More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_2042 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_2042  guanylate kinase  100 
 
 
180 aa  357  6e-98  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.677493  decreased coverage  0.00281662 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1715  guanylate kinase  77.65 
 
 
218 aa  273  8e-73  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.244891  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18030  guanylate kinase  77.4 
 
 
199 aa  268  2e-71  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0118922  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1318  guanylate kinase  72.07 
 
 
183 aa  266  8.999999999999999e-71  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.117984  normal  0.348392 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2259  guanylate kinase  70.06 
 
 
190 aa  254  6e-67  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.294995  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14800  guanylate kinase  72.32 
 
 
199 aa  253  1.0000000000000001e-66  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.338079  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1850  guanylate kinase  78.53 
 
 
188 aa  251  3e-66  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.112941  normal  0.242923 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1996  guanylate kinase  67.8 
 
 
197 aa  249  1e-65  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000144214 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2992  Guanylate kinase  76.61 
 
 
173 aa  241  3.9999999999999997e-63  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.40634 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12550  guanylate kinase  70.62 
 
 
216 aa  241  3.9999999999999997e-63  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12720  guanylate kinase  67.43 
 
 
201 aa  223  9e-58  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0387967  normal  0.0253788 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1062  guanylate kinase  63.13 
 
 
196 aa  219  9.999999999999999e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3097  guanylate kinase  64.61 
 
 
195 aa  219  1.9999999999999999e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3195  guanylate kinase  65.71 
 
 
184 aa  217  8.999999999999998e-56  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0922592  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5238  guanylate kinase  65.14 
 
 
199 aa  211  4.9999999999999996e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3007  guanylate kinase  64.57 
 
 
223 aa  209  1e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000380844  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1360  guanylate kinase  64 
 
 
199 aa  210  1e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.288733  normal  0.0500423 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2436  guanylate kinase  72.16 
 
 
194 aa  209  1e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1713  guanylate kinase  62.29 
 
 
192 aa  206  1e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00781731 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2813  Guanylate kinase  60.57 
 
 
234 aa  201  3e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.672067 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3157  guanylate kinase  55.56 
 
 
209 aa  200  9.999999999999999e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.250425  hitchhiker  0.0000168585 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2345  guanylate kinase  58.89 
 
 
193 aa  199  1.9999999999999998e-50  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.849127  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0087  guanylate kinase  60 
 
 
196 aa  198  3.9999999999999996e-50  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.388944  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5345  guanylate kinase  60.57 
 
 
204 aa  196  2.0000000000000003e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.313334 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1293  guanylate kinase  58.76 
 
 
208 aa  194  4.0000000000000005e-49  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.316602  normal  0.120188 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2411  guanylate kinase  56.82 
 
 
198 aa  189  1e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2370  guanylate kinase  56.25 
 
 
198 aa  188  4e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0470056  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2417  guanylate kinase  56.25 
 
 
198 aa  188  4e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.391978 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06681  guanylate kinase  52.51 
 
 
192 aa  185  3e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4162  guanylate kinase  58.43 
 
 
194 aa  185  3e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.13383  normal  0.396618 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11418  guanylate kinase  53.98 
 
 
217 aa  185  4e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000747341  normal  0.348875 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3127  guanylate kinase  60.34 
 
 
203 aa  184  5e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.128924  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0632  guanylate kinase  52.54 
 
 
185 aa  184  6e-46  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0915  guanylate kinase  54.8 
 
 
202 aa  183  1.0000000000000001e-45  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07800  guanylate kinase  51.43 
 
 
189 aa  181  4.0000000000000006e-45  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.364153  normal  0.897368 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1730  guanylate kinase  56.42 
 
 
199 aa  180  1e-44  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3740  guanylate kinase  53.41 
 
 
203 aa  173  9.999999999999999e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0778245 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11910  guanylate kinase  56.25 
 
 
170 aa  172  1.9999999999999998e-42  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000147119  normal  0.0183319 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0195  guanylate kinase  50.29 
 
 
188 aa  172  2.9999999999999996e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2578  guanylate kinase  51.7 
 
 
202 aa  171  5e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0638633  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2667  guanylate kinase  54.55 
 
 
203 aa  171  5.999999999999999e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.615305  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15620  guanylate kinase  53.71 
 
 
208 aa  171  6.999999999999999e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0579342  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0190  guanylate kinase  49.71 
 
 
184 aa  171  7.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.160767 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3894  guanylate kinase  46.86 
 
 
200 aa  166  1e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000112061  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0785  guanylate kinase  49.14 
 
 
201 aa  164  4e-40  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000101008  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3208  guanylate kinase  51.46 
 
 
186 aa  161  5.0000000000000005e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.703275  normal  0.494303 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1475  guanylate kinase  46.89 
 
 
199 aa  161  5.0000000000000005e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000468376  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4124  Guanylate kinase  47.78 
 
 
233 aa  161  6e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1597  guanylate kinase  49.14 
 
 
197 aa  159  3e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00198885  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1799  guanylate kinase  45.2 
 
 
186 aa  159  3e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1660  guanylate kinase  49.12 
 
 
190 aa  158  4e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000545308  hitchhiker  0.000108168 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09810  Guanylate kinase  45.71 
 
 
194 aa  157  5e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04921  guanylate kinase  42.86 
 
 
184 aa  158  5e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.032848  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05221  guanylate kinase  44.63 
 
 
186 aa  157  1e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.645705  normal  0.16422 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05231  guanylate kinase  42.86 
 
 
184 aa  157  1e-37  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0840  guanylate kinase  48.85 
 
 
202 aa  155  3e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1237  guanylate kinase  45.14 
 
 
195 aa  155  4e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.74814  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1191  guanylate kinase  50.88 
 
 
183 aa  154  5.0000000000000005e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0997306  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04671  guanylate kinase  45.51 
 
 
185 aa  154  5.0000000000000005e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0895533  normal  0.75989 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1761  guanylate kinase  41.71 
 
 
207 aa  154  6e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4981  guanylate kinase  45.03 
 
 
198 aa  154  7e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.023832  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1329  guanylate kinase  40.57 
 
 
204 aa  154  8e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000708025  normal  0.428768 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0808  guanylate kinase  46.2 
 
 
192 aa  153  1e-36  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.116088  normal  0.89906 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001862  guanylate kinase  46.15 
 
 
207 aa  152  2e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2001  guanylate kinase  41.14 
 
 
216 aa  152  2.9999999999999998e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1719  guanylate kinase  41.14 
 
 
216 aa  152  2.9999999999999998e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0099  guanylate kinase  40.57 
 
 
204 aa  151  4e-36  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.261524  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1677  guanylate kinase  42.29 
 
 
217 aa  151  5e-36  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00630  guanylate kinase  45.56 
 
 
207 aa  150  1e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1700  guanylate kinase  41.32 
 
 
200 aa  149  1e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2318  guanylate kinase  41.71 
 
 
198 aa  149  2e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000195285  hitchhiker  0.00462206 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0035  guanylate kinase  44.57 
 
 
209 aa  149  2e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05311  guanylate kinase  44.1 
 
 
184 aa  148  3e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3845  guanylate kinase  48.57 
 
 
202 aa  149  3e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0985  guanylate kinase  41.71 
 
 
207 aa  148  3e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00175631  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3426  Guanylate kinase  45.14 
 
 
194 aa  149  3e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1145  guanylate kinase  41.71 
 
 
207 aa  148  4e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.49439  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3877  guanylate kinase  44.89 
 
 
210 aa  147  7e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2158  guanylate kinase  46.86 
 
 
205 aa  147  7e-35  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0962  guanylate kinase  39.77 
 
 
202 aa  146  1.0000000000000001e-34  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0132271  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3155  guanylate kinase  47.73 
 
 
220 aa  147  1.0000000000000001e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1443  guanylate kinase  40 
 
 
210 aa  146  2.0000000000000003e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.86751  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3948  guanylate kinase  47.27 
 
 
207 aa  145  2.0000000000000003e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.498976  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1035  guanylate kinase  40.57 
 
 
199 aa  146  2.0000000000000003e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2280  guanylate kinase  42.54 
 
 
229 aa  145  2.0000000000000003e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0467  guanylate kinase  40.57 
 
 
184 aa  145  2.0000000000000003e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3260  guanylate kinase  45.71 
 
 
221 aa  145  2.0000000000000003e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1473  guanylate kinase  46.29 
 
 
191 aa  145  3e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.110392  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1058  guanylate kinase  45.76 
 
 
204 aa  145  4.0000000000000006e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000145749  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2444  guanylate kinase  49.69 
 
 
203 aa  145  4.0000000000000006e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.337517 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1948  guanylate kinase  45.76 
 
 
205 aa  144  5e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0758  guanylate kinase  43.18 
 
 
204 aa  144  9e-34  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000183217  hitchhiker  0.0000103593 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3630  guanylate kinase  46.86 
 
 
209 aa  144  9e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.601224  normal  0.100424 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0361  guanylate kinase  42.61 
 
 
207 aa  143  1e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4145  guanylate kinase  44.07 
 
 
207 aa  143  1e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1457  guanylate kinase  39.05 
 
 
212 aa  143  1e-33  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70440  guanylate kinase  44.57 
 
 
203 aa  144  1e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0336  guanylate kinase  42.61 
 
 
207 aa  142  2e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.57704 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3810  guanylate kinase  43.18 
 
 
207 aa  142  2e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.18291  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02367  guanylate kinase  44.57 
 
 
203 aa  143  2e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>