More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_1318 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_1318  guanylate kinase  100 
 
 		 183 aa  373  1e-102  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.117984  normal  0.348392 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18030  guanylate kinase  73.48 
 
 		 199 aa  284  5e-76  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0118922  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2042  guanylate kinase  72.07 
 
 		 180 aa  266  8.999999999999999e-71  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.677493  decreased coverage  0.00281662 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1715  guanylate kinase  69.89 
 
 		 218 aa  258  4e-68  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.244891  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2259  guanylate kinase  69.44 
 
 		 190 aa  257  7e-68  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.294995  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1996  guanylate kinase  67.98 
 
 		 197 aa  256  9e-68  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000144214 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1850  guanylate kinase  75.57 
 
 		 188 aa  256  2e-67  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.112941  normal  0.242923 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14800  guanylate kinase  63.64 
 
 		 199 aa  241  3.9999999999999997e-63  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.338079  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12550  guanylate kinase  62.92 
 
 		 216 aa  228  3e-59  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2992  Guanylate kinase  68.24 
 
 		 173 aa  224  7e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.40634 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12720  guanylate kinase  61.88 
 
 		 201 aa  221  3e-57  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0387967  normal  0.0253788 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1713  guanylate kinase  58.66 
 
 		 192 aa  216  1e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00781731 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3195  guanylate kinase  58.62 
 
 		 184 aa  210  7.999999999999999e-54  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0922592  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1062  guanylate kinase  59.43 
 
 		 196 aa  210  1e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3097  guanylate kinase  60.34 
 
 		 195 aa  207  7e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1360  guanylate kinase  57.3 
 
 		 199 aa  206  1e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.288733  normal  0.0500423 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3007  guanylate kinase  59.77 
 
 		 223 aa  204  6e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000380844  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3157  guanylate kinase  53.04 
 
 		 209 aa  200  8e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.250425  hitchhiker  0.0000168585 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2345  guanylate kinase  57.14 
 
 		 193 aa  200  8e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.849127  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1293  guanylate kinase  56.28 
 
 		 208 aa  200  9.999999999999999e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.316602  normal  0.120188 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5238  guanylate kinase  56.9 
 
 		 199 aa  194  5.000000000000001e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2813  Guanylate kinase  53.37 
 
 		 234 aa  194  7e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.672067 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0087  guanylate kinase  56.42 
 
 		 196 aa  192  3e-48  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.388944  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0632  guanylate kinase  53.41 
 
 		 185 aa  187  9e-47  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06681  guanylate kinase  54.24 
 
 		 192 aa  186  1e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11418  guanylate kinase  52 
 
 		 217 aa  186  1e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000747341  normal  0.348875 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2436  guanylate kinase  60.67 
 
 		 194 aa  186  1e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2370  guanylate kinase  51.43 
 
 		 198 aa  186  2e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0470056  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2417  guanylate kinase  51.43 
 
 		 198 aa  186  2e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.391978 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2411  guanylate kinase  51.43 
 
 		 198 aa  185  3e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15620  guanylate kinase  54.02 
 
 		 208 aa  184  8e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0579342  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0915  guanylate kinase  49.72 
 
 		 202 aa  182  2.0000000000000003e-45  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2578  guanylate kinase  50.29 
 
 		 202 aa  179  2.9999999999999997e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0638633  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4162  guanylate kinase  54.24 
 
 		 194 aa  178  2.9999999999999997e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.13383  normal  0.396618 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3740  guanylate kinase  50.86 
 
 		 203 aa  178  4.999999999999999e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0778245 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07800  guanylate kinase  47.7 
 
 		 189 aa  177  7e-44  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.364153  normal  0.897368 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1730  guanylate kinase  52.27 
 
 		 199 aa  176  1e-43  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3127  guanylate kinase  56.11 
 
 		 203 aa  175  3e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.128924  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5345  guanylate kinase  50 
 
 		 204 aa  174  7e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.313334 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2667  guanylate kinase  50.29 
 
 		 203 aa  169  3e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.615305  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4981  guanylate kinase  46.55 
 
 		 198 aa  165  2.9999999999999998e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.023832  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04921  guanylate kinase  44.25 
 
 		 184 aa  165  2.9999999999999998e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.032848  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05231  guanylate kinase  44.83 
 
 		 184 aa  165  4e-40  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1329  guanylate kinase  44.83 
 
 		 204 aa  164  8e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000708025  normal  0.428768 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0195  guanylate kinase  46.55 
 
 		 188 aa  163  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04671  guanylate kinase  46.55 
 
 		 185 aa  162  2.0000000000000002e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0895533  normal  0.75989 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0190  guanylate kinase  46.55 
 
 		 184 aa  163  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.160767 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09810  Guanylate kinase  45.4 
 
 		 194 aa  162  4.0000000000000004e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1597  guanylate kinase  48.85 
 
 		 197 aa  160  7e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00198885  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1799  guanylate kinase  47.73 
 
 		 186 aa  160  8.000000000000001e-39  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0840  guanylate kinase  51.22 
 
 		 202 aa  160  1e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1475  guanylate kinase  45.45 
 
 		 199 aa  159  2e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000468376  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05221  guanylate kinase  47.16 
 
 		 186 aa  159  2e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.645705  normal  0.16422 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3894  guanylate kinase  44.83 
 
 		 200 aa  159  3e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000112061  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1660  guanylate kinase  46.99 
 
 		 190 aa  157  8e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000545308  hitchhiker  0.000108168 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1845  guanylate kinase  46.29 
 
 		 230 aa  155  2e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0099  guanylate kinase  44.58 
 
 		 204 aa  154  8e-37  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.261524  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05311  guanylate kinase  43.68 
 
 		 184 aa  153  1e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0467  guanylate kinase  41.95 
 
 		 184 aa  153  1e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0758  guanylate kinase  45.14 
 
 		 204 aa  153  1e-36  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000183217  hitchhiker  0.0000103593 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1700  guanylate kinase  42.86 
 
 		 200 aa  152  2e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0347  guanylate kinase  43.96 
 
 		 215 aa  152  2e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4124  Guanylate kinase  45.29 
 
 		 233 aa  151  5e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2003  guanylate kinase  45.98 
 
 		 216 aa  151  5.9999999999999996e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3208  guanylate kinase  45.29 
 
 		 186 aa  150  7e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.703275  normal  0.494303 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3426  Guanylate kinase  44.83 
 
 		 194 aa  150  8e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0294  guanylate kinase  42.93 
 
 		 212 aa  150  8e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1761  guanylate kinase  40.8 
 
 		 207 aa  150  1e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1473  guanylate kinase  45.98 
 
 		 191 aa  149  2e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.110392  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2158  guanylate kinase  44.83 
 
 		 205 aa  149  2e-35  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0785  guanylate kinase  43.02 
 
 		 201 aa  149  3e-35  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000101008  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1948  guanylate kinase  46.59 
 
 		 205 aa  148  4e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3845  guanylate kinase  47.06 
 
 		 202 aa  148  4e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2001  guanylate kinase  39.08 
 
 		 216 aa  147  6e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1719  guanylate kinase  39.08 
 
 		 216 aa  148  6e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1035  guanylate kinase  43.68 
 
 		 199 aa  147  7e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2834  guanylate kinase  47.85 
 
 		 186 aa  147  8e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.522471  normal  0.276726 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1398  guanylate kinase  44.44 
 
 		 209 aa  146  1.0000000000000001e-34  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00115166  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3877  guanylate kinase  41.71 
 
 		 210 aa  146  1.0000000000000001e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0808  guanylate kinase  40.59 
 
 		 192 aa  146  2.0000000000000003e-34  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.116088  normal  0.89906 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001862  guanylate kinase  44.05 
 
 		 207 aa  145  2.0000000000000003e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1443  guanylate kinase  41.67 
 
 		 210 aa  145  4.0000000000000006e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.86751  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1058  guanylate kinase  46.02 
 
 		 204 aa  144  7.0000000000000006e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000145749  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1285  guanylate kinase  43.1 
 
 		 210 aa  144  7.0000000000000006e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000194386  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3155  guanylate kinase  45.14 
 
 		 220 aa  144  7.0000000000000006e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0100  guanylate kinase  39.08 
 
 		 202 aa  143  1e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0912271  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2318  guanylate kinase  40.23 
 
 		 198 aa  143  1e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000195285  hitchhiker  0.00462206 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1677  guanylate kinase  40.23 
 
 		 217 aa  144  1e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2280  guanylate kinase  43.9 
 
 		 229 aa  142  3e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0360  guanylate kinase  41.14 
 
 		 210 aa  142  3e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0976  guanylate kinase  45.14 
 
 		 211 aa  142  3e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.194665  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0355  guanylate kinase  41.14 
 
 		 210 aa  142  3e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.398163  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11910  guanylate kinase  46.15 
 
 		 170 aa  142  3e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000147119  normal  0.0183319 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0353  guanylate kinase  41.14 
 
 		 210 aa  142  3e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0361  guanylate kinase  41.14 
 
 		 207 aa  142  4e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0363  guanylate kinase  41.14 
 
 		 210 aa  141  5e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000053777 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0962  guanylate kinase  40.57 
 
 		 202 aa  141  5e-33  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0132271  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4581  guanylate kinase  41.71 
 
 		 207 aa  141  5e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.877029  unclonable  0.0000000250462 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3810  guanylate kinase  41.14 
 
 		 207 aa  141  6e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.18291  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0313  guanylate kinase  44.44 
 
 		 209 aa  140  7e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0875391  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>