More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_5599 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_5599  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
846 aa  1595    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0595123  normal  0.659361 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2561  PAS sensor protein  36.47 
 
 
846 aa  334  4e-90  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.218837  normal  0.950665 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2784  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.07 
 
 
841 aa  328  3e-88  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.759601  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2493  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.85 
 
 
853 aa  324  4e-87  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.308506 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5204  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.24 
 
 
969 aa  291  5.0000000000000004e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.299525  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2948  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.95 
 
 
1000 aa  277  5e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.420098  normal  0.0858273 
 
 
-
 
NC_004310  BR1606  sensory box histidine kinase  28.82 
 
 
1035 aa  252  2e-65  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.23328  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1549  sensory box histidine kinase  28.82 
 
 
1035 aa  252  2e-65  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3923  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.64 
 
 
1055 aa  232  3e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0318  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.31 
 
 
1138 aa  228  4e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.619733  normal  0.530694 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4618  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.42 
 
 
1191 aa  225  3e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1012  Signal transduction histidine kinase  28.87 
 
 
1005 aa  219  2e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.948548  normal  0.15115 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1447  histidine kinase A-like  30.22 
 
 
1201 aa  214  7e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1249  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.18 
 
 
1031 aa  213  1e-53  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.244216  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1469  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.47 
 
 
1149 aa  212  3e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0171  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.13 
 
 
1192 aa  212  3e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0381  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.27 
 
 
1296 aa  199  1.0000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00957634 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0413  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.8 
 
 
1276 aa  197  5.000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0153135  hitchhiker  0.00020462 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0827  two component sensor kinase  31.68 
 
 
1410 aa  197  6e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3942  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.64 
 
 
1188 aa  194  4e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0478025  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6820  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.09 
 
 
981 aa  194  5e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0915227  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3474  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.28 
 
 
836 aa  177  9.999999999999999e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0680  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.38 
 
 
728 aa  154  4e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.391065 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0950  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.69 
 
 
911 aa  115  3e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.666627 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0936  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.81 
 
 
617 aa  105  3e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.422617  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3431  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.64 
 
 
844 aa  101  6e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.737925 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0438  putative non-motile and phage-resistance protein  27.38 
 
 
773 aa  101  6e-20  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2051  two component sensor kinase  27.27 
 
 
511 aa  97.1  1e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2574  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.25 
 
 
512 aa  95.5  4e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.389941 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4820  histidine kinase  28.97 
 
 
513 aa  95.1  5e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.780698  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3460  putative sensor histidine kinase, putative membrane protein  28.7 
 
 
532 aa  95.1  5e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.305573 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1929  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.8 
 
 
594 aa  94.7  6e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2663  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.95 
 
 
784 aa  94.4  8e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.501852  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1553  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.34 
 
 
505 aa  94.4  9e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0616  sensory box histidine kinase  27.45 
 
 
783 aa  94  1e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.260748  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0956  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.23 
 
 
600 aa  94  1e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.818722 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0615  sensory box histidine kinase  27.45 
 
 
783 aa  94  1e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2079  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.48 
 
 
511 aa  93.6  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.964001  normal  0.759382 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2316  histidine kinase  26.48 
 
 
511 aa  93.2  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.243806  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1449  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.54 
 
 
775 aa  92.8  2e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00109411  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2185  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.21 
 
 
531 aa  92.8  2e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0118  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.05 
 
 
861 aa  92.8  3e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.235165  normal  0.571653 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3395  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.47 
 
 
530 aa  92.8  3e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.109713  normal  0.424622 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1600  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.48 
 
 
511 aa  91.7  6e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.501895 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2046  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.47 
 
 
530 aa  91.7  6e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.227598  normal  0.375408 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3152  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.64 
 
 
468 aa  91.3  6e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.229393  normal  0.25439 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2064  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.26 
 
 
533 aa  90.9  9e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0167055  normal  0.0634721 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1427  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.84 
 
 
717 aa  90.5  1e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1935  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.07 
 
 
523 aa  90.1  2e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.345754 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0905  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.48 
 
 
774 aa  90.1  2e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.226148  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1469  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.39 
 
 
536 aa  88.6  4e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.997673  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1749  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.86 
 
 
511 aa  89  4e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1200  Signal transduction histidine kinase  26.81 
 
 
779 aa  87  0.000000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1212  Signal transduction histidine kinase  27.39 
 
 
536 aa  87.4  0.000000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.39876  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1847  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.98 
 
 
775 aa  87.4  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0491237  normal  0.422245 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1335  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.11 
 
 
518 aa  87  0.000000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1010  histidine kinase  27.85 
 
 
503 aa  86.3  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.232775  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1700  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.71 
 
 
798 aa  86.7  0.000000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0658643 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1884  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  25.98 
 
 
389 aa  86.7  0.000000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.329348  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0080  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.9 
 
 
829 aa  86.3  0.000000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.572947 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0718  sensory box histidine kinase/response regulator  27.42 
 
 
589 aa  86.3  0.000000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.97168  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1406  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.02 
 
 
484 aa  85.9  0.000000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.197112  normal  0.954465 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2033  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.94 
 
 
797 aa  85.9  0.000000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0848  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.72 
 
 
513 aa  84.7  0.000000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.88824  normal  0.551331 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0929  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.85 
 
 
769 aa  84.7  0.000000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0582666 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1626  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.78 
 
 
770 aa  84.7  0.000000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.255804  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2018  ATP-binding region, ATPase-like  26.38 
 
 
771 aa  84.7  0.000000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.88254  normal  0.468508 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3213  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  27.47 
 
 
778 aa  84.3  0.000000000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1078  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.29 
 
 
769 aa  84  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.459877  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4061  multi-sensor signal transduction histidine kinase  23.55 
 
 
885 aa  83.6  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.193403  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3094  two-component sensor histidine kinase  26.45 
 
 
774 aa  84.3  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0045  histidine kinase  26.56 
 
 
838 aa  83.2  0.00000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.327934 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3436  histidine kinase  25.5 
 
 
771 aa  83.2  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.416045  normal  0.0284383 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2148  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.17 
 
 
769 aa  82.8  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0053  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.8 
 
 
838 aa  82.4  0.00000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0884  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.85 
 
 
513 aa  82.8  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.683034  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.31 
 
 
1352 aa  82.4  0.00000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2901  GAF sensor hybrid histidine kinase  28.38 
 
 
733 aa  82.8  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.248575  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1119  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.21 
 
 
502 aa  82  0.00000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.092302  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0912  ATPase domain-containing protein  26.34 
 
 
513 aa  81.3  0.00000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0873  histidine kinase  26.34 
 
 
513 aa  81.3  0.00000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.428917 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3284  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.93 
 
 
856 aa  81.3  0.00000000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0250894  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0382  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.76 
 
 
843 aa  80.5  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3481  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.42 
 
 
704 aa  80.5  0.0000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.112139 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3153  histidine kinase  30.43 
 
 
218 aa  79.7  0.0000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0747566  normal  0.115047 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0066  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  27.51 
 
 
773 aa  79  0.0000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.712477  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0899  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.46 
 
 
562 aa  79  0.0000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.000736499  normal  0.0870171 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0742  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.5 
 
 
862 aa  79.3  0.0000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0047  histidine kinase  25.95 
 
 
508 aa  78.6  0.0000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0577  sensor histidine kinase  25.51 
 
 
609 aa  79  0.0000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0577  sensor histidine kinase  25.51 
 
 
609 aa  78.6  0.0000000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.704828  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0192  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.51 
 
 
795 aa  78.6  0.0000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.228463 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0877  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.34 
 
 
548 aa  77.8  0.0000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.991624  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0768  signal transduction histidine kinase  23.61 
 
 
383 aa  77.8  0.0000000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5419  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.82 
 
 
713 aa  77.8  0.0000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0613  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.32 
 
 
641 aa  77.4  0.000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0268  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.83 
 
 
764 aa  76.6  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0862951 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1605  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.63 
 
 
830 aa  76.3  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0705844  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1639  multi-sensor signal transduction histidine kinase  23.37 
 
 
583 aa  76.6  0.000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.19247  normal  0.411999 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3690  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.24 
 
 
833 aa  75.9  0.000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0862317  normal  0.782884 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>