More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_12720 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_12720  guanylate kinase  100 
 
 
201 aa  402  1e-111  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0387967  normal  0.0253788 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1715  guanylate kinase  70.21 
 
 
218 aa  244  8e-64  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.244891  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1996  guanylate kinase  66.1 
 
 
197 aa  238  4e-62  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000144214 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14800  guanylate kinase  67.23 
 
 
199 aa  236  2e-61  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.338079  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2259  guanylate kinase  65.57 
 
 
190 aa  232  2.0000000000000002e-60  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.294995  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2042  guanylate kinase  67.43 
 
 
180 aa  223  1e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.677493  decreased coverage  0.00281662 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1318  guanylate kinase  61.88 
 
 
183 aa  221  4e-57  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.117984  normal  0.348392 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18030  guanylate kinase  63.3 
 
 
199 aa  221  6e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0118922  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3195  guanylate kinase  62.36 
 
 
184 aa  215  4e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0922592  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12550  guanylate kinase  63.54 
 
 
216 aa  214  5e-55  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1713  guanylate kinase  61.33 
 
 
192 aa  212  1.9999999999999998e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00781731 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3097  guanylate kinase  62.09 
 
 
195 aa  213  1.9999999999999998e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3007  guanylate kinase  62.98 
 
 
223 aa  211  3.9999999999999995e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000380844  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0087  guanylate kinase  61.8 
 
 
196 aa  209  3e-53  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.388944  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1062  guanylate kinase  58.82 
 
 
196 aa  207  1e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2813  Guanylate kinase  56.84 
 
 
234 aa  204  9e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.672067 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2436  guanylate kinase  69.23 
 
 
194 aa  204  9e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1360  guanylate kinase  57.89 
 
 
199 aa  203  1e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.288733  normal  0.0500423 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3157  guanylate kinase  59.12 
 
 
209 aa  202  2e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.250425  hitchhiker  0.0000168585 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5238  guanylate kinase  58.47 
 
 
199 aa  202  2e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1850  guanylate kinase  65.17 
 
 
188 aa  202  2e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.112941  normal  0.242923 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4162  guanylate kinase  59.79 
 
 
194 aa  202  3e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.13383  normal  0.396618 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5345  guanylate kinase  61.02 
 
 
204 aa  201  5e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.313334 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1293  guanylate kinase  59.89 
 
 
208 aa  201  5e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.316602  normal  0.120188 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2411  guanylate kinase  56.61 
 
 
198 aa  198  5e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2992  Guanylate kinase  66.67 
 
 
173 aa  197  7e-50  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.40634 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2370  guanylate kinase  56.08 
 
 
198 aa  196  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0470056  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2417  guanylate kinase  56.08 
 
 
198 aa  196  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.391978 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2345  guanylate kinase  57.87 
 
 
193 aa  193  1e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.849127  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15620  guanylate kinase  54.01 
 
 
208 aa  191  8e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0579342  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0915  guanylate kinase  53.63 
 
 
202 aa  187  1e-46  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11418  guanylate kinase  53.26 
 
 
217 aa  184  6e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000747341  normal  0.348875 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4124  Guanylate kinase  50.28 
 
 
233 aa  183  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2578  guanylate kinase  54.4 
 
 
202 aa  182  3e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0638633  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06681  guanylate kinase  49.2 
 
 
192 aa  180  1e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1475  guanylate kinase  50 
 
 
199 aa  178  4e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000468376  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1730  guanylate kinase  53.93 
 
 
199 aa  179  4e-44  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0632  guanylate kinase  50.53 
 
 
185 aa  178  5.999999999999999e-44  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3127  guanylate kinase  59.02 
 
 
203 aa  176  2e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.128924  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2667  guanylate kinase  51.98 
 
 
203 aa  176  2e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.615305  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3740  guanylate kinase  53.19 
 
 
203 aa  176  3e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0778245 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2001  guanylate kinase  42.13 
 
 
216 aa  169  2e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1719  guanylate kinase  42.13 
 
 
216 aa  169  2e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09810  Guanylate kinase  45.81 
 
 
194 aa  169  2e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0195  guanylate kinase  46.56 
 
 
188 aa  168  4e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2834  guanylate kinase  46.28 
 
 
186 aa  168  6e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.522471  normal  0.276726 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07800  guanylate kinase  50.28 
 
 
189 aa  167  9e-41  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.364153  normal  0.897368 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0190  guanylate kinase  46.03 
 
 
184 aa  167  1e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.160767 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0840  guanylate kinase  50.6 
 
 
202 aa  164  6.9999999999999995e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3894  guanylate kinase  46.63 
 
 
200 aa  163  1.0000000000000001e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000112061  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4981  guanylate kinase  48.24 
 
 
198 aa  162  4.0000000000000004e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.023832  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2158  guanylate kinase  46.33 
 
 
205 aa  161  6e-39  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1329  guanylate kinase  44.31 
 
 
204 aa  159  2e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000708025  normal  0.428768 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2318  guanylate kinase  45.56 
 
 
198 aa  160  2e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000195285  hitchhiker  0.00462206 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1761  guanylate kinase  39.33 
 
 
207 aa  158  4e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1398  guanylate kinase  48 
 
 
209 aa  158  5e-38  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00115166  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05311  guanylate kinase  41.9 
 
 
184 aa  158  6e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0808  guanylate kinase  43.33 
 
 
192 aa  156  2e-37  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.116088  normal  0.89906 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1799  guanylate kinase  45.56 
 
 
186 aa  155  3e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1700  guanylate kinase  42.01 
 
 
200 aa  155  4e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1473  guanylate kinase  46.63 
 
 
191 aa  155  4e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.110392  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0785  guanylate kinase  45.76 
 
 
201 aa  154  6e-37  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000101008  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05221  guanylate kinase  44.97 
 
 
186 aa  154  1e-36  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.645705  normal  0.16422 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0467  guanylate kinase  38.67 
 
 
184 aa  152  2e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0758  guanylate kinase  42.7 
 
 
204 aa  153  2e-36  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000183217  hitchhiker  0.0000103593 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3208  guanylate kinase  44.81 
 
 
186 aa  152  2.9999999999999998e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.703275  normal  0.494303 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04671  guanylate kinase  41.42 
 
 
185 aa  152  4e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0895533  normal  0.75989 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0962  guanylate kinase  40.11 
 
 
202 aa  152  4e-36  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0132271  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1948  guanylate kinase  45 
 
 
205 aa  151  5e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04921  guanylate kinase  38.12 
 
 
184 aa  151  8e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.032848  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1058  guanylate kinase  44.44 
 
 
204 aa  150  8.999999999999999e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000145749  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1191  guanylate kinase  49.41 
 
 
183 aa  150  1e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0997306  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3426  Guanylate kinase  43.58 
 
 
194 aa  150  1e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05231  guanylate kinase  37.91 
 
 
184 aa  150  1e-35  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1597  guanylate kinase  47.34 
 
 
197 aa  149  2e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00198885  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1176  guanylate kinase  42.7 
 
 
206 aa  150  2e-35  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000749098  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1713  guanylate kinase  42.7 
 
 
198 aa  148  5e-35  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.463283  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2238  guanylate kinase  41.57 
 
 
203 aa  148  6e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3877  guanylate kinase  44.69 
 
 
210 aa  148  6e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1638  guanylate kinase  44.13 
 
 
208 aa  148  7e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1268  guanylate kinase  41.49 
 
 
207 aa  147  9e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.33638  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1293  guanylate kinase  41.49 
 
 
207 aa  147  9e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0776  guanylate kinase  40.43 
 
 
207 aa  147  1.0000000000000001e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.753859  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1457  guanylate kinase  40.22 
 
 
212 aa  147  1.0000000000000001e-34  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2401  guanylate kinase  41.36 
 
 
202 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0298091  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0313  guanylate kinase  45.4 
 
 
209 aa  146  2.0000000000000003e-34  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0875391  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4066  guanylate kinase  44.13 
 
 
207 aa  146  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11910  guanylate kinase  50.67 
 
 
170 aa  146  2.0000000000000003e-34  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000147119  normal  0.0183319 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3948  guanylate kinase  44.13 
 
 
207 aa  146  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00531185 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3845  guanylate kinase  46.24 
 
 
202 aa  146  2.0000000000000003e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4127  guanylate kinase  44.13 
 
 
207 aa  146  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.514606  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4020  guanylate kinase  44.13 
 
 
207 aa  146  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1266  guanylate kinase  43.58 
 
 
217 aa  146  2.0000000000000003e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.979121  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3957  guanylate kinase  44.13 
 
 
207 aa  146  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_17617  predicted protein  44.51 
 
 
227 aa  146  3e-34  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.910339  hitchhiker  0.000867282 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5344  guanylate kinase  44.51 
 
 
206 aa  145  3e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0394211 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5204  guanylate kinase  45.09 
 
 
206 aa  145  3e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.952406  normal  0.288026 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4388  guanylate kinase  41.53 
 
 
205 aa  145  5e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.11044 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5296  guanylate kinase  44.51 
 
 
206 aa  145  6e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0446222  normal  0.471806 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1529  guanylate kinase  45.83 
 
 
217 aa  145  6e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.2579 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>