More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_2992 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_2992  Guanylate kinase  100 
 
 
173 aa  344  3e-94  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.40634 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2042  guanylate kinase  76.61 
 
 
180 aa  258  4e-68  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.677493  decreased coverage  0.00281662 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14800  guanylate kinase  74.71 
 
 
199 aa  258  4e-68  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.338079  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1715  guanylate kinase  77.06 
 
 
218 aa  257  5.0000000000000005e-68  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.244891  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1850  guanylate kinase  78.82 
 
 
188 aa  242  1.9999999999999999e-63  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.112941  normal  0.242923 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18030  guanylate kinase  72.35 
 
 
199 aa  242  1.9999999999999999e-63  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0118922  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1996  guanylate kinase  69.41 
 
 
197 aa  241  3.9999999999999997e-63  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000144214 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2259  guanylate kinase  70.59 
 
 
190 aa  239  2e-62  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.294995  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1318  guanylate kinase  68.24 
 
 
183 aa  238  2.9999999999999997e-62  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.117984  normal  0.348392 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12550  guanylate kinase  68.24 
 
 
216 aa  227  6e-59  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12720  guanylate kinase  66.67 
 
 
201 aa  211  2.9999999999999995e-54  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0387967  normal  0.0253788 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3007  guanylate kinase  66.07 
 
 
223 aa  207  4e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000380844  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1062  guanylate kinase  63.16 
 
 
196 aa  207  5e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3195  guanylate kinase  64.29 
 
 
184 aa  201  5e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0922592  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3097  guanylate kinase  61.99 
 
 
195 aa  199  9.999999999999999e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3157  guanylate kinase  58.72 
 
 
209 aa  198  3e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.250425  hitchhiker  0.0000168585 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1360  guanylate kinase  61.31 
 
 
199 aa  196  9e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.288733  normal  0.0500423 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2411  guanylate kinase  59.17 
 
 
198 aa  195  3e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1713  guanylate kinase  61.9 
 
 
192 aa  195  3e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00781731 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2370  guanylate kinase  58.58 
 
 
198 aa  193  9e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0470056  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2417  guanylate kinase  58.58 
 
 
198 aa  193  9e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.391978 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5238  guanylate kinase  63.03 
 
 
199 aa  192  3e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2813  Guanylate kinase  58.33 
 
 
234 aa  191  5e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.672067 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2345  guanylate kinase  58.72 
 
 
193 aa  190  7e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.849127  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2436  guanylate kinase  70.41 
 
 
194 aa  186  2e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0632  guanylate kinase  53.53 
 
 
185 aa  181  4.0000000000000006e-45  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0087  guanylate kinase  58.33 
 
 
196 aa  180  7e-45  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.388944  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0915  guanylate kinase  55.69 
 
 
202 aa  180  9.000000000000001e-45  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3127  guanylate kinase  60.82 
 
 
203 aa  179  1e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.128924  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2578  guanylate kinase  54.02 
 
 
202 aa  179  2e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0638633  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11418  guanylate kinase  53.85 
 
 
217 aa  175  2e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000747341  normal  0.348875 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5345  guanylate kinase  56.55 
 
 
204 aa  176  2e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.313334 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1293  guanylate kinase  55.88 
 
 
208 aa  176  2e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.316602  normal  0.120188 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06681  guanylate kinase  52.33 
 
 
192 aa  174  7e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15620  guanylate kinase  56.36 
 
 
208 aa  172  1.9999999999999998e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0579342  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1730  guanylate kinase  55.29 
 
 
199 aa  172  2.9999999999999996e-42  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3740  guanylate kinase  56.21 
 
 
203 aa  172  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0778245 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4162  guanylate kinase  57.89 
 
 
194 aa  171  3.9999999999999995e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.13383  normal  0.396618 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07800  guanylate kinase  51.5 
 
 
189 aa  167  6e-41  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.364153  normal  0.897368 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2667  guanylate kinase  55.03 
 
 
203 aa  165  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.615305  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11910  guanylate kinase  51.92 
 
 
170 aa  159  1e-38  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000147119  normal  0.0183319 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1475  guanylate kinase  50.62 
 
 
199 aa  158  4e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000468376  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4124  Guanylate kinase  50 
 
 
233 aa  155  4e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3894  guanylate kinase  46.63 
 
 
200 aa  151  4e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000112061  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4981  guanylate kinase  46.95 
 
 
198 aa  151  5e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.023832  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3208  guanylate kinase  50 
 
 
186 aa  150  7e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.703275  normal  0.494303 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1597  guanylate kinase  50 
 
 
197 aa  149  1e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00198885  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09810  Guanylate kinase  46.95 
 
 
194 aa  149  2e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0195  guanylate kinase  48.17 
 
 
188 aa  149  2e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1660  guanylate kinase  48.5 
 
 
190 aa  148  3e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000545308  hitchhiker  0.000108168 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0190  guanylate kinase  47.56 
 
 
184 aa  148  4e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.160767 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1799  guanylate kinase  44.19 
 
 
186 aa  147  7e-35  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1845  guanylate kinase  51.53 
 
 
230 aa  147  8e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0808  guanylate kinase  45.73 
 
 
192 aa  146  2.0000000000000003e-34  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.116088  normal  0.89906 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05221  guanylate kinase  43.6 
 
 
186 aa  145  2.0000000000000003e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.645705  normal  0.16422 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0840  guanylate kinase  50 
 
 
202 aa  145  4.0000000000000006e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2523  guanylate kinase  46.67 
 
 
214 aa  144  5e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1191  guanylate kinase  48.78 
 
 
183 aa  144  6e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0997306  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1473  guanylate kinase  49.1 
 
 
191 aa  143  1e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.110392  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1761  guanylate kinase  41.72 
 
 
207 aa  143  2e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0758  guanylate kinase  44.24 
 
 
204 aa  142  2e-33  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000183217  hitchhiker  0.0000103593 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1398  guanylate kinase  47.31 
 
 
209 aa  142  2e-33  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00115166  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1035  guanylate kinase  41.92 
 
 
199 aa  142  3e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0099  guanylate kinase  43.75 
 
 
204 aa  141  4e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.261524  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2084  guanylate kinase  49.69 
 
 
207 aa  141  4e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.338387  decreased coverage  0.00871463 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04671  guanylate kinase  43.45 
 
 
185 aa  141  5e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0895533  normal  0.75989 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04921  guanylate kinase  39.29 
 
 
184 aa  140  6e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.032848  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2834  guanylate kinase  45.24 
 
 
186 aa  140  6e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.522471  normal  0.276726 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3155  guanylate kinase  47.27 
 
 
220 aa  140  7e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05311  guanylate kinase  46.75 
 
 
184 aa  140  9e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1700  guanylate kinase  42.33 
 
 
200 aa  139  9.999999999999999e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05231  guanylate kinase  39.29 
 
 
184 aa  139  9.999999999999999e-33  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0294  guanylate kinase  47.24 
 
 
212 aa  140  9.999999999999999e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1237  guanylate kinase  43.9 
 
 
195 aa  139  9.999999999999999e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.74814  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2003  guanylate kinase  49.08 
 
 
216 aa  140  9.999999999999999e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_17617  predicted protein  47.02 
 
 
227 aa  139  1.9999999999999998e-32  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.910339  hitchhiker  0.000867282 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1948  guanylate kinase  46.99 
 
 
205 aa  139  3e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1677  guanylate kinase  43.29 
 
 
217 aa  138  3.9999999999999997e-32  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0035  guanylate kinase  44.79 
 
 
209 aa  137  4.999999999999999e-32  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3845  guanylate kinase  47.67 
 
 
202 aa  137  7.999999999999999e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0330  guanylate kinase  45.73 
 
 
224 aa  137  8.999999999999999e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0351596  normal  0.331396 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001862  guanylate kinase  45.34 
 
 
207 aa  137  8.999999999999999e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00630  guanylate kinase  45.34 
 
 
207 aa  136  1e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2001  guanylate kinase  39.26 
 
 
216 aa  136  1e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1719  guanylate kinase  39.26 
 
 
216 aa  136  1e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2902  guanylate kinase  47.24 
 
 
215 aa  136  1e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1329  guanylate kinase  40.74 
 
 
204 aa  136  1e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000708025  normal  0.428768 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0361  guanylate kinase  44.51 
 
 
207 aa  135  2e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3877  guanylate kinase  44.24 
 
 
210 aa  135  2e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3613  guanylate kinase  45.12 
 
 
207 aa  136  2e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3810  guanylate kinase  45.73 
 
 
207 aa  136  2e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.18291  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0785  guanylate kinase  46.71 
 
 
201 aa  135  3.0000000000000003e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000101008  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1058  guanylate kinase  45.18 
 
 
204 aa  135  3.0000000000000003e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000145749  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0962  guanylate kinase  41.25 
 
 
202 aa  135  3.0000000000000003e-31  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0132271  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4019  guanylate kinase  49.39 
 
 
204 aa  134  7.000000000000001e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.565127  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3630  guanylate kinase  45.12 
 
 
224 aa  134  8e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.09026  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0467  guanylate kinase  38.69 
 
 
184 aa  134  9e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0776  guanylate kinase  42.86 
 
 
207 aa  133  9.999999999999999e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.753859  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4145  guanylate kinase  44.24 
 
 
207 aa  133  9.999999999999999e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0353  guanylate kinase  44.51 
 
 
210 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>