More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3599 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3599  guanylate kinase  100 
 
 
210 aa  421  1e-117  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0365546 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4286  guanylate kinase  90.48 
 
 
210 aa  387  1e-107  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0368614 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1870  guanylate kinase  67.16 
 
 
209 aa  283  1.0000000000000001e-75  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.786175  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0619  guanylate kinase  57.35 
 
 
210 aa  242  3e-63  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_33  guanylate kinase  50 
 
 
205 aa  216  2e-55  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0032  guanylate kinase  49.48 
 
 
205 aa  213  1.9999999999999998e-54  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0035  guanylate kinase  48.97 
 
 
206 aa  197  9e-50  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1638  guanylate kinase  46.2 
 
 
208 aa  186  2e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2318  guanylate kinase  43.78 
 
 
198 aa  169  4e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000195285  hitchhiker  0.00462206 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0840  guanylate kinase  47.59 
 
 
202 aa  168  7e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09810  Guanylate kinase  41.62 
 
 
194 aa  167  1e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1700  guanylate kinase  43.78 
 
 
200 aa  167  1e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1597  guanylate kinase  47.57 
 
 
197 aa  165  5e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00198885  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1761  guanylate kinase  43.55 
 
 
207 aa  163  2.0000000000000002e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3894  guanylate kinase  43.55 
 
 
200 aa  159  3e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000112061  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1058  guanylate kinase  44.09 
 
 
204 aa  155  5.0000000000000005e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000145749  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0776  guanylate kinase  43.01 
 
 
207 aa  154  7e-37  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.753859  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1443  guanylate kinase  42.11 
 
 
210 aa  154  8e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.86751  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1948  guanylate kinase  44.62 
 
 
205 aa  154  1e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3845  guanylate kinase  42.33 
 
 
202 aa  152  2.9999999999999998e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1268  guanylate kinase  43.01 
 
 
207 aa  152  2.9999999999999998e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.33638  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1293  guanylate kinase  43.01 
 
 
207 aa  152  2.9999999999999998e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1791  guanylate kinase  39.46 
 
 
201 aa  150  1e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.395222  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0634  guanylate kinase  42.63 
 
 
210 aa  150  1e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1329  guanylate kinase  38.71 
 
 
204 aa  150  1e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000708025  normal  0.428768 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2001  guanylate kinase  40.86 
 
 
216 aa  149  2e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1719  guanylate kinase  40.86 
 
 
216 aa  149  2e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1677  guanylate kinase  42.16 
 
 
217 aa  150  2e-35  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1237  guanylate kinase  39.78 
 
 
195 aa  150  2e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.74814  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0099  guanylate kinase  41.4 
 
 
204 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.261524  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0962  guanylate kinase  37.1 
 
 
202 aa  146  2.0000000000000003e-34  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0132271  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2523  guanylate kinase  44.09 
 
 
205 aa  146  2.0000000000000003e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1285  guanylate kinase  40.54 
 
 
210 aa  145  3e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000194386  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11418  guanylate kinase  41.03 
 
 
217 aa  145  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000747341  normal  0.348875 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2158  guanylate kinase  40.86 
 
 
205 aa  145  4.0000000000000006e-34  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0758  guanylate kinase  42.11 
 
 
204 aa  145  4.0000000000000006e-34  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000183217  hitchhiker  0.0000103593 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1713  guanylate kinase  42.25 
 
 
198 aa  145  5e-34  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.463283  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0765  Guanylate kinase  38.04 
 
 
216 aa  145  5e-34  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0958444  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1035  guanylate kinase  40.54 
 
 
199 aa  144  8.000000000000001e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1315  guanylate kinase  38.66 
 
 
203 aa  143  2e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.559001  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2093  guanylate kinase  41.49 
 
 
223 aa  143  2e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.353708  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3260  guanylate kinase  40 
 
 
221 aa  143  2e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4162  guanylate kinase  47.88 
 
 
194 aa  143  2e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.13383  normal  0.396618 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1987  guanylate kinase  37.23 
 
 
209 aa  142  3e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0985  guanylate kinase  42.16 
 
 
207 aa  142  3e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00175631  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1763  guanylate kinase  42.27 
 
 
218 aa  142  3e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.201865  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1992  guanylate kinase  37.23 
 
 
209 aa  142  4e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3630  guanylate kinase  42.78 
 
 
209 aa  142  4e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.601224  normal  0.100424 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1145  guanylate kinase  41.62 
 
 
207 aa  141  8e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.49439  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3823  guanylate kinase  41.09 
 
 
219 aa  140  9.999999999999999e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.162212 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1176  guanylate kinase  40.11 
 
 
206 aa  140  9.999999999999999e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000749098  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3970  guanylate kinase  43.01 
 
 
205 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0125676  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2606  guanylate kinase  43.32 
 
 
226 aa  140  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.100354  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1231  guanylate kinase  38.83 
 
 
198 aa  140  1.9999999999999998e-32  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.726797  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3155  guanylate kinase  40.86 
 
 
220 aa  139  3e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1273  guanylate kinase  43.01 
 
 
205 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.213463  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2714  guanylate kinase  40.86 
 
 
213 aa  139  3.9999999999999997e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1311  guanylate kinase  34.54 
 
 
205 aa  139  4.999999999999999e-32  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2692  guanylate kinase  42.78 
 
 
225 aa  139  4.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3778  guanylate kinase  41.18 
 
 
233 aa  138  4.999999999999999e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.208797 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1192  guanylate kinase  34.54 
 
 
207 aa  138  4.999999999999999e-32  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0439  guanylate kinase  39.23 
 
 
205 aa  138  6e-32  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.483895  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3722  guanylate kinase  42.47 
 
 
205 aa  138  7e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4009  guanylate kinase  42.47 
 
 
205 aa  138  7e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3885  guanylate kinase  42.47 
 
 
205 aa  138  7e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000575833 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1319  guanylate kinase  42.16 
 
 
224 aa  138  7e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.773987  normal  0.110661 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2787  guanylate kinase  42.25 
 
 
225 aa  138  7e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3919  guanylate kinase  42.47 
 
 
205 aa  138  7e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.364605  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3914  guanylate kinase  42.47 
 
 
214 aa  137  7.999999999999999e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3612  guanylate kinase  42.47 
 
 
214 aa  137  7.999999999999999e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3630  guanylate kinase  42.47 
 
 
214 aa  137  7.999999999999999e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2138  guanylate kinase  37.36 
 
 
205 aa  138  7.999999999999999e-32  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.585915  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0100  guanylate kinase  35.68 
 
 
202 aa  138  7.999999999999999e-32  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0912271  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1845  guanylate kinase  40.64 
 
 
230 aa  137  8.999999999999999e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3694  guanylate kinase  43.01 
 
 
205 aa  137  8.999999999999999e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1266  guanylate kinase  38.5 
 
 
217 aa  137  8.999999999999999e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.979121  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0632  guanylate kinase  40.45 
 
 
185 aa  137  1e-31  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07800  guanylate kinase  41.9 
 
 
189 aa  137  1e-31  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.364153  normal  0.897368 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0048  guanylate kinase  39.67 
 
 
202 aa  137  1e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1089  guanylate kinase  35.68 
 
 
204 aa  137  1e-31  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.350405  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2444  guanylate kinase  39.46 
 
 
203 aa  137  1e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.337517 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0808  guanylate kinase  40.11 
 
 
192 aa  137  1e-31  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.116088  normal  0.89906 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0811  guanylate kinase  39.06 
 
 
206 aa  136  2e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.990051 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04671  guanylate kinase  38.33 
 
 
185 aa  136  2e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0895533  normal  0.75989 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0552  guanylate kinase  34.02 
 
 
205 aa  136  2e-31  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.713895  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3623  guanylate kinase  39.01 
 
 
207 aa  137  2e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2286  guanylate kinase  40.44 
 
 
202 aa  135  4e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.30068  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1335  guanylate kinase  36.92 
 
 
206 aa  135  4e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2578  guanylate kinase  40.86 
 
 
202 aa  135  5e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0638633  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2411  guanylate kinase  39.44 
 
 
198 aa  135  5e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2401  guanylate kinase  37.57 
 
 
202 aa  135  5e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0298091  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1773  guanylate kinase  41.71 
 
 
197 aa  135  7.000000000000001e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.159684 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1529  guanylate kinase  36.9 
 
 
217 aa  134  7.000000000000001e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.2579 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2975  guanylate kinase  40.64 
 
 
204 aa  134  8e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1796  guanylate kinase  36.02 
 
 
206 aa  134  9e-31  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1683  guanylate kinase  39.34 
 
 
219 aa  134  9.999999999999999e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4981  guanylate kinase  36.07 
 
 
198 aa  134  9.999999999999999e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.023832  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0837  guanylate kinase  35.23 
 
 
201 aa  134  9.999999999999999e-31  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0222597 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0407  guanylate kinase  38.04 
 
 
206 aa  134  9.999999999999999e-31  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.360667  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4329  guanylate kinase  37.44 
 
 
206 aa  134  9.999999999999999e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.970942  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>