More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_3097 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_3097  guanylate kinase  100 
 
 
195 aa  387  1e-107  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1062  guanylate kinase  77.32 
 
 
196 aa  293  2e-78  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3007  guanylate kinase  73.98 
 
 
223 aa  281  6.000000000000001e-75  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000380844  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1360  guanylate kinase  71.66 
 
 
199 aa  271  5.000000000000001e-72  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.288733  normal  0.0500423 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2813  Guanylate kinase  70.27 
 
 
234 aa  263  1e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.672067 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1713  guanylate kinase  66.29 
 
 
192 aa  235  4e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00781731 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3195  guanylate kinase  67.61 
 
 
184 aa  234  5.0000000000000005e-61  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0922592  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5238  guanylate kinase  65.03 
 
 
199 aa  234  8e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1715  guanylate kinase  65.78 
 
 
218 aa  230  9e-60  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.244891  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5345  guanylate kinase  63.59 
 
 
204 aa  229  2e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.313334 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3127  guanylate kinase  66.3 
 
 
203 aa  226  2e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.128924  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3157  guanylate kinase  58.92 
 
 
209 aa  224  5.0000000000000005e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.250425  hitchhiker  0.0000168585 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1293  guanylate kinase  64.2 
 
 
208 aa  223  2e-57  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.316602  normal  0.120188 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2042  guanylate kinase  64.61 
 
 
180 aa  219  1.9999999999999999e-56  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.677493  decreased coverage  0.00281662 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18030  guanylate kinase  59.57 
 
 
199 aa  216  1e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0118922  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12720  guanylate kinase  62.09 
 
 
201 aa  213  1.9999999999999998e-54  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0387967  normal  0.0253788 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14800  guanylate kinase  59.36 
 
 
199 aa  213  1.9999999999999998e-54  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.338079  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15620  guanylate kinase  62.01 
 
 
208 aa  212  2.9999999999999995e-54  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0579342  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1996  guanylate kinase  59.89 
 
 
197 aa  210  1e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000144214 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2259  guanylate kinase  60.45 
 
 
190 aa  210  1e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.294995  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1730  guanylate kinase  61.27 
 
 
199 aa  209  2e-53  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1318  guanylate kinase  60.34 
 
 
183 aa  207  9e-53  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.117984  normal  0.348392 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2345  guanylate kinase  57.54 
 
 
193 aa  207  1e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.849127  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1850  guanylate kinase  65.73 
 
 
188 aa  206  2e-52  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.112941  normal  0.242923 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2411  guanylate kinase  58.1 
 
 
198 aa  206  2e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0632  guanylate kinase  55.37 
 
 
185 aa  205  3e-52  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2370  guanylate kinase  58.1 
 
 
198 aa  205  3e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0470056  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2417  guanylate kinase  58.1 
 
 
198 aa  205  3e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.391978 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12550  guanylate kinase  58.92 
 
 
216 aa  203  1e-51  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4162  guanylate kinase  59.68 
 
 
194 aa  201  6e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.13383  normal  0.396618 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06681  guanylate kinase  55 
 
 
192 aa  200  9.999999999999999e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05311  guanylate kinase  50 
 
 
184 aa  198  5e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04921  guanylate kinase  48.6 
 
 
184 aa  196  1.0000000000000001e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.032848  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2578  guanylate kinase  54.35 
 
 
202 aa  197  1.0000000000000001e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0638633  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11418  guanylate kinase  52.31 
 
 
217 aa  194  6e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000747341  normal  0.348875 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07800  guanylate kinase  54.55 
 
 
189 aa  194  9e-49  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.364153  normal  0.897368 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05231  guanylate kinase  48.04 
 
 
184 aa  193  1e-48  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0195  guanylate kinase  52.54 
 
 
188 aa  192  4e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0467  guanylate kinase  47.49 
 
 
184 aa  191  5e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0190  guanylate kinase  51.98 
 
 
184 aa  190  1e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.160767 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2992  Guanylate kinase  61.99 
 
 
173 aa  189  2e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.40634 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3740  guanylate kinase  57.87 
 
 
203 aa  188  5e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0778245 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3894  guanylate kinase  50.28 
 
 
200 aa  186  2e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000112061  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4124  Guanylate kinase  51.11 
 
 
233 aa  185  3e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1660  guanylate kinase  56.29 
 
 
190 aa  185  4e-46  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000545308  hitchhiker  0.000108168 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2436  guanylate kinase  61.67 
 
 
194 aa  185  4e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4981  guanylate kinase  48.07 
 
 
198 aa  182  2.0000000000000003e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.023832  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1799  guanylate kinase  50.29 
 
 
186 aa  183  2.0000000000000003e-45  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0087  guanylate kinase  54.4 
 
 
196 aa  182  2.0000000000000003e-45  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.388944  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05221  guanylate kinase  49.71 
 
 
186 aa  181  6e-45  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.645705  normal  0.16422 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1475  guanylate kinase  49.71 
 
 
199 aa  181  6e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000468376  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3208  guanylate kinase  50.84 
 
 
186 aa  181  7e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.703275  normal  0.494303 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2667  guanylate kinase  53.09 
 
 
203 aa  180  1e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.615305  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2834  guanylate kinase  52.38 
 
 
186 aa  179  2.9999999999999997e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.522471  normal  0.276726 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1329  guanylate kinase  45.3 
 
 
204 aa  178  4.999999999999999e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000708025  normal  0.428768 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04671  guanylate kinase  48.8 
 
 
185 aa  176  2e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0895533  normal  0.75989 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1058  guanylate kinase  51.67 
 
 
204 aa  174  5e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000145749  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09810  Guanylate kinase  46.7 
 
 
194 aa  174  9.999999999999999e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1473  guanylate kinase  50.28 
 
 
191 aa  173  9.999999999999999e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.110392  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3845  guanylate kinase  49.44 
 
 
202 aa  172  1.9999999999999998e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3155  guanylate kinase  49.45 
 
 
220 aa  172  2.9999999999999996e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1035  guanylate kinase  44.2 
 
 
199 aa  172  2.9999999999999996e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0758  guanylate kinase  45.41 
 
 
204 aa  172  2.9999999999999996e-42  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000183217  hitchhiker  0.0000103593 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0266  guanylate kinase  46.45 
 
 
207 aa  172  2.9999999999999996e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1948  guanylate kinase  50.56 
 
 
205 aa  171  5.999999999999999e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3877  guanylate kinase  44.74 
 
 
210 aa  171  6.999999999999999e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0776  guanylate kinase  48.89 
 
 
207 aa  170  1e-41  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.753859  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0355  guanylate kinase  46.24 
 
 
210 aa  170  1e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.398163  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11910  guanylate kinase  53.95 
 
 
170 aa  170  1e-41  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000147119  normal  0.0183319 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0353  guanylate kinase  46.24 
 
 
210 aa  170  1e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0360  guanylate kinase  46.24 
 
 
210 aa  170  1e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1191  guanylate kinase  51.96 
 
 
183 aa  169  2e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0997306  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0363  guanylate kinase  45.7 
 
 
210 aa  169  2e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000053777 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0915  guanylate kinase  48.44 
 
 
202 aa  169  3e-41  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4581  guanylate kinase  44.09 
 
 
207 aa  169  3e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.877029  unclonable  0.0000000250462 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3630  guanylate kinase  45.7 
 
 
224 aa  169  3e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.09026  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3810  guanylate kinase  45.7 
 
 
207 aa  169  3e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.18291  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3426  Guanylate kinase  47.49 
 
 
194 aa  167  6e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0361  guanylate kinase  45.16 
 
 
207 aa  168  6e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0336  guanylate kinase  44.09 
 
 
207 aa  168  6e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.57704 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0330  guanylate kinase  45.16 
 
 
224 aa  167  1e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0351596  normal  0.331396 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2001  guanylate kinase  43.65 
 
 
216 aa  166  2e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1719  guanylate kinase  43.65 
 
 
216 aa  166  2e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3613  guanylate kinase  44.62 
 
 
207 aa  166  2e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2003  guanylate kinase  46.32 
 
 
216 aa  166  2.9999999999999998e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2318  guanylate kinase  45.86 
 
 
198 aa  165  2.9999999999999998e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000195285  hitchhiker  0.00462206 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0347  guanylate kinase  43.92 
 
 
215 aa  165  2.9999999999999998e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001862  guanylate kinase  44.26 
 
 
207 aa  165  4e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1597  guanylate kinase  48.62 
 
 
197 aa  165  4e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00198885  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0099  guanylate kinase  44.91 
 
 
204 aa  165  4e-40  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.261524  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2280  guanylate kinase  42.35 
 
 
229 aa  164  5.9999999999999996e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1315  guanylate kinase  42.86 
 
 
203 aa  164  5.9999999999999996e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.559001  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1761  guanylate kinase  41.49 
 
 
207 aa  164  5.9999999999999996e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2158  guanylate kinase  47.75 
 
 
205 aa  164  5.9999999999999996e-40  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1700  guanylate kinase  44.02 
 
 
200 aa  164  6.9999999999999995e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3623  guanylate kinase  45.3 
 
 
207 aa  164  8e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2444  guanylate kinase  51.11 
 
 
203 aa  164  8e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.337517 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0840  guanylate kinase  51.5 
 
 
202 aa  163  1.0000000000000001e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3433  guanylate kinase  43.55 
 
 
207 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.21703  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1398  guanylate kinase  50.6 
 
 
209 aa  163  2.0000000000000002e-39  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00115166  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>