More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_0413 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011989  Avi_0827  two component sensor kinase  71.27 
 
 
1410 aa  751    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0318  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  53.85 
 
 
1138 aa  1171    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.619733  normal  0.530694 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0413  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
1276 aa  2542    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0153135  hitchhiker  0.00020462 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3923  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  45.8 
 
 
1055 aa  728    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0381  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  85.34 
 
 
1296 aa  2155    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00957634 
 
 
-
 
NC_004310  BR1606  sensory box histidine kinase  58.48 
 
 
1035 aa  580  1e-164  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.23328  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1549  sensory box histidine kinase  58.28 
 
 
1035 aa  577  1.0000000000000001e-163  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3474  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  45.35 
 
 
836 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0680  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  50.39 
 
 
728 aa  391  1e-107  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.391065 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5204  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  43.76 
 
 
969 aa  389  1e-106  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.299525  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4618  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  42.91 
 
 
1191 aa  373  1e-101  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2948  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.33 
 
 
1000 aa  368  1e-100  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.420098  normal  0.0858273 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1249  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.72 
 
 
1031 aa  368  1e-100  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.244216  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1469  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  42.01 
 
 
1149 aa  360  9e-98  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3942  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  42.08 
 
 
1188 aa  358  3.9999999999999996e-97  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0478025  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1447  histidine kinase A-like  39.6 
 
 
1201 aa  352  3e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6820  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.63 
 
 
981 aa  352  3e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0915227  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1012  Signal transduction histidine kinase  39.53 
 
 
1005 aa  333  1e-89  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.948548  normal  0.15115 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2561  PAS sensor protein  34.98 
 
 
846 aa  243  1e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.218837  normal  0.950665 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2784  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.98 
 
 
841 aa  243  2e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.759601  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1700  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.24 
 
 
798 aa  229  2e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0658643 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0066  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  42.39 
 
 
773 aa  223  1.9999999999999999e-56  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.712477  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2493  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.27 
 
 
853 aa  222  3.9999999999999997e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.308506 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1427  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.03 
 
 
717 aa  220  1e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3213  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  43.82 
 
 
778 aa  219  2e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1935  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.13 
 
 
523 aa  219  2.9999999999999998e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.345754 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3395  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  41 
 
 
530 aa  206  3e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.109713  normal  0.424622 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3251  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.8 
 
 
377 aa  205  4e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.360727  normal  0.404582 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1884  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  41.5 
 
 
389 aa  205  6e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.329348  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0215  sensor histidine kinase  40.38 
 
 
470 aa  204  8e-51  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.00343195  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0950  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.8 
 
 
911 aa  204  8e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.666627 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4820  histidine kinase  40.44 
 
 
513 aa  204  9e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.780698  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3460  putative sensor histidine kinase, putative membrane protein  41.6 
 
 
532 aa  204  9.999999999999999e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.305573 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3431  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.28 
 
 
844 aa  204  9.999999999999999e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.737925 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2046  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  41 
 
 
530 aa  204  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.227598  normal  0.375408 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2574  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.54 
 
 
512 aa  203  9.999999999999999e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.389941 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2185  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.38 
 
 
531 aa  203  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0885  sensor histidine kinase  39.1 
 
 
470 aa  201  7e-50  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.982785  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0438  putative non-motile and phage-resistance protein  41.04 
 
 
773 aa  201  7e-50  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2064  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  41 
 
 
533 aa  201  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0167055  normal  0.0634721 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1212  Signal transduction histidine kinase  41 
 
 
536 aa  199  2.0000000000000003e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.39876  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0936  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.39 
 
 
617 aa  199  4.0000000000000005e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.422617  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2079  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.64 
 
 
511 aa  199  4.0000000000000005e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.964001  normal  0.759382 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1600  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.83 
 
 
511 aa  198  5.000000000000001e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.501895 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0848  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.15 
 
 
513 aa  198  6e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.88824  normal  0.551331 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2316  histidine kinase  40.64 
 
 
511 aa  198  7e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.243806  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2148  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  43.72 
 
 
769 aa  197  8.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0873  histidine kinase  40.52 
 
 
513 aa  197  9e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.428917 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0912  ATPase domain-containing protein  40.52 
 
 
513 aa  197  9e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1119  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.84 
 
 
502 aa  196  2e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.092302  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0956  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  45.99 
 
 
600 aa  196  2e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.818722 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1373  two component sensor kinase  40 
 
 
790 aa  196  3e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1469  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.46 
 
 
536 aa  195  4e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.997673  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1358  histidine kinase  40 
 
 
288 aa  194  1e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.688927  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2051  two component sensor kinase  40.24 
 
 
511 aa  194  1e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1749  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.34 
 
 
511 aa  192  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1847  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.87 
 
 
775 aa  192  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0491237  normal  0.422245 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1449  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  41.18 
 
 
775 aa  192  2.9999999999999997e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00109411  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3152  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.24 
 
 
468 aa  192  4e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.229393  normal  0.25439 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2663  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34 
 
 
784 aa  191  5e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.501852  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1929  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.52 
 
 
594 aa  191  5.999999999999999e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1688  PAS sensor protein  29.97 
 
 
823 aa  191  8e-47  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1335  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.38 
 
 
518 aa  190  1e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2018  ATP-binding region, ATPase-like  41.6 
 
 
771 aa  189  2e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.88254  normal  0.468508 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0905  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.13 
 
 
774 aa  189  2e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.226148  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0327  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  41.57 
 
 
620 aa  189  4e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1010  histidine kinase  39.78 
 
 
503 aa  188  5e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.232775  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3094  two-component sensor histidine kinase  41.6 
 
 
774 aa  188  7e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1200  Signal transduction histidine kinase  41 
 
 
779 aa  187  9e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1078  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.82 
 
 
769 aa  187  9e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.459877  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0616  sensory box histidine kinase  40.76 
 
 
783 aa  187  1.0000000000000001e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.260748  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0615  sensory box histidine kinase  40.76 
 
 
783 aa  187  1.0000000000000001e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0639  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.82 
 
 
456 aa  187  1.0000000000000001e-45  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0929  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.18 
 
 
769 aa  187  1.0000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0582666 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3481  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.51 
 
 
704 aa  186  3e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.112139 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3436  histidine kinase  41.1 
 
 
771 aa  186  3e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.416045  normal  0.0284383 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1626  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.88 
 
 
770 aa  185  5.0000000000000004e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.255804  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0884  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.69 
 
 
513 aa  182  2.9999999999999997e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.683034  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0641  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.46 
 
 
772 aa  182  2.9999999999999997e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.544021 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2221  Signal transduction histidine kinase  40.62 
 
 
605 aa  182  4.999999999999999e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.763849  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0720  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.97 
 
 
882 aa  181  7e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.488385  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1639  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.92 
 
 
583 aa  181  1e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.19247  normal  0.411999 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0711  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.25 
 
 
646 aa  180  1e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.386988 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0700  PAS sensor protein  39.25 
 
 
648 aa  180  2e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.390085  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3045  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.78 
 
 
587 aa  180  2e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0484  multi-sensor histidine kinase  30.29 
 
 
1255 aa  180  2e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.908962 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1035  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.25 
 
 
1041 aa  180  2e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.73134 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1553  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.15 
 
 
505 aa  179  3e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3648  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.87 
 
 
1237 aa  179  3e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.289797  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0673  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.87 
 
 
643 aa  179  4e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.431385 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1726  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.9 
 
 
881 aa  179  4e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0185814  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0648  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.22 
 
 
661 aa  178  6e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.173169  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1062  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.43 
 
 
509 aa  178  7e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1052  sensory transduction histidine kinase  31.89 
 
 
1046 aa  178  8e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1944  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.39 
 
 
607 aa  177  8e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.133284  normal  0.0645132 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2623  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.23 
 
 
614 aa  177  8e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0514  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.41 
 
 
786 aa  178  8e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.292682 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1238  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.11 
 
 
579 aa  177  9.999999999999999e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0280549 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1406  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.59 
 
 
484 aa  176  1.9999999999999998e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.197112  normal  0.954465 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5599  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.05 
 
 
846 aa  176  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0595123  normal  0.659361 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>