More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_2561 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_2561  PAS sensor protein  100 
 
 		 846 aa  1636    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.218837  normal  0.950665 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2784  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  96.45 
 
 		 841 aa  1545    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.759601  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2493  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  78.62 
 
 		 853 aa  1191    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.308506 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5204  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  44.27 
 
 		 969 aa  361  3e-98  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.299525  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2948  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  42.46 
 
 		 1000 aa  331  4e-89  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.420098  normal  0.0858273 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5599  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.95 
 
 		 846 aa  309  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0595123  normal  0.659361 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1447  histidine kinase A-like  31.13 
 
 		 1201 aa  274  5.000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0318  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.67 
 
 		 1138 aa  273  1e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.619733  normal  0.530694 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1469  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.94 
 
 		 1149 aa  269  2e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4618  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.95 
 
 		 1191 aa  268  2e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1606  sensory box histidine kinase  33.63 
 
 		 1035 aa  267  7e-70  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.23328  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1012  Signal transduction histidine kinase  31.25 
 
 		 1005 aa  266  1e-69  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.948548  normal  0.15115 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3474  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.84 
 
 		 836 aa  266  1e-69  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1249  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.76 
 
 		 1031 aa  265  3e-69  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.244216  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1549  sensory box histidine kinase  33.45 
 
 		 1035 aa  264  4.999999999999999e-69  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3923  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.77 
 
 		 1055 aa  253  1e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0171  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.18 
 
 		 1192 aa  252  2e-65  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6820  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.67 
 
 		 981 aa  250  9e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0915227  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0827  two component sensor kinase  35.46 
 
 		 1410 aa  247  6e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0381  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.26 
 
 		 1296 aa  244  5e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00957634 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0413  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.98 
 
 		 1276 aa  243  1e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0153135  hitchhiker  0.00020462 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0680  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.48 
 
 		 728 aa  237  8e-61  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.391065 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3942  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.49 
 
 		 1188 aa  236  1.0000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0478025  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4820  histidine kinase  34.3 
 
 		 513 aa  134  7.999999999999999e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.780698  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3460  putative sensor histidine kinase, putative membrane protein  34.04 
 
 		 532 aa  134  9e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.305573 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1305  two component sensor kinase  34.51 
 
 		 599 aa  133  2.0000000000000002e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.282696  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0438  putative non-motile and phage-resistance protein  30.71 
 
 		 773 aa  131  7.000000000000001e-29  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2064  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.77 
 
 		 533 aa  129  3e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0167055  normal  0.0634721 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2574  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.06 
 
 		 512 aa  129  3e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.389941 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1935  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37 
 
 		 523 aa  128  4.0000000000000003e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.345754 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1469  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.49 
 
 		 536 aa  128  5e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.997673  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3395  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.91 
 
 		 530 aa  128  6e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.109713  normal  0.424622 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3251  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.36 
 
 		 377 aa  127  1e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.360727  normal  0.404582 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0215  sensor histidine kinase  30.77 
 
 		 470 aa  127  1e-27  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.00343195  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1749  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.47 
 
 		 511 aa  127  1e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2185  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.91 
 
 		 531 aa  126  1e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0884  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.46 
 
 		 513 aa  126  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.683034  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1212  Signal transduction histidine kinase  31.49 
 
 		 536 aa  126  2e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.39876  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2046  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.91 
 
 		 530 aa  126  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.227598  normal  0.375408 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1406  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.4 
 
 		 484 aa  125  2e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.197112  normal  0.954465 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1427  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.81 
 
 		 717 aa  125  3e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1010  histidine kinase  33.46 
 
 		 503 aa  125  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.232775  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1335  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.47 
 
 		 518 aa  125  5e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0912  ATPase domain-containing protein  33.06 
 
 		 513 aa  123  9.999999999999999e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0873  histidine kinase  33.06 
 
 		 513 aa  123  9.999999999999999e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.428917 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2051  two component sensor kinase  30.99 
 
 		 511 aa  123  1.9999999999999998e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1884  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  31.03 
 
 		 389 aa  123  1.9999999999999998e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.329348  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5419  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.68 
 
 		 713 aa  122  3e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1700  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.28 
 
 		 798 aa  121  3.9999999999999996e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0658643 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0848  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.23 
 
 		 513 aa  121  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.88824  normal  0.551331 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1358  histidine kinase  30.53 
 
 		 288 aa  121  4.9999999999999996e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.688927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1553  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.54 
 
 		 505 aa  121  4.9999999999999996e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0066  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  34.92 
 
 		 773 aa  121  6e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.712477  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1929  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.35 
 
 		 594 aa  121  6e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0534  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.87 
 
 		 697 aa  120  7.999999999999999e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.608337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3680  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.43 
 
 		 744 aa  119  1.9999999999999998e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.614037  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0327  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  36.25 
 
 		 620 aa  119  3e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3431  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.35 
 
 		 844 aa  118  3.9999999999999997e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.737925 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1626  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.62 
 
 		 770 aa  118  5e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.255804  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3152  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 468 aa  117  6e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.229393  normal  0.25439 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1062  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.42 
 
 		 509 aa  117  8.999999999999998e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2316  histidine kinase  30.99 
 
 		 511 aa  116  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.243806  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0885  sensor histidine kinase  29.74 
 
 		 470 aa  116  1.0000000000000001e-24  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.982785  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2079  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.99 
 
 		 511 aa  116  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.964001  normal  0.759382 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1600  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.2 
 
 		 511 aa  116  2.0000000000000002e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.501895 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3213  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  34.93 
 
 		 778 aa  114  9e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1142  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.99 
 
 		 631 aa  114  9e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0950  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.92 
 
 		 911 aa  113  1.0000000000000001e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.666627 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2746  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.08 
 
 		 596 aa  111  5e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.313231  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1052  sensory transduction histidine kinase  24.93 
 
 		 1046 aa  110  7.000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2623  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.4 
 
 		 614 aa  110  1e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0617  histidine kinase  32.46 
 
 		 525 aa  110  1e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.862925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3045  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.62 
 
 		 587 aa  110  1e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0599  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.61 
 
 		 957 aa  110  1e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2221  Signal transduction histidine kinase  31.72 
 
 		 605 aa  109  2e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.763849  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1722  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.51 
 
 		 1007 aa  109  2e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.608863  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0047  histidine kinase  32.77 
 
 		 508 aa  109  2e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0559  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.2 
 
 		 704 aa  109  2e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0560  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.78 
 
 		 940 aa  108  3e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4529  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.81 
 
 		 989 aa  108  4e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1035  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.31 
 
 		 1041 aa  108  4e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.73134 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0484  multi-sensor histidine kinase  22.89 
 
 		 1255 aa  108  4e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.908962 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0808  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.4 
 
 		 929 aa  108  5e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1235  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.54 
 
 		 989 aa  108  6e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.172784  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3722  ATP-binding region, ATPase-like protein  30.16 
 
 		 1120 aa  107  7e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4585  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.33 
 
 		 1350 aa  107  7e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.20208  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3552  Cache sensor hybrid histidine kinase  29.79 
 
 		 970 aa  107  8e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4114  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.95 
 
 		 3470 aa  107  8e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1934  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25.67 
 
 		 1015 aa  107  1e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.452261  normal  0.114848 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3113  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.56 
 
 		 898 aa  107  1e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.265974  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1847  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.96 
 
 		 775 aa  107  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0491237  normal  0.422245 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0708  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.06 
 
 		 453 aa  107  1e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3094  two-component sensor histidine kinase  29.96 
 
 		 774 aa  107  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2536  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.9 
 
 		 801 aa  107  1e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.087707 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0186  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.19 
 
 		 657 aa  106  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00908915 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2061  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25.92 
 
 		 738 aa  105  2e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2762  PAS sensor protein  31.15 
 
 		 1135 aa  106  2e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.449168  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0204  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  32.16 
 
 		 687 aa  105  3e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.478023 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2148  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.58 
 
 		 769 aa  105  3e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2901  GAF sensor hybrid histidine kinase  29.39 
 
 		 733 aa  105  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.248575  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>