e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0638633  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2667  guanylate kinase  54.8 
 
 		 203 aa  174  5e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.615305  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1799  guanylate kinase  47.25 
 
 		 186 aa  172  2.9999999999999996e-42  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07800  guanylate kinase  48.59 
 
 		 189 aa  171  3.9999999999999995e-42  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.364153  normal  0.897368 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04671  guanylate kinase  46.37 
 
 		 185 aa  172  3.9999999999999995e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0895533  normal  0.75989 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2436  guanylate kinase  61.67 
 
 		 194 aa  171  5.999999999999999e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05221  guanylate kinase  46.7 
 
 		 186 aa  169  1e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.645705  normal  0.16422 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05311  guanylate kinase  44.89 
 
 		 184 aa  169  2e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2834  guanylate kinase  47.46 
 
 		 186 aa  169  3e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.522471  normal  0.276726 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0467  guanylate kinase  43.18 
 
 		 184 aa  167  7e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3894  guanylate kinase  46.33 
 
 		 200 aa  165  2.9999999999999998e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000112061  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1191  guanylate kinase  50.57 
 
 		 183 aa  164  5e-40  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0997306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4388  guanylate kinase  45.45 
 
 		 205 aa  164  9e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.11044 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0099  guanylate kinase  42.37 
 
 		 204 aa  163  1.0000000000000001e-39  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.261524  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0313  guanylate kinase  49.71 
 
 		 209 aa  163  1.0000000000000001e-39  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0875391  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3426  Guanylate kinase  45.25 
 
 		 194 aa  162  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2003  guanylate kinase  48.86 
 
 		 216 aa  163  2.0000000000000002e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3845  guanylate kinase  48.89 
 
 		 202 aa  162  2.0000000000000002e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2280  guanylate kinase  44.94 
 
 		 229 aa  162  3e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001862  guanylate kinase  44.94 
 
 		 207 aa  162  3e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1398  guanylate kinase  48.55 
 
 		 209 aa  161  5.0000000000000005e-39  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00115166  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0808  guanylate kinase  45.93 
 
 		 192 aa  160  8.000000000000001e-39  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.116088  normal  0.89906 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3208  guanylate kinase  50.59 
 
 		 186 aa  160  1e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.703275  normal  0.494303 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2444  guanylate kinase  46.99 
 
 		 203 aa  160  1e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.337517 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2158  guanylate kinase  47.16 
 
 		 205 aa  160  1e-38  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00630  guanylate kinase  44.38 
 
 		 207 aa  160  1e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0473  guanylate kinase  48.31 
 
 		 209 aa  159  2e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0330  guanylate kinase  45.51 
 
 		 224 aa  159  2e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0351596  normal  0.331396 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1660  guanylate kinase  46.33 
 
 		 190 aa  159  2e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000545308  hitchhiker  0.000108168 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09810  Guanylate kinase  45.76 
 
 		 194 aa  159  3e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3155  guanylate kinase  48.59 
 
 		 220 aa  159  3e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6112  guanylate kinase  46.59 
 
 		 203 aa  159  3e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.509466  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2001  guanylate kinase  40.11 
 
 		 216 aa  159  3e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1719  guanylate kinase  40.11 
 
 		 216 aa  159  3e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3613  guanylate kinase  44.94 
 
 		 207 aa  159  3e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70440  guanylate kinase  46.59 
 
 		 203 aa  159  3e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3810  guanylate kinase  45.51 
 
 		 207 aa  159  3e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.18291  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5296  guanylate kinase  46.59 
 
 		 206 aa  158  4e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0446222  normal  0.471806 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0091  guanylate kinase  44.81 
 
 		 207 aa  158  4e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4867  guanylate kinase  44.26 
 
 		 207 aa  158  4e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.807857  hitchhiker  0.00555507 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5549  guanylate kinase  44.89 
 
 		 206 aa  157  8e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.405224 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0776  guanylate kinase  45.76 
 
 		 207 aa  156  1e-37  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.753859  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3877  guanylate kinase  44.94 
 
 		 210 aa  157  1e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1035  guanylate kinase  42.05 
 
 		 199 aa  156  2e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0361  guanylate kinase  44.38 
 
 		 207 aa  155  2e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3957  guanylate kinase  44.26 
 
 		 207 aa  155  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4066  guanylate kinase  44.26 
 
 		 207 aa  155  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5344  guanylate kinase  46.02 
 
 		 206 aa  156  2e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0394211 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3948  guanylate kinase  44.26 
 
 		 207 aa  155  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00531185 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4127  guanylate kinase  44.26 
 
 		 207 aa  155  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.514606  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1473  guanylate kinase  46.59 
 
 		 191 aa  156  2e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.110392  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4020  guanylate kinase  44.26 
 
 		 207 aa  155  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5204  guanylate kinase  46.02 
 
 		 206 aa  155  3e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.952406  normal  0.288026 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1176  guanylate kinase  45.66 
 
 		 206 aa  155  3e-37  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000749098  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0294  guanylate kinase  46.11 
 
 		 212 aa  155  3e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0057  Guanylate kinase  43.72 
 
 		 207 aa  155  4e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1761  guanylate kinase  40.68 
 
 		 207 aa  155  4e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>